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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATAATTCTGTTCGCAGTAGGCATTAATTTGAGTATTTGTTGTTTAATTTAGATCAAATTAATATACTTTTTACAATTTGTTGCTTGGGTTGAAGATACTCCAGCTAACCCGCTAAATTCAAGGCCTCACAACTCACAAGCAAATGTCTTTGCTTGTACGACTTTGTTGATGTGTGCAAGTGCATTGGAGCTGTGATATTACTATTACTTTTCTAGTTATCTTTCTTCTGGGTTTCTATTGTCAACAATGTTTGTTCATGTAGATGTGAGTGAGAAAAGAAGGGAGAGAAAATATAGGGAGTAAGTGACTGAAAAGTGCATAAAACACTAGTGGGAAATGAAGGAAATAGTGTTCTTGGTCCAAGTCTGCATTTAATGCTAAGTCTAAAAAATGCGGTTCAGTATTAATTAAGTAGGTTAGTTATTCAGTGAGATCAAGTGATCTGAATGCCTAGCAAGAGGTCGCTTCAGTTCAAGTGGAATTAATATCATTAATGCCACAACTTACTCTTGACTGAACCCGTAGGGTCACACAAATAGTACGTGAACGGATCAAGTACTTAATTGAATATTATATTCAATAAATACTCTAATTATGGATATTGGGAAATGACGGATGTTGGTGTCAGTGGGAGCTAAACAAACAGTCAAATGGCAAAGAAATAATATTTTCCGGAAATGAAGATATTACCGGAAACGAAAATATGGTTCATAACGGAAATATAAATATTATTGAAGTCGATAATATTGTCGGAAACAGAAATATGGTTCGTATATTAAATATTATCCGAAATAGAAATATTTTTGGAATCGGAAATATTACCGGAATCGGAAATATTGTCGAAACAAGGAAATATTGTCGGAATCGGAAATATTATCGGAAACGTAAATATTGTTCGAATCGGAAATAAATTACGGAATCGTAAAAACAAATCGGAAGCTCGACGAGCGATAGGCCAGCGCATGGGCCAGCCCATCGCTCGACGAGCCAACACGCAAGTGCATCGCAACAAGCCATGCGCAAGGCCCAACGCGCAGCAATGTACGCCAAGCCGCAAGGCCCATCGCACAAGGCAGCACGCCAGGCCCAGCGCGCGCCCTTGGAGCATGGCAGCGTTGTTTGGGCCAGCGCACAAAGCAGCCCTCGTGGCATTTCTTGTACATCAAGGTTTGTCGGTTTTCTTGCCTTGCAAGCAGCCGACCAACCCTAATGCTTTAGGGTTTTTCGGTTTTGGTGAATTCCTAAAACTTTCCTAAAACGTTCTAGGACTTTGGCTCCTAGGGTTTTTCCTATTTCTTATAAATACATGGCCTATGGTCATGAATAAACACATCAATTGAAACACAATTCAATACTTTTTGCCTATCACCTCAAAGTGAGATCCCTAAATCATAAACCTTACATTATATCCTAGTTGGTACGATCTAAGGCAGATCCGAACGTACTGTGGACTATCTACGGAGAGACGACGTTTGACGTTCTAACTTGTTCTTGTTCGGTTCGGGAGCAGCATGGGAAGGCACGCATCACAAAGTGTGTTCACTAAATTATGCTAAATGATTATGTGCATTTAATTTGGATTTTGGCATTTATGGTTTTTCCGCATGACATTAGATTGTTCATAACCTAACTGTGGTATAAGAGCCTTTAATTATTTGCATAATCATTTAAAATTAATATGGATTAATCTTATAAATTTGCAAAGAATTAAAGGGGTGAATTAATTTGGTGTAATTAATTGCAAATTCATGCGATTATTTAATTATAGGTTCGCAGGATTATCAGCAGTTTTGTCAATAATTGTCGGAATCTTGTGTTTTTATAGTGAATTCCGCATGTAAATGACGTTTTAAATTTTTGACACAATTCAAAAATTTACGGTTGAACCCAGATTTCCCAAATTCGAATCCTAACTATGACTTTTCGGTCGTTTTAGTTTTTCGAATGCATAATTATAATTTCAATGATATTAAAAAGTTAATTTTTGCGAAGCTTGTTTAATAATCTTGAATTAATTAATGACCTACATTATATGGTTAACAATTTCAAGATTTAAAATCGTTAATTATGCTACCTACTTTGTAATTATAATTAATTTGTTGAAATTCAAATAATTCCGAATTTGTTTTGATTTCCATAACTAATTAGTAATTTAATTGGGATCCTATGACTAAAAGACCACCTAAAATTTATTCAAGTTTGAAACTTTAAAATTTTTGAAACCTAATTTTAATCCCTAAATTTTATGAAATCGGAAATTATTTTAATTAATGAATTTTCGATTAATCGCCTAAATATTAATGAAATTAATATAATTTATTAATTTGCCATAAATTTTAAAATATATATATATATATATATATATATATATATTATATATATATATATATGTAATCTTATATAAATCGTTCACAAACTTGCACGCACGAAGCAATGGATAGCTTAGTGTTACCCTTAAGGGTGTTGCAATGGTGCGGGCATGCGACGACGAGCAAGGGAGCTCGTCGTCCATGTGGTATTGTGGCAACGAGCAAGCACGAGCCGCGCGCGGGCAAGGGCCTATGCAGTGTATGCGAGGTGTGAATGAACAAGAAAGGTGAAAGGGGTAGTGCGCGCACAAGACCAGCAAGCGCTAGCAATGAGGCATCAAGTGATGCCCTCGTGCCATGCGCGCATGCCCAGCAACAACAGCGCTCCAGTGAGCAATGGTGTCGAGCCAACGAGAAATGGTGTGGAGCCAGGGAGCACTGGCGAGGGCATGGTTGTGCGATGGCTTCGGCCATGCATGCGGTCTCTCCCTTGCGACGCTGCAGCCTTCGCGAGGCATGGGCCTTGCGCCCATGAGCCTTGCCTCGGCTCAATAACTTGTTTCGATTTATTTTTCGTTGAGCGACAAATTTAGTTTATATTTAATTTCGTGCTTATAATTTTTCTCGGAATTTAATTTTATTAGTTTAATTATTATAATTAATTTTACACTAATTATTTAATAAAATTAAAACCTTGAATAAATTATAATTAATTCATTTTAATCAACTAAAAACGTTTAAGGGATTTAAAATAATTGTATGAGCTTTTAACTTTAATTAAATATGTGGTTTCCGATTGGACTTGGAAAGACAGTTTATGTTTAAAACTAGTAAAGCATATAAAATCCTTGTTTGAGTGGGAGCTTTTATTCATGATTAGTTAAATTCCTGATTAGGTCCTTGTTTCCTTGGGATTAATAAACTTGATTAGAACTAATAAGGTCAAATAATTGGTAGATTCTTGACCCTTATTAGTTGTTGCAATTATTATGTGATGCATTTTCTGCTAACTTGCTAAGTGGGAAATTCATTGATAAATGAATGGGTGAATGGTATATTGTAAATATATTGTTTTGCTGGTTGCGAAAAAGTGACTAGTATGGCCAAATAGGATAGAAAATATGGTCTGCATACCATTAAATTTGAATGTAAAATATGGTCAAAAGTACCATGGTTTTTATTTAAATATGGTATGCGTACCATTAATTTGTTGTAAATTCTACTTGGTGAAAATGACGCTTCCCATGGTGAAATTCAAGAACGGGGCTTCCAATGCATTTTCAAGACGGAGTTTGAAGAGTGAAGCTTCAAGATGAAGTCGGGCCATACTAGATCACAAATTTTATCTTATGCATGTTGTAAGATATTTATTTCTTTAAATATGTCTTGATATTATGCATGAGATTGTGGTTTACCTATGTTGCATGATTAAGGATTTTAGTTCACTTAAATCTAACCAACATAGTAAAAGCCTTAAGTTCCAAAGTTTAAATTGAGTTAAACGGTGCAATTCCAAAATAACACTTACTTTCTCACCTTTATGTAAAGTTAGTGATAGTTTTCTGCCAAAGAGAGGTGTCACTTCTTGATTTCATTGGGGTAAGATATAGATTAGTTGTGAGTACAAGTTGATTTTGGTTGAACTCAACGATATATGTAAGGAGTCCTTTTATGTCTTGGCAAATGGGATAAATTTCCTAATAAGTACTTACACGCACCTATCAACCAAGAGTAGTTCCTAGACTATTAACAACGGATTTGCTTACCTAAAATATTTTAGAATTAAGACAAGCCAAAGCATGCTTAGTTCTTTAATGGTTTTGAGGATTTTGGATTCATTTTATTCACACCTAACGGAACACAAAAACTTGAATAAAATGCTAAATAACTTTGAATTATGCATGATTGCATGAATTTAATTTTATGAAGGTCACGTATGAATGGTTATTTACTTGTTTATTCTTTTCAATTGTAGTTTTAAGTATGGAAAACAACAATCAAAACATCATCAAGGGTTCTGCACTTATGATCAAGTTGAACATAACAAATTTTCTTGAATTGGAAGGGAAGCTAGTTGAAATGCTAAAACTCAATGGCATTGAGTATGCACTATTCTACCCAATTCCAAGATATTATGCAAGAGACACGACTCCTGAAAGACACGCCTCCTGGGAAGCGGATCTCAAAAGGGTTATGAGTTTCATGCTGAGCAACATCCCTGACAATTGGCAAAGACAGTTTGTAGCTTACGAACCATATATGCTTCTCGGACATCTAAGGGATATCTGTCGTGGAAGCACGGACGAAAGATACCTAAATGTCCATGAATTGATTCGATCAATGAAAGGGCTAAAGATTGATCTTCATAACAGATGTTTCAGGCGAGAAGTCCAAGAAACACATGCTCAAGTCCTTCGCTCTAAGCAAAGAGTTGTTAAACCACTTAGGGATCACGTGAACTACATGTTATCATTATTTGATCACTTGAGTCTGCTAGGTTCACCAATAAGCGAAAGATTGCAGTCTCCATCTTAATCAACTCACTTCATGATGGATTTAGACGCTTCAAGCAGTTCTATATGAGTGAACCAAGAGAAGAAACAATCGGTGAGTTTCTTCGGCTAGTCAAAAATGATGAAATAGTACTCGACTGTGAAGCCAAAGATTTACTCAAGGCTAAA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ATGAATAATTCTGTTCGCAGGCCGGGTTGTTCGTCTATTGGAGCAGGGGCCTTCGCTGAACATGGGCCTTTTAGAGCAAAAGGAAATTTATTGGTAAAAAATGAATTTAGCTGGAATAAAGAAGCAAACATGTTGTATCTTGAATCACCCGCAGGAGTTGGGTTTTCTTATTCTGCTAATCAATCATTTTATGATGGAGTTAATGATGAAATGACAGCTAGAGATAATCTGGTATTTCTTCAGAAATTTCTAACAAAATACCCAGAATACAAGAATAGGGATTTGTTCATCACTGGAGAGAGCTATGGAGGGCATTATGTTCCACAACTTGCTAACCTCATTCTAAAATCAAGCCTCAAATCAAATTTGAAGGGAGTTGCTTGTACATTTGTAATGCAGCTTGGAAATCCACTACTAGAGTTTAACACTGATTTCAATTCAAGGATGGAATATCTTTGGTCGCATGGACTAATATCGGATACAACATATGAACTCTCCCAAAAAGTATGCAATTTCTCACAAATAAGGAGACAAGCACAACAGGGATTTCTCTCGGCTCCTTGCCGGTTAGTTAGTTCTCACATGAGTAGTGAGATTGGCAAGTTTATCGACTCGTACGATGTTACACTCGACGTTTGTTATCATTCGGTTTCTCAACAAGCTCATATCCTGAATCAAATGGCGGATGAAGAGAAGATTGATGTTTGTCTAGATGATGAAACAACCAAATACTTGAACAGAAAAGATGTACAAAAGGCTATGAATGCACAACTTATTGGGTGTGCTCAACTATCATATGGACGATTTGGAGGTTCCTACTCTTCCTCTACTCGGGACTTTCACTAA