Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGAGAGAATCGCGAGTTGGAGGCAAAGCAGAGAGCTGGAAAATTTGGTGAAGGTGATTGCGTGTAATTGAGGTATGCGGCTGCCCTTTTATTTTTTGGCACGTGTGGGCCTTGGGTCCACAGTAAATAATGGTGGACCAGGTCCACACAAGAATTTTTCTTTAAAATAAGTAAATCCCACTAAAAGTAAAATCCGGAGCAACGCTCGGGCCACAAACTAGTCTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGGGGAGTTTTTTCAAGAGATTTCGGAGCGTCCACGTAGGATTTCCACGTCATCGCATATAATTAAAATATTAACTAATTAAATAAATAATATTAGATAAATATATTAGAGTCTTCACGTAATTGACTACTTAATATGATAAACATAGATTCCACAAACTTCTACCCTTTTGTATATATATATACATATAAACTTCACGAAACAAAATAAAATAATTCCGGTGTGATAGGTAGTCTTCGAATTTTTTATATTACGCTAATATTTCGCTGTTTTTAGCATGTACGGAGTACTATAATTTCATTGAATTTGGCTGCTTTGTTTAATTGTTTGTTAATCAATTGATCTGTGATTATGATTAGTATGAGGATTAGTATTGATGCAGTTGCTATTTGGTATTCTCTTATATGATATAATACCTGTTTGGATGATGATTGTGAATATTGTTTGTTTTCCTAACTTGGAATGGTACGTTGTTAACTTTTATCCAATGTTAACTACGTATACCACTTTTATACCATTACGAAAATCGAGCAGGGATGATGATGGATTGTTTCGAGCCAGTATATCTTCATAATGCATTAATTAGGGTTAATGATCATGATGATGATCTTGCCGATGAAAGCGATCATCTGGATTTATATTACGGACGACAATAATGATGATGATGATATTCGATATGGATGCGAAGATTATTGCCAATTAAGACGAGGAAAAACAAGCTCGGTTACAAAGAAGAAAAGGATGATACACAAGAATTATAGGGCCCGAAAATATTGAAAGAACAACCTCAATACTACATGTTATAAGACGAGCAAGGAATTGAGATCAATGGAAGTCAAACGATGAACTATTGAACTAATTACGCAGATTCAAGTCAATTATGATCTTATTTGGTTTAATAATTAAGTTGATGTTTTATTACAACTTTGTTTTATACTACGTATATGTTTCCTTTTCAATACCCATGACTTCACATATATGAAAATGAAATATACACTCTTTTCAATAATTTTTGTACGTGAAGGTGTGCTTAGCAAGGTCGGATCTAATATGATAAACATGTACATTTAGTATATAAACACTTTTACCAAACATTGATTTAGAGATAGATCATAAAACCAAAACAAAAACCCTACAATTAATTAATATGAAAGCAATAATGAAATCGTTGCAAGCTAAAGACGGTGAACGAGTTTCTTGGATAGTCTAATTCGTAGTGATCCCTAAACAACACTAAATAATACTTCGCTTCTAATGTTCTATGTTAATGGAGGACAAACCACATAATCAATTATTTGATTATGGGTGATTTTTTTTTTTGTTTGTTTTGTCAATTATTGTTGCTATTTATGTTAGCACTATATATGTAGCCAATTAGTGCGAATTAGTTCTATAGGCAATACAAACTATAAATGCAGGCGGAGAGATTTGAACTTGAGACCTATTATACACCGGTCTTCAGTCTTAACCACTAGGTCAAGACGTCATTATTATTTGCGATTAATGCAACAAATTATAGTAGATTGCTATTGTTCCATTGATTACAAAAGGTTGTCTTTTATCCGACACAACAAACTATATAGGTGTGAAAATTACACCAACCCCGCAAGATCGCTCTGCATCAAGAATTTTGAAAGTTAGATGTTATTAAATTTTTTTAGTGGTGATTGTAATTTCAATTCCCTTTTTAGTCTCTTTTAATATTCAACCCCCACCAACAAACACAATCAGCAACGAAATCCATGCAACTAGACAAACTCTAATCTCTCCCTGAACAAAAAGTTTCTTTCTTTTAACAAAATTGGATTGACTGTACGGATACATTGTAGTTTTTACATTATATAAAGTCTTTAGATATAACTATATGAGGCACGAGGAAGGCAAATAAATGGCTATAAAACAATTCACTTTTTCTTATATGAAGTACGGAATTAATATTTCTTNATGTCCCTAAGTGGAAGTACTCTCTCTTGATATATTCAGTCATCATCATCAATTCATCACCATCTCGATGATTTTTTCACCGGTTATCGGTCACTTAAGCCCAATAAAAGTCGTTGGGTAGTAAATGTGGGATTATTAAAAAATATGTCGTAGGTGGGATTAATAAAAGAAAACCGGCCAAAGGTTGGATTAATATTACCAAATTTTCCTATTTTAAATCATTTTGAAATACTAATAATTTTTTTTTATTATTAGGTATAACCGAAAATTTGGGGTATTACACCTACTATACACCGGTCTTCAGTCTTAACCACTAGGTCAAGACGTCATTATTATTTGCGATTAATGCAACAAATTATAGTAGATTGCTATTGTTCCATTGATTACAAAAGGTTGTCTTTTATCCGACACAACAAACTATATAGGTGTGAAAATTACACCAACCCCGCAAGATCGCTCTGCATCAAGAATTTTGAAAGTTAGATGTTATAAAATTTTTTTAGTGGTGATTGTAATTTCAATTCCCTTTTTAGTCTCTTTTAATATTCAACCCCCACCAACAAACACAATCAGCAACGAAATCCATGCAACTAGACAAACTCTAATCTCTCCCTGAACGAAAAATTTCTTTCTTTTAACAAAATTGGATTGACTGTACGGGTACATTGTAGTTTTTACATTATATAAAGTCTTTAGATATAACTATATGAGGCACGAGGAAGGCAAATAAATGGCTATAAAACAATTCACTTTTTCTTATATGAAGTACGGAATTAATATTTCTTATCGTGCATATTCGAGACACCTATAAGGATAAGTCATACTTAGAGTTGGTAAAAAGAAGGCATTATTAGATCGAATCTCCTATTCTCAATTCTTTAGAGTTTGAAACATATAATAATATGATTAACATAGGAAAATATTCAATTGTCCAATCTAACTCATCATCCTAATTTAAGTATCAAGTAAATCTTCAGTGTCATTTTGATGAATAATAAAATTACTTTGAATGATCAGCTACGACCTTTTATTAGGCCGCAATAAAAAAAAATTTGATTTTCGGAATTAGTAATGAAATGTCATCATATATAATTAAATTATTAACTAATTAAATAAATAATATTAGAGTCTTGACATGATTGACTACTTAATGATAAACATAGATTCCACAAATTAACATAGAATTATTATTATCTTTAAAACACTCCATACATATATAGATTTTAACGTAAATTTATCCTACTTTTACTTTTCCCATATTAAGATAAATATTTAAAAAAAGGACAATGAATAAAAGGATAGTAGATTTCAACGTAAATTTATCATACTTTTCCCATATTTTGTACATATCGTTTTCATTATGCGATAAGGATTAAGGGCCATGGGTTTAATTGCTACAAAATAACATGGAATGATGGAAAATATCAATACGTACACAAAAAGATCCTTGAGATTGTTATACTCCGTACCAAATAGTCAAACACATATTCTAATTTATTTTATTCTTTTTTGCAAATTTTTACTGAAATATATAGTAGATTTTATTTCATTAAACCTTTGATATTTGGATTAATTTATATTATAATAGAATTCTACTTGCATTATTTCATATTCTATATCTTCCATGTTTTATACTCTATAATATATTACCCATAATGATAAGATAAATTTTAAAAAAGATGATAATTAACATAGAATTATTATTACTTTAAAACACTCCATACGAATATCTCTACCATGTTTTATACTCCATGTATATTACCCATAGTGATAAGATAAATATTTAAAAAGATGATAACAAATAAAAGGATAGTAGATTTCAACGTAAATTTATCCTACTTTTACTTTTTCCATATATTTTTTTAACGTTATATTAAAGGAAACTTAATACAAAGTAAATGGGGTTTATAGGGTAAATTTAATACAGCATACAAAAATGAAGCAACCGAATGGACTAAACAGAATATGGGGCGAAAAAAATAAGGGCAGAGTGAGTCTACACGACTATACTTATACAAAGCATATGTAATAATTTTGTAGAGAACACATGAATAACTAACTCGAGTTTTACCATTATTGAACTAACCATTTGATAACTCGGTTTTCCTATAAATACCTTATTCATAAACATTTTAAATATTAAGAACACATTTATACTCCAATTTGAAATGAGACCTATTTTAACTTTCTATTATACATATACTTTATAAAACAACTATTTGTATGCGATGGTATAATAAGACAAATATGTACGAAAATTGATAAACCCGTGCATCGCACGGGCTTCGATACTAGTTTATATTTATAATTTAGTGAAAACTTAAATTTTAAACTTTTTAAATCGCGTATTTGCACGGCTACTCTACTAATTCCTCGGAAAAGAGGAGGAAAAGCAGTGGCTACGCACAGTCGCACACTAGACGTTTTTACAAAAATATTCCCTCTCCTCAACTTTTACACCTCTGCGTTTTCTGTGGTGAAGTTGAAGAACCAATACTTGCTTCAGAGCTTCCGAGGCCTTTCTCTGTCCGCAGGTAATTTCTTGACCCTTTAATTTTTGTGGCAAAGGGAGCAAACCTTTTACCTCTGTAATCCTAAATTGAAATTCTATTGTTGCAAATGATTATTTGATCATTGATCATATTTGCTGAATACTGTAAAAGGATTTTTATTTAGAGACTGTTTGTAGAAATTTAGACTTCTTTTGCCTTCAAAATGGGTTTTTATTTATAAATTATTTTCAGAGTTCTCTAGTCCTTGAATTTATGA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ATGGAGGAGAGAATCGCGAGTTGGAGGCAAAGCAGAGAGCTGGAAAATTTGGTGAAGGTGATTGCGTTTGAAGAACCAATACTTGCTTCAGAGCTTCCGAGGCCTTTCTCTGTCCGCAGGATTTCTAACTTATCTCGTGGAGTTTCATGTTTACCTTCTTGTTTGAACAAACATGATCCTCTTGCTCCAGGTCTCAGATCTGGGATGATACCAACTGAAATTGTAGAAAACATGACAAGGATTGAAGTAACTGAGGAATACTCTTGGGATTTGACCCATTCACGCTCTTATGAGACTGTCATGGAAGCACTTTCTTCCCTCATTACATGTCGGAAACGTGGCGAAAAGCCTTCTATTGGAGGAAAATACACTAAGCTGGAACGCATGACAATGTATCTGAAGATATTAGGATTGGAAGAAAATATAGCCGGACTGAACATTATCCATGTTGCTGGAACAAAAGGGAAGGGGTCAACATGCGCTTTCTCTGAGGCAATTTTACGTGAGTGTGGTTTCAAGACTGGCCTTTTCACATCACCTCATTTAATTGATGTGAGAGAGAGATTTCGACTTGATGGGATTGACATTGCCGAAGAGAAGTTTTTGCAGTACTTTTGGGACTGCTGGGATCAGTTAAGGGATAATGTAACCAAGGATTTGCCTATGCCTCCCCTATTTCAGTTTCTCACTCTTCTGGCATTCAAGATATTCATTGATGAAAAAGTTGATGTTGGAATTTTTGAAGTTGGCCTTGGAGGGGAAAAGGATTCCACAAACGTGATTAAAGAACCTGTTGTTTGCGGAATCTCTTCATTGGGGATGGACCACTTGGACTCCTTAGGAGACACTTTGGGAAAAATTGCTTTACACAAGGCTGGTATTTTTAAGCCCAATGTACCAGCATTTACAGTGCCCCAGCTCCCTGAAGCAATGAATGTTATCAGTCAAAAAGCTCAGCTATTAAGGATTCCATTGGAAGTTGTGCAACCTCTTACCCGCGGAGAGTTAAATGGATTACAACTTAGTTTGGCTGGTGATCATCAATTTGTCAATGCTAGCCTTGCTGTTTCCCTCTGTAAATCTTGGCTTCGACATACAGGGAACTCGGAAAAGGTGTTTACGAATGATGGTTGTGAAGCTGATATGCCAGATGCTTTCTTGAGAGGTCTTTCGTCGGCACGTCTTCCTGGGAGAGCTCAGATTGTCCATGATGCCATATTCAGGTCCTCCGATACAGCTACAGGAGACCTGGTGTATTATTTGGATGGAGCACACAGTCCTGAAAGCATGGATGCCTGTGCTAGATGGTTCTCCAAGATGGCGAAAGGCGATCACAAGTCAACACCATTATCCTCTTCTAAATCATCATGTGAAAATGGGCTTGGAGAAGCAGTAAGCAAAAATGGTTTCACCAAACAAGAAAAGGGAAATTGTGACAAAATTTCCAAGCAGATTCTTTTGTTCAATTGCATGGAGGTGAGAAATCCACAAATCCTGCTTCCAAAGCTTATTGGGACCTGTGCTTCCTCAGGTGTTCATTTCTCTGGAGCGTTATTTGTTCCTAGTATATCCACGTACAACAAAGTTGTTTCTGGTTATTCAATCACTTCAAACATACCTTTGAGAAACCTGTCTTGGCAATTTAATCTGCAGAGAATATGGGAGAAGACAGTCAATGGGAAAGATTTTGATCTGGACAGAAACAGCATGACAGAGTGCATAAAGAATGAGAGTACTGATGCCCTGCCACCTCTTGAATTTCTTCACGGTGATGGTTATCGTGACTTTCCTGGCGATTCCTTCCGTAGCAGTGCGGTTGTTCCTTCATTGTCATCAGCAATAAAATTGTTGAGGGATTGTGCAAGGGAAAACCCTTCTATCAGACTGCAGGTTCTTGTAACAGGATCATTACATCTAGTAGGAGACGTTTTGAGGCTGCTAAAGAGATAA MEERIASWRQSRELENLVKVIAFEEPILASELPRPFSVRRISNLSRGVSCLPSCLNKHDPLAPGLRSGMIPTEIVENMTRIEVTEEYSWDLTHSRSYETVMEALSSLITCRKRGEKPSIGGKYTKLERMTMYLKILGLEENIAGLNIIHVAGTKGKGSTCAFSEAILRECGFKTGLFTSPHLIDVRERFRLDGIDIAEEKFLQYFWDCWDQLRDNVTKDLPMPPLFQFLTLLAFKIFIDEKVDVGIFEVGLGGEKDSTNVIKEPVVCGISSLGMDHLDSLGDTLGKIALHKAGIFKPNVPAFTVPQLPEAMNVISQKAQLLRIPLEVVQPLTRGELNGLQLSLAGDHQFVNASLAVSLCKSWLRHTGNSEKVFTNDGCEADMPDAFLRGLSSARLPGRAQIVHDAIFRSSDTATGDLVYYLDGAHSPESMDACARWFSKMAKGDHKSTPLSSSKSSCENGLGEAVSKNGFTKQEKGNCDKISKQILLFNCMEVRNPQILLPKLIGTCASSGVHFSGALFVPSISTYNKVVSGYSITSNIPLRNLSWQFNLQRIWEKTVNGKDFDLDRNSMTECIKNESTDALPPLEFLHGDGYRDFPGDSFRSSAVVPSLSSAIKLLRDCARENPSIRLQVLVTGSLHLVGDVLRLLKR Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo16223.