Spo14668 (gene)

Overview
NameSpo14668
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_00601 : 273054 .. 279589 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATAAAAAAAAAACACTAGCATCCTACCCTTAAATTCCTTCATGATTTACGGCCCTGCCATTCCTTTTTCGTTGGCCAGCTGTCTTCGTTCTCCCTTCCCTGTCTTCGTCCTCTTGTGTCCTTCTGCTTCCCCTCCTCTGCAATGGCGTTACTTCATCTTCCATACTAATCTTTCTCGATTTTTCCTCTCCATCTTCTATTTATCCTCGTCAAATTTTATCAGCTCCTCTATCTTCTCTCTCTCCTTCGCTTATTTCCTATCAATAATCTCAATATCAACAAACCCTAAATCCCTAATTTTGGGATTTCAATGAACCAGAGGGATCACAAGATTCCAAATAGTGCCTTAAGGTGCCCACCCCTCTTTCTTTTTCTTCGTGTGGCCGATTTCCTTTCCTCGACATGTCGTTGATGCCTCCACCCTCCTCTTCATCGCGGTGGTCCCTCCGCCATCTTCTCTCCTACATATCTTCTTCGTTCTGCTGGTAAATGCGAGTATCCAACTTCATTTTAGTCCAATCTGTAGCTCTCCATCGTCATCTCTGGCAAGGTCTTCAAATAACACCTTCGAGGATTCCAATGCAAAGCCCATATTCAGACAATTAGTTGGCCTTGGAATCTTCCAAGATGTTATTGGAAATCTTGTTGAAAGATGCAACAATGGTGTTATTTGTTGAGAAGTAGGTAATTTTCTTGATTCGCAGAAGCATAAAATTTTCCTTCAATGTTTAATTGGTAGGCTTACTCATTTAGTTGTAGCTGAATCCATAACCCCTATGTACTTTAATGATATTGACTTGCATAATTCGTTCATAGTTGATGTCAATGGGACTTATAGTTGATGTACATGAAGTATTAGCTTATGGATATTTATGTTTATAACCTAATTTTTATTGTTACTTGATTTAAATTGGAATTTTGGCAGGTGTTTGTGAAATATGAGTATACTCCAGAAACATTGCCTAATTTTTGGGTGATCTTGGGGTTTTTAGTTGATTGCTTAAATATATCTCTGCTCTGGAACGCTCAAGCATGATAGAGCTTTATTGTCTAGGCTTCTTTAATAAGAAATTATTTTGCAGTCCAATTTTTAGGATTTTGTTTGGTATTTTGACGATTGTTCATGTAACTTCCTTAAGATAGATGGTTGTATCAATATATCAAACTTCACTCTAAAATAAGAAAAAAGAAAAGATATACATAAGTCTAAAATGAAAATTCGTCAGGCTTGTGACTGTTACAAGCCGAACTCTAACTGATTAATTGCTACCATCATAGATAATTATCCGGAAGAAGGTGTTTATGAAACTCTGGTACCCAAGGACCAACGGAGGTAGAGCTTTGTCTGATCGAGCTCAGGATAAAGTAACCCTGAAGTGCCTGAGACACTGACTTATGAATTAATTTGTGACTTATGTTTAGACCCTTGATATCGTCATCGTATAATACTGATTCAGGCAAGGCTTTTTCCTGAGTAAGAATCATTGTTGTATGTGACAATGTTACAGGTCTTAATGGTTGATTTATGCTTAGGATCTGATTTACTGTCTGCAGAATCATGTTTTTGTTAATTGTTTTTTAAAAGAACTTGCAATCCTCTGCTGCTGATCTAAGTCAAAGATGAAAGCTTTGCAGAATTGCAGTTTCCATTAGATATGGAAGTTGTTTACTTGTTGCTGCATTGAGCAATCATAATAATCAGCTTGTGGTTTATTTACGAGTCATTTGAATTGTCACTATAATAATTAATCCCTAGAGATTTTCTGTAGTTTAGTTTTGATGGCTTCTGAATTTTAAATGTCTGCAGTTGTGAATTTTGATTATATTTAATTTGGTTAATCTGGGCATATTGATCGAAATTGTTGATGGGTTGGTAATGAATTGAGCTAATATCGCTCGTTTTATGGAATTGATAGGTTGGTGTTTTAAGATGTAGAGATCAGATTCGAAGATGTTGGTTATCACAAACCAAACTGGATAGGCAAGCAAAAGGATTATGCCTACAGTGTTGGATGCCCCGTTAGCCCTTGTGAAGGAATTCCTAAACCCTCCTGATGCTCGGATGTGTTCTCGGTTCAGCTTTAATTAGTTTAATTTTACAGTGTACCCCTTGTAACGAGGGGGGGGTGATATTTTGTTCTAAGAATTACTGGTGTCAAACTGTTAGCATTACTATATTAGATTATTTTTTTCATCTTACAAACAATGTTGACCAAAATTAGGGTTTCATTATTACATTATCGAATTATTGGTTTTCATTTCATCTCTGTTTTTTTCTCAATCTAAACGTAGGATGAAGTGAACACGGCCTTGTTTTCCTTTCGTTTTAATCAGTTTGAATTGGTTTTTTTTTTTGCAGTTCCAGCTTCATGGGAGGGACAGATGATTCAGCCTTTACTTGGTTACGAGAAGAGATGAGATGTAAGTTGGATCTGCTAAATCCTATATTTTTCAAAAAGAAAGAGATGCACCCCTGTATCTGTATTTTCCATTTTTAGTTTGCTAGCTTCATGTTGTAGGCCTGTGTTGGGAACTTATTGTGGCCGTTGTTTCCTCAAACACATCTTCTGTATACAGCCACATACTTTTGGTTAGTTATGTAACCTACAATGTGTTTCACTATGCATAATGGAATGAAGTTTGTTTGAGCATTTTATACTGGTGTCCCTCCTTTTTTTAGTTCCTACATGCCCTTGTATTGCTCATTTCCCCAAAGATCCTGGGGTTTTTGTTTACCTTCCGCTATTTAAAACTTGGAAATATGTTGGTGAATTCCATGTTAGATTACAGTGAATATGTTTTAGTACAGTTGGTTGAGCAGTCTGGACTCTTAGAAGTTATTGGATTCTTCTGCAGATACAAGCTACTCAATTGCCCCAATATCCTATTGCCTCAGGTATGAGTATGATTCTTCTTGGCTGCAACTTTTTCTAAATGCATACAAATCAAGTATGTAGACTTAAGTGAATCCCTGGTGCATAGAATTATGCTCTACACCAACTATGGCATCTTAGGTGAATCCAGAAACTCAAACGCACTTGGACACTAATTCTAATCTGCTGTAAGATTTAATGAATTTAACAATGTACTTAACTCTTACGTAAAGTTGCAGTAAGGTTTTGAGAATATACTTTGTTTTGGAAGTTTCTCAAGACCTTATATTTGTCTCATTAACATTGGCTTCTTTTTAATTAATGGGTTGATATCTTAATTTTAAGTTTCAACCGTTTAAGTGTGACTAATGCTCTGCAATGTTAGGGTTATCATTTGGTGTGCTCACCAATGCGGGATTTCTTGGACTGATTCTTGCATTTGGGATGCCTGTAAATTTGTTTACAAATTTACATTGGGGTTATTTATAATATGTATACATATATTTCTTTTGACCTGTAGTCATGTTTATCCAAGAAGTTTGTAACTGGGTCGGAGATTGAAGTATACAACATTAAGTGTTGTTCTTCAGGGTTTATTAAAACCCGACTTTCTTCGCTTCTATTTGTGAGTTGATTTCTGAAACCATCTTGCTCGTTTTATGCTCTCCTTTTCAGTTTATAAATATCCATGTACTCTGAAATTTGTTTATTAGCTCCTTTTTGGATGCATGAAGCAGGTGGTGCAACCCTCCCCTTCAGCTCATGTAGTAACGAGCAAAACTTCCCATTCTGGTCCTTCAGCGACAGGTATTGTGTCCATACTTATGATCAAATCTAAGCTTCCCCCACAATCTGACTGCATCAACACTTGATACTCTTCAGTTAATACATGATAGAACCGAAAAATGATGAAACGTGTGCTTTCACCAATTAAAAAAGTTGTTATCCTCTTAAGGCATCTTTTTGTTAGATGGAAAATAACTCAGGTTTGTCTTTTGAAAAAAGGAAATAAAAGAATTTGTGATCTTTTAATACACCTGTGAGGAGAAGAAATGATAAGATTCAATATATACACAAAATGAGCAACATTGCATCTGACAGGACTGTAATAGCATGGTCTGAAATGACTTTATTGAATGAGTGTTGCAGATCCCTACTCGCCTGTTGTGTTGCAGAACCCTACCCGCACTTTCTGAATTGGTGTTATTCATTTTCCCTGGTCAGTGGTCCATCTATTAGACTTGATGGGTAACTAGCTATGCTTGTTGTGTGTCTATGATGTTCCTCTCTTATGTATTGCTTCTAATAGATGTTTGTTCTCCATGGCCAACCATCAGTTGTATCGAGCCGGAGTAAACAGTTGAGAATGACTCAAGCCTTGTCACACAGTTCAGCCCATAGGTCATATAGTTTTCAAAACTTCCATTTATTAGTGCAAAATACAAATATCCTTAATAAACAAGACTACTGACATACCTTTTCAAACAATTCATCAAGCCATGAGAGTTTGGTAAAAAGGGGAGTACTTGTTTGATCTAGAAAAGGTGTATCTGTTTGAATGCTATGATTCACTTTTATATGAACTCCAGTCTATTTCCTCTTCTTCATTGTAATAAGACTTGGGAGGGCTTTGAAATTGGCGCTTATCTGGCTCTTGATCAACAACTCGTCCTTCTTCTTTCTGCTTGGAATTTGCAACATTGTCCTACAATTCCACCAACATGCCAAAAAGAGTAAGAACAACTCAAGTGGAAGAACATGTAAGATGCAATGTATGTAAAACTGAAACATGGTACACTACATACACGAGTGTTAAGAACTTCCTTTGGCCTTTCTTCCTCACCTATTATGCAAACTGAATCATCCTTATCCATCTTTGCATCTTGTGCAGCTTGTTCTTCCAGCCTCTTTATTACCAGCTCAAAATGTGAAAGATCTGCAGGCAAAATGGATTTCAAACCATCAGTGAGCTGAGATCAGATCAACAAGGAGCACACAAATTGACAAGGTCCGGGTTTTCTACTGTTGCCTTCTGTAACCTTTTTCTTGCACAATTTGACACACACTATTATCAAAATTCGCCTCTACTTTCCTTCTCTTAGACAAGGTACACCAATTTAATTTGGACATACAAAAGTAGGCAGCAAATTCTCAGAACTAGAGCCCAAGGAGTCAGAATCTATGTGCTGAAACAATTTCATGGAGTGTACAGAGAAATAGGTGCTTTAAATCCACACAAGAATCCTCCACTCTACTAAAGTCCTCTCCCAACGGGAAAACAATATAAATAGAGTTAACTAGAAGAAACATTTGAACTCTGACATATCCAAGGTACAAGAATTCTTAAGTGGAAAAATATCCCGTAATAGCATCTTTACACCTTTTCAGTGTATGTGTTTGAATGCTATAATCTAAAAAGGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATCTGTTAATGGCTTGAGAAGTGGCAGAATACGCACACTCATATAAACTGAGCACGCACAATTATACTTCGTATAAAGTAGATCGTTTAGATAAAATTCTGATTACTCCCCTTTTCTGTAATATCGCTTGTAAAATTATATTTCCTATGTTCTTTTTTAAAAATGACACAATTATTTAGCCGCGTTTGTCAATGGACGGTTTAAAACATTAATATCTCTCATTATGGATATGAAAAAATTATAAAAACTTGATATTCAAAAATATTTATGAAGACGAAACTAATAAGGCCCAACGATCATGTTTTTTCTTAAGTATAAATCACAAAAAGAAGTCAAATAAGCTTGTATGAATAGTGTCAAAAACCCATTGTGTCGTGTAAATGAGAACGGAGGAAGTATTACATTGCTTAAGAATGGAAAATATCATACAATTTTCACCCTTCAATACAAATCAGACATAGCTACAAAAATATCCATATAGACACATGCATTGATATAAACACATCCATAGATAGAAATCATTAGACGTTCTTGATGCTAGATTTTAAGCCTTTGTGACTTGAGCAGTTATGTAAAGTATTAACACTCGAGTATATTAGAGGTAAGATTTGAGCAACCCTACAACAGAATATCACTGTTGTTATTTAATTGGCAACTCAATTTTATATTCGTAACATTTACAGAATGATGAAAAAGAAATCACGACCGTGAACTCGTGAAGGAGATGCTACGTACCAAACATGTATCGGTCGAGGTAGGCCCAACAACTACAAGGAGGTGGCACTGGAGGATAACGTCGATAAGGCTTTGGAGGTTGCGGTCGAGAAGTGATCTTGATCAGTTTCAGCAATGTCTCGCTTTTATATGTGTAAAAGTTATTACAATAAGTATGTGTGAAAGCTAATTAGTACCAAAACTATGTATGATGGCGATATGCATGTATGCCTTTTGCAAGCATACCTTGTTTATATTGCATTTCTTAGTATTGTGAACTACCTTATGTGGTAGAGTTTTTTTTACGAGGAACAGGGAAGACCTGAAGTTTCACGTTCCTAGGAAATAATCATTGAACCTTTTGGATCACCTATGTATGAGGCAATCCTATGGAACCTACGTTATGTAAGTAAACTACTTCCTCCGTTCCGTAAATATCACACCATTTTGTTTTTTACATTATTCACACTACGACTTTGG

