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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATAAGGTATATGTTTGAGTATTAAACCCATGGGTTTAGAATCAACGATACATAGAAACTCATACCTTATTCCACCTGTTTGATAAAATGAATTTAGAATTTAATCATACCGATAATATACTCTTGTACTCCTCATTCCCATCTTCTTTTTTTCTACACCTTCCTCTCCTCCTTCTGCTTAAAAATATAAGAAAAAAAAAACTAAAATTCAATAAAATATAAAAGGCAGACATTATATTTTGATATATGGCACCATCTCCACCACCACAATCGCTCGCTTTGCTTTAGCTCTAACCATCACATCCTTCTGTCACTGGACAAAATTTGATTTTTGGTGGTTTTTTTTTTTTTTACAATTGAAGCTACAAATCTAGACTTCAATGTCCAAATTTCGACAACTAACATTATATCTAGGTATTTTATTGAAAGATATGTTTAGTTAAATTATTTTTCAGTATTCTAATTTCGTCCTTTTGGGTTCTTACGGGGTGCTGATGGTGACGTTAGGTAGCATTGGCGATTTGATGGCTAATCAATGGGGTAGTAACTTTGTAGTGTAAGTTTTAGTGGTATTGATTTTTTTGGTAAGTTTGGCGGCGACGGTGGTGGAGTAACATTAGCTAGGCTGTCATAGTGTTGGTTTGCTCGAGTTTGCAGTGTCGATTTTATTTTCAGTTAAGATGATTCCATATCAAAAGTTCTTGCGCGCACAAGGTGTACAATAAATTTATTGTACACCAAGATAACTTTTACCTATTTTTTTGTAACTTTAACTTAGTTTTGATTAACTTTTATATTAGTAAAAAAAAGTTGATAGATAAATATTTTAAAGAGTTCAATGATTAATTTTATACATTATTAGTGATTTTGAAGAAATGAGTTTTATTAAAATGAAAAAAATTATCACTAAAAAATAGATAACTTTTACATATATAAGCTTAACTTTTACGCATTTTTAGTTAACTTTTACTCCGGTGTACAATATTTATTGTACAACCCTTGTAAATAAGAATTTGTGATTCCATATACCCACCTTCCCTTGGGTATGATAACTCGATATCAGAGGGGTTTTGGAGGTGGGTCCCAAAGTATTAAATTTTATAAAAATAGTTAACCAAACATCAAATATAGGGTTGGATAATTTCAAACCCATACCTGATTCCGAAATATGATAAACCAAATACACCCTTAATGATTTAATTCCATTTGTCTGCTTGGGCCAGGCCCAAATTTGTAGCACGGTTTCGGATATAGGCTATGCAAGTATGAAATACAGAGTAACTGATATCTTCTTCAACCTAATTTCAGTTTTCTGGCAGAAAAACTTTCATACAATTAGCAAGTTTGCTTGGGAAACGTGAATATTAGATTGAAATCTCGTTTCCCATTCGTTTCCGGGATGAATTCAGTTTCAAACACGTCTCTATTTTTCTGAAACGGTTTTGGCGCGTTCCGAAACGCGTTTCCCGGTTTCCCCCGTTCCAGGACGTTTCGGAAACGGTACGTCGTGATTTTTTTGGCGTTTCCGTGCACCGTAGATAGTATGTTGCAAATTTCAGAATGAAGGAAAAAAAAACAAGGAATTATTAAGTTTTAAGTATTACTGAGTATTAAATTGTAATGTGAAATTTGAGACATTAGAATGATTTTTTGTGAATGATTTTTTGGAGATGTTAATTTTTTTAATAGTTGTGGTCAAACGGGTCGGTACTCGATAGTTCCCGACCAATCTTCCATTATTATAATACTGGGTCCCAGTGGATGGATGCTGAGATCAAGGTTTTGATGTAGAAGTAGATGCCATTTAGATTAGCTTGAGGACTTGGAATTCTGTTTTTCAGTTTGGTTTTGGCTGAAGAAAATGAAAAACTCTTTTTATTGAATGTATGAGTTTACCTCAGCGCCTGATATGTGTTTTATGACTTTTATCTGTGTGCTCATAGCTCAAAATAATGTTGTGTGTTTTTTCTGTTTGCTCATATTTAGAGTTGGAGATTGTTAAATGAGCATATTAAACATGTCATTTTCATCTCAAAGCCTAATTAAAATTTTGATGTGGGAGGTTTCAGGAACTTATGAAATCCTTATTAAATTTTTAAAAAAAGTTGACGTAAAAGCTCGAGCTTATCTCTTTCATTACATCTTTGCAAAACCAGGAATTAATAAGGTGGGTCACATGATGGAAGCAATTGAAGGTGATTATGTGCATACATCAGACGGAGTTGATATTTCAGATGCAAATAGAGACTTTGACAAAAAAGAGAGACCAATCCATCTAGCAAAAAGTAATCAACCTCTAAGGGGAAGGAGATCTTTCAAGAGAGTAGCAATGTTATTGACCATACCTTCTTATACCCTGAGGGTAGGTTCAATGAATGTATACCGTGAAAATCGCATGAGGTTGCAGTACCTCCTCCGTAAGCTTGTGGTACAACATAATTGGGTGGACGCTAGTGGAGTGCTAAGTGCATTGTTAAAAGGGACTTGCAGAGAAACAACACCTCAGAACAACCGTATCAAGTATTGGGTATGCATTTAAAATAACTTTTAGTTTCCATTATCCTGTTCTCTTCTGTACTAGTATGGCTTGACTAATGACTATCGGTGCTAATTGGGAGTAAGATATCTGACAGAGGTGGCCATTCAGCTCTTGTGACTTGCCATTTCTGGATAATTTTATGTTTTGGCTTGAACTATCTTTTTTTTCAAAAAACACATACCTGTATTGCTGCCTTTTGGATTTCAAATGATCACATTTTTTGTGACATAGCAGTCTCTCTCGCATGTAAAATCTTTGTTAAATAATGACTCAGAAATTCCTCAGAAATCCCACAAATTAAGTAAACCATGAGCAGTGGCTTCTGAACATTTGATAGTAGGAATTAGTTTACAAAGAACCAATGAATGTGGTGGCTTTAGTGGCGGTATTGTTGGGTGATGTGTTTTAGACCAAGGCATTGAAATCTTGAAAAGAACGCAGGCCTGAAATACCCTCTATTTGTACTTAAGAAATGTGGGAAATTTGCTTTTCTAATGAAAATGTATTGTACCGTAAATAACCATGTGATGTGACTAATAGATTCATGAAAGTTTCGTTCTTTGTAGGATGAAATGGAACATTATAATAAGATACAAACAATCATATCCTAGAACTACCTATTAATTTCATAACAAACATCCTTTTTCTCTTCTAGTTCCTCTTGCCCTTCCACCTTTCCCTCCTACCATTCCTATTTATCCGGGGGTCTTTATGTACTGGAATAAACTAGAATTTGGGAAGAAAATTAGAGAAGGAAGAAGAAGAATTTTAATTGAATAACTAGAAAATCATAGAAACAAAAGGATGTCCAAGCTTTTGACGGGCTTGATGCTCTCCCAACTATTAATAAAGGTCGTACCCAATGCAAAATCTCTAGCTATTTAGAGCATGGTCTGCGGAAGTTCTAAATCTAAGCAACCTTACCCTTATAAAGAGGTTGTTTCCAAGGATCATCGAACCTATGATCTAGCGATAGCAAGTAGACACTTGACCAAGGCACCACCTTGCTCTCCCAACTGTTAAGGGTAAATAAAACTTGTAATTTTCTTCATAATTTGTCTCCCTCTGAAGTCTGAACTCCTCTGTTCATAGTATATGATTCCATTCTCACTATTTTCCATCTTCTTTTTGCACAGGAAATCCTTAACTGAAATATAACGACCATAACCAAATTTGCCAATCCTATATGTCCTATGGACGGTATCTTTAACTTGCAACCCCTATTATTCTCATATTTGTTTATACTTTATTTTTTCTTGCATTGGTTTTAATCTGTCTCTTTTGTTAACTATACTATTTGTATTTTTTGATTTATGCTCCATATAGGTTGTTGTATTGCTTTTATTTTTAATGCTTGCATTCTTCTTCTACTTTTTCCTTCCATTACTTCTCTTGGAAATATTAATCCTCGGGTTTCATAGTGACTACTGTTCAGCTAGTTTAAATCTTCTACAGGGAGGTCTATATAGTACTCTTTAACTCTTTAACCATAGCTTTTGTTGGCAAAAGGTGTTATTCCTTGTGTTATAGACTCCAGATAATATAATTGTTCACTGCTAATATAATACATCTTCGTTCTTTTACAGTTGATACAGTTTGACTGTTGACACTATTCATATAATATACTAAGAAAAAATATAGTCATGTGGGGTTTTGTTATAATCGTCTCATTGTATAGAACTTATTATAACTTCCGCATCGCTTTTTATTTTTTACTTAGAAATTATGAAATCTAAATCTAAGAATAATCAACTTTTTATAATTTTTACTCATTGTTAATTAAAGATATTAATGATTGAAATAATATACAAACGTGATAAAATAAATTTGTCAACTAAAATAGAACGAAAGCACTATGCAACTTCTTTGACAAGCATTCTATATCTTTGTTATCTTAGGTCGCAATGGAGCTTCTTCGACATATGAAATGTGATCCAGACTCATCAAGGATTGAGCACTTGTACGATACGTGGAAGGAAAAGATAAAGTCTGCCAAGAAGCAGCCATTGAAGGTATAGATTTAAATCATGTCATATAAAGTGTGAAGAGTGAAATAAGACACCTTTAAAAAATCACTTAACCTATTCTAATTTCTCTTAGAGCATCACCAATGGTGAGCCTCTAATTGAGGCTCAAAATTCTTTCATAAGCTGTTCTATTTCTCCAATGGTTAGTCATAATAACTTTTTGAAGAAGTTCACACCGTGTTACTTGCAATTCATTACATTTATCCGTTACAAGCCGCTTTCGCGACAATGCCACCGTTACCGGGATCAAAACCACATCCGCGATTTTTTCCATTCTGGCGTAATACAGAAGCATTTTTAAAAGATTGAAATTTGCACTCTTGCTTTTTGAAGAATTTTGTATAGCTTGGTATTTAATTGGTTTTCTTTTTTTTACTTTTTATTTTACTTTTAGGAAAGGTATTAATTGGTTTTGAGCTCTACAA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ATGTATAAGTTTCAAACACGTCTCTATTTTTCTGAAACGGTTTTGGCGCGTTCCGAAACGCGTTTCCCGGTTTCCCCCGTTCCAGGACGTTTCGGAAACGGAATTAATAAGGTGGGTCACATGATGGAAGCAATTGAAGGTGATTATGTGCATACATCAGACGGAGTTGATATTTCAGATGCAAATAGAGACTTTGACAAAAAAGAGAGACCAATCCATCTAGCAAAAAGTAATCAACCTCTAAGGGGAAGGAGATCTTTCAAGAGAGTAGCAATGTTATTGACCATACCTTCTTATACCCTGAGGGTAGGTTCAATGAATGTATACCGTGAAAATCGCATGAGGTTGCAGTACCTCCTCCGTAAGCTTGTGGTACAACATAATTGGGTGGACGCTAGTGGAGTGCTAAGTGCATTGTTAAAAGGGACTTGCAGAGAAACAACACCTCAGAACAACCGTATCAAGTATTGGGTCGCAATGGAGCTTCTTCGACATATGAAATGTGATCCAGACTCATCAAGGATTGAGCACTTGTACGATACGTGGAAGGAAAAGATAAAGTCTGCCAAGAAGCAGCCATTGAAGGACAGGTCCGTTCTGTTGGAGTACATACTTTTATGTCTTGCACGAAATAACCATGACTTTGCCCGTGTTAATTTGCACAGTCTTCAGCAGGAATATGAATCCGCAAGAGACCAAAAGTCTAATCTGGTAATAGGTTTGACCAATTATGAGTTGTGGTATTCCGAGCTACCAAATGAGATGCGGCTGGGAAACGTAGAAGAGTCTTGCATGCCTATGGAGTCGGAGACAATGAAAACCAACTCCTCTGAGGAAATAGATAACCTGAAGGGAGAGGAAGCAGCCAGTGTTTATGAGACATTTTCAAACTTGCACTATTTTTCAGAGACATCTGTTGTGAATGACAAGGACACTTGTGCAAATGCCAATATAAAGCTAGATGGGGAAGTATCTGGGATAAAGCCAGTTGAGAATATCAAGAAATCCCAGTCACGAGATTTTTATATGAAATCTGAAGAGTTAAGTGTAGAAATTGATAGCTCAAGTCAACATGGTTATGATCAATTTCATTGTTCTTCTGCCTATAATGTACACAGCATGCAATCATTGTTGCCCGTAAGAGTGCCTTCTTCAGATAATTTTATGGACATCCTTTCTTCTCGTAGACAGCTTTTTGGTGATCATTACAAGGAAGCTTTAAAGTTTCTAAAGCTTACTCTTCAGTCCCCGCCTCCAATCTCAGAGGCAGCATTACTTCCTTCAGTACAGTTGTTGCTCCTTGGTGGCCATGGTAAGGAAGCCTTAGCTATTGTTGAGCAGTCATGCAATGAGTCAAGCTCAGTTCTTTCTTTTAGATTAAAAGCTCGTCTTTGGGAGTGCTTTGATGCGAATAATTATGATGAACTCTTTGCATGTTTTGAGGATGTTATGAAGAAGGATCCCACATGTAGGCGTTCTCTAGCAAGACTCATGGCCTTGCATCAAAAAGGAGAATATGCTACTGAGCGTCTAGTGGAGATGATTGCTCTTCACTTGGAAGCAACATATGGAGATCACACTTCATGGAGGGAATTTGCGTTGTGTTTGCCTAAACTTTCACATTGTGAAGAAGACAGAATGTCAATGTGTGGGGATGTGGAGCAAGTTAAGAGTGGGAATTTGCATACTACTCGGTTCTGTAGGACACCTGCCTCATTGGTGGAGGGAATGTCTGGGAAGGCTTGGAAATTTCGATGTAAATGGTGGTTGAACCGACATTTTAGCAAGCAGATACTGGCATCTGAAATGGAAGAAGGTGACTTGCAGCTGATGACATACAAGGCAGCTTGCGCATCCCATTTTTACGGGCAAGAGATGGAATATGTTGGGAAGGTTTATACATACTTGAAAGAGCAGGAACCCAAGAGGCCGAGCCTGATAAGATGCTGTTGTCATTTTTGTATACGCACATGA 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This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
BLAST of Spo08700.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902230361|gb|KNA21834.1| (hypothetical protein SOVF_039690 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1135.2 bits (2935), Expect = 0.000e+0 Identity = 572/617 (92.71%), Postives = 577/617 (93.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731329152|ref|XP_010675442.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104891444 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 893.3 bits (2307), Expect = 2.600e-256 Identity = 440/593 (74.20%), Postives = 498/593 (83.98%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870861823|gb|KMT13082.1| (hypothetical protein BVRB_4g086240 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 847.0 bits (2187), Expect = 2.100e-242 Identity = 415/551 (75.32%), Postives = 469/551 (85.