Spo21936 (gene)

Overview
NameSpo21936
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_00709 : 32505 .. 39891 (-)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCATCTATTGTGCAGGGAAGTCAAACTGAGCGAGTATACAGAGGATTGTTTGAAGAATTAGTCATAGTCAAATACGGTGATATGTTGAAGAGGTTACTAGACAGCTTAATAGTTTTGTAAAAGTGAGTAGTACTCTTCAAGTCTTCAGTTTCAATATCTTCTGATGTATCTGTTTGCGGAAAGATTACATATTAGTTTTTCTTCTTGCTTTCATCATATTATTCGTGTATTCTTTACATCTGGAATTTTTCTTGATTCTAGCAATCTCATTGCTCTGATAACTTGGCTATCATTTCTAGCTTTAAAGGTTGTTCTTGTTGATGTTTTCGACTTAATGAAACTCTCTCTTTGGATATCCATATGTTCCTTGTTTGCATGCTATCTTCTTGATTCCTCTTTCAACCTTTATTGTGATATTCTGTATGCAAACCTAGATAAGAGTGTTCTGTACACCTCTGGTTTCTTCCTTTAAGATTGTTGTTAGTCAGAAGATTTGTGAAAATGTGCTTCATCCATTAAATAATCAATTGCTTAGTAGAGGCCTTCCTAGATAACATTGGACCTGATTAAGCTGTACTTTTGGTGGCAGCATCTGTTTGGAGGTCTATGGTATTGTTGAAAGCATTAATACTACACCCTTTAAAAAGCAAGGAATGGTGTTTTACTATTCATCAAATAGTGAAGTGACGGATCCACCCTCACATTCCTTCACGTTTTCATTTTGTCGTTATTCTTACAGACAGTGTAATCACCTCTTTGCCCTCATTCCCAGATTTCCCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCTCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCCCCTACTGATCCGCTGCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTTCCTCCCCTTCCGTTTGCGAACGCTACCTCTCATCTCTCCTCCGCCCCCTTAACTTTTCTCTCTCCTTTTCAATAACCTCGGATCATCAGCAAAACGTCGCCGACCACCTGGATCTCTCGCTTGGTACTCTCTAGTCTCTCCTTTTCTGTTTCGCTTTCATAGCAGTGAGAAGGAAATTGATTTCATCAAGGTAATTCCTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATAATTCAGCCTGTAATTAGTAATGATGGTCTGAAGTTGATTGGTTGCTATTACTTGATTGATTGTCTGTAATTACGACGCTTTTCAAATTCAGGATCTTGTTGCTGTTTTATGGAAATAAATTGGTAGTTTGACGCGTTGAGGAGGCGATTTCCCCCAAAAGTCAGGTAATTGTTTTCTTTTATTCATTCCCCAGAAGTAAGTATTTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTACTTGAGAAATGTATTATTTGGAAGTGTATTGCATTGTATGTTGGAAAGGGGAAACAGATTTCATCATGTAAAACCCAATGAAGAAGCAAGTTATGGCAATGTAAACGCTTGCAGAAATTCCTAATTTTCTCCTACAGCCTGCAGTGTATGACCACCCATGTGCCCTTCTATGTCATATCTGGAATAGATCATCAGATTACAGGAAAACAAGAAACATGATAAGAAACTTTAGTTGGATGGAATTTTAATTAGTTAGGAATGTTGTAAGGAACTTAGCAAAAGTTTGGATATGATACCTTCTGGTTTTTGCTGGTGATTGATGTAAGATGATGATGTTTAAATTAATTTTTTAGCAATATATTTGGGAAATAATATGTTCAAGCGTTCTTTATGTGCTTAAATTCTTTTGCTGATTGTTGCCAAAAAAAAAAAAATCTTTTGCTGATTATTGTGGGTTGCAATTGAATTTTTTTGTGGGGCAATTCCAACAGGTGATTTTAGAGAAGTGGCTATTAATCCACTGGGTTGCATTTCAGTGCCGATTATGGGTTCATCCTTCAGGTAACTGTACTATATTTTGGTTACCACAAAATTTGTTTCCTCAATGTTAATGTAAGAACTGAGTGTTGCTGGAGTGTGATTACATCTGGTCTTGAAGAGGCGTGTGAAACCAATAGAGACGAGATAAGCAAAAAATGCAATCTTTTTCTTATCTTGCTGTTCAATAATTTCTCTGAATAATTGGGGACTTGAAATTCGATTATTTGACATTGATGTGGAAAAATTGAAGCTTTTTTATGCTTCTTTTATATAGTAGGTTGGGAATTGGAATTCTGCACGGGTTAGGTAATTATATGGTTTAGGAAAAGATCAAACTGATTCGTCATTGTCTAGAACCGCAGCCACCCGTATTAACAATTGTCATTAAGAACAACACTGATAAATACAATTAAGTTACGGATAAGTTTTTCGATTTTGTTGACCGAGTACTGGCTAGGGGTAATGATCTCAACTGCTCACCTTCACACCAACACTACCTATAAGAAGAGGGTACTGCTTTTACTACCAGCCAGAGGTGGCGAGCAGATAGGTTACTTGGCTATGTTTTTACCAATTTTAAGGTTCATGAATTGCTGTTGGAGCTAAATTTCATGTCCAAATATGAGTTACCAAAGAAAGTAATCCAGCATTCTCATTCTCTCTGGTCTTTAACTCTTTAACTCTCAGTTGTTTGAAACTAGACCAGAATTAGCAAGATCACTAATGCGCGAGGATGAGGGCGACTATCCATTTGGAAGTAGTCATAACCTGCCGTTTGAGATTATAAACGCACACTCTCTTGAGTCTTTCCGTTACATTGGTATTGATCCTGATGTTTATGAATTATGAATTTATGATCACTTGACTAGGAAGGTTCATAAAGAGATTAGTGGTGCTTCCTTATATAAACTCCACTATATACCTTTATCAGGACTTCTTCAGAGATTAATCTTTTCTTATATAGATTCCCTTGGATATTTGTTACACTCAACTAAGAAATTTTGACGCCTAGGCCCTAGGCTTCTTGGAAGTTAGAACTATTGAACTGTTGCACGTTCTTATCTCATAAAGTAGCGTACTGAGTACTGACTGACAGTGGAAGCAGGAAAAGCCTAACTGTCAGTGTGATGTGTGCAATCTTGCAGAGAGAAAGAATTACGCTTATTATTTTCTGTGTATAATGGTAAATCATTTGGAAATTCACTCTTTTTTGGGAAACTAATCATATGCAATATCCAATGTCCTAGCAGTAGTTGCTAAGATTGATGTCTGCAGTTTGGAGTGGTTGTGGCGGACGGGAAAATAGGAAGGTAAATTTGCACGCATTGAAGCCTAACTAAGTTGGGGCAACTTTCTGTAATATATGAATTCTCTTTAGATAGATATGACGTAATGCTTGCATTTCAAAAGATATTAACGTCTTGTATACTTATTCCATTGTCCGCGAAATAGTATTATTCTGTATCTCAGTCGATGATGATCAATGGCCAGTTAATAGACTTAAACTTTTGTGTTACTTGAAAAGAATCTATCTATCTTCTTCCACAGTAAGATATTGGTGATCTTTTTAAATGAAACTGGTGAAAGTATTGAATCTTATTTAATAATTTTATATTTTTTTGCATGAAGAATCAATCAGTGCTAATCCGACTCAAGCTGAAAAGGAGGAGGTTGATTCTTGTTCAATATATGTTGGCAATGTGAGGCAATTTCTATCTTCTTGGTATCCTTATTTCTCTTGATATTGATATTCTTTAACTTATAAAATGTCAGTGTGGAAATGTGCAAGCTTTGATTAGATTTACAATTAACGTGTGTGAATTTTGTAGTTGAGTGTTAATTTAGATCTCTTTCTCTCATTGTACAATAATGCATTAATGGATGGATTGCGTTTCATCTCTCTAAATTATCTAGGTAACCTGAGCTATGCAGATACTGCAGAGTCGCTGCTGGGATTATAACGTCATTGCTTTCAAGCATTAGTAGAACCTTGTTTAAATTCTCTCCATATGCAAACGACAGTTCACATCATTATTTTGTTACATCTGAAAATTTGTCAAATATTCTAGAATAGGAATAGATTAAGATTATAGTTGGATTTTCCATGCTTTCATTTTAATGGAGTGGTGAGACAGGATGAGGAAAATGATGGTGGACTCTTTATCACAAGTCATTGGGACAATGTGACAGAAATTCCTTGCAGGGAGTTTATAAAACTTGTATCGATGTGTTTCGAATCACGACTAAGTATAGGGATGTTAACCGGTATATTGCATCAAGTTCTTGTAAACTAAAGAAAGGTTATGTTTTGTAACTTCAACTCTCTCTAGTGTTTTTGTGGCTACAATTTCATGTAGGAAATGCCAGTGGAAAGATTTGCTTGTCTTTGATTAGTTTAGTGTACCCCGTGACCTTTTATTGTTCAGTTTGGCATGAATGTTGCTCAGAAGCACTTAAAGAACTCTTCAAAATTTTGGTTTGGTGTATGTTTACCTTTGTTTGAAGAATTTGATTAACAATTTGGAAGGGGAGAATGGCTTAACTCAGTATTTGGAGTAAGACCTTGAGGGCATGAGAGCGTATCAGGCGAGACTAGAGGGATTTATAGAGGCCCAACAAATACCTTACATGTAACCCCTTGTGATTGTCTTACACGAAGGTGGTTGGCGTGTATTAAGCTGCTATTACTTAGTTGTGTAGGTAATATCTGCTTTTGATTGACGGTTTGGGAGGGGATATGCAAGCCTCTTAGTTAATTACCTATGGGGAGGAACAAATGTTGGTTTGGCACTGGCCATTCCAATGGTAAGCTTTCTGTAGATATTGGGTTCTCAATTTTATTAGCGTAAGTAGTTAATTTGACAAGGAAATTGCTCTACATTTCAGGTAGCTAGGATATATCTTCCCTTTATGATGTACTCTGCGTACGCAAGGAAGAATTAGCAGCAGAAGATATGCTCCAAGTGCAGAGCCATATGTCCAATTTGTCTCTGGTTCTTTGGCACATCGTTAGCTTGTATGGTTGTAGCACATGTTATCCAATTGAACTTGCTCACGCTCGAATGCAGGTGCTTATCCTTTCATGTTTTTGTAGATTACTGATGTACAATTTTTTCTACCGCGTTGTGTGAATTATTGTAACTATAATCTGTTGGCACTCAATTTTGAATCTGCCTTTTTATTTGATTGTAGGCATTCAAGGATACTGGAAAGGAGCTCCCTGGTGTATTCTAGACCCAAATTAGGACTTTCGAATGCTAAAAATACAACCACTTTTCAAGGCAAGTGTAAGTTCATCTTGGCTTTCATGTAACCATTGTGGTCTCGTATTACATCTCTATTATCCTTCTTGAAATTTCATACTACTGCAACTAAACCTCAAAACCTCTTTGCTTTACAAATACACGAATACATGTTTAGTAACCTCCACCAGTTCCGGAATGCGTTAAGGAAAGAGCACCCTAAAGGGAAGTAAATGCCTACACCATTAGCATTTAGTTGAAATGAAGACAATGAGTTAGCATAAGGCCACCTTTGAACTTACTTTCGAATATATTTGTTTTGCCTCATTTCTTGTATTTTATTTAATTTATTTATTATGTACTTGCAGGGAAGCTGAAATAAAACAATGAATGAGAAGAGCAAGACCAGGGTGAATGTTCAAAGTTTGTAAGTATAGAGATAGTGCTAACTGATTTATGCTTAATATAAATAAAAAAAAGGAAAAAACTCCATTTTTGGTGTAGTTACAAAAATAGACATTTGTACTCAAGAGATGATTTTTGCTCTAGGTCAATGATGCCTCTAATTTGATTTAGGAGCCCTATCTGTGGAGTTGGATAGTTTTGCAAACTACTTTCATTTGTATGCTATAGAGTATAGAGAACTATTCATGTAGCTCGGGACGTCCAAGAGTGTTAAATTGTTAATCAACTTTGTCTTGGGGTTATATCCTGTCATATATGGTGATATAGTTTACACCCATAAATAAGAAATTCAAGTGAGGAAGAGACACGAGGTGATAAAATTCAAATACTACTTCCGTCATGGAATACTCAAAACGCTTTTCTTATAAGGTCGTTCTGGATTACTTGCAACGTTTCTAGAAATGAAAACTTTTATTAATATTATATCAATTTCTCACTTATTCAAAGATTCACCTATATCTCTACTCCCTACAAAAAATAATATTAAAAAATTCCACTATCTCCACCCATATCCTTTTAAAAGTTTGATACACATCTCACTACCTATATTAAAAAATACTCCACTACCATCTAATTAAATAATAGGTCAATTATAATGCATTAAATTCTATGTCGGTCAAATCGTTTTGAGTATTCTGAGATGGAAGGAGTATTTTTTAATATGAAGTTAATAAAAAACTTGGTGCGGGTCATTTTTACTTTAGCTACTTGATATTATTGTGTATGCATTAATATGAAACTTGCGCTTATATATGAAAATAATACCAATAATTAACTTATTTTCTATTGTATCAATAAACAACCATCTCTTAACTTGTTCACAATCTCCAAATAATTTGCTCCGAATTCTAACTAAGTTTTGCTATCTTGGTGTGCGTCGTCCAACAACTAGTATTGTAAGAAGTTGAAAACAACATTTCTGTAATGCTGCAGTAAAACGACTACCAACTATTGTAAGTTTGAGGCTCAAATTGGAAAGTAATAGTTTTTCGTATAGATATGTAGATTATGTTTGAACTTGTTAATATTGTTGACCCAACCCCTACACCTAAGATAACTACTAATACACGGTAGAACTTGAACTTAGAAGATCTGAGCAAAGCATACATGAAAGCATGACTGTTTCGGGTAAAGAAGCTCAACCTAAAGGATGAACTTGAAGATGAACATCAAGGGCATACTAGAGCTGGCAAAAGCTGACTCAACCCGCCGACCCAACTCGAACACAACCCAATAATAAAGGGTTGGGTCAAGATTTTTAACCCGCTTAATTAAATGGGTTGACCCAACCCAACTCGTCTAATTAAATGAGATGCGTCAGATTGAAATTTTCAGTCTGAAAGCAACCCGTCTAACGCATATACCTATTTGGGTCAGGTCAATCCACTCAATCCGTATAAATATTTTCTTTTAATCTTTTTAGCTTTTACAAANAACCCGCTTAATTAAATGGGTTGACCCAACCCAACTCGTCTAATTAAATGAGATGCGTCAGATTGAAATTTTCAGTCTGAAAGCAACCCGTCTAACGCATATACCTATTTGGGTCAGGTCAATCCGCTCAACCCGTATAAATATTTTCTTTAAATCTTTTAGCTTTTACAAATTAAAATATGAAAACGCTTAAACTAACAACTAGCATCCTTCCCTACCTAATCTTCTTTCAATATCTATTTTCTCTAACTCATCTCAAAGATTATCAACCTAGATTTGTTCTCTATATATTCTTTTTATCAACAAACAAAGCATTGGATCTTGGTTAATAGGTAATTGAAGTTGAAGCAATACGAGAAGAAGTAAATAATGAG

mRNA sequence

ATGCCATCTATTGTGCAGGGAAGTCAAACTGAGCGAGTATACAGAGGATTGTTTGAAGAATTAGTCATAGTCAAATACGGTGATATGTTGAAGAGCATCTGTTTGGAGGTCTATGGTATTGTTGAAAGCATTAATACTACACCCTTTAAAAAGCAAGGAATGGTGTTTTACTATTCATCAAATAGTGAAGTGACGGATCCACCCTCACATTCCTTCACGTTTTCATTTTGTCGTTATTCTTACAGACAGTGTAATCACCTCTTTGCCCTCATTCCCAGATTTCCCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCTCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCCCCTACTGATCCGCTGCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTTCCTCCCCTTCCGTTTGCGAACGCTACCTCTCATCTCTCCTCCGCCCCCTTAACTTTTCTCTCTCCTTTTCAATAACCTCGGATCATCAGCAAAACGTCGCCGACCACCTGGATCTCTCGCTTGTGAGAAGGAAATTGATTTCATCAAGGATCTTGTTGCTGTTTTATGGAAATAAATTGGTGATTTTAGAGAAGTGGCTATTAATCCACTGGGTTGCATTTCAGTGCCGATTATGGGTTCATCCTTCAGAATCAATCAGTGCTAATCCGACTCAAGCTGAAAAGGAGGAGGTTGATTCTTGTTCAATATATGTTGGCAATGTAGCTAGGATATATCTTCCCTTTATGATGTACTCTGCGTACGCAAGGAAGAATTAGCAGCAGAAGATATGCTCCAAGTGCAGAGCCATATGTCCAATTTGTCTCTGGTTCTTTGGCACATCGTTAGCTTGTATGGTTGTAGCACATGTTATCCAATTGAACTTGCTCACGCTCGAATGCAGGCATTCAAGGATACTGGAAAGGAGCTCCCTGGTGTATTCTAGACCCAAATTAGGACTTTCGAATGCTAAAAATACAACCACTTTTCAAGGCAAGTTAACCTCCACCAGTTCCGGAATGCGTTAAGGAAAGAGCACCCTAAAGGGAAGTAAATGCCTACACCATTAGCATTTAGTTGAAATGAAGACAATGAGTTAGCATAAGGCCACCTTTGAACTTACTTTCGAATATATTTGTTTTGCCTCATTTCTTGTATTTTATTTAATTTATTTATTATGTACTTGCAGGGAAGCTGAAATAAAACAATGAATGAGAAGAGCAAGACCAGGGTGAATGTTCAAAGTTTGTAATTGAAGTTGAAGCAATACGAGAAGAAGTAAATAATGAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCATCTATTGTGCAGGGAAGTCAAACTGAGCGAGTATACAGAGGATTGTTTGAAGAATTAGTCATAGTCAAATACGGTGATATGTTGAAGAGCATCTGTTTGGAGGTCTATGGTATTGTTGAAAGCATTAATACTACACCCTTTAAAAAGCAAGGAATGGTGTTTTACTATTCATCAAATAGTGAAGTGACGGATCCACCCTCACATTCCTTCACGTTTTCATTTTGTCGTTATTCTTACAGACAGTGTAATCACCTCTTTGCCCTCATTCCCAGATTTCCCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCTCCAAGTGCCTTCATCCTTTTCTTCTCCCCTACTGATCCGCTGCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTTCCTCCCCTTCCGTTTGCGAACGCTACCTCTCATCTCTCCTCCGCCCCCTTAACTTTTCTCTCTCCTTTTCAATAACCTCGGATCATCAGCAAAACGTCGCCGACCACCTGGATCTCTCGCTTGTGAGAAGGAAATTGATTTCATCAAGGATCTTGTTGCTGTTTTATGGAAATAAATTGGTGATTTTAGAGAAGTGGCTATTAATCCACTGGGTTGCATTTCAGTGCCGATTATGGGTTCATCCTTCAGAATCAATCAGTGCTAATCCGACTCAAGCTGAAAAGGAGGAGGTTGATTCTTGTTCAATATATGTTGGCAATGTAGCTAGGATATATCTTCCCTTTATGATGTACTCTGCGTACGCAAGGAAGAATTAG

Protein sequence

MPSIVQGSQTERVYRGLFEELVIVKYGDMLKSICLEVYGIVESINTTPFKKQGMVFYYSSNSEVTDPPSHSFTFSFCRYSYRQCNHLFALIPRFPQVPSSFSSLQVPSSFSSPLLIRCLFAFSEISSPSVCERYLSSLLRPLNFSLSFSITSDHQQNVADHLDLSLVRRKLISSRILLLFYGNKLVILEKWLLIHWVAFQCRLWVHPSESISANPTQAEKEEVDSCSIYVGNVARIYLPFMMYSAYARKN
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo21936.1Spo21936.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo21936.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo21936.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo21936.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo21936.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0009553 embryo sac development
biological_process GO:0050983 obsolete deoxyhypusine biosynthetic process from spermidine
biological_process GO:0008612 peptidyl-lysine modification to peptidyl-hypusine
cellular_component GO:0005634 nucleus
molecular_function GO:0034038 deoxyhypusine synthase activity
RNA-Seq Expression
   



Co-expression
Gener valueExpression
Spo031990.68Barchart | Table
Spo267890.68Barchart | Table
Spo005930.67Barchart | Table
Spo109650.66Barchart | Table