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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTGTTTCCAAAACAGCCCTGTTTTCTCCACGTGGCTATTTCCTATTCCCTTCACTGTGAGTCGCAAACGACGCTTGGGTTGCACCACTGGGTCCCACGTACCGTCACTTCTTTTCTTTCATTTTCTGGAAAAAAGGAACCCCAAAACAGAAAAAACAAACACAACTAACAATTTCTCTCTCCTCCATTGCCACCGGCGAAGAAACGACCTTCAAAATCGAGCTAACTCATTTGAAAAACTCGAATTCGAATTCAATTTCACTCTGATTGCTGAATTCGGCACCGGAAATCAAGGGCGGCGGTTAAAACGATGCCGTTTCCGAGGCGGAGGAAGGGGGCATCACCGCCACCACCATCACCGCCGTCACTTACACCACCGGAAGATTCGGATAAGGAAATAGAGGAGACCAGAAAGAGGAGAGAGAAAGAGGAGGAAATAGCTAGACGGACGAGGAGGAATAAGAAATGGTCATGCGTTGATAGTTGTTGTTGGTTTGTAGGTTTGGTGTGTTGTACATGGTGGTTTTTGTTGTTTTTATTCAATGCAATGCCAGCTTCGTTTCCGCAGTTCGTTACCGAAGCTATTACCGGGCCATTACCCGACCCGCCTGGTGTGAAATTACATAAAGAAGGGTTGAAGGTGAAGCATCCTGTGGTTTTTGTACCCGGGATTGTGACGGGCGGGCTTGAGCTTTGGGAAGGTCATCAGTGTGCCGAAGGCTTGTTTCGGAAACGACTTTGGGGTGGTACTTTTGGTGAATTGTACAGAAGGTATATGCTTTTTTTTCCCTTCCTTTTTTGGGTTAGTTTAATGTTGATGGTTTTGTTTGGTAAATTATGAATAACTATGAAATTGAAATGTGGTCCAAAATGAGTTTAAATGCTATGTTATTTGGGCACGGGTACTTGTCTAAGTGTTTGACTTGAGTTTTGTGCAAAATTTGCATGATTTTAGCACACATTGAAGTGTCAAAGTGTCTAGAGGATTCGACACAGGTATTTGAGGTGAAATAAAATTTTCATGATTTTAGCACATATTGAAGTGTTGAAATGTCTAGAGGATTCGACACAGGTATTTGAGGTGAAATGAAGAGTCTTGGTAACATAGTTTAAATGTAAGTGTGACATGTTCTAATCTTAGAAGCGAAATTCACCCGAACTATGGTGCATTCAGAAAGTTTGGGGTTTGGTTTGGAAAGTGATTATGAGGATTTATTCCTTTAGATTGAGACAGCACCTTTTACTCTTTTAGTACGAGTTCTTGGGGAGTTGAATTTGTTTGTGAAGTGGTTAAAGTTTGAGGTTTGGTTTGGAAAGTGTTTATGAGAATTTATTCCTTTAGATTGAGACAGAGTACCTTTTAGTAGGAGTTCTTGGGGAGGTGAATTTGTTTGTAAAGTTGTTAAAGTTTGAGGTTTGGTTTGGAAAGCGATTATGAGAATTTATTCCTTTAGATTGAGACGATACCTTTTAGTACGAGTTCTTGGGGAGTTGAATATGTTTGTAAAGTTGTAAACTTGTTAGGTGAGGGATAGTTAAAAAGTTAGATAAAGTAGGTACTGCCTTTGCTTTGTGTCTGTATCCTATGTAATGTAATTCTACATGATATAGTCTTTGTGGTTTTCCCCTTCTACTTTCCTTGTTGTGGAAGTTGTTTGTGACTCAAGTTTTGGAGCGAGTTGATGAATGGCTGAATATTACAACAGCTTTAATGAGTTTATTATTTGTGGCTTAACATATTGGTGATGATCTAACTAGGCTTTTTAATTGTTGGGCGATATTTGTCTTGCCTCTATGACTGTTATTGACTTATTGTAGCATTATTCGAATTTGTAGTTAAGAACTATATTGCATGCTAGAAATGGTCTGTTTGTAGCGCTATCTCTAGTTAAAATATTGATATACATGTTCTGGATATAGAGCATCAATCAATTAAAAGACATTATATTTTCACTAGCTAACGGGTTCCATCAAAATCAAATAGGTCCTTTGATGATTACCTAAACTACCGACCTAACAAGTCAAGGACTTTATTTTAGCCTTGAAGTAGCAAGCTCTTATTTGCAGCTCACCGTATATTTGTAGAGTTTTTGAAGAGCCTGAATTTGTGTTGTATCATTGAGTTGAGCTAAAAAAGGGTCAGAAAGTCAGTTTTGTTACTTAATTGAAGCAGAGATTAGAGATGAAAACCATATGGCTGAGAGTGCACAATTAGTTTGCTGAACTTCTCCAATTTTCCAAATTTTCCTTCTGCCTTAGTCAGGAGATAGATCATGGTGAAGGATATCGGTCATGGCGAGTAGCCTATTCAACCATAAAAGTTTAGGTAGGTAAGATCTTATGAGATTGAGGTGAAAGAGATATGTTCAAGGTTACAAAGTACTGGAGCACGAGATGATTTTGTTCAAATGTACATCAAATACATGCACTTTTGATAATGTTTGCTAGAGTAAAGAATTAGATACCAATTTTTTGGAAATTAAAGAGTAACTGATGTGGCTATTTGGTGCCTGTATATCAGTATCTGTTTGTTAGATTTTCTTCTAAGGATGTTTTGAAAATATGAAGCACCAGTTTCTTGTGTATGTTTACTTCTTCCTCCCAAACACCAACCAATATCAAGATTAATTAAGGAGAAAGTTATACCATCAATCTTATGGTATCAGCTTGGAATACAGAAACTTATGCCCAGAGTAAAGGTATTCCATTGTTTGTTTATTTTGTTTGAAGAAAGGGTTTTATATCAGTGCTTTAGTTGGATGCTAATAATCAACACACAGTTTCAAGCTCATCCTGCAAATATGTAATATTTAGGAAAATAGAAACTGGAAATTGAAGAGAGAAGACACATTGATAATTTAACGCCACAAAGTCCCCAAACTAAGAATCATTCTTACATTTGCAAAGGTTCCTTTCGCAATTCAGTAGGTCAAAACAATGGACTTTCTTTACATATTAGCCATGTCTTATAAATTGGCTGGTTTAAGTTGGGGGTTGTTAGTCCAAAATAGCTATTTTATAACATTGGATTCGGATGTTATGGGCATATGGATACTGGGAGCTTCTCTGGATTATATCAAATGTGCTTGACCTATGCATACACTGAGACATTGTTTTGTGGGTGGGATTACAAAGACCGTTAGCCTGATGTTTCTGTTGTATGCCATGTGGTACCATAGTGGTGGTTTGTCTGCGCCTTTGAAGAGATTAACAGATTCTCATCAAATTGGTTCTGTTGGAATTTGGAAGAAGCCCTTGAGCTTCTTGGTTCACTATATTGGCGGTATGGTGTGGGGAATTGGGGTCAATATGCCTTAATCTAATTTATTGCCAGTTTGGGACTCCACATATTGTGCTTTTTCACAGGGTATCTTATCCATTTCTTTTATGTTTTAAATTTCCTCTCTATTCATCTTTATTTTCTACTCGAGAATGATGAATGTAATTTGATTTGTTGATTGCCTGATAATATGGCATCCTTCTATATTTAATTACAAATATTCACTTAATAAATATTTGAACTATCCGTCTATCTAACATCAGCACTAGAGATATATTTCCCTGGGTAGCTAATAAAGTATGCTTATGCGACGTACACGTTGTTATGTTTGAAGATGATGCTACTGATTAAAAGACCTGGCCTTCTGTATATCCAATGAGGTAATATGCGTTGTGCATTTTCTTACACACATCTTACCTATTTCGACCTGTTGAAGTTCCAGATTACATCTTGACCTTTTGGTGCTCTCACTCATTCACCGGCCCATTATTCTAATTGTCTTTGACCCTTTCGACCCCTGTAAGAGAGGTTAGAACTTAGAAGCATTTCTAGAAGTTTCTGCACTCCTTTGTCGTTGTCCTTCGTTCGATTCAGCGAGAGTTAATAACCAGAGTTTAGGATTTACTGTTCATTTCAACTTAGTGTCGAAAGTTGTAGTTCCCTACAATAGTAATGTCCCAAATTTCCATCCGTTGAAGTTAGAATCTGCTGAATCACCCCCCTCCCTATTTCAGTACCTGTGCTGTTTTTTTTTTATGCAAGCTTGGAACATTAGATTAAAAGTTCACCTGTGCTGTTTTGATAGACTGAGTTTTTATTTTCTCTGTATATTGGACAAAATCAGACATACTGTTGGTCATCTTAAATCGTTAATGCTTCTCTTCTGCACATATTATTGATGTCTATGTCAATATTCAGCTGGATAAGAAACCTAAATTTGGTATTTTCTTTAGCCCCATCACCGTTGTATTAGCTGCCTTGATGTGCATATTGTGGGTCATTTTTTTTGTTATATGTGGAGTTCTTGTTGTTTAGAGTTCAGAGGTGGGGATATTTTATGAAAGCGAAGTGGTTTTTACCTTTCATTTTTTGTATTTTTTCATTGTAGTTTGTCGTTTACCTTTCATAGTTTTCTAGTAGTTTTTAAAAGGTGCAAATGCTCACCTATGAGAAGGGCATACTGCAGACATGTGATGAGGAAAAGTTGGATGCTAGACAATGTTGTAAGAGGCGCCAAGACTGGGAAATGTATGTGGTCTATTGAAAATTCCGTAAACAAGACTTTGTGATTGTAGCTAGAAATTGTTTGTGCTAATTCGTAAAGTGAACTGTAAATGGTTTGGTCCGATGTTAGCTAGAAATGGTTGATGTGCTGTTTAGCTGGGGACCTGGGGTTTGTTGAAGAAGGGTCTGATGGGGATTAGAAGACGTTCACATTGCTGTTGTTAATCTTGGGATGGGATCGGTTTGATGAACTAAGATAATAATGAAGTAAGCGAGGAGATGAGAAATTCAGCGATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGNGGAGAGGGTCACTGGGTCAGTAGGTGGCGGTGGCTAGCTAGTAATTTTGACATGTTATCAGCTTAATGTTAATTATTTAATGTTATTGGTAAATGTGCACAATAAGATATAATCCTCCAGTATATAAGCTAACTCTTGAGAATTTTGAACTACCTAAAATACCCTTACTTTTC