Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCCAACTTTGCAGGGCAACAGCAACCTTCCGGTGTCAACATATCTGACTATGTTCTCAACATGCCCGGCTTTGTAAGCCAAGGCCAAACTCAGCCTACTACTGGCAGTCCTGTTATGAACAACATAACATCGGATTTTGTGGAGCAACAACAGCGTCAATCTCCTGATTCTATTATAAGTGGTGGTACGCGCAATTTCTTGGCCCAACAAACCCAAACTGCTTCTCCCAACTCGAGCTACAATTTAACTAATTATCAACAAACTCAAACTGTTTCTCCCAACTCGAGCTACAACATGGACATGAACTCGACTCCTCCCGAGGAAACACCGATGTCCAACTACTTCAACACCAACTCCACCCAAGTTGCTGGAAATCAGGGATACTACAGTTCTTCTAGCTCAAATGATGTTCAGCGTGCTCAGGTTTGTTTTGCAACCATGTTCAACATCAATATCTAATCTACTATCTATTACTTCTATTACATTATACTAAAACAAACACCAGGAATGACACATATCCCGCCAAGAAACCTCTTTCATAATTCCCATATAATTTGCTATTTGCTCGTTTTCCTCGAGCCTTTTGCACTAATAATTCTACATAATGTGATAATATTTGTAGGGAATGCAGGGCTATGGGTTCGTAAGTGGATCATCCGGTCAACTCGAAGATTGGACGACAACACCATCTAATGCTTTTGGTGATTACTCCATGGTACATAAACTTCTTCAATATAATCTTCATTTTCCACTTGCATTTCTCATCCAAAATGCTTTACATACCACTAACTTAGGAGCGTGTTGGGGAAAATTAGAGGCTTTGACCAAAATCAGCGGTTTGACATGTGTAACTTCTAGTTTAAGTGTGTGGTTAGAACTTAGAAGAGGTCTGTGACAGCTTTTTGGCACCAAACCAGTGATTCTCCAAAAGCTCATTTTAGCAGCATTTTGGGAAGAGGGGTTTGAGTGAAAATTATCCATCCAATGTTACCTAATCCCCTAATCACCCCAAGAACAATGAACCAAAAAAGGCAATTATAAACATGAAAAATGGTGCATTTTTCTGTCTAATTTAGCAAATTAGAAAGCAAATTACGAACTTATACCCGATCTCATACTAGCGAATCAGGTAAACAGTGTTTTGGACTACTCTACCTTCCTCATCTATATTACACAATTAGCAGCAAAAAGAAACCCAAACAGAACCCAGAAAATACCATAATTCAATTGAAGAACAAAAATCTAAAAGTTAATGCAAAATTATGAAAAAGAATGTAAATTCACAGAAATTAGAGTCTGATTTGTGAATTGAACATGAATAATTGAAAGAAAAAAGGGATAATACCTGAATTAAACTTCAATCCTCTCTGATGTTGGATGTTTAGATCCCATGAAATTTGAGTTTTAGATCTTGTGAGAAAGTGTAAATCATCTCCACAACAATAAATTAAACACAAATTTAATAAGATCTAGTGTTTCTAATTGGGAATTAGAGAGTAGTCAAATGGCAGGAGCTTCAAAGAATTGTTCCAGGAAATCCAGTAGGGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGGGGGTGTGTGTGTTTGGTTTTCTAATCTTTCTCGTTAAATGTAGGATGGTAAAATGTTGACTAGTTTGACCGATATCCGACAAAAATCGAAGTAACACTGGAAAAATTGTACATTTAAGTTGTAAGGGCGCAAATACAATGACGTCACACAAAACACGTTTGGAACCGAAGTGGTTAGACCAGACTCATAACGGATCGATGACCTGATTTGACAGAGCAAAACGCTCAACCTTAAAGATTGTCCAATGTGCTATTCAGGATTTGTTTTTCTTTGTTGCGGAGTATCGTGTATTCATGTTCGTGTTGTTCATTTTAAACTATCAACTATACCAGACACTTTTTAAGCTATAATTAATTATTAGCAAGATTAAGTTCTCATGATATATATCGTTATCTATATTTTGCAGGATACTCGTCCTGAGAATGTTGATGCCTACTTCTCAAACATAGATCCTCATAATGGTGGCAATGGTGCAGATTTGGGAGACTATTGAGGATTCATATGTTTCTCATCTATGCCTAATTAAAATAAAGCAAAAAACTATTTGCTATTTCTTTTATGTTAAATGTTGAACTTCCCATTAAAATGGACTAACAATATGAATTTTGGACTAGTTTTCAAAATTAATTTGAAGTTTAGATAATTTTGGAATATAATCTTACAGTTGTATAGGAATTTTCCAAATAATATTTTAAAAAGCTGGTGCATAAGTGGAAAATTTCTATGGAACTTGAGACTATTCCGTAATGTTAAGAACTTCATATTAATTTTTGTTCAAAAAAGTCCAAAATTCAATTAGTTTTAGTCCATTTTTCTTTAATAATTCTGTTAAACATTGGATATGGTTGAATCTGATTTGTACTTTAAAATTCGGTAATCAAGGATTTTATGTTGAATTGGATGATTTTTCTACTTGCATATGAAATTAGGAGGTATACATATCTTCCAATATTTGAATTGCATGGATATCAGGTGATGGCCTTGCAGAAGAAGTTCTGCAAAAATCAATTAAAAGAGGTATGTAAGTGATTATAACAAGTTGAGTTAAGTTCGAGTCCGGATAACTCAACTTAGTCTGTAACACTTGACTAGTTGACTCGACTTAAGTCAAGTTTTACGATCTCGTCTAATTGTGTTTCTACACAGTTAAATACAAGTAATAAACAATATTTAAAAAATTTACTTAAAATTAGTTTTAACATGTTTAATGTTTGTGTATATTGAATTGAGTTTAAATATAATCAATTTATGACAACTCAAGCCGAGCTTTAGTATGAGCTATTTGAGAATCAAAATTCAATCTCATATATTTATTGTAAAAATTGTTGAAAAAACCTAAGATTGTGTAAATTGTTTAACTACTCAAGATTCAATCACCTAATTAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAATCAAGATTCAATCACATATCCTCCAATATCCACACACCAAAATTCAAATTCGAAGTAGCTCTTTCTTTCTACACTGGAATACATTTCAAAATTACTTTTATACATATTAAAAAAAGTTTAGTTTATTTAAATTTAGCTATAATTACAGTGAAAATGTAAGTTAGCATAATGGAGACATCTTTTTATTTATTTTTCTCGTTAAAGGAATGAGAATTTTGCTGCTCATCACCTTGTTAGACAATACAATTTGGAGTAGAATAATTGTGGGAGAATCACTATCATAGTACCATGCAATGTTTAACATAATGTAGGTTAACATAATATTGTAAACTAAATAGTCTGATTAAATCATGTTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATATGTTTAAGTCGATACCATAAACTAGTACTCCAAAACAAACTAACAATTACGGAAGAATTGTAATATACGGAAACTAACAACCGATTGTATCATACATGATTATCCGAGGACAGTAGTACACAGTATCCTGCAAGAAAGAACAACATGGAAACTTCGCTGTCCCAATTTCTATTTTGTACCCAACAACTTTTTCTCTTTGTCCAAATCCCCCATCATTTTTTTACACAAATAAATAATTCCAAAATCTTGACTTTCTCACTTCATCTTCTTACTCACTCTGATAGAGACTGTTAAAAACACTGTGAAAACCCAGAAAAAAGCCCCATTATTGAGAAATATCTCAATTATTATTTGTTGTAATCTGCTGATTTTTTGTGGTCTACATATCATCAACCCCATCTTTCCCAATTTTTTGCCCAAAATCCCTCCAAAATTCATCAGGTATATTCCCCTAATCTCTCTCTCTTTTTTTTTTCTTCAATTTCTTGCATAATTTGATTTGCTACTTTACTAATTAGGATCTAAAAGATTTCATTTCTGTTTTGTTAATTACTTCACATTTGTCTGTATTACAGGAAATTTAAAGCTTTTTTTTTCCTAAAGTTATACTCTTTTTAATGTTTTTGAGTTGATTATGATGTAATCTTGTTGCGTGATGGGTTAATTTTAGTGGGGAATGGTCATTTTGTTCTGTTAATTACTTCACATTGTTTCTAGTACAGGAAATTTAATCCCTTGTTTTTATTTTTTATTGGTAAAGGTATAATCTTTTTAATGATTTGAGTTGATTATGATGTAATCTTGTTGCGTGATGGGTTAATTTTAGTGGGTAATTGTCATTTTCAGTTAATAAATATTAATTATATCAATGTTTTTTGACAAAGTCAGAAGCATACATGTGTAAATTACTACTAATTTAGTTGTTTTATGGAAGACAAGCTTCTTAGAAAAGACCATAATTGTTGGAGGAAATTGTACTTTAGGGTTGACCTAATGTTTGATTAACTACTGCAGTACAATTTTAAGGTTGTAGTAGTAAGTTGTTGGCTGTTTCTTAGTTGACTGACTTTAGTAATTTCAAAAATATTCCATGGAATTTCCATTTGTGTGATGCTAAGAGGATTATTATTCAATTTGGAAATGTTGAATGATTAGGATTTAATGATTTATCTAGGTTATTTGCACTTCTGCCTCGTTGCCGCGTTCATAGGCATGGAAATATCTACAATGTAAATTCTATATCTTTTTCTGTCTTTGTCAATTTGAGGTGAGGTGTGTAGTAATTTGGAAAATTTGTCGGAATTCTTTGCTGAAATGGCTTGATTAGAGAAGAAATTCAAATTAGTAAGGACTAATATGTCTATAAATACACCAAACTTTTAACTAGGTTCTTTCCTCCTTTTTTTCACTTGCTCATTAATCTTTCTTTTTGAAATCATGTTTTAATATTGATCAGATTCTGATTAGTTGTGAAGAAGGGAGATCTTTAGACGGGTTTATGCGGGTCCTTCATTAAGGTCATAATCATCTTTCATATCTGCTAATTTATGTGCAATGCATTCGGTTATTCCTTTTCCCTATCAAGGAAAGGAAACACCCTTCCTTTTTCATTTAGGATTGAGATTAGGACATTCATCATTCTGAATTTCTGATGATCTTGTATACTATTATGTTCTGGATTTCATTACTTGTACTCATTAATATTCAATTATTCAGTATTAATCAGTAAGATACCATCCTTCTATTGTTCTGAGGTGATTAAAAATCTGATCAAAAAGGATTTTTTCTGGATTTCAGATTTAAAGTCACTATTTGGTTTGAGGTGCTGATACATACTGTTCTGCCTCTGTTGATGGTTTCAATCCCAACTCAGTTTATAGAACTGAGGTGCTTTCAATTGTTGATTAAAAGTGAAATTTTCCTGGACTTCAGATAAAAAGGTAACTTTGGGTTTGAGGTAATTGTTGGGGTGTTGATACTACTCTTCTTTGCTCTTGTCTTTCTCGGTTTTTATTTCTTTGGTATACCCGAGTAACTTTTTGTAAATTCCATCATGGTAATCTTGTGCAGGAACGATTCCCGAGGAATTGAGATTTTGTGGTGGATATTGTCAAAGCAGTGCTTTCTTTCGCAGGTATCATTTTTCTCGCTTCCTTTTGAATATCAGATTTTAAATCAATGTTCTTCAAGCTACTCCTGCCTGTTTGTGCCATTTGATTCAATATATTTGATTAATTGTTAAGTAGTGAGGAGGATTATCAGAAAACATTAACGGCCTGTTTGGTAGCCGGTAATAAACAGTGGTAATGAGAATAAATCATAGTGTAATTTGGCAAGAAATTAACATCATGATGTCCATGGTAATGAAATTTTGTCTCAAATTTGGTGTTTTTCTTCATAAATTTGCATTTACACCTAATACCACTCCCCAAATGGTAATGGAAATTTATAAAGAAAAGAGATAATTTTGAGTGAATTAGCATTACCATGGGAATATATATCGACTTTCCTTACAAATTTACATACAAATTCATTCCCATTGACACCATTTATGGCCGGCTACCAAACGGGCCGTAAGGGTTCTTGAACTGACCTTTAATTAACCAAATTTATCAAGGACTAA ATGTCCAACTTTGCAGGGCAACAGCAACCTTCCGGTGTCAACATATCTGACTATGTTCTCAACATGCCCGGCTTTGTAAGCCAAGGCCAAACTCAGCCTACTACTGGCAGTCCTGTTATGAACAACATAACATCGGATTTTGTGGAGCAACAACAGCGTCAATCTCCTGATTCTATTATAAGTGGTGGTACGCGCAATTTCTTGGCCCAACAAACCCAAACTGCTTCTCCCAACTCGAGCTACAATTTAACTAATTATCAACAAACTCAAACTGTTTCTCCCAACTCGAGCTACAACATGGACATGAACTCGACTCCTCCCGAGGAAACACCGATGTCCAACTACTTCAACACCAACTCCACCCAAGTTGCTGGAAATCAGGGATACTACAGTTCTTCTAGCTCAAATGATGTTCAGCGTGCTCAGGGAATGCAGGGCTATGGGTTCGTAAGTGGATCATCCGGTCAACTCGAAGATTGGACGACAACACCATCTAATGCTTTTGGTGATTACTCCATGGATACTCGTCCTGAGAATGTTGATGCCTACTTCTCAAACATAGATCCTCATAATGGTGGCAATGGTGATGGCCTTGCAGAAGAAGTTCTGCAAAAATCAATTAAAAGAGGATTTAATGATTTATCTAGGTTATTTGCACTTCTGCCTCGTTGCCGCGTTCATAGGCATGGAAATATCTACAATATTCTGATTAGTTGTGAAGAAGGGAGATCTTTAGACGGGTTTATGCGGATAAAAAGGAACGATTCCCGAGGAATTGAGATTTTGTGGTGGATATTGTCAAAGCAGTGCTTTCTTTCGCAGGACTAA