mRNA sequence

ATAAAAAAAAAACACTAGCATCCTACCCTTAAATTCCTTCATGATTTACGGCCCTGCCATTCCTTTTTCGTTGGCCAGCTGTCTTCGTTCTCCCTTCCCTGTCTTCGTCCTCTTGTGTCCTTCTGCTTCCCCTCCTCTGCAATGGCGTTACTTCATCTTCCATACTAATCTTTCTCGATTTTTCCTCTCCATCTTCTATTTATCCTCGTCAAATTTTATCAGCTCCTCTATCTTCTCTCTCTCCTTCGCTTATTTCCTATCAATAATCTCAATATCAACAAACCCTAAATCCCTAATTTTGGGATTTCAATGAACCAGAGGGATCACAAGATTCCAAATAGTGCCTTAAGGTGCCCACCCCTCTTTCTTTTTCTTCGTGTGGCCGATTTCCTTTCCTCGACATGTCGTTGATGCCTCCACCCTCCTCTTCATCGCGGTGGTCCCTCCGCCATCTTCTCTCCTACATATCTTCTTCGTTCTGCTGGTAAATGCGAGTATCCAACTTCATTTTAGTCCAATCTGTAGCTCTCCATCGTCATCTCTGGCAAGGTCTTCAAATAACACCTTCGAGGATTCCAATGCAAAGCCCATATTCAGACAATTAGTTGGCCTTGGAATCTTCCAAGATGTTATTGGAAATCTTGTTGAAAGATGCAACAATGGTGTTATTTGTTGAGAAGTAGGTTGGTGTTTTAAGATGTAGAGATCAGATTCGAAGATGTTGGTTATCACAAACCAAACTGGATAGGCAAGCAAAAGGATTATGCCTACAGTGTTGGATGCCCCGTTAGCCCTTGTGAAGGAATTCCTAAACCCTCCTGATGCTCGGATGTGTTCTCGGTTCAGCTTTAATTAGTTTAATTTTACAGTGTACCCCTTGTAACGAGGGGGGGGTGATATTTTGTTCTAAGAATTACTGGTGTCAAACTGTTAGCATTACTATATTAGATTATTTTTTTCATCTTACAAACAATGTTGACCAAAATTAGGGTTTCATTATTACATTATCGAATTATTGGTTTTCATTTCATCTCTGTTTTTTTCTCAATCTAAACGTAGGATGAAGTGAACACGGCCTTGTTTTCCTTTCGTTTTAATCAGTTTGAATTGGTTTTTTTTTTTGCAGTTCCAGCTTCATGGGAGGGACAGATGATTCAGCCTTTACTTGGTTACGAGAAGAGATGAGATATACAAGCTACTCAATTGCCCCAATATCCTATTGCCTCAGGACTGTAATAGCATGGTCTGAAATGACTTTATTGAATGAGTGTTGCAGATCCCTACTCGCCTGTTGTGTTGCAGAACCCTACCCGCACTTTCTGAATTGGTGTTATTCATTTTCCCTGATGTTTGTTCTCCATGGCCAACCATCAGTTGTATCGAGCCGGAGTAAACAGTTGAGAATGACTCAAGCCTTGTCACACAGTTCAGCCCATAGTCTATTTCCTCTTCTTCATTGTAATAAGACTTGGGAGGGCTTTGAAATTGGCGCTTATCTGGCTCTTGATCAACAACTCGTCCTTCTTCTTTCTGCTTGGAATTTGCAACATTGTCCTACAATTCCACCAACATGCCAAAAAGAGCAAAATGGATTTCAAACCATCAGTGAGCTGAGATCAGATCAACAAGGAGCACACAAATTGACAAGAATGATGAAAAAGAAATCACGACCGTGAACTCGTGAAGGAGATGCTACGTACCAAACATGTATCGGTCGAGGTAGGCCCAACAACTACAAGGAGGTGGCACTGGAGGATAACGTCGATAAGGCTTTGGAGGTTGCGGTCGAGAAGTGATCTTGATCAGTTTCAGCAATGTCTCGCTTTTATATGTGTAAAAGTTATTACAATAAGGAAGACCTGAAGTTTCACGTTCCTAGGAAATAATCATTGAACCTTTTGGATCACCTATGTATGAGGCAATCCTATGGAACCTACGTTATGTAAGTAAACTACTTCCTCCGTTCCGTAAATATCACACCATTTTGTTTTTTACATTATTCACACTACGACTTTGG