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ATGCCGTTTCCGAGGCGGAGGAAGGGGGCATCACCGCCACCACCATCACCGCCGTCACTTACACCACCGGAAGATTCGGATAAGGAAATAGAGGAGACCAGAAAGAGGAGAGAGAAAGAGGAGGAAATAGCTAGACGGACGAGGAGGAATAAGAAATGGTCATGCGTTGATAGTTGTTGTTGGTTTGTAGGTTTGGTGTGTTGTACATGGTGGTTTTTGTTGTTTTTATTCAATGCAATGCCAGCTTCGTTTCCGCAGTTCGTTACCGAAGCTATTACCGGGCCATTACCCGACCCGCCTGGTGTGAAATTACATAAAGAAGGGTTGAAGGTGAAGCATCCTGTGGTTTTTGTACCCGGGATTGTGACGGGCGGGCTTGAGCTTTGGGAAGGTCATCAGTGTGCCGAAGGCTTGTTTCGGAAACGACTTTGGGGTGGTACTTTTGGTGAATTGTACAGAAGACCCCTTTGCTGGGTTGAGCACATGTCATTGAATAATGTGACTGGACTGGATCCGGATGGTGTAAGGGTTAGACCTGTCTCTGGTCTTGTGGCAGCTGATTATTTTGCACCTGGCTACTTTGTGTGGGCTGTTTTGATTGCTAACTTGGCTCGTATAGGGTATGAGGAGAAAACAATGTATATGGCTGCATATGATTGGAGAATTGCATTCCAGAACACTGAGGTAAGGGACCAAACTCTTAGCAGGATGAAAAGTAATATAGAACTTCTGGTTGCTACAAACGGAGGGAATAAGGTGGTTGTCATTCCACATTCCATGGGTGCTTTGTACTTTTTACACTTTATGAAGTGGGTTGAGGCACCAGCCCCGATGGGTGGCGGGGGTGGATCTGATTGGTGTGCTAAACATATCAAAGCGATAATGAATATTGGTGGACCATTTTTAGGTGTTCCCAAAGCTGTTTCTGGACTATTCTCGGCCGAAGCCAAGGATATTGCTGCAGCCAGATCTGTTGCACCTTCTGTTCTGGATAAGGACGTGTTTGGTCTCCAAACATTGCAGCATGTAATGAGGATGACTCGTACATGGGATACAACCATGTCAATGATACCAAAAGGCGGGGACACAATCTGGGGTAATCTTGATTGGTCACCTGAAGATGGGTACAATTGTACTCTGAAGAAGCAGAGGAATAATGATAACTATACTACTGGAAAGAATGAGAATGGATGCCTGGATTTATCAGGAAAAGGTGCACATTTTGGAAGAATTATATCATTTGGAAAGGATGTAGCCGAGTCTCCTTCTTCAACAATTGATAGAATGGACTTCAGGGATGCAACTAAAGGAAACAACCTTGTTAATGCAACTTGCCGGGATGTGTGGACAGAGTACCATGACATTGGCATTCCCGGCATCAAAGCCGTTGCAGATTATAAAGTTTATACAGCTGGATCAATATTAGATCTACTTCATTATGTAGCTCCAAAAATGATGAAACGTGGTGATGCTCATTACTCATATGGAATAGCTGATGATCTAGATGACCCAAAATACAACCACTATAAATATTGGTCAAACCCATTAGAAACCAGATTACCAAATGCCCCAGATATGGAGATATTTTCTTTATATGGAGTTGGAATTCCTACTGAGAGAGCCTATATTTACAAGCTGAGCGCAACTGCAGATTGTTACATTCCTTTTCAGATTGATACAATGGCAGACAGCTCAGATGAGTGCTCTTGTCTCAAAGGAGGGGTTTACAATGTTAATGGAGATGAAACAGTTCCTGTTTTGAGTGCTGGTTACATGTGTGCTAAAGCATGGAAAGGGAAAACCCGGTTTAACCCTTCTGGAATGCAAACTTTTATAAGGGAGTATGATCATGCTCCTCCGGCTAATTTACTGGAGGGTAGAGGCACCCAAAGTGGTGCGCATGTTGATATAATGGGAAACTTTGCGTTGATTGAGGACGTTATTAGGGTAGCAGCAGGTGCTAAAGGAGAGGACTTAGGAGGAAATCGTGTATATTCTGATATTTTTGAATGGTCCGAAAGGATTGACTTAAAGCTATAG MPFPRRRKGASPPPPSPPSLTPPEDSDKEIEETRKRREKEEEIARRTRRNKKWSCVDSCCWFVGLVCCTWWFLLFLFNAMPASFPQFVTEAITGPLPDPPGVKLHKEGLKVKHPVVFVPGIVTGGLELWEGHQCAEGLFRKRLWGGTFGELYRRPLCWVEHMSLNNVTGLDPDGVRVRPVSGLVAADYFAPGYFVWAVLIANLARIGYEEKTMYMAAYDWRIAFQNTEVRDQTLSRMKSNIELLVATNGGNKVVVIPHSMGALYFLHFMKWVEAPAPMGGGGGSDWCAKHIKAIMNIGGPFLGVPKAVSGLFSAEAKDIAAARSVAPSVLDKDVFGLQTLQHVMRMTRTWDTTMSMIPKGGDTIWGNLDWSPEDGYNCTLKKQRNNDNYTTGKNENGCLDLSGKGAHFGRIISFGKDVAESPSSTIDRMDFRDATKGNNLVNATCRDVWTEYHDIGIPGIKAVADYKVYTAGSILDLLHYVAPKMMKRGDAHYSYGIADDLDDPKYNHYKYWSNPLETRLPNAPDMEIFSLYGVGIPTERAYIYKLSATADCYIPFQIDTMADSSDECSCLKGGVYNVNGDETVPVLSAGYMCAKAWKGKTRFNPSGMQTFIREYDHAPPANLLEGRGTQSGAHVDIMGNFALIEDVIRVAAGAKGEDLGGNRVYSDIFEWSERIDLKL Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo17012.