Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAACCATAAACACAATCCAAAACCATAACCCCCAAAAGAAAAGAAAAATCATTCCAAAAAATTCCCATTGGCTAATCCTCCTTTAGGTGGCGTTTTCCACCACCCACCACCTGTCACCGCCCCATAACCACTCTCTCACCACCCCATCAAAATTACCAAACCACCCTCCACCGCTAATCATAAATGCAAAGCCCATTAACAGTAAATGAGTCATGTCTGACTAACACTTCCACTAAACTCCTCCGATTACAAACTCCATCATATTTTGCATTTCTAAAATCAGCATCAAACCCCAGAAATTTGCGAAAAAGAGGAGAGAGAAAATTCAATCACACTAATCTCACCACCACCACCATAACTACTACTGTTAGGGCAATGCCTGCTACTTGTTCGACCTCCATTGAAGCAACTTCAGGTGGCAATCTTCGTAACTTTAAGCATACTGAAGCCTCTTTTCTCGCTTCTCTCATGCCAAAGCGAGAGATCGCCGCTGATAAGTTTCTTGATGCTCATCCTCACTTCGATGGCCGCGGCGTCCTCATTGCTATCTTCGGTACTACTGTCACTCCATTTTCTTTCAATTTTATGATTTCTTTATTGTTCGAATTTGTTTTTGTTAATGATGCATGAAGATCAGATAATCATACTACTTAATTAAATAATGATTGTTGATTTGGTCGGTTTTTTCAATTTTATGAGTTCTTTATTGTTTGAATTTGTTTTTGTTAATGATGCATGACGATCAGATTATAATACTAATTATTGATTAATGATTGTTGATTTGGTCGGTTTATTTTTTAATTTTCCAATTTCCAGTATTATACAATGATTTGTTCGATTTGCGATTTTATTTTTTTGGTTTCTTTTTGGTGAAATGATGATGTTATTGAACCTATGATTGCTGACACGCCGAATTGCGAAGTATAGGTTGTTATTAGAAAGTTACCATTTGATAAAGGAAAATAAGAGGCATCACACTGCTGATTTTATTACGATTTTTTTTTGTACTTTTATTATTATTAAGAAGTAGAAACTGGCATTCAGCTTAAGTATATTAGTACTCCGAATATTCAAGTGTGTTGCTAGAATTAGCATTTCGGGTGATGTATGCGGTTGGAACATGGAATAGTTGTGACATTGTGGCAACTCTCGCAATTAAGGATGTGATTTGACAAAGGAAAAGAAGTTGCATCATATTGCTAATTTATTACGATTCGAGAACCTTTTTTTTAATATTTTTTCTTTATATTAAGAAGTAAAACTAGCATTTAGCTTAAGTATATTATTAATTTTGGTGTATGAAAAGTTGAAAACTCCGATATTCAAGTGTGTTACTAGAATTAGCATTCTTTGTGAGGTATGCGGTTGGAACTTGGAATAGCTCTGACATTGTGGCAACCTCTGGCAATTAAGGATATGCCATGATTTTACTAAATAAACCTTTCGTTATAGTTAAACCAATGCCACAATATTCGGTTGGTCATTCAAGAGAAGCATAAAGACCAAAAAGAAGTATGATCAAGAATAAGAACTTGATAAAATCTGCCTAGTTAATCAAGATATTTTTGTTTCGGGTGTATATAACTTTTATTTATAACTTGCTTTCTTTTATTCTGTGTTATTCTTTAAGATGCTTTGTTCTCAATACTTTGTACATTCCTTTGCTTTTACTAACATTCCTTATTTTAATGTGCTAAACCTGACGAAAACTACTATATCCCCATGATCTTTCTACCACCTCCTCAAGCCAAATTCTTACATGCTCTCAAATGTCTATATACATTCAACTTCTAATCATCTAATGTTATACAACTTTATCAAAAAAAAATGTCACTCTGCATCTCGTGCATTCGAGCACTTATTTAGTGTCGGTGTGTCAAATTTAATTTGCCTGTTAGTAGCAAAGCATATGATCGTGCGACTTTTTGAGCAGTGTATAGGTCCGAGAAAGTATATCCCATCTTGGAGAGTTGACTCTCAGGGTGTCATAGACTCGTAGTATAAACTGTTACTACTTTCGAAAAGGTGGCAACTATTTTGACATCCCAAAGTAACATGTGACGATTATTTCTAGATGGAGTGACTATTGGTGAAGTTTATGGTGGTTGTTTATCACATGACATTTGTTGATGGCTTAATTATCCAATTGCGATGCTGATTGGGAAATTGTTAAATTATGTGTTTAAATTATGCTTATTGGTGTAGCCAGGAGTGAAGGAATCGGTTATAATAGATTTTTGTGCTTAATTATTTCAGTATTACTTATTGATATTGAATGGTTGTCTATAATTAGATTCGGGGGTGGATCCATCTGCGGCTGGTTTACAAGTAACTTCAGATGGGAAACCTAAAGTTCTGGATGTCCTTGACTGGTATATCTAAAATCTCTTAATGTGGTTTTTACTTTTTGCTCTTTGTGACTCTCTATTACGAAACTTTTTTGGATCAACTGGGAGATTAACGCAGTGGATAAGGGGGAAAGATTGACCAATGTTGAGTGCTATGAAGTTAGTTAATTAAAACATGTTTTGATCTTGTGGTGATTTCGTTCTTAAAAAGACACTTTGTGTATTCTTTTGGAATTTAGCTAATGAGTTGTACATTTCCGCTACATTTTCTCAGTACTGGTAGTGGGGATGTTGACACGTCCACTGTGGTGAAGGCTGATGCAGATGGCTGCATTTGTGGAGCTTCAGGTTGGTCATTTTGTATAGATGACTTGGATGTGTTGTGATACAATCAAATAGCTATTCTTAGTTTACAGTTGCATACATAAATTCATTTGTTCATTTATCTTATATTTCTGCTTTGGTTTAATATGTTGTATAAACATGTTTCATGCCTGGTGTATGTTTTCCATGTGTGCTTCTGTTTATTCATGTGCACTTGTGCGTTAGAAGAAATAATTCTTTCTGCTTTCCCATAGCATACACTAGCTCAACTTCTCTATGCGACATTTTCCTTGTGAATTGTTGATGGACAATGCATCCTTTTAATTGTTTGGATGGAACTTTATTGACGTCAAAGTTTTAGGGGTCATATGAAGAACAATATCCAAGATGTTTTGGTGCATTAGACATTGCACTTTGGTCATTTTAAATTGTGCAAGCACATGATCTTGTGTCATTTTCAAAACCTTGATGGAAAATATACAAACTAGATTTGTGATGCAATGATGTGAAATTTTTCTAGTGAATAGTTTTAAAACTACAACATCTGTGATTCTAGTTTCCACAACTAATGAATCTGTATCCTGTTCTAAATTTTATAGACATTTCATCACATCGTGGAGTGCTTTCCATCCTGCTGTTTTATATTATTTTGCATTATTCTAGTCACTATACATTTGCATCAGTCTGTGGTACCATGTGTGGAACCAGTCATGTTATCATTTCCCTTCCATCATATTTATCCAAAATTTTGTGGTTAAATTATCAATCATCTCTGCACTATGATTGGTTCAGTGCTACCATGACCTGTCCCACATACATCTTGGGTGCGTCATGAAGACTTTGGATTCAAGTAATCCTTTTTATGATGATATATTTGGTTTCTTTCTTTCGGATGCAAATATGAATAGGAGCACCGTTGGTTGTGAATTCTTCATGGAAGAATCCGTCCGGGGAGTGGCATGTCGGTTGTAAACTGGTTTACGAGCTATTTACTAAAGATTTGACATCCCGTCTGAAGGTATTGCCTAATTGGAACCTCTTTTTTTTGTTTCCTTGTGTCTGGTGGATATTTAATCTAGTTACGTTAAGAACTCTTCAGAGTATCCCTTCTGAAAACGTCTCTGTTATGGGCAGAAAGAGAGGAAGAAAATGTGGGATGAAAAGAATCAGGAAGCAATAGCTAAAGCTGTAAAGGATCTCTCAGAATTTGAACAGGTTCTTTTATGAGTCCTTCATTTTTGTATCTATATTGATGCTTAGTAGTTGTACCCCGCATATGTTTCTTTTTATCTTGGTTGGAGTGTAGAGGATCTTATTTTAAGTACGTCCGAAGATGATAAGCAGCTGTCCAATTGGCACTTCATATATGCCTCCACCCTCCTTCCCCAAAGAAATGAAAAATGAAAATTTTGCGTGGTACTACCTCCGTTTCATAAAGAAATTTACAGTTCTATTTGCACAAAGATTAAGACAAAAGTAGAAAAGTTGGTTGAATATAATAGAATATGAATAAAGTAAGAGAAATTTGTAAAAGGTAAGTAGGTGTAAGAAAAAAAATGAATAAAGTAAGGGAAAGTGAGTGGAAAATTGTAAATATGGTGGGGTAAGAATGGTAAGGTAGTAAATTTTCATGTCCAAAAATAGAATAAAGCAAAGTGTAAAGACCATATGAAACGGACTAAATCGGAAAGTGTAAAGATCATTTTGAAACGGAGGTAGTGTATGCCTAATTCCATGTTCTTAGTTTCTTTTTAAAAAAAAAAAATTTAAAATCAAATTTGAATTTCTTTCTTCATGATATTTATATTCAGAGACTGATTTTTCCATGCATTAGAAATCATGTAAGCAACTAAAACTGTAAAAAAATTAGCTCGACCATTACCCAGCCCTTGGGTAGTGGGTTGTCAACAAAAAATTATGACCAGAAAACCGAAATATCCGGACCTGAACAACCTGGAAAAATTGGGCCTAGTCCACCCCTCTCTGTTTTACCAATCTGACCAAGAAGGCAAGAACCGTCTATTTCTAGTATTGAGTGATTTGAGAACTTTACCTTCAGAGTTCAGATGTTATGTTGCTACTGCTGGGCTAAACAGGATTTAGGTAGGACATAGAAGTTAGAAATCATTTTATGATTATACTTTGCTATAAATGACTATTTTATTATAATGTGTTACTCGACACGTATATTTTGTACTTGTATGTTTTTGTTAAGATACGACTATACATATTGCACTGAAAATGGAAATTGAAATCTCTTAACCCATTGGGTCGACTTGGAAAGTCACCAACCTGAAATTCTCAAACCGGATCCGACCAACC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MQSPLTVNESCLTNTSTKLLRLQTPSYFAFLKSASNPRNLRKRGERKFNHTNLTTTTITTTVRAMPATCSTSIEATSGGNLRNFKHTEASFLASLMPKREIAADKFLDAHPHFDGRGVLIAIFDSGVDPSAAGLQVTSDGKPKVLDVLDCTGSGDVDTSTVVKADADGCICGASGAPLVVNSSWKNPSGEWHVGCKLVYELFTKDLTSRLKKERKKMWDEKNQEAIAKAVKDLSEFEQKHTKLEDPHLKRLREDLQSRVDFLQKGTNSYNDKGPVIDAVVWNDGELWRVALDTQSLEDEPGKGKLADFVPLTNYRTERKFGIFSKLDACSFVTNVYEEGNVLSIVTDCSPHGTHVAGIATAYHPQEPLLNGVAPGAQIISCKIGDARLGSMETGTGLTRALIAAVEHKCDLINMSYGEASLLPDYGRFVDLVNEAVDKHHLVFISSAGNEGPALSTVGAPGGTTSSIIGIGAYVSPAMAAGAHCVVEPPSEGLEYTWSSRGPTADGDLGVSVSAPGGAVAPVPTWTLQCRMLMNGTSMSSPCACGGVALLISGMKAEGVHVSPYSVRKAIENTCVPISSSPEERLTTGMGLMQVDRAFEYIRQSSDIPSVSYEVKVNLSGKSTPTYRGIYLREASACQQAAEWTVQVAPKFHEDASKLDDLVPFEECIELHSSDTTVVRAPEYLFLTHNGRSFNVIVDPTNLETGLHYFEVYGIDSKAPWRGPLFRIPVTITKPVAVINCPPVISFTGMQFCPGHIERRYIEVPLGATWVEATMRTSGFDTSRRFFVDSVQLSPLKRYMKTESVVTFSSPSAQNFSFAVEGGRTIEFAVAQFWSSGVGSQETTTVDFEIAFHGFKIKNEEIILGGSEAPTRIDVGSLLSSEKLFPSATLKKVRIPLRPVTTKLRALPTSRDKLPSGKQILSLTLTYKFKLEAGAEIKPYIPLLNNRVYDTKFESQFYVISDANKRVYASGDVYPEAASVPKGELTLQLYLRHDDVQLLEKMKTMVIFIERTLDNKEVIQLSFYSQPDGHVTGKGSFQSSILVPGSEEAFYVGPPSKEKLPKNCPEGSLLVGAISYGRVSFSGEKNGGDPEKNPVPYQIYYVVPPNQPVEDKKDLSVSASKTVAERIEEEVRDAKMKVLTSLKQSSDEEREEWKKLSESLKSEYSRYTPLLAKILEGLLSQTNIEDKCSHLEEVIDAADEVIDSIDRDELAKFLSQKTVPEDDEEEKTKKQMETTRDQLAEALYQKGVALSEIESLKAESVAADLASDQVGTPSDDSFEATYKELRKWADVKTAKYGTLSVIRERRCRRLGTALKVLNDMINDDEQPAKKKLYDLKLSLIEEIGWDHVATYERQWMHVRFPQSLPLF Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo04422.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902232870|gb|KNA22818.1| (hypothetical protein SOVF_030530 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 2576.6 bits (6677), Expect = 0.000e+0 Identity = 1302/1302 (100.00%), Postives = 1302/1302 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731322402|ref|XP_010671869.1| (PREDICTED: tripeptidyl-peptidase 2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 2375.1 bits (6154), Expect = 0.000e+0 Identity = 1202/1379 (87.16%), Postives = 1277/1379 (92.60%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870865315|gb|KMT16382.1| (hypothetical protein BVRB_3g055270 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 2343.9 bits (6073), Expect = 0.000e+0 Identity = 1172/1306 (89.74%), Postives = 1238/1306 (94.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731424105|ref|XP_010662738.1| (PREDICTED: tripeptidyl-peptidase 2 isoform X2 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1973.0 bits (5110), Expect = 0.000e+0 Identity = 983/1344 (73.14%), Postives = 1144/1344 (85.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731424103|ref|XP_010662737.1| (PREDICTED: tripeptidyl-peptidase 2 isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1971.8 bits (5107), Expect = 0.000e+0 Identity = 985/1345 (73.23%), Postives = 1147/1345 (85.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RTN4_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_030530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2576.6 bits (6677), Expect = 0.000e+0 Identity = 1302/1302 (100.00%), Postives = 1302/1302 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CRZ8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_3g055270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2343.9 bits (6073), Expect = 0.000e+0 Identity = 1172/1306 (89.74%), Postives = 1238/1306 (94.