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902227881|gb|KNA20868.1| (hypothetical protein SOVF_048480 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1221.5 bits (3159), Expect = 0.000e+0 Identity = 604/605 (99.83%), Postives = 605/605 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902227882|gb|KNA20869.1| (hypothetical protein SOVF_048480 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1153.7 bits (2983), Expect = 0.000e+0 Identity = 572/572 (100.00%), Postives = 572/572 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731324386|ref|XP_010672944.1| (PREDICTED: folylpolyglutamate synthase isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 952.2 bits (2460), Expect = 4.700e-274 Identity = 483/617 (78.28%), Postives = 535/617 (86.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. NCBI nr
Match: gi|297739883|emb|CBI30065.3| (unnamed protein product [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 729.6 bits (1882), Expect = 4.900e-207 Identity = 385/613 (62.81%), Postives = 460/613 (75.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731400365|ref|XP_002274685.2| (PREDICTED: folylpolyglutamate synthase isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 729.6 bits (1882), Expect = 4.900e-207 Identity = 385/613 (62.81%), Postives = 460/613 (75.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RN08_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_048480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1221.5 bits (3159), Expect = 0.000e+0 Identity = 604/605 (99.83%), Postives = 605/605 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RPP7_SPIOL (Folylpolyglutamate synthase OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_048480 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1153.7 bits (2983), Expect = 0.000e+0 Identity = 572/572 (100.00%), Postives = 572/572 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8FGV9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_3g062250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 952.2 bits (2460), Expect = 3.300e-274 Identity = 483/617 (78.28%), Postives = 535/617 (86.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HLM9_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_08s0007g05910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 716.1 bits (1847), Expect = 3.900e-203 Identity = 373/584 (63.87%), Postives = 446/584 (76.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4RK01_9ROSI (Folylpolyglutamate synthase OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10004610mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 709.5 bits (1830), Expect = 3.700e-201 Identity = 367/577 (63.60%), Postives = 452/577 (78.