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902198262|gb|KNA13627.1| (hypothetical protein SOVF_114960 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1309.3 bits (3387), Expect = 0.000e+0 Identity = 624/624 (100.00%), Postives = 624/624 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731372802|ref|XP_010666453.1| (PREDICTED: phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1268.1 bits (3280), Expect = 0.000e+0 Identity = 605/684 (88.45%), Postives = 638/684 (93.27%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225444798|ref|XP_002278397.1| (PREDICTED: phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.000e+0 Identity = 537/676 (79.44%), Postives = 601/676 (88.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. NCBI nr
Match: gi|824632731|gb|AKI88004.1| (PDAT [Camellia oleifera]) HSP 1 Score: 1135.6 bits (2936), Expect = 0.000e+0 Identity = 534/675 (79.11%), Postives = 595/675 (88.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. NCBI nr
Match: gi|720018989|ref|XP_010261970.1| (PREDICTED: phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1-like [Nelumbo nucifera]) HSP 1 Score: 1126.3 bits (2912), Expect = 0.000e+0 Identity = 521/652 (79.91%), Postives = 585/652 (89.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R4A8_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_114960 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1309.3 bits (3387), Expect = 0.000e+0 Identity = 624/624 (100.00%), Postives = 624/624 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B8H0_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_002140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1268.1 bits (3280), Expect = 0.000e+0 Identity = 605/684 (88.45%), Postives = 638/684 (93.27%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A5AJT2_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_11s0016g01470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.000e+0 Identity = 537/676 (79.44%), Postives = 601/676 (88.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0G2YQ95_9ERIC (PDAT OS=Camellia oleifera PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1135.6 bits (2936), Expect = 0.000e+0 Identity = 534/675 (79.11%), Postives = 595/675 (88.