Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACTTGAAGAAAGCTAGCAATGGTGCAATTGGGTGAGAAAGATAAGGCTGTGTTGACAAACAAGGACATCAAAAATGGTGGTCAGATTACTGCAATGGTCGTGGGCGCTATAAGAAGCAGTTTCAGCCAACGAATGAGGAAGTACAAAGAGCACAGCTGGATAGGGAGTTTCATGGCGAGGCTTCCAGAGTTCATTAATGGAGGCGATGGGGCTGTGTTTGCGCACAAGGGCTCTAAGGGAGCCGTGATTTATGGTCTCGAGCAAGATGCATCACCTCGTCCTCTTGCATGGATACTGGCCTGGTCCAAACCCGATACCCTTGGTCAACCTAACAGGGTATGTATATAGTATATACATGCATAAACTTCCCTAGATAAAATGTGATTTATTAAAGTTTATTTATGTAGGACCCTGAATCCCTGATTGATATTAATTTGTTTGTTTTGTTCTGCAGGTGTATGTGGAGGGTGGGACACTAGAGAGGATCCTTAGCAAGGGTTGGAATGAAATTGAAGAGGATCTTGATAAGTCTGGAACCTACAGTCAAAACTATGACAAGGAATCAGGTGCTACCATAACTGCTCGCATCCAGGACGATAGCGAGAAAGTGGCTATCATCGATTCCACCTACAGTATCAACGACCCAGGGATGCCATGGCCATAATTCATAAACTTCCTGTCCTACCCATGGCCCATGGGCTCATAATATTTAATAATATAATATATGTATTCAGAATAAACACACGCAGCTTAGTACGTGTGCTAACTTATCACATCTTTAAAATGCCTATTGTATTGCTTCGATTTGTCATCAACTGGGCATAGTCTCATATTTAATATAAAATCCTTATTACGCGTATGTTTCTTGTATTATTATTTTCCCCTTTTTAGCCCCTGTTTATTTCACCTTATTACTTATTTCAGATTTAATCAGCTCAGATCAGTCCAGATCAAACCAAATCAGATTAGATCATATAAGAAAAAATAAGTTCACATCAAATCATACCAGATTTTTTATTATTATTACTAGATTTTAGCCCATGCGATGCACATAATCTATTATATTGTTATTTTTAATTAAAACTCCTATATATATACCAAATTTATATTCTTTGTGTTAGACTATATTAGTTTTTTATTTTACATTGAATTTCATTTTAGATTTTTTTATAATTACGAGAGTGTTTGTTTTTGGATGAAATTGTATATGCGTGATATTAATAATTAATTAATAAAAATATCTACGTGACACTTAATTATTTATCTACGTGACACTCGACTTTTTAATTCAAAATTAATTTTGAAATTTTATTTTTCATTGGCCGAAACCATTAGTTTTCCTACGTGGCGCTCTAATATTGAATTAATATTTGATTTTAAATTGAATTTTATTTATTTTATTTTAGATTAGTGTTGGATTTTGGATGAATTTTATTTTAGATTTATTTTTTAATCATCATAGTGTTTGATCTTAGATGGAGTTGTATATATTAGTAATTAATTAATTAAAATATCTACGTGGCACCTAATTAATTATCTACGTGGCAATCGATTTTTTTAATTCAAAAATAAATTAGAAATCTTATTTTTCATTGGCCGAAACCATTAGTAATCCTATGTACGTGGCACTCTAATAATTCAGCAAATATGCCTCCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAGATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATCAAATGCTAACAAAGCCATAAGTGGGAAGCCGAGATACAATCTGGGCCCCCACTCCTCTAGCTATAGCAAATCCTACCCTGGTGAAAATATGAGTAGTAGCACGAGCCCCAATGTCCTGGTTCCTAGAAAATTTCTGAATCCGCTTCAGCAACGCAACAACATCCTTATCCAGCTCCCCCAATATTTATATCCATTAGAGGAATTAGAGCTGCAAATTTTCAACCCGAACCGTTGAACCCTTTGGCTTGATCCGATCGTTAAAATCCGAATTGTCAATAACCCGCAAGCTAGAACCCAAAACCCGATCTAATTCGATTATATTCAACCCGAATCCGAATTGACCTGAAAATACATGACTAGTTAATTTTCCTGCCCAATCCAATCCAACTCGTAAGCAAAATAAATTTGTTTTAACCCAAATCAATAAATCCGATCTAAACATGATCCGTTTGTCCGAATTGAAGCCCCTACATCGACTACAATATTAACGATAATCCTATCACATTTAATACCAAAAAAAAAATTCCTATCACAGTTAATACCACAAAAAAATCCTATCACCGTTAGGAAACGTGGCAGAAGTATAATAAATCTCTGTCACCTTCCTGTGGGAATAGTATTCCAAAATAGGATAAAGGTTGTACATTAAGGTTTGGAAAAATTGACAAAAATAATCCCACCTTTCACTCATCTTCTCAAAATAATCCCAACTTTGGATTATTTTAGAATAATACAAACTTTAGGGGTTACCTTCTCAAAATAATCCAAATTATCAATTTGCATATGTACAATAGACCCAAAATGGATTAGTAATGACAAGAAAAAAGGACTTCGGATTATTTTGAGAAGGTAACCTCTAAAGTTTGGATTATTCTAAAATAATCCAAACTTGGGATTATTTTTAGAAGATGTGTGAAAGTTGGGATTATTTATGTCAATTTTTCCTTAAGGTTTTGCCTATATACTTTTGTGTTTGTCAAAGGAACATTGAGGTTTTGCCTATATACTTTTGTGATTGTCAAAGGAACTAGATTCATATGCCAAAGCTAAATAATTAACAGAAAACGGAATTCACTATCACATGTTTTTAATTGTTATTTGTGTATGCGCGCAAGCGTATATGTGCGTTCTTTTAACCTACCTTTTTCCTTTTTTCTTTTTTATTTATTTTATTTTATCGCGAATAAGTTCTCCATTAGTATACCTTTGGCGAAAAAAGTACTAGTTCAATTCCATGCTATAAATTTGCAGTTGATATGCGCCCTTTTAATCAGTCTATCTCGCAACATATTTATTTTCTCCAGTGCTCTTAGCTTCATCGTCGTATAGGCTATTTGGCTGTATTGAAATCAAGGTAAGTAAATCCTAATGTACGTACTACTTTTTACTTCCTCCGTTTTCTATAATTGCATGATTTGTAATTTTATGCTATTTAAGTATTTTTTGATCAATTTCTTTTTTGTGATTTATGTATAAATAATTCGTACAATCATGTGATATATTATTAGATTATCCTCAGCTCGTTATATATTTTCAAAATGCCGATCACCATTTTATAATTTAATTTTATGTATTAATTTGAGATATTAATGGCTAAAAATTTACATTGATAAATGTGAAACGTATAAAGTTTTACTGTACGTTGAACAGACAAAGGAAAACATGGCAGCAACCCAGCAAGTCTCGGCAATGCTTAGCAACGAAGAAAAGGCTATTTTCGAGAAGGTGATTGCGGGTGCTAAGGATAAATCAGGCATGGAAGTTAAGGGACAAGTTGTTACTAACGGCAACTTGGTTAATACTATTAAGGACAAAGCAGTGTTGCAAATAATTGATCAGCATAATTGGTCTGGGAAACCAGTGCCTCTCTACCCTGAGGTTCTTCCATTTGGTGAAGTTGTCCAATTCGAGCACCGTGGACCCCTTCCAGAAGGCTGTAAGGGTGGAGTAGTTTATGCTGATGGTACCGACTCCACTGCTCGGAAATGGCTTGTGGCTTTTCACATTCCAAACAACGAATACCATCATTCAGGGGACAAGGTTGTGTTCTATTTTCTCAAACTCTTAATATTTTGTTTTTTTTTTTATCTATATTAAAAAACCCAAATTTATCAGTAATTACTTTACAATTTTTATTTTGCCAAAACTACCTTATAAAAAAATATTATTATTATTAACTAGGAGGACAAAGACTTCCATGGTAGAAAGAAGGAGAGAGAAAGTAAACTGGTTATACTAAATTAAAGTTAAAATTAAATTGAGATAAATCAATTATATAATGACACGTGTTAAATTAACATGTCAAATCGGTTATCAACCGGTTAAAGACTGTTATGGGAAGAAATCTTCCAAAGCTTGGATTATTCTTGAATTACTCAAATGTGGTACTGTTTTTAGAAGAACGGCCAAAGGTTGGATTATTTCTTACGGAGTACAAATTTTCCTAAATGTTTTAATATTCTATCAAAATTGGTGTCTAATGATAATTTAACCAATTAAATTCATTAGGTCATTTAATTTCTCACACTTTTCTAATGGGACATTAAATTTTTCTCATTTTTCCAATATCAGATTATATTTTGATGATAGTGAAAGCATTATAAATAAACGTAATTATCCTTGTTTAAATAAAAAAAATAGAGGAATCTCAATACACATTAATTAGTCTTