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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCCTCTTCTTCGTCTTCTTCAACTCTGACTCAACAGCGACGCTTCAAATTCAAATTACTCTACGCTTTCTTCTCCCTCATTTTCTCTCTCCTCTCCCGTCTCTTTGATTCTCTAATCTTCTCTCTCTCCTCCGCCATGGACAACCTCTTCGATCCCGACGACTTTCTCTCCGTCGGTAACGACGCCACCACCACTTCCAACAACGACGATGGAGATGACGACGACGGTGATCTTCTCTACCCGCAGTCTCGCCGCCGCCGACGTCGTCTTCATTCTTCTCCTCCGTCATCGTCGTCTACCTCAACTCTTTATCTTCGCAGTGATCGTCTCTTTCTCGTCTGCTACAAGTATTCAATTCATACTTTTTCAGTTGATTTGTTTTGTTATTTGAGTAATGTGGATTCAGTTGAGCTGAATTGAGTTTAATTTAACTGAATTAATGTTTACAGGTGGTGGAAAGATGCGAGGGAGGGGTGCTTGGGTAGTAAGGGTGAAATTAAAGGCGATCGTTATACTACGGCGGAGTTGTCAGATGATGAGAATAAGAGGGAGAGTGATTCTGATGATGAGTTTGTTTTGAATTTGAAGAGAGAAGTGGATGATGATGACGATAATGGTGGCGACGATAAGGGCAAGGGTTTTTCTGGCCGGGAGTACGCTTTGATTACTGAAAGCATGTGGTTTACGGGGCTGAAATGGTGAGCAATTTTATTGCATTAGTGTGAACTTGTATTGTCTACTGTTGCATGTATTCAGTTTTCCTGGTTTTTTGTTAAATACTTACCATATTTGGATTGAAGTTCCTGTTCAAGTTGCCTAATCTCATGCACTAAGGTGACAGTACCACAATGCCTGTATGATGTAATAGCATAGTAGCTCTATGAATTCATGTAACAAAATTCGTGGGTCAAAGTGTTACAAAAATTTAGCAATAACTGAACTCTCTACACTTTGGATTTATAATTATTGACTTTGATGGAATCCTAATAGTAGGAACTTTAACACTAATGGTGTCTGTATCGTGCATTCCTGTGTGTTAAGAACTCTATGTTTGGGTAAACAAAATGTCTCTTCATTGGGAAAGGTTTGGTAGAAACTTCTCTTGTATAAGTGAAGATATAAATAAGAACTTACTACGCCCTTCTACACAAAACACAGTAGAATAAAGTAGACGAGAAGTGAGCATATGATTCTAGGTTATTCGGGAAAGTTTTTAGTTCAAGGTATGTGTTAGCGGGGCTTTGAAACTTCGAATTGTCTTTTTATTGGCACATCATGTTACTAAAGATACAACACAACGTGATATGAGGCTCAAATACTAATACTATCTTTTTTTGGCTCGGAAGTCACGAAGAATTACTAGCATATTAATATCTAAGGTTTAGATGAAAGTCACCCCTCACCAATATCAGGAAGGAACCCAAATTTACTCTACATTGGCGGTGTCATCCAAAATGTGTTGGAGGTAGAGGAGAGCACCCTTATTGGTGGTGACGATCTTATACTTCGTATGAAAAAGTGGTTACCACACATAGATAGTTGAACTTTAAAAGGTTGAAGGATGGAAGAAAAGATAGAAAATATTAGTAAGCAAATCTAAGAAAGATAAAAAAAAATATATTTCATCTTACTAACCGTAGGTAATCGAGCATATTGATCCACTATAATTTTCTAGCTCCACAAAAAATCACCAATTCTTAGCCTTGTTATGGAGTATGTAAATTCTTCTCACTACCACCATAGCTTTAGAAGGGAATCATGAAGGGATTATAAATAAAACAGAGATAGGTTTTCAAACTTTTGTGGAATACAGGAAACTATATTAGCTCTAGGAGGAGTGGTTGAACCCCATTGCAGACCAAAGAAGCTCAAGAAGAACATGGGACCATTTCTTATAATTGTAAATCTCGACCCTCTTGAATGCTTTGATATGGTTAGGACCATGTTTGAAACTTTACCCCGTTAAATATTTTTATTTGGCTAGAACCATAAACAACGTATTTATAGCCTACTTTTCATGAAGATTTCTTCTACTATGATAATCTTAGAAGCTATTTTGTTGAATCTAATAGGGAATTGTATTGGTGGTGCAAGAGGACTAAGGACTAGTTAACCTTGGTTTCTCATATCGATGATGTTCTTTTGCTTGTTTGAAGAACACTTGGATTGACTTTGCTTCAATCCATTAGGTTTTGTTCTCTATAACTTCCTTTCATCTCTCTCTCTCATGTCCATTGAGGGTATTATATGTCCGTCCCCACAGTAGCGTATAAGAAGGTGGCCTAGGCGTTGGGAGCCAACGCCTTTTATGGTATGATCGAGGAGATTTTGATGAGGCACACCCAAGGCGCGCCCCATTTTTCACAATTATTTTTAGTTTTTATTAGGGGCGTGTCACTTCAAGAGGAAGATTCTCACTGGTTCTCATTCTAGTGTGTTATCTTATTTGGGTTACAATTATTGTTGACTACACTTGGGTTGTTTAATTTTGATTGACGATGTTTGGATCTTGTTGGTAACAATTGTTGTCTTCTACTCTCTCCGTCCCTAAAAGATTATCCCTTTTGACTTTTCTCAGTCTCCAAGACATGATTTAAAACTTAAATATCTCTAATTTTACACGCGTAAAAATTATAAAAAGTTGATATACCGAAAACATATATTGAAACAAATCTAACAAGACCTTGCATGACTATATTATTTCTTATAAGCTAATGAGAATTCATGGTCAAAGTTTTCAAAGTTTGACCCAAAAAATTGCAATGAGGCAATCTTTTAGTGACAAAGGGAGTATAATTTTATATATTGTTGACTTCCCCTTATTTGATTGTTAGTAAATTGTTTCTTGCTTTAATCAAGACTGGCGCTCTTCCCGTTTACCTTTTTTGTATTGATGCTAGGAAGTGGAATAAGTGGAATAACCTTTTTTGGAGGGTTGAATGAGGGAGCATCCCTTAATGGTGAACTTCAATAGTTGTAATACCATGAGCTTGTATAACTAAGGGCTTCATCATCATGAAACTATATTTTGTGGTTTCCACTTTTTTGGTTAGTGCGGACTTTTTTGGTTAACATATTATGCTTGTAGGAGACTAAGTGGGTTGGAAACAAGGCAAGAGAAATAGCTCCATGGGGTTATAAGCTTTGGTATTCTGGAAAAACTAGGGGTAGGAATGGAGTAGGTATCCTTATTGACCGAGAATATATTGAATGATGTAGTGGACGTGTCTCGAAAGAGTGATCGAATTATGAGTATTAAGCTTGTGATAGGGGATGAAGTTGTAACTATTGTGAGTGCCTATGCACCACAAGCAGGACTAGATGCTTCAACTACACAAGAATTTTGGGAGGATTTAGAAGAAGTGGTGCAACGTGTCCCTAGAAGTGAGAAACTGATCATTGGTGGGGATCTCAACGGACATGTAGGCTCGAGTCGCGATGGATTTGAAAGCATTCATGGTGGTTTTGGGTATGGTGAGCGGAATGAAGCGGGAAATGCTATTTTGGATTTTGCATTGGCATATGACTTGAGTGTAATGAACACTTGGTTTGAGAAAAGAGACTCTCACCTAGTAACCTATAGGAGTGGAGATAATACGAGTCAAATTGACTTCTTTTTAGTAAGGAATGCTTTGATACAGTGCTACACCAATTGTAAGGTGATTCCGGGTGAGAGTACAACAACCCAACATAGACTTGTGGTACTTGAGTTTCGAGGTAGAAGTTATATAAGGAGGAGAAGACCACTAGTAGAGCCTAGGATCAAGTGGTGGAAACTTCAAGGGGAGCAAGAACTAAAATTTGTGGAAAAGGTGGCAAGTGAAGGTATTTGGGCCGGGGATATGGATTTGGATATAGACTCATTATGGACAAGAATGGAGCACACCATAAAGGGAGTTGCGAGAGAGGTCCTAGGGGAATCTAAAGGAATCATGCCACCAAGTAAGGACACATCTTGGTGGAACGAAGTTGTGCAACAAGCTATAAAGAGCAAACGAAAAATGCTATAAGGAGTTGGGAAAATGTAGAAGTGATGAGAACTACGAGAAGTACAAGGAGGCTAAAAGGGAAGCAAAGAAGGCCGTAAGAGAGGCTAGAGCAAAGGTGAATCAGGATCTTTACGCAAGATTGGATACAAAAGAAGGGAAAAAAGACATCTATAGACTTGCTCGAATGAGAGATAGAAAGACGCGAGACATCGGGAGGATTAAATGTGTGAAAGATGTTGATCAAAAAGTTTTGGTGGGAGATAAGGAAATCAAGGATAGATGGAGGTTCTACTTTGATAACTTGTTTCAACGGGATCAAGGGCGCGATATTGGGCATACAAATATCCCTCGGGATATGGTTAACTTAGACTTTATGCGAAGAATTCAAAAGAGAGAAGTCGAAATGGCACTGAAAAAGATGGGATGCAAGAGGGCAGTGGGGCCCGATGGTATACCTATCGAAGTCTGGAGATGTTTGGGAGAGAGAGGGGTTGTATGGTTAACAACTCTTTTCAACAAGATTTGGGGAAGTAATAAGATGCCAGTAGAGTGGAGGAAAAGTACTATCATCCCCTTGTACAAGAATAAGGGTGATGTCCGGAATTGTGCCAACTATCGAGGAATCAAACTAATGAGTCATACTATGAAACTTTGGGAGCGGATTATTGAGCAAAGACTGAGGAGAACTGTGAGAATTTCGGAGAACCAGTTTGGATTTATGCCTGGGAGATCGACTATAGAGGCCATTCATCTTCTAGGGCAACTAATGGAGAATTCTCGGGATAAGAAGAAGTATTTACATATGGTTTCATTGATTTGGAGAAGTCGTATGATAAGGTACCAAGGGAAATTCTTTGGTGGGCATTAAGTAGGAAAGGAATTCCGAGGAAGTATATTGATATCATCATGGACATGTATGAGGGAGTTTGCACGAGTGTGAGAACTAGTGTTGGTAAGACCGAAGAATTCCCCATTACGATTGAAGTGCATCAAGGTTCCGCA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ATGCCCTCTTCTTCGTCTTCTTCAACTCTGACTCAACAGCGACGCTTCAAATTCAAATTACTCTACGCTTTCTTCTCCCTCATTTTCTCTCTCCTCTCCCGTCTCTTTGATTCTCTAATCTTCTCTCTCTCCTCCGCCATGGACAACCTCTTCGATCCCGACGACTTTCTCTCCGTCGGTAACGACGCCACCACCACTTCCAACAACGACGATGGAGATGACGACGACGGTGATCTTCTCTACCCGCAGTCTCGCCGCCGCCGACGTCGTCTTCATTCTTCTCCTCCGTCATCGTCGTCTACCTCAACTCTTTATCTTCGCAGTGATCGTCTCTTTCTCGTCTGCTACAAGTGGTGGAAAGATGCGAGGGAGGGGTGCTTGGGTAGTAAGGGTGAAATTAAAGGCGATCGTTATACTACGGCGGAGTTGTCAGATGATGAGAATAAGAGGGAGAGTGATTCTGATGATGAGTTTGTTTTGAATTTGAAGAGAGAAGTGGATGATGATGACGATAATGGTGGCGACGATAAGGGCAAGGGTTTTTCTGGCCGGGAGTACGCTTTGATTACTGAAAGCATGTGGTTTACGGGGCTGAAATGGCATAGTGATTATTGCACAAGAATTAAGGATATGGGATGTTCTTTGGCTGCAGAAGATAATGAGCAGGATGTTTTCCCTATTCAAATAAGGCTTTATGTTATGCAACAGACCGATTCTTTGGTGGTGAAGATATCTCTGATGGATAATCCAATCCAGCTTTACAAAAGTGCTTATCAGATCTTTGACGTGCAATCCAACTTGGTTTGTATTTGGGACTTCTCTGGGCAGATGACCCAATTCTTTGAGAGAGGTGGTGCACTATTTCCAAATGGCTGTCCAGGCCAAGCCCCTGAAGAGGTTCTCCTTGAATTACAAGTTTACGGGCCAAGTTTTGGCAACAATGCAGGGGAAAAGAAAACTGAGATTGCAATGCAAGGAAGTTCTAGCAGTGGAGATTCTTGTGGCAGCTGTTCGATAAAGATGGATGGAACTGTTCAGAGCTCATCTTCACCATTTCTCAGTTTGCAATCATGCACTCATAGATATGGAGAAACTGGTGTTCTTGGTTTGACTGGACTTCTCAATCTTGGGAACACCTGCTTTATGAACAGTGCGATTCAGTGCTTAGCTCACACTCCGAAGCTAATTGATTATTTCCTTGGAGATTTTAAGAAAGAAATAAATTATGAAAATCCTTTAGGCATGAATGGTGAGCTTGCTTTGTCGTTTGGGGATTTGTTAAGAAAGTTGTGGGCTCCAGGTAGGATGCCGGTTGCTCCAAGATTATTTAAGTCAACCTTAGAGAACTTTGCTCCTCAATTCTGTGGTTATAATCAACATGATTCCCAGGAATTTCTTGCTTTTCTATTGGATGGGCTCCATGAAGACTTGAATCGTGTGAAACACAAGCCATATATACAGCTTAATGATACAGAGGGCCGTCCAGATGTTAAAGTTGCAGATGAACATTGGGAAATTCAGCTAGCTCGTAATGACTCCATAATTGTTGATCTGTATCATGGTCAATTTCGATCAACGCTTGTTTGTCCTATTTGCAAAAGGGTCTCTGTCACGTTTGATCCGTTTATGTACCTGTCTCTCCCTTTGCCTTCAACGACTATGCGAACCATGACTGTTACTCTTTTGAGTACTGATGGGAGTATGCCGCCATCACCACTTACTGTAACGGTACCCAAGTCTGGAAGGTGCAAGGATCTTATTCAAGCCCTTGGCACAGCCGTTTCATTACAGGATGATGAGACACTCTTTGTAGCTGAGGTATACAATCACTGCATCCTCCACTCCCTGGAAGTTCCGTCTGATTCATTAGCATTGATAAGGGATTGCGATTACCTTGTTGCTTACCGCTTACCAAAAGAGAGTGAGAGCAGCCTGTTGGTGGTTTTCATGCATCAGCGGTGTGAAAGGCAATTTGGCTTTCGTATGGGAAGGCGTAGCTGGAGTCCGTTTGGCATTCCTTTGGTGGCAAGGATTCCTAATATTTCAGATGGATCTCAGATTCATGATACATTCAAAAAATTGCTCAGGCCTTTTTTGAATATGGATGAAGATGATTATGATGATATTGAAAACTCAGATAGTGAGCTAGAGAGTTTTCCAAATTCAGACAATTCATGGAGCTCAGATGATGAAATGGGAGATGACTTGCATGTGCCCTCTGATTTTCAGTTTCATATAACAGATGAGCGAGGTATGTTGAGGGGCCGGAGGATAAAGGTGGGTAAAGTTCTGGATGTTTCTGTTGCATCTAATAAAGTGTACGTGCTTGTTAGCTGGTCTAAACCAGTGTTGAGGCGGTATGATACCTGTCGTCTCAGCTTGTTGCCGGAGGTCTTTAAACATGTATTTGCTGCTATGAAACCTCAAGAATCAGTTTCCTTGTACAAATGCTTGGAAGGCTTCTTGAAGGAGGAGCCATTGGGCCCAGAAGATATGTGGTATTGTCCGAGTTGCAAAGAACATCGGCAAGCGAGCAAGAAATTAGATCTTTGGAGATTACCTGAAATTTTGGTTGTTCATCTGAAAAGATTCTCCTACAGCCGGTTTTTGAAAAACAAGCTTGAGACATATGTTGATTTCCCCTTGGAGGAGCTTGATCTTACGGGTTTCCTTGCCCACGAGAGTGGTCCAAGATTGAATCGTTATAGATTGTATGCTCTCAGTAACCACTACGGCAGCATGGGAGGCGGTCACTATACTGCTACGGTTTATCATGGTAAAGGGTGGTACGAATTCAATGATAGCTTTGTTGAACTGGTTAGAGAAGAGGACGTAAAGACTTCCGCTGCTTATGTTCTTTTTTATCGCAGAATCTCCGATACTTAA MPSSSSSSTLTQQRRFKFKLLYAFFSLIFSLLSRLFDSLIFSLSSAMDNLFDPDDFLSVGNDATTTSNNDDGDDDDGDLLYPQSRRRRRRLHSSPPSSSSTSTLYLRSDRLFLVCYKWWKDAREGCLGSKGEIKGDRYTTAELSDDENKRESDSDDEFVLNLKREVDDDDDNGGDDKGKGFSGREYALITESMWFTGLKWHSDYCTRIKDMGCSLAAEDNEQDVFPIQIRLYVMQQTDSLVVKISLMDNPIQLYKSAYQIFDVQSNLVCIWDFSGQMTQFFERGGALFPNGCPGQAPEEVLLELQVYGPSFGNNAGEKKTEIAMQGSSSSGDSCGSCSIKMDGTVQSSSSPFLSLQSCTHRYGETGVLGLTGLLNLGNTCFMNSAIQCLAHTPKLIDYFLGDFKKEINYENPLGMNGELALSFGDLLRKLWAPGRMPVAPRLFKSTLENFAPQFCGYNQHDSQEFLAFLLDGLHEDLNRVKHKPYIQLNDTEGRPDVKVADEHWEIQLARNDSIIVDLYHGQFRSTLVCPICKRVSVTFDPFMYLSLPLPSTTMRTMTVTLLSTDGSMPPSPLTVTVPKSGRCKDLIQALGTAVSLQDDETLFVAEVYNHCILHSLEVPSDSLALIRDCDYLVAYRLPKESESSLLVVFMHQRCERQFGFRMGRRSWSPFGIPLVARIPNISDGSQIHDTFKKLLRPFLNMDEDDYDDIENSDSELESFPNSDNSWSSDDEMGDDLHVPSDFQFHITDERGMLRGRRIKVGKVLDVSVASNKVYVLVSWSKPVLRRYDTCRLSLLPEVFKHVFAAMKPQESVSLYKCLEGFLKEEPLGPEDMWYCPSCKEHRQASKKLDLWRLPEILVVHLKRFSYSRFLKNKLETYVDFPLEELDLTGFLAHESGPRLNRYRLYALSNHYGSMGGGHYTATVYHGKGWYEFNDSFVELVREEDVKTSAAYVLFYRRISDT Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo30018.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902238425|gb|KNA25187.1| (hypothetical protein SOVF_009050 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1941.4 bits (5028), Expect = 0.000e+0 Identity = 961/961 (100.00%), Postives = 961/961 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731333119|ref|XP_010677561.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1214.5 bits (3141), Expect = 0.000e+0 Identity = 619/835 (74.13%), Postives = 691/835 (82.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870860195|gb|KMT11558.1| (hypothetical protein BVRB_5g108750 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1214.5 bits (3141), Expect = 0.000e+0 Identity = 619/835 (74.13%), Postives = 691/835 (82.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. NCBI nr
Match: gi|719975524|ref|XP_010247842.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 932.2 bits (2408), Expect = 7.400e-268 Identity = 492/866 (56.81%), Postives = 607/866 (70.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225439374|ref|XP_002270470.1| (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8-like isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 929.1 bits (2400), Expect = 6.300e-267 Identity = 498/869 (57.31%), Postives = 609/869 (70.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9S241_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_009050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1941.4 bits (5028), Expect = 0.000e+0 Identity = 961/961 (100.00%), Postives = 961/961 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CHM7_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g108750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1214.5 bits (3141), Expect = 0.000e+0 Identity = 619/835 (74.13%), Postives = 691/835 (82.75%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061GV07_THECC (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_041174 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 903.3 bits (2333), Expect = 2.600e-259 Identity = 480/890 (53.93%), Postives = 613/890 (68.88%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061GVP6_THECC (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_041174 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 898.7 bits (2321), Expect = 6.300e-258 Identity = 472/857 (55.08%), Postives = 600/857 (70.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HAA6_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_06s0009g00890 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 895.6 bits (2313), Expect = 5.400e-257 Identity = 470/883 (53.23%), Postives = 615/883 (69.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: UBP8_ARATH (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 OS=Arabidopsis thaliana GN=UBP8 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 1.800e-234 Identity = 443/883 (50.17%), Postives = 581/883 (65.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: UBP5_ARATH (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 OS=Arabidopsis thaliana GN=UBP5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 623.2 bits (1606), Expect = 4.600e-177 Identity = 376/896 (41.96%), Postives = 512/896 (57.