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A5BP62_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_09s0002g01550 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1113.6 bits (2879), Expect = 0.000e+0 Identity = 517/659 (78.45%), Postives = 582/659 (88.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PDAT1_ARATH (Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=PDAT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1067.8 bits (2760), Expect = 5.000e-311 Identity = 505/680 (74.26%), Postives = 577/680 (84.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PDAT2_ARATH (Putative phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=PDAT2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 809.3 bits (2089), Expect = 3.200e-233 Identity = 377/644 (58.54%), Postives = 489/644 (75.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PDAT_SCHPO (Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=plh1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 235.0 bits (598), Expect = 2.500e-60 Identity = 116/279 (41.58%), Postives = 162/279 (58.06%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: PDAT_YEAST (Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) GN=LRO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 3.500e-54 Identity = 114/292 (39.04%), Postives = 161/292 (55.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: LCAT4_ARATH (Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 OS=Arabidopsis thaliana GN=LCAT4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.600e-6 Identity = 59/205 (28.78%), Postives = 86/205 (41.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G13640.1 (phospholipid:diacylglycerol acyltransferase) HSP 1 Score: 1067.8 bits (2760), Expect = 2.800e-312 Identity = 505/680 (74.26%), Postives = 577/680 (84.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G44830.1 (Lecithin:cholesterol acyltransferase family protein) HSP 1 Score: 809.3 bits (2089), Expect = 1.800e-234 Identity = 377/644 (58.54%), Postives = 489/644 (75.93%), Query Frame = 1
BLAST of Spo17012.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G19860.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 9.000e-8 Identity = 59/205 (28.78%), Postives = 86/205 (41.95%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo17012.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo17012.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo17012.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo17012.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 3
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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