ATGAATAATTCTGTTCGCAGGCCGGGTTGTTCGTCTATTGGAGCAGGGGCCTTCGCTGAACATGGGCCTTTTAGAGCAAAAGGAAATTTATTGGTAAAAAATGAATTTAGCTGGAATAAAGAAGCAAACATGTTGTATCTTGAATCACCCGCAGGAGTTGGGTTTTCTTATTCTGCTAATCAATCATTTTATGATGGAGTTAATGATGAAATGACAGCTAGAGATAATCTGGTATTTCTTCAGAAATTTCTAACAAAATACCCAGAATACAAGAATAGGGATTTGTTCATCACTGGAGAGAGCTATGGAGGGCATTATGTTCCACAACTTGCTAACCTCATTCTAAAATCAAGCCTCAAATCAAATTTGAAGGGAGTTGCTTGTACATTTGTAATGCAGCTTGGAAATCCACTACTAGAGTTTAACACTGATTTCAATTCAAGGATGGAATATCTTTGGTCGCATGGACTAATATCGGATACAACATATGAACTCTCCCAAAAAGTATGCAATTTCTCACAAATAAGGAGACAAGCACAACAGGGATTTCTCTCGGCTCCTTGCCGGTTAGTTAGTTCTCACATGAGTAGTGAGATTGGCAAGTTTATCGACTCGTACGATGTTACACTCGACGTTTGTTATCATTCGGTTTCTCAACAAGCTCATATCCTGAATCAAATGGCGGATGAAGAGAAGATTGATGTTTGTCTAGATGATGAAACAACCAAATACTTGAACAGAAAAGATGTACAAAAGGCTATGAATGCACAACTTATTGGGTGTGCTCAACTATCATATGGACGATTTGGAGGTTCCTACTCTTCCTCTACTCGGGACTTTCACTAA MNNSVRRPGCSSIGAGAFAEHGPFRAKGNLLVKNEFSWNKEANMLYLESPAGVGFSYSANQSFYDGVNDEMTARDNLVFLQKFLTKYPEYKNRDLFITGESYGGHYVPQLANLILKSSLKSNLKGVACTFVMQLGNPLLEFNTDFNSRMEYLWSHGLISDTTYELSQKVCNFSQIRRQAQQGFLSAPCRLVSSHMSSEIGKFIDSYDVTLDVCYHSVSQQAHILNQMADEEKIDVCLDDETTKYLNRKDVQKAMNAQLIGCAQLSYGRFGGSYSSSTRDFH Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo16428.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902226038|gb|KNA20259.1| (hypothetical protein SOVF_053730 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 1.400e-137 Identity = 247/253 (97.63%), Postives = 247/253 (97.63%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731324594|ref|XP_010673054.1| (PREDICTED: serine carboxypeptidase-like 45 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 1.900e-118 Identity = 213/260 (81.92%), Postives = 233/260 (89.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870864076|gb|KMT15209.1| (hypothetical protein BVRB_3g063200 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 1.900e-118 Identity = 213/260 (81.92%), Postives = 233/260 (89.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. NCBI nr
Match: gi|641834644|gb|KDO53634.1| (hypothetical protein CISIN_1g0128612mg, partial [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.800e-97 Identity = 173/253 (68.38%), Postives = 211/253 (83.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568857001|ref|XP_006482059.1| (PREDICTED: serine carboxypeptidase-like 45 [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.800e-97 Identity = 173/253 (68.38%), Postives = 211/253 (83.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RMX3_SPIOL (Carboxypeptidase OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_053730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 9.500e-138 Identity = 247/253 (97.63%), Postives = 247/253 (97.63%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CT19_BETVU (Carboxypeptidase OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_3g063200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 1.300e-118 Identity = 213/260 (81.92%), Postives = 233/260 (89.62%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067EIC8_CITSI (Carboxypeptidase (Fragment) OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g0128612mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.300e-97 Identity = 173/253 (68.38%), Postives = 211/253 (83.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067EEN8_CITSI (Carboxypeptidase (Fragment) OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g0128612mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.300e-97 Identity = 173/253 (68.38%), Postives = 211/253 (83.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A164WP07_DAUCA (Uncharacterized protein OS=Daucus carota subsp. sativus GN=DCAR_020587 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.300e-97 Identity = 173/253 (68.38%), Postives = 210/253 (83.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SCP45_ARATH (Serine carboxypeptidase-like 45 OS=Arabidopsis thaliana GN=SCPL45 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 1.100e-83 Identity = 148/256 (57.81%), Postives = 194/256 (75.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SCP46_ARATH (Serine carboxypeptidase-like 46 OS=Arabidopsis thaliana GN=SCPL46 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 9.600e-83 Identity = 148/258 (57.36%), Postives = 194/258 (75.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SCP42_ARATH (Serine carboxypeptidase-like 42 OS=Arabidopsis thaliana GN=SCPL42 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 201.8 bits (512), Expect = 9.700e-51 Identity = 115/258 (44.57%), Postives = 155/258 (60.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SCP44_ARATH (Serine carboxypeptidase-like 44 OS=Arabidopsis thaliana GN=SCPL44 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 197.6 bits (501), Expect = 1.800e-49 Identity = 111/259 (42.86%), Postives = 156/259 (60.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SCP32_ARATH (Serine carboxypeptidase-like 32 OS=Arabidopsis thaliana GN=SCPL32 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 5.000e-47 Identity = 107/262 (40.84%), Postives = 145/262 (55.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G28110.1 (serine carboxypeptidase-like 45) HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 6.400e-85 Identity = 148/256 (57.81%), Postives = 194/256 (75.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G33530.1 (serine carboxypeptidase-like 46) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 5.400e-84 Identity = 148/258 (57.36%), Postives = 194/258 (75.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G42240.1 (serine carboxypeptidase-like 42) HSP 1 Score: 201.8 bits (512), Expect = 5.500e-52 Identity = 115/258 (44.57%), Postives = 155/258 (60.08%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G43780.1 (serine carboxypeptidase-like 44) HSP 1 Score: 197.6 bits (501), Expect = 1.000e-50 Identity = 111/259 (42.86%), Postives = 156/259 (60.23%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16428.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G61130.1 (serine carboxypeptidase-like 32) HSP 1 Score: 189.5 bits (480), Expect = 2.800e-48 Identity = 107/262 (40.84%), Postives = 145/262 (55.34%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo16428.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo16428.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo16428.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo16428.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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