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: UBP9_ARATH (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 9 OS=Arabidopsis thaliana GN=UBP9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 600.1 bits (1546), Expect = 4.200e-170 Identity = 377/927 (40.67%), Postives = 532/927 (57.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: UBP10_ARATH (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 OS=Arabidopsis thaliana GN=UBP10 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 594.3 bits (1531), Expect = 2.300e-168 Identity = 372/927 (40.13%), Postives = 524/927 (56.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: UBP11_ARATH (Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 OS=Arabidopsis thaliana GN=UBP11 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 572.4 bits (1474), Expect = 9.300e-162 Identity = 340/812 (41.87%), Postives = 475/812 (58.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G22030.2 (ubiquitin-specific protease 8) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 3.500e-223 Identity = 414/787 (52.60%), Postives = 533/787 (67.73%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G40930.1 (ubiquitin-specific protease 5) HSP 1 Score: 623.2 bits (1606), Expect = 2.600e-178 Identity = 376/896 (41.96%), Postives = 512/896 (57.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G10590.2 (ubiquitin-specific protease 10) HSP 1 Score: 600.1 bits (1546), Expect = 2.400e-171 Identity = 377/927 (40.67%), Postives = 532/927 (57.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G10570.1 (ubiquitin-specific protease 9) HSP 1 Score: 594.3 bits (1531), Expect = 1.300e-169 Identity = 372/927 (40.13%), Postives = 524/927 (56.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo30018.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G32850.1 (ubiquitin-specific protease 11) HSP 1 Score: 572.4 bits (1474), Expect = 5.300e-163 Identity = 340/812 (41.87%), Postives = 475/812 (58.50%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo30018.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo30018.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo30018.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo30018.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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