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FPGS2_ARATH (Folylpolyglutamate synthase OS=Arabidopsis thaliana GN=FPGS2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 658.3 bits (1697), Expect = 8.700e-188 Identity = 349/615 (56.75%), Postives = 428/615 (69.59%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FPGS1_ARATH (Folylpolyglutamate synthase OS=Arabidopsis thaliana GN=FPGS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 519.2 bits (1336), Expect = 6.300e-146 Identity = 286/555 (51.53%), Postives = 368/555 (66.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FPGS3_ARATH (Folylpolyglutamate synthase OS=Arabidopsis thaliana GN=FPGS3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 463.0 bits (1190), Expect = 5.400e-129 Identity = 264/558 (47.31%), Postives = 346/558 (62.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FOLC_HUMAN (Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial OS=Homo sapiens GN=FPGS PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 286.6 bits (732), Expect = 6.900e-76 Identity = 220/603 (36.48%), Postives = 297/603 (49.25%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: FOLC_BOVIN (Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial OS=Bos taurus GN=FPGS PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 285.0 bits (728), Expect = 2.000e-75 Identity = 214/594 (36.03%), Postives = 297/594 (50.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G10160.1 (DHFS-FPGS homolog C) HSP 1 Score: 658.3 bits (1697), Expect = 4.900e-189 Identity = 349/615 (56.75%), Postives = 428/615 (69.59%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G05980.1 (DHFS-FPGS homolog B) HSP 1 Score: 519.2 bits (1336), Expect = 3.600e-147 Identity = 286/555 (51.53%), Postives = 368/555 (66.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G55630.3 (DHFS-FPGS homolog D) HSP 1 Score: 463.0 bits (1190), Expect = 3.000e-130 Identity = 264/558 (47.31%), Postives = 346/558 (62.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo16223.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G41480.1 (Folylpolyglutamate synthetase family protein) HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 1.400e-26 Identity = 63/175 (36.00%), Postives = 99/175 (56.57%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo16223.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo16223.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo16223.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo16223.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 4
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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