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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTCAATAATCATTTTTTTCCTATCCAGTACGTACTAGTGTACTACTCGTCCTTCCAATTTCTACTCACGTAGCGTTATTGAATGCTGGCTTCTTTTCGCAGACCTATTTCCCCCTTTTTCTCCTCCCGTCCCAGAACCTTCTTCTTCCTTCCCTTACCTCCTCGTTTTCTCGCTCTTCTTCGCTGCAATACTGCTGCAACTGTCTCTCACTCTCACTCAACCATGCCGCGCAACAAAGTAATTGCTTGCTATTTCATCAACTTTTTGTCGAAATTATTTCAGAATTTTGATGTTTTGAATTTTAAGTTTGATCCTCTCGTTGTATTCTCCTTGCTTGAATTCGTCATTGAGCATTGCTGCTGTTTGTTTATCTATTTTTAATATTTAATTTTTAATGTTGGTTATATTTTATCATCTCGCCGATTCTCCGTTGTTCGAATTCTTCATCGAACATTGCCGCTGATTTCTATATTATTTCTATTTTTTTTTCATCTCGGCGATTCTCCATTGTTTGAATTCGTCATTGAAAATTGCTGCTGTTTTGTTTTTTTGAGAAATGTGATATTCCGTATTTTATGGTTGTGCTTGTAGTTGTATCATACTGTAGCTGCTATGGATGTGTATACTGAAATTTTCCTGAACAAAGAAAAGCAAATGTTGTGGGTGTCTAAACTTTTGTTGCGTTTCGATTTTCTCTACTGTGGTCTATATTATGGTCATGCCAGTATCATACCTGTTGTGGATGTATTTACTGAAATTTTTCTGCCAGAAGAGAAATAGGAAAATAAATATATAAAGCTAATAGTAGAAAGAGTATGTGTTTTACGGAGTAATTACTAATAACGCTGATTGAGTTTCTTAGGGATGCATTTTTCAAAGTTTGAAAAAATGTTTTGAATCTATGACTATTGATGTTTCAAGTTTTATCATGATTTTTTAAATTATTTTTGACAAACTCCTTGTTTGTATTTGTCATTGGGGAAATCTGCTGAACTGTTTTCTTTCTGTTTTTGGTTGAATGTTGTCTGAAATGATCATGCTTGTATTATACTCGGTAATTTATACCTGCTATGGATGAACTTTTTCTGTTTATTGTTTCTTTGGTGGAATGGGGTTGCACATGAATGGTGGATACATCATGTTAATGTTTTGATTTTAGGTTTATTGTTTTGTTCTTTGTAATTTGGATTTGAGTAGGGGAAGGGTGTAAATCGTAAGGAGGAAAAGTGGAAAGTAAAGTCAAATCCTGGTGTATCATCATCGACTGTAAGGACAGAAGCTGTCGTTGATGATCTTAGAGGGGTAAGCATAACGGAACAAAGTGGACAGACACATGCTCCTATTACATCGGATCAAAATCAGAGTGCAAGACCCGGACATACTGTGGTTTGGAAGCGCAAATCTTATGGAACTTTGAGTGGCGTTACAAATACTCCTGTCAATGAAGTTGCTGCTCAAAAGAAGACAAAGGAAGCAGAATCGGCTTCAAGTAAGAAGAACATGACTAATCTCAGTACATTATGCAGTGGAAAATTATTGGAGAACTTCACTGTTGACAACATCACTTGTTCACATGCCCAAATAAGAGCTACCTTCTATCCCAAATTTGAAAACGAGAAATCTGATCAGGAGGTATTATTTTATGTTGCTTTACTGCTACCTTTTATGTTCTCTTCTTAGGCCTGGCTATTTTAATATTTGTTGTATCCAGAAAATTTGCACAGTTGGTTCTATGCCAACCATTTTACACTATTTTGTGTTTTGATCTCCCAGTAACGACATTCTTACTGGTTTTTTGCTGGTTTATGTTTGGGAAACTCCCATTTCCCCATGTACTTTATTGTGATTAACTCGTTATAGCATGCTTTGCTATAACAATTGTGGTGTGGGTATTCATATAATGTATGATGTGGCTTTCGAACTTTCTCACCCTTATATGAGTTTTTAGTATCTGGTCATATGTTATTCATATAGTGTATGATGTGGTGTTCGAACTTACTCACCATTGTATGAGTTTTTAGTATCTGGTCATATGTTATTTCTGCCTCTTACTTGTTTTACAAGCACAGTTTGCATGGCTACTGCTAATTATTTGTTTCATATTTGTTTTCAGATTAGAACGAGGATGATTGAAATGGTTTCCAATGGCCTTGGCATTGTTGAGGTAAGGGACTAATTTTCACCTTATTCAATTATTATGAACATTTATCAACGCTTTTTATTCCAGCTCATAGGATATTAACATTGTGGCATTGAGTGCTTAGTTGCTTACAATATGTTTACAGTTACTTTTCAATTAATGCAGGTATCCCTTAAACATTCTGGGTCTCTTTTTATGTACGCTGGGCATGAAGGTGGAGCATATGCAAAGAACAGCTTTGGAAATATGTAAGTTTTCATTTTGGCTTGCGCTGTCAATATGTCCCCTTTTTTGACATACGATTTCTGATATATTCTCCCATGCTAATAGTGACGCAAAAGAAATAATTGCCATTGGCGGCTTAGTGAAGGGGAAGGATTTTGGGTTCTTGCCACATATTTTTGGAATATGTGCATTAATGTGATATAATAATCCTTTCTACTATCTGAAATAATAAGGAATGGAGGAGTTATCAGTAGGTAGTGACCGTAGTGTTTGAATCAATCTCTTTTGTGTAAAATGTATGCCACTGAAAATTTTCCCTGTTCTATTCTTTTGTTTAATTGCACTATGAATTTTTTTTTTGCTACAGATGGCATGTGTTAATACGGCATCATTATTCCACAGACAAGATTGAGACTCATTTACGCAATGAAAATGGCCTTTGTTTAGTTTTGTATTGCATTGCTGGAGTGCTGGAGAAGAATCTAAAGAGCTTTCATTTTGGATATAGTAGATATTATTAATCCATAAAAATAATATAAATTCTGGAGAAGTAGCTCATTGCTTATCTGGGCTAGTTTGTTAAAGCTATGTTCTACAGTCCTATGTTCTTATGACAGTTCTATAGTTGCTGTTAATGTCTGTCTGAGATAGACAGATAGTATATGTTGGAGTAGATTTGAAACCTTGTACATAATCTAGAATAATATCGAATTGTGACAGTTGTGATCCTTGAACAAATTTAGCAACTTCTAATGCTTCAGATGGGACCTGCATTCAAGTGATTTCACATCTTAGTTTACGGTAATTATTTGTCTAAATTTACTTGTGCAGATACACTGCAGTTGGTGTTTTCGTTCTTGGAAGGATGTTTCGTGAGGCATGGGGTATTCAAGCGAGTAAGATGCAGACAGAATTCAATGACTTTCTCGAAGTAAGCTTGTTATTTATCATTGGTTGGTGATGGTGTGTTAAAAGTTGAAATACCAACATTTATGGATGTCACAGTAATACTGGTTTCCTCTTTTTATTTTGGTGTAGTTGAATTTTTGCTAGTGCTTGCATGATGTTTGGGTATAGGGTAAAAGATAATGGTTGCGTGCAGTAGAAGAAGATTCTTGGTCGAGATATTATATTAAGTAAGAAGAGTGATTTGTATCTGAAATTTTGAAATTTTATTTTCAGCTTACTTCTTTTTCGATGGTCTTGGCCCACTCCTGTGCTAATAGTCTATAGATAAACTCACACATACACCGATACATGTGTTGCTTTGCAACTCATTTGTTTGATACATAAATTGTTATCTTCTGCTACTTCAGTTTTGTAGAAAACGCAAAGCAATCAGTAGTTTGTAATTTCCCAAAGAAGAATAGAAGAGTGGTTGGTTTTCTATCAATTGACCTACTAAATATGGGTTTCGGAGTACGCCTATTTGGCTTTATGTTTATAATCCAAATATACTATATGTGTCTTGTAGTTAAGGCTTTAAGCCAAGGAGTATATGACGACTGAAATGCGTGATTGATTTATACAGGGTATTTTTTCATATTGGTATTAAATCATTCCTTCACACCTGTTATAAACACTATGACATTACCATGAAAGTGACCTTTGACTGTGCTCGTGATATACTGAATCTCAGATTACCTTTTATTAAAAGATTATGTCCTAAATTTTTTACACATCGGGCAGAATAGGAGATGTTGATGTTAATTTTTCCTACAGTACCCTAGATTTATAGATCTATCCAGACCTTGTATGCTTCCTGCAATATCCTAACTGTAGCACACATAGTGACATTTACTATTTCCTTGGCAAACCATTAAAATATGAAACTGCCCCTTGACTTTACTGCTAACTCTTAAAGGTTCATTAGATTTCTGTATTCTCCTGTAGTGTAGTTTTTCTGCCACTGGAAGATGTCAATCCAGTCTAAGATCTTTTGCCTTGTGATAGGAGAAAGAGCTTAGCTAAAGGTTCTCTCTTTGTTGTCATTATGAAGACTGCAATGGTGTCATCTATTTTCATTTTGTGATTGTTTTTTTCTTTTAAATTCTGGTTATGTCTGGATGCTTTCAATGAATCTTTTGAAGCTTTATGTGACATTCTTTTCAACTTCTGTCCTGTCAGAGAAGTCACGTGTGCGTATCTATGGAACTGGTGACTGCTGTCTTGGGTGATCATGGCCAGCGTCCTCTAGACGATTATGGTGGGAGGCTTTTTAATACTAAATAGTTATATGCTTTTGTCTTGTGTATTGGTCAATCATTGATGTTACCCATCTACAATAGATGATGAGCAGTTTGATCAATCATTGATGTTCAAAACATCTCAAAATGAGGGAAAACTAAAATTTTGAGCTAGTCCAGTGTTTTAGAGCACACCACCCAGATGCCAGTCAACTGTATTGCTGTGCCTTGATGCTTTGTACTTTGTGTTGTTTTTGCAGTTGTTGTGACCGCTGTTACGGAATTGGGTATAGGAAAACCGAAGTTCTATTCTACCCCTGAAGTAATTGCTTTTTGTCGGAAATGGCGGCTGCCAACAAATCAGATCTGGCTGTTCTCTACAAGGTAAATTCACTCTGGCTTTTTTTGTTTGGTTTGATTAGTGTTTGATGTATGTTTCATAG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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Homology
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Match: gi|731392516|ref|XP_010651123.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100258617 isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1531.2 bits (3963), Expect = 0.000e+0 Identity = 782/1152 (67.88%), Postives = 916/1152 (79.51%), Query Frame = 1