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6H6M8_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_16s0050g00490 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1973.0 bits (5110), Expect = 0.000e+0 Identity = 983/1344 (73.14%), Postives = 1144/1344 (85.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067EDP6_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g000645mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1951.8 bits (5055), Expect = 0.000e+0 Identity = 955/1314 (72.68%), Postives = 1129/1314 (85.92%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4U7H5_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10004167mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1948.7 bits (5047), Expect = 0.000e+0 Identity = 954/1312 (72.71%), Postives = 1126/1312 (85.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPPII_ARATH (Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=TPP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1817.7 bits (4707), Expect = 0.000e+0 Identity = 914/1367 (66.86%), Postives = 1105/1367 (80.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPPII_ORYSJ (Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=TPP2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1770.7 bits (4585), Expect = 0.000e+0 Identity = 868/1306 (66.46%), Postives = 1052/1306 (80.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPP2_HUMAN (Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Homo sapiens GN=TPP2 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 830.1 bits (2143), Expect = 3.500e-239 Identity = 496/1289 (38.48%), Postives = 735/1289 (57.02%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPP2_RAT (Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Rattus norvegicus GN=Tpp2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 826.6 bits (2134), Expect = 3.900e-238 Identity = 494/1285 (38.44%), Postives = 730/1285 (56.81%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TPP2_MOUSE (Tripeptidyl-peptidase 2 OS=Mus musculus GN=Tpp2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 824.3 bits (2128), Expect = 1.900e-237 Identity = 493/1291 (38.19%), Postives = 730/1291 (56.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04422.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G20850.1 (tripeptidyl peptidase ii) HSP 1 Score: 1817.7 bits (4707), Expect = 0.000e+0 Identity = 914/1367 (66.86%), Postives = 1105/1367 (80.83%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04422.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo04422.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo04422.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo04422.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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