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902152924|gb|KNA05646.1| (hypothetical protein SOVF_188420 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 547.0 bits (1408), Expect = 4.600e-152 Identity = 270/282 (95.74%), Postives = 279/282 (98.94%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902211775|gb|KNA16809.1| (hypothetical protein SOVF_085840 isoform A, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 3.800e-146 Identity = 255/267 (95.51%), Postives = 259/267 (97.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RSE3_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_039690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1135.2 bits (2935), Expect = 0.000e+0 Identity = 572/617 (92.71%), Postives = 577/617 (93.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CHQ8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_4g086240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 847.0 bits (2187), Expect = 1.500e-242 Identity = 415/551 (75.32%), Postives = 469/551 (85.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QGG7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_188420 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 547.0 bits (1408), Expect = 3.200e-152 Identity = 270/282 (95.74%), Postives = 279/282 (98.94%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RCT7_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_085840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 2.600e-146 Identity = 255/267 (95.51%), Postives = 259/267 (97.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RBE6_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_085840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 463.8 bits (1192), Expect = 3.600e-127 Identity = 224/234 (95.73%), Postives = 226/234 (96.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08700.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G53200.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 276.6 bits (706), Expect = 4.100e-74 Identity = 187/572 (32.69%), Postives = 310/572 (54.20%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo08700.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo08700.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo08700.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo08700.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
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