Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAGTCACTGCACTATTGGATGAGTATTGTACTCTTTTATTTTTACCAAAAAAAACTTAGTCGAGCTTCGGGCTTTTGCAGAAATGGAGGACGAATCATCTATGTCACCAAATAATCCATTTGCTCTCCAAGCCGACCCAACCGTCGCTGGATGCTCTCTCTTCCCCATAACTTCGGGCACCACCACCGTCGCCGCCGCCACAACTCCTCAATGGCTAAGCAGTTCCAGCTTCACCGCCGACCTCTCCGTCATCAACGACACCGTCGTCTCGCTTCAATCTCGCATCATCAAAGACGACGACGATGACGAAGAAATGAGAGAATCAGCACCCCCAGAAGCTTCTAAGCTGTCTTCCACCTCGTACCAGATTCTGGAATCTTCGGAATCCGACAAGGGGGAGAGAGGTTACTCAGGGAAGAAGAGGAAGAAGTCGAAAAAGAAGCGGAGGAGCGAGAATGAAGGAGGAGCTGGTGAGTTCGAGCCGTTTGCATATGGTGGTAGAAAGTCTGGTGTTCGTGCTTGGGCTAATTCCGATTCCAAACCCTCTAAGGATTATTACTCAGATTCTCGGGGTGACCGCGATAACCTGGCCTTTGGGTGCTTGTATAGGTACTTCTTTATCTGTACATTGTGAATTCTAGGTTTATTTGATGATTGAAATTGGAATTCTGTTGAAAATTGGGTTATAGAAACCTCAAATTCTTTGAATTTTGCATACTTCACTTGTTTGGTGGTATATATTGTTGGAGCGGAATTGAAGGGAAAGTTTGGGAAAGAAGGGAAGCTAGGGAATGAAAGGAAAGGTTGTGACAAAATGTTTTTGAATTTTTGAAAACCATGCATGAAATGCCCTAAACAAAGCATAGTTGGACGACAAAAGAGTGAAGTAGATAAGTTACTAGAGAACTCTATTAACTAAAGTATTCACAGTTTCGCCTGGACATCAAACTGAATTTCACTGCAGCTTGTAATTGCCAAATTTCTGCAGGTTCTGTTCCAACCTCACTTTAAGGGGTTGTTGTCCTTATTGGGCCAACACTTGATTTACGCCTGCCGTTTGAAAAACTTGGTCATTCGCTATCATAATGCAAGATGACTAAAGCCCAAATGCATATGTGGCTGGTGCTGGTTTAAGTAATAGATCCTGTTAAATCCATTGCCTTACCTCACCCTTTATTGCTTATATATCATTTTTAATTTTTGATCGGAACCGTTCAGCCTCTTTGTTGAAATATGTGATTTTAAAGTTATACCTAATATTTAGCTGTATAAACTCCACCACTAACTAATATCCAATGCTGAAAGGTACTTAAAATGATGTTCATGGCAAACAAATCGTTTTCAGGTGGTTTGGGCAAGTTTGGTTCTTGTGATCTTAGTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTATATAGAGCTTTTGGGAACCAAAATATTCCAAGATTTCTGAAGTATTGAGCAGAGTTTCTAGGTTTTGGTCTGCAGTTTTGCTTAACAACTTACAACCCAGAGTTTGAGAAAGCTAGAAAAGGAGGGCCTTTGGGTTGGTGGGGTGGGGTGAGAGAGAGAGAACCTTAGATAGGTTGAAAGTTTTTAAGTTTCTAACAACTGAGGCATTATTATGATAATCGATTTCGTCCATTCAGAAATAATAGGCACATATATTTATTATAATTGGATTGCTTAATGTACGAGAGAGACTGAGAAGGATGTAACTTTACAAAGGGTCATTTTTGTGAAATCATGCTAAATTCCTTAATTATGGGTTGAAAGTTTGGAGCCATGTGACAACTCCTGAAAACTATTTCCGGATAGAGGAAATATATTAGCAAAAGTACCACAAGTCTGCTTGTTTCATCTAGTTGCCAACTGACATGCGTGTATCATTTTCTTACAGGATGGATATCGGGCGATATAAGCTTCATGATGTTGCAAAAAGTTCAGGGATTGATTTTAAGCAGCATCCTCGACTGAGTAATTGGGGGTTCCTTACAAAAGGAGAGCTTGATGCGGATGGATTAGATACTAAACTAAAAACTAGTGGACGCTATTGGTCAGCTAAGCATTCAGTCTTTGAACAACATAGGAATTATAAGCGCATTCGCATCGTTGCTTCAGAGAAGCATGTACATTTGACGTATGATGATTTCATTCCGTTTCTGGATGAAGATGATGATAGTAGCTTAGTTTCTAGAGCTTCTGTGATTGTGGAGTCATGGGAAGATGAGGTGCTGCGGAAAACAAGAGAATTCAATAAAATGACTAGGGAGCACCCCCATAATGTTACAGTATGGATGGATTTCGCTGAGTTTCAAGACAATATAGCAAGTAAGCAACCACAAAAAGGTGCACGCTTGCAGACATTTGAGAAGAAAATTAGTATATTAGAAAAGGCGGCTGAGCTGAACCCAGAAGATGAAGATTTATTGCTTTGCCTTCTAAAAGCTTATCAGAAAAGGGATAGTGCAGATGTTTTTATTGGTAGGTGGAAGAAGGTTTTGATGAAACATTCAGGAAGTTGCAAGTTGTGGAGAGAGTTTTTACGGGTTGTTGAGGGAGACTTCTCCACTTTTAAAGTTTCTGAGGTTCGGAAGATGTATGCTCATGCAATCCAAGCTCTCTATGCTGCATCTAGCAAGAGGCATAGGCAGGTTCTTACATCCACTTTGTGCTTGTATTTTCCATGTGCATGTTTGCATCTGTGGTGTAGCCTTTACTGCAATTCCTTGTCTCTTTACATATATTATTTGCATATGTCGTACTCTCTTCGTGCTATCTGCTATGTGATGTTTTTCTTTGGTTTGCCTTTGTTTGAAATTATGCTCCTCTAATTGATGGTTTTCTCAAATTTCAAAAAAGTAATAATAAAAAGCAGCAGGAATTACAATAGTGGATCTCTCCTAGGTTGTGCTTTTGTTCTTGTCATTTCCTTAATCATACACCTTTTGCAGAAAAGTGAGGTCCCCATTTTCTTTGCACTATTCTATTAGTCTTTCAAGCTTCGTGTGTCCTTTAATATATTGTACATGTAGACTGTAGAGGTTTATTTTTAATGTTTATCTGATACTCGCTCTGTTCTTAAATAGTTGCAACAATTTGACAGGCACACTTGCCAATGCATAAGTTTGACCATTAGTATCTGTTACTCCCTCCGTCCCTTAATACTCTCCCCGCTTTCCTTATAAAGCCGTCCTTTAATACTCGCCACGTTTCTATAAATAGCATACTTTTACTAGTATTATATCATTTTTCTCACTTACACAAGGACCCACAAATATTCATACTTCCTAAGAAAAGTTAAAAAAATTCAACCCCACCCATACCCCACCCCTTTATTTGTCACATTTCCCACTAACTATATTAAAAAAATGCTCCACTATCAACTACGACCTAATAAGTTAATAAGTCAATTAAATTGCCTAAAACTTTGTGCCGGTCAAACCGGAGCGAGTATTAAGGGACGGAGGGAATATTATGTATCAGTAAAAAATTGTAAATATCCGGTTTTTAAAAATTATGCGTTGGAACTAATACAACAAGATAATACACATATCTGATTTTCATAAATTGGTAAGAAAATGTGGCTGAAGTTAATATATAAATAGTGAAACAGTTAAAAAGTTGCGATTATTTAGGGAAGGAGGGAGTATTATCATTTTATTTCCCGGGTTGAAGGCTGTGATTTGTTGTTGCTGTTGTCGTCATAAGTGCATTCGTATGTAATTTCTGTTTCTCATTGATGTATGCGTGTAATTTCAAGGACATTAGACCATGGGTTGTCTTTCTCAAATGCTTGATTTGCATTTGTTAACTGCAGGTTTGTCCAACTTTGGAACTGCCTTCTCCGGAGAATGTGGATACTGACCTTGAAATGGGCATTGTTGATATACTTCTCAATCTGTGCCGGTTTGAGTGGCAGGCAGGTTATCATGAGTTAGCCACCGCATTATTGCAGGCTGAAATAGAATATAGTTTGTTCTCTCCACCTTTACAGCTCACAGAGCAGAGCAAAAAACGGTTGTTTGAGCACTTCTGGACTGGCAATGGTGCAAGAGTTGGAGAAGATGGTGCCCTTGGTTGGTGCACCTGGCTGGAGAAAGAAGAGGAAAACCGACAGAAGCTCATGCGAGATATATCTGTTAAGGAAGACGAGCAAGGTGGTTGGAGTGGATGGTTTGTCCCACCATCCATAGCCAAGGAGAATTCACCTAACTTAGAGGATGATGGCGTTACTGATATGGCTGCGGCGGATACGGAAGAACCAAAAGACGACATGGATGCAAAGCAAGAAGAGGATGACACTGCTCTGCTGAGAATATTAGGAATTGATGTCGATGCTGAAGCTAACAGGGAGGTTCATGACACAAATACGTGGGTCAGGTGGTCAGAAGAGGAGTCATCGAGAGACCATGATCAGTGGATGCCTGTTCGTATGTGTTTCCCTTTTTATAAGCTACATGCCTATATTTTCTGTTTTTGTTTTCTACTTGTGCATGTTTTCTCGGTTGCTTTTCTTTTCTCTTGTCCTAGTAAGAAAAAGGCTGCCATTTATTACTGGTTTTAATTTGTTTGGTATATCCGTGTATGGATGTTCCTAGAACTTGTGTGCAGCAGAATTCTTCCTTGTCATTGCTGCTTCCTGCTTCCATGGAATCTTACTTGTGGTGATGCATTTGTAATAGGGGCTGGTATTCATGTTTTCTGTCAGGTCCAAAAGAGTGAAAGAGGATATTTATTGATTCCCCTTGACCTATTTTTATTTTGTGAAATGGTTGAGAGATTATAAAGAAATAACTGTAAAGAGTGGTTGTCAACATTTTAGAGATTATGAAGAAACCTCCGTTAATGCTGTAGGAGAATCCTAGGAAGCTGTAACTAGTTGACTTTGGGTAAAAAGACATGGTTAATCCTTCTGACTCAATTGCTTAATTAGCTCTTGAATTTATGGATCAGTTGGACTCAATAATATAAGCTTGACTAAATTTGTACTCCACTGGTTCT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ATGGAGGACGAATCATCTATGTCACCAAATAATCCATTTGCTCTCCAAGCCGACCCAACCGTCGCTGGATGCTCTCTCTTCCCCATAACTTCGGGCACCACCACCGTCGCCGCCGCCACAACTCCTCAATGGCTAAGCAGTTCCAGCTTCACCGCCGACCTCTCCGTCATCAACGACACCGTCGTCTCGCTTCAATCTCGCATCATCAAAGACGACGACGATGACGAAGAAATGAGAGAATCAGCACCCCCAGAAGCTTCTAAGCTGTCTTCCACCTCGTACCAGATTCTGGAATCTTCGGAATCCGACAAGGGGGAGAGAGGTTACTCAGGGAAGAAGAGGAAGAAGTCGAAAAAGAAGCGGAGGAGCGAGAATGAAGGAGGAGCTGGTGAGTTCGAGCCGTTTGCATATGGTGGTAGAAAGTCTGGTGTTCGTGCTTGGGCTAATTCCGATTCCAAACCCTCTAAGGATTATTACTCAGATTCTCGGGGTGACCGCGATAACCTGGCCTTTGGGTGCTTGTATAGGATGGATATCGGGCGATATAAGCTTCATGATGTTGCAAAAAGTTCAGGGATTGATTTTAAGCAGCATCCTCGACTGAGTAATTGGGGGTTCCTTACAAAAGGAGAGCTTGATGCGGATGGATTAGATACTAAACTAAAAACTAGTGGACGCTATTGGTCAGCTAAGCATTCAGTCTTTGAACAACATAGGAATTATAAGCGCATTCGCATCGTTGCTTCAGAGAAGCATGTACATTTGACGTATGATGATTTCATTCCGTTTCTGGATGAAGATGATGATAGTAGCTTAGTTTCTAGAGCTTCTGTGATTGTGGAGTCATGGGAAGATGAGGTGCTGCGGAAAACAAGAGAATTCAATAAAATGACTAGGGAGCACCCCCATAATGTTACAGTATGGATGGATTTCGCTGAGTTTCAAGACAATATAGCAAGTAAGCAACCACAAAAAGGTGCACGCTTGCAGACATTTGAGAAGAAAATTAGTATATTAGAAAAGGCGGCTGAGCTGAACCCAGAAGATGAAGATTTATTGCTTTGCCTTCTAAAAGCTTATCAGAAAAGGGATAGTGCAGATGTTTTTATTGGTAGGTGGAAGAAGGTTTTGATGAAACATTCAGGAAGTTGCAAGTTGTGGAGAGAGTTTTTACGGGTTGTTGAGGGAGACTTCTCCACTTTTAAAGTTTCTGAGGTTCGGAAGATGTATGCTCATGCAATCCAAGCTCTCTATGCTGCATCTAGCAAGAGGCATAGGCAGGTTTGTCCAACTTTGGAACTGCCTTCTCCGGAGAATGTGGATACTGACCTTGAAATGGGCATTGTTGATATACTTCTCAATCTGTGCCGGTTTGAGTGGCAGGCAGGTTATCATGAGTTAGCCACCGCATTATTGCAGGCTGAAATAGAATATAGTTTGTTCTCTCCACCTTTACAGCTCACAGAGCAGAGCAAAAAACGGTTGTTTGAGCACTTCTGGACTGGCAATGGTGCAAGAGTTGGAGAAGATGGTGCCCTTGGTTGGTGCACCTGGCTGGAGAAAGAAGAGGAAAACCGACAGAAGCTCATGCGAGATATATCTGTTAAGGAAGACGAGCAAGGTGGTTGGAGTGGATGGTTTGTCCCACCATCCATAGCCAAGGAGAATTCACCTAACTTAGAGGATGATGGCGTTACTGATATGGCTGCGGCGGATACGGAAGAACCAAAAGACGACATGGATGCAAAGCAAGAAGAGGATGACACTGCTCTGCTGAGAATATTAGGAATTGATGTCGATGCTGAAGCTAACAGGGAGGTTCATGACACAAATACGTGGGTCAGGTGGTCAGAAGAGGAGTCATCGAGAGACCATGATCAGTGGATGCCTGTTCGGGATTCTCAGTACAAGGAGGTGATCGAAGAAGAACAGGAACAACTTTCTAGAGTCATCTTGTTCGAGGATGTTAGCGATTATCTTTTCTCGTTAAGCTCTGCCGATGCTCGCTTGTCTCTTGTTTTGCAGTTCATCAATTTCTTTGGTGGGGAGATATCTCATTGGTTTTGTACAAATTCTTCATGTTGGAATGAGAACATACGGAGTCTAGAAACACTGCCAAACTCTATCCTGCAATATCTGGGAAGGGTAAATGGTTCTAGAATATTTGAAAGTGGTTCAAGCACTCTCTGTATGGAGTCTCTGTTGCATCATTCAGAGACTGTTGCGAGCACAAATATCATGAAGTTTCTGCGCAATGCTGCTCTCTTATGTCTAAAAGTTTTCCCTCGAAATTACAAGATAGAAGAGGCTATTCTTATTGCTGAAGAGAAAACTGTTGTAGGGATCAATTCCTCGCAGTGCGCAACTATGCCTTCTCGGGCTTTGGCAAAGCACCTCTTAAAAAGTGATCGACAGGATGTATTATTATGTGGAGTATATGCTCGAAGGGAGGCTGCTTACGGAAATATTGATCATGCAAGGAAGGTATTTGACATGGCATTATCATCTATCAGTGGGCTTCCTTTGGAAACTCAGTCGATTGCTGCTCCGTTGCTTTACCTATGGTACTCAGATATGGAACTTGCTGATGGTTTATGCGGTGAATCAGAGTCTACACAACGTGCTTTGCACATATTATCATGCTTAGGAAGTGGGATGGTTTATACTCCATATAGAAGTCGACCGTCAAGCACACAATTGCTGAGGGCACACCAGGGTTTCAAAGAACGCATAAGTACTATAAGATCATCTTGGACATCTCATAATATAGATGAGAGTTCCGTCAGTCTCATTTGTTCAGCTGCATTATTTGAAGAGTTGACTGCTGGTTGGGTTGTAGGGGTTGCAGTTATCTCCGATGCTCTTTCAATGGTGCTTCCTGAAAGAAAGAGCCGAAGCAATCAACTTGAATTTTTGCTCAACCGTCAAATGAGGATGCTTCAAAAACATCATCAACAAGCAACTTCGTCAAAAATATTGCAGTCTGTGTCAGTAGGATTGCAAATCTATCCCTTTAACCCAGAACTTTTTTGTTGCCTGATGCATCTTGGTCATCTGTACACCACACCCAATAAGCTCCGACGGATCTTTGACGACCTCTTTCAAAAAAAACCATCAGTTATCCTTTGGCTGTTTTCTCTGTCATATGAACTGAGTAGAGGGGCTTCTCAGCACAGGATCCATGGATTATTTGAGAGGGCGGTGGCAAATGATAGACTACGCACATCTGTGTTGCTGTGGCGCTGTTACATCTCATATGAGATTTGTATAAGTAACTTTCCTGCTGCAAGAAGAGTCTTTTTCCGAGCTATCCATGCATGTCCATGGTCAAAGATGCTGTGGCTTGATGGCTTCCATAAACTGCATAACATTGTTCCCGCGAAAGAGCTGTTGGATCTCCATGAGGTGATGCGGGATAAGGAGCTCAATATAAGAACGGACATTTATGAGATTCTTCTACAAGATGAATTTAATCACACAAGCACTGGGCGGGCCGGGCTTGCTGCTGCGTGTGGCGTCGGCCATGGGCCAGCAAGCACTGGTCTTCGACCAATGGCCCGTGCTAGCTGTTTGCGGCTCTGGGTGTTGCTCGCTTCCATTTGA MEDESSMSPNNPFALQADPTVAGCSLFPITSGTTTVAAATTPQWLSSSSFTADLSVINDTVVSLQSRIIKDDDDDEEMRESAPPEASKLSSTSYQILESSESDKGERGYSGKKRKKSKKKRRSENEGGAGEFEPFAYGGRKSGVRAWANSDSKPSKDYYSDSRGDRDNLAFGCLYRMDIGRYKLHDVAKSSGIDFKQHPRLSNWGFLTKGELDADGLDTKLKTSGRYWSAKHSVFEQHRNYKRIRIVASEKHVHLTYDDFIPFLDEDDDSSLVSRASVIVESWEDEVLRKTREFNKMTREHPHNVTVWMDFAEFQDNIASKQPQKGARLQTFEKKISILEKAAELNPEDEDLLLCLLKAYQKRDSADVFIGRWKKVLMKHSGSCKLWREFLRVVEGDFSTFKVSEVRKMYAHAIQALYAASSKRHRQVCPTLELPSPENVDTDLEMGIVDILLNLCRFEWQAGYHELATALLQAEIEYSLFSPPLQLTEQSKKRLFEHFWTGNGARVGEDGALGWCTWLEKEEENRQKLMRDISVKEDEQGGWSGWFVPPSIAKENSPNLEDDGVTDMAAADTEEPKDDMDAKQEEDDTALLRILGIDVDAEANREVHDTNTWVRWSEEESSRDHDQWMPVRDSQYKEVIEEEQEQLSRVILFEDVSDYLFSLSSADARLSLVLQFINFFGGEISHWFCTNSSCWNENIRSLETLPNSILQYLGRVNGSRIFESGSSTLCMESLLHHSETVASTNIMKFLRNAALLCLKVFPRNYKIEEAILIAEEKTVVGINSSQCATMPSRALAKHLLKSDRQDVLLCGVYARREAAYGNIDHARKVFDMALSSISGLPLETQSIAAPLLYLWYSDMELADGLCGESESTQRALHILSCLGSGMVYTPYRSRPSSTQLLRAHQGFKERISTIRSSWTSHNIDESSVSLICSAALFEELTAGWVVGVAVISDALSMVLPERKSRSNQLEFLLNRQMRMLQKHHQQATSSKILQSVSVGLQIYPFNPELFCCLMHLGHLYTTPNKLRRIFDDLFQKKPSVILWLFSLSYELSRGASQHRIHGLFERAVANDRLRTSVLLWRCYISYEICISNFPAARRVFFRAIHACPWSKMLWLDGFHKLHNIVPAKELLDLHEVMRDKELNIRTDIYEILLQDEFNHTSTGRAGLAAACGVGHGPASTGLRPMARASCLRLWVLLASI Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo19394.