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BLAST of Spo07592.1 vs. NCBI nr
Match: gi|702272448|ref|XP_010043703.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104432846 [Eucalyptus grandis]) HSP 1 Score: 1511.5 bits (3912), Expect = 0.000e+0 Identity = 765/1147 (66.70%), Postives = 906/1147 (78.99%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07592.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B594_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_9g225460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1702.2 bits (4407), Expect = 0.000e+0 Identity = 872/1177 (74.09%), Postives = 972/1177 (82.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07592.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A059D5C1_EUCGR (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis GN=EUGRSUZ_B02467 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1506.1 bits (3898), Expect = 0.000e+0 Identity = 763/1137 (67.11%), Postives = 901/1137 (79.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07592.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0R0E4L3_SOYBN (Uncharacterized protein OS=Glycine max GN=GLYMA_U020600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1496.9 bits (3874), Expect = 0.000e+0 Identity = 769/1171 (65.67%), Postives = 903/1171 (77.11%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07592.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067LA50_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_05575 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1490.3 bits (3857), Expect = 0.000e+0 Identity = 758/1122 (67.56%), Postives = 891/1122 (79.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07592.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7SKU0_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_06s0004g03300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1482.2 bits (3836), Expect = 0.000e+0 Identity = 738/1028 (71.79%), Postives = 853/1028 (82.98%), Query Frame = 1
BLAST of Spo07592.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G07910.1 (RNAligase) HSP 1 Score: 1428.3 bits (3696), Expect = 0.000e+0 Identity = 724/1110 (65.23%), Postives = 874/1110 (78.74%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo07592.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo07592.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo07592.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo07592.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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