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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTGATGTAAGAGATGAAGATAAACTGGATGAATGCGACTTCTCGTGGGGTTTAAAGGGAATAGCGAAAAGTGTAAAGAAGGGAATTGGTAATAAAGATCAGTATGTGCAGTTCTATCGTTCTTTTACATATGATGTCGTGGAATACTTTCTCTATGATTCCATATATCTGTTCAAGGAAGGAGAATCAGAACCATACATTGGTAAGCTCATCCAAATTTATGAGCTTCCCGATAAAACAAGGAAGGTACGAGTGCTTTGGTTTTTTCGCCCTTCAGAAGTATCAAATTTTTTGGGGGATGAACATGTGCTTGAGAATGAGCTATTTTTAGCAACTGGTGTTGGCAGAGGCTTGGAAAATGTTAATCCCTTGGTAACGTTATTACTATATGTGGTTCAAATTTGAAATATCTTCATTGCTCCTGTTCTTTCCTTCTTTGTCGTTGTTGACTGCGAAAGTCATTAGTAATTTCCTTCCCACTATAGCTTGTGGCTTATTGCCTACTGTGCTTCTGTATTACTAGTTCACTGTAGTCCATATTACACTTTTACTACTATGTTTGTATCTCTTTACCATTTATGATGTGCTAGTCTAAGCTAGTGGTTTTTCCACTTTGGTGATGTTTCGTCTCTTTGTGAATCCACCAGATTTTTTGGCTAGGAAACCAATTAGGGATAAAGGTGAGTACGCATTGACATCTCGAGATGCAAAATGAGCAGGGAGCCACAGATTCTACTTATGGTAGTGTTTTTGCAACATGAAGTTGATGGGTGTTCAGACACTACATTAGTGGTAGCCTGTTTTATTGTCTATAGGGACATGAGTTGATTAGTCTATGAATGGCCGATCCAGGAAGTAGATGATTAGTTCTTGTCATGTTAATACTTTTAGTCTATTAAAAACAGGGGAGTCAAGTTGTCAAATCTTATAAGTATCACAGGTTAAGTATTTCTAATGACAATTTTGGAATAAGAGGGGGAGGGCATCGAGTTTTGAAAATTTGGTAATGTTTTCTTTGCTTGTTTGGAGAGTTAAAATATCAATGGCAGAGAACTCAGGAAGAGCTTAGTATTTTTGTGTGAAGTTGTCAATTAGCTTAGATGTGAAAGGTTGTAGAGAAGCATTGTATCGAAGAATTACTTTTGAAATTGATTTTCTAGATATTGCCTTTGGTTGCTCGTTGGATTATGAGTTTCTTTGTATGGGTAGATCATTCAGCCTGTTCTTATTCTGAATCCATTGCTTCTGGGGGGATAGAAGATGAAAAGAGAGTAGTCTTGGGATTTTCACTGGTTGTGAACTTGTCAAATAAGTATCTTTATTTCTCTATTTCTGACAATTTTCTTCATTCTGTTGCGCTACGACAGAAAAAGGGCATTGGTTTTTAATGTTTTGGTGATTTGTGTGGCACTGCAGAGGGTTCCTTGTTAAGTTAGGCCTAGAAGTTCAGCCAAGGATTACTGTAGATTCTGCCTAGTAGCATTTTTGGTATATAAGAGTACATGTCATGTTAATTATTTGAGATTATGTCAATTTTAATTTGTTTTGCTTCTCATAGTTTTTTGAGTGAATAAAGACTTATGCTAAAGAGATTAATTGTGTGCACATATCTTGCCTATTTTGTGTCTGTGGAGGAAACCTAATGAGTAGGTTTCATTTTCTAGGCCTTCATCATTAGGGTACTTGGGGGATATCTGGTTCGAGGTTCATGGGAAGGGAGAGGATCCATGACTTCTATTTTACCCGTTTACGTGTTGTGAATGTAGATGGAAGGAACACCATCAGTAGGGTGCTCAAGTGCAGATTAGATGTGGTGGTGTGCAGAGAATAAGGAGAAGAGAACGAAATATATGGTTGTAGTCTATGGTAGAATGAGAGAGGATAGAAGCAAAGTGACTTGAATCCTTGATTCCTTGCTAAACGACTAAGAAGTTAACGTTGTTGTTAAAGGCTATTCAATTTCAAACATTTAGATGGTGACCATCTAAATTCAAACGTTGACCTTCTAAATGAGATTATGGGAGGTAAACACCTTACTTTGTGCTTGTAGGGATAAATGCTTTGAGATTAAATGGTTAAGTAAAGTGCTTTATTCTTATGTTTGTGTCATTGCTTACTTAGTTTTTCATTTTAGGTCTCCTTATGGTTCATGGAATTTCATCTTTCCATAGGTCATTGAACTTCAAGAAATAATTGGATTACCTTTTCCTCAATGGTTTTAGGGGCATTTAAGACCTAATTTCTGTGTGTGCTATAAGCCCACAATTTTGTAAAGAAGCTTTTGAATAGTCTAACTCATTTGATTGTATGTCCATATTGTGGTCACATTTGCTAAGAAACAGAGATCTAATACTGATTTACTATGAGTTATTCAATATCATATTTAAGATTCTCAAACAATTTTGTTTTTAGTTATTAAACACTTAGTGCTTTATAGTATAGCTACCAATTTGATATCATCATGATCAAAGAGCTGATTGACTTGAAAGATTGAAAGGACATAAAACTTTTCTTTGGAGAGGTAGTAATTATCTTAAGGAATTACTTAGAGGTTTCATTTGCCTATGAAATGTTGAAATACTTCTGACATTGCTAAAATAATTACCCTTGAAAAATAGTCTCTCTTTTAATAGGAGTTTCACTCTAAAGGGATGGAATTGTTGATATCTTTTAATGTAGAATGTTCATTTTTTAGCGGATTTGCAACGTCTAGATGGGAGGATTTTGGAATTATGAGATTCTTGTTGGGTCTGTTTATCATGTTTTAGTCTAGGCATCCAGATGGTGGATCTTTACTTCTACTTTTTACCCTGCTTCTCCCTTCATTCCCTAGCCTTTCACTAAGCTTCTATTGATTGTACTCCTCGTGTTCAGACACTACATTAGTGGTAGCCAGTTTTATTGTCTATAGGGACATGAATGACCGATCGAGGAAGTAGATGATTTAATTGTTGTCATGTTAATACTTTTAGTCTATTAAAAATGAGGGGAGTCAAGTTGTGAAAGCTTATAAGTATCACAGGTTGAGTGTCTCTAATGACAATTTCGGAACAAGAGGGGAAGGGGCATTGAGTTTTGAAAATTTTGATTATGTTTTTTGCTTGATTGGAGAGATAAAATATCAGTGGCAGAGAACACATGAAAGAGACAGCTTGAATGTTAGTGAGCGTAGAATCTTTGTGTAAAGCGGCCAATTAGTTTAGCCGTGAAAGATTGTAGAGAAGCATTGTATCGAAATTAGTTTACTCTTGAACTTGATTTTCTAGGTCTTGCCTTTTGGTTACTCATTGGATTATGAGTTTTTTGCATGGATAGATCTGGTTCAGCCTGCTCTTGTTCTGAATCCAACGCTCCTTCTTGGATAGAAGATGAAAAGAGAGTAGTCTTTGGATTTTCAGTGGTTGTGCACTTGTGCTTGGGTATTCTGGTGATTAAGTACTTTGATTTCTCTATTTCTGACAATTTTCTTCATTCTGTTGTGCTACGAAAGAAAAAAGGCGTTGGTTTTCTTAATTTTCGTGACTTGTGTGACACTGTTAGGGGTTCTTTGCTAGGTTAGACCTTGAAGTTCAGCCAAGAATTACTGTAGATTCTGCCTAGTAGCGGTTTTGGACTTTCGGTATATAAGAGTACCTGTCATGTTCATTAATTGAGATTATGTCAATTTTAATTTGTTTTGGTTTGGTTGGTTCGAGGTTTTAAGGGAAGGGAGAGGATCCATGACTTCTATTTACCCGTTTTGGTGTTTGTTACGTTGTTTCTATTTGTTGACATTCCCTTTCCCTACTCTCACTTTTTGGGTTTTGATTTCTGTACCTCCAATAGTTTTAACCTCTTCTTTTTTCACGTTATGGGTCTTATGATACCACAGCCTAGCCAAAATAACATGTCTCCAACATTTTTTTCACGACATTGTTCAACACTTCAACTACACATCTTTCACCAACATTGTCCCGTAGCTGCATTCCCTAAACAAGCACCCATCCACTTCAACTTGCTATGAAATTGTTCGCCAGTAGCCTGACAGCCCATTATCCATCATGACTATTGACTCCACTACAGTTTTCCATCCATAGATTCCACACTCCATGTAACATCATGAAATTAGTAGTATACATAAGAAAAAATCACTTGCGTAAGTCTAATGTTTAATCCAACACAATCATAGTCCTTGGGCCTGGAAGGTGACAATGCAGAATAAACCCCAAAGCTTGTGTAGTTCATAGTTTTGAACAATGGCTAAGATGTGACTGGTAGTTGAATTTAGCCGCATATGTTCTCACTTCTGGTGGTCAATGTGATCTCCACTAGGTTGAATCAGTCATCTATGAAAGTTGTCCAATTCGAGGTTGTTGTGAACTTAGATGGATGAAACACTAGCAGTGGGGTGCACAAGTGAAGATTAGGTGTGGCAGTGTGAAGAGACTAAGCCACTAAGGTGAAGAGTACGAAATTGATGCCTGTAGTCTATGGTAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATATTGGGATATAAGTAAAGTGACTTCATCCTTGCTAAAGGACTAAGAAGTTAACATTGTTGTTAAGATTTTGACCTTTCACAATGAGGTTATTCAACTTCAAACAGTTAGGGTTGAGTCCGTTGACGATCTAAATTCAATAGTTGGCCTTCTAAATGAGATGAAGAGGAAACACCCTTCTTTGTAGACCGTAGGCGTGGAAGGTGGCTACGGTGGAAGGTGGCAGTGCAGAATAAACCCCAAAGCTTGTGTAATTCATAGTTTTGAACAATGGCTAAGATGTTGACTAGTAGTTGAATTTAGCCACTTACGTTCTCACTTCTGGTGGTCAAATGTGATCTCCACTAGGACCACTAGGTTGAAACTAGTCATCTATGAAAGTTGTCCAATTCGAGGTTGTTGTGAGCGTAGATGGATGAAACACTAGCAGCGGGGTGCGCAACTGAAGATTAGGTGTGGCGG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ATGTCTGATGTAAGAGATGAAGATAAACTGGATGAATGCGACTTCTCGTGGGGTTTAAAGGGAATAGCGAAAAGTGTAAAGAAGGGAATTGGTAATAAAGATCAGTATGTGCAGTTCTATCGTTCTTTTACATATGATGTCGTGGAATACTTTCTCTATGATTCCATATATCTGTTCAAGGAAGGAGAATCAGAACCATACATTGGTAAGCTCATCCAAATTTATGAGCTTCCCGATAAAACAAGGAAGGAAGCAATTGCCGGGAAGTGCAATGTTGTTTGTATCTCCAAGGATCAAAGGAATCCGCAACCCTCAATTGAAGAAGCCAAGGCGGTGCACTATGTGTTTTACCGTACATTTGATGTTCAATATCATAAAATATCTGATGTACTGGGTGAAACAATCGCAAAAGTTAAGGTTAAGTACTTATTGAACTATAATGATTTTCAACTGTCGAATCACGCTAAGTTAGATAGCGGGAATCTGGAGGGGAGCATAGAAAATCCACTTATTTCTGTTGAAGATACTCGTGTGGCTGATAAAGCTGTAGAGAATGACGACGTTACTGGTTCTTTTACATTAAATGAAGATGATGGGGAAAAAGATATTCTGGACAAGTCAAAATTTTATCTTCCAGAACATCGTGAAGATGCTAAAAAAGATACGGGTCTAATGAAGGACTTAAAGGATAACTTGGTATCCAACAAGGATGTTGGTGGTACAGATGAAAATGTTTTGTGTGTTGCTGGCGTGGGTTCTATGTTGGTGAAGGATGACCAAGTATCAAACAAAAAGGATCCTAGACCTTATAAAATAGGTTCAATGAAGTCATATGATACCCCAGTGGTCTTGGGTTCGGGTCAGAAAATTCTCAAGTCTGCTACTGTTTTTGCTGGGAGTAATAAGGGGTCAGGTTCATTGTCAGCTGGCGTTGTTTCTGAAGCAACAGATACAGGCAAGTTGGAAAATGTAGTTACTCCGTTGGATGAGAAGGCATATAATCTTAGGCTGAAGTCGGATGATAATAGTGGAAAAATTGAAGGCTCTAGTATAGTTCCATCCACTACTGGCTCTGACAAGGGAAAGACAGAACTTAAATTGGACGTTCATATTAGAACTGGTAATGTGCGGAAATTAAAGTCTGATAATGACTACGGTGCTTTGGAGGACAGGCCGTCTAAGAAGCTTAAGCATATTGGTACTCCTCCAATACCAAGGAATGATGGTGGGATCATTACTAAACAATCTGCTATAGTTTCTGCTGCAAATAATAAGGCTTCACAATCTGCTGGAGCTGCTGCTAAAACAAATGATGAAGGTGAGATGAATCGATTGGTTGGTACAAGCAGTGGCATTCCTAGGCTGCTGAAGTGCAATAGCATAACTGAGAGCAAGCCTGTCGACAAGTTGCATAAACTGTCTACCAAACAATCAAGAGATCAAGAAAAATATGCCATCACTTCCGGTACAAGTAAGATGGTTATACTACCTGTTGGTGCTGCTGTTGAAACTAGTGATAGAAGACAATTGGATAGCAGTACAAGTCATGGTCTTCCTAGGAAGATGAAGTCCAATGGTGCAACAGAGGAAAAATCTAGTGACAAAGTGAGCAAAGCTGTTGCAACACAATCAAAAGATTTGCGAAAATCAGCCTTTGACTCTAGTACGAGAAACGAATCTCCACAATCCACTAGAGTTGATATTGGCTGTGTGGCGAAGCTTGCTAAGGGTTTGGGGGGTACAAAGGATGGCCTCTTTGAGCCCAAATCCAATGTCATGGTGGAGGAAAAGTCTAATCTCAAGTTTCATGGAGCACCCATCAAACAATCTAAAGGTTTGGAGGCTCAAGCTTACGGGCGACTTAAGGAAGTCACTCAAAGACCACCTGATGGGAGCAAATGGGTGCAGACGAGTTCTGTTCCTTGGGAAGAAAGAATGAAAGAAGCCCTTGATCATGATCAGGGAACTCTTGTTCTGCTCTTGAACTTGGATCCCACATACACCTCACTCGAAATTGAGAACATAGTATGGCATGGTCTTGGATATAGTTGCACGGCGAATTTGGTGCCCCGTACTGCTACATCTAGCCCACATTCTGGACAAGCTTTTGCTATTTTCAAAACTCCAGAAGCTGCAAAGAAAGTCATTGGGAAGCTGGCTTTGGGGTGTTTAATGCTCCCTAATGGAAGGCCTCTTGTAGGCATCTATGGGGGATTAAGCTTCTGTGGAAAGAAATCTTCATTTCCTGGTCATCTGGCCATTGATAAACTAAGGCACCAAATATCACGAGACTCGAGAGAAGCAGTTTCCACTTCTCATTCTTCTCAACCAAACACCCTTGAGTATGAGATGGCAATTGAATGGCGCTTACTACAAGAGAGATCAAACGTGTGGTGGACGACGTTGCACAAGAGACAAAGAGAAGAAATTGAAAAACTGAAGGCGAGGCTGAAGTTAAAGTGA 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The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo25955.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902234547|gb|KNA23489.1| (hypothetical protein SOVF_024410 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1483.4 bits (3839), Expect = 0.000e+0 Identity = 778/862 (90.26%), Postives = 782/862 (90.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731332269|ref|XP_010677112.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104892805 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 443.4 bits (1139), Expect = 8.900e-121 Identity = 281/548 (51.28%), Postives = 336/548 (61.