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGGGACAGATGATTCAGCCTTTACTTGGTTACGAGAAGAGATGAGATATACAAGCTACTCAATTGCCCCAATATCCTATTGCCTCAGGACTGTAATAGCATGGTCTGAAATGACTTTATTGAATGAGTGTTGCAGATCCCTACTCGCCTGTTGTGTTGCAGAACCCTACCCGCACTTTCTGAATTGGTGTTATTCATTTTCCCTGATGTTTGTTCTCCATGGCCAACCATCAGTTGTATCGAGCCGGAGTAAACAGTTGAGAATGACTCAAGCCTTGTCACACAGTTCAGCCCATAGTCTATTTCCTCTTCTTCATTGTAATAAGACTTGGGAGGGCTTTGAAATTGGCGCTTATCTGGCTCTTGATCAACAACTCGTCCTTCTTCTTTCTGCTTGGAATTTGCAACATTGTCCTACAATTCCACCAACATGCCAAAAAGAGCAAAATGGATTTCAAACCATCAGTGAGCTGAGATCAGATCAACAAGGAGCACACAAATTGACAAGAATGATGAAAAAGAAATCACGACCGTGA

Protein sequence

MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLRTVIAWSEMTLLNECCRSLLACCVAEPYPHFLNWCYSFSLMFVLHGQPSVVSSRSKQLRMTQALSHSSAHSLFPLLHCNKTWEGFEIGAYLALDQQLVLLLSAWNLQHCPTIPPTCQKEQNGFQTISELRSDQQGAHKLTRMMKKKSRP
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo14668.1Spo14668.1mRNA


Homology
[Close]
BLAST of Spo14668.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902205681|gb|KNA15235.1| (hypothetical protein SOVF_100010 [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 7.600e-9
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1  MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLR 32
          MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLR
Sbjct: 1  MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLR 31
[Close]
BLAST of Spo14668.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R6U8_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_100010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 5.300e-9
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1  MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLR 32
          MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLR
Sbjct: 1  MGGTDDSAFTWLREEMRYTSYSIAPISYCLR 31
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo14668.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|902205681|gb|KNA15235.1|7.6e-9100.hypothetical protein SOVF_1000... [more]
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BLAST of Spo14668.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0K9R6U8_SPIOL5.3e-9100.Uncharacterized protein OS=Spi... [more]
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BLAST of Spo14668.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo14668.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo097120.67Barchart | Table
Spo272970.65Barchart | Table