ATGTCCAACTTTGCAGGGCAACAGCAACCTTCCGGTGTCAACATATCTGACTATGTTCTCAACATGCCCGGCTTTGTAAGCCAAGGCCAAACTCAGCCTACTACTGGCAGTCCTGTTATGAACAACATAACATCGGATTTTGTGGAGCAACAACAGCGTCAATCTCCTGATTCTATTATAAGTGGTGGTACGCGCAATTTCTTGGCCCAACAAACCCAAACTGCTTCTCCCAACTCGAGCTACAATTTAACTAATTATCAACAAACTCAAACTGTTTCTCCCAACTCGAGCTACAACATGGACATGAACTCGACTCCTCCCGAGGAAACACCGATGTCCAACTACTTCAACACCAACTCCACCCAAGTTGCTGGAAATCAGGGATACTACAGTTCTTCTAGCTCAAATGATGTTCAGCGTGCTCAGGGAATGCAGGGCTATGGGTTCGTAAGTGGATCATCCGGTCAACTCGAAGATTGGACGACAACACCATCTAATGCTTTTGGTGATTACTCCATGGATACTCGTCCTGAGAATGTTGATGCCTACTTCTCAAACATAGATCCTCATAATGGTGGCAATGGTGATGGCCTTGCAGAAGAAGTTCTGCAAAAATCAATTAAAAGAGGATTTAATGATTTATCTAGGTTATTTGCACTTCTGCCTCGTTGCCGCGTTCATAGGCATGGAAATATCTACAATATTCTGATTAGTTGTGAAGAAGGGAGATCTTTAGACGGGTTTATGCGGATAAAAAGGAACGATTCCCGAGGAATTGAGATTTTGTGGTGGATATTGTCAAAGCAGTGCTTTCTTTCGCAGGACTAA MSNFAGQQQPSGVNISDYVLNMPGFVSQGQTQPTTGSPVMNNITSDFVEQQQRQSPDSIISGGTRNFLAQQTQTASPNSSYNLTNYQQTQTVSPNSSYNMDMNSTPPEETPMSNYFNTNSTQVAGNQGYYSSSSSNDVQRAQGMQGYGFVSGSSGQLEDWTTTPSNAFGDYSMDTRPENVDAYFSNIDPHNGGNGDGLAEEVLQKSIKRGFNDLSRLFALLPRCRVHRHGNIYNILISCEEGRSLDGFMRIKRNDSRGIEILWWILSKQCFLSQD Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo12954.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902212799|gb|KNA17097.1| (hypothetical protein SOVF_083350 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 1.300e-79 Identity = 165/200 (82.50%), Postives = 166/200 (83.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12954.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902212798|gb|KNA17096.1| (hypothetical protein SOVF_083350 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 1.300e-79 Identity = 165/200 (82.50%), Postives = 166/200 (83.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12954.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RC74_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_083350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 8.900e-80 Identity = 165/200 (82.50%), Postives = 166/200 (83.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12954.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RE33_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_083350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.1 bits (780), Expect = 8.900e-80 Identity = 165/200 (82.50%), Postives = 166/200 (83.00%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo12954.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 2
BLAST of Spo12954.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 2
BLAST of Spo12954.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo12954.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
|