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870860464|gb|KMT11800.1| (hypothetical protein BVRB_5g105010 isoform B [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 429.1 bits (1102), Expect = 1.700e-116 Identity = 281/574 (48.95%), Postives = 336/574 (58.54%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902208368|gb|KNA15933.1| (hypothetical protein SOVF_093850 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 8.400e-87 Identity = 291/841 (34.60%), Postives = 416/841 (49.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731352235|ref|XP_010687440.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104901549 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 312.4 bits (799), Expect = 2.400e-81 Identity = 195/427 (45.67%), Postives = 256/427 (59.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RX37_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_024410 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1483.4 bits (3839), Expect = 0.000e+0 Identity = 778/862 (90.26%), Postives = 782/862 (90.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CI65_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g105010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 443.4 bits (1139), Expect = 6.200e-121 Identity = 281/548 (51.28%), Postives = 336/548 (61.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CDC8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g105010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 429.1 bits (1102), Expect = 1.200e-116 Identity = 281/574 (48.95%), Postives = 336/574 (58.54%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R8Q0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_093850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 5.900e-87 Identity = 291/841 (34.60%), Postives = 416/841 (49.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BUQ8_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g189870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 312.4 bits (799), Expect = 1.700e-81 Identity = 195/427 (45.67%), Postives = 256/427 (59.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G11470.1 (bromo-adjacent homology (BAH) domain-containing protein) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 2.200e-40 Identity = 89/180 (49.44%), Postives = 121/180 (67.22%), Query Frame = 1
BLAST of Spo25955.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G15605.4 (nucleic acid binding) HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 9.400e-20 Identity = 55/140 (39.29%), Postives = 75/140 (53.57%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo25955.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo25955.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo25955.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo25955.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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