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902218740|gb|KNA18120.1| (hypothetical protein SOVF_073710 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 2325.4 bits (6025), Expect = 0.000e+0 Identity = 1178/1202 (98.00%), Postives = 1182/1202 (98.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731351852|ref|XP_010687243.1| (PREDICTED: protein NRDE2 homolog isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1713.4 bits (4436), Expect = 0.000e+0 Identity = 877/1162 (75.47%), Postives = 989/1162 (85.11%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870851707|gb|KMT03715.1| (hypothetical protein BVRB_8g188650 isoform B [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1660.2 bits (4298), Expect = 0.000e+0 Identity = 860/1162 (74.01%), Postives = 970/1162 (83.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870851708|gb|KMT03716.1| (hypothetical protein BVRB_8g188650 isoform C [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1651.3 bits (4275), Expect = 0.000e+0 Identity = 860/1185 (72.57%), Postives = 970/1185 (81.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731427239|ref|XP_010663903.1| (PREDICTED: protein NRDE2 homolog [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1280.4 bits (3312), Expect = 0.000e+0 Identity = 688/1160 (59.31%), Postives = 850/1160 (73.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RF76_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_073710 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2325.4 bits (6025), Expect = 0.000e+0 Identity = 1178/1202 (98.00%), Postives = 1182/1202 (98.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BUP9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g188650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1713.4 bits (4436), Expect = 0.000e+0 Identity = 877/1162 (75.47%), Postives = 989/1162 (85.11%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BQF7_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g188650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1660.2 bits (4298), Expect = 0.000e+0 Identity = 860/1162 (74.01%), Postives = 970/1162 (83.48%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8EL75_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g188650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1651.3 bits (4275), Expect = 0.000e+0 Identity = 860/1185 (72.57%), Postives = 970/1185 (81.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5WT90_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa000464mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1251.9 bits (3238), Expect = 0.000e+0 Identity = 684/1176 (58.16%), Postives = 840/1176 (71.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NRDE2_MOUSE (Protein NRDE2 homolog OS=Mus musculus GN=Nrde2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 254.2 bits (648), Expect = 7.000e-66 Identity = 242/933 (25.94%), Postives = 393/933 (42.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NRDE2_HUMAN (Protein NRDE2 homolog OS=Homo sapiens GN=NRDE2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 157.1 bits (396), Expect = 1.200e-36 Identity = 157/617 (25.45%), Postives = 262/617 (42.46%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NRDE2_SCHPO (Protein NRDE2 homolog OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=SPBC20F10.05 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 79.0 bits (193), Expect = 4.000e-13 Identity = 87/376 (23.14%), Postives = 169/376 (44.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NRDE2_DICDI (Protein NRDE2 homolog OS=Dictyostelium discoideum GN=nrde2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 3.500e-9 Identity = 66/265 (24.91%), Postives = 123/265 (46.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G17740.1 (unknown protein) HSP 1 Score: 1075.8 bits (2781), Expect = 0.000e+0 Identity = 594/1147 (51.79%), Postives = 783/1147 (68.27%), Query Frame = 1
BLAST of Spo19394.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G17712.2 (unknown protein) HSP 1 Score: 639.8 bits (1649), Expect = 3.400e-183 Identity = 386/832 (46.39%), Postives = 510/832 (61.30%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo19394.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo19394.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo19394.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 4
BLAST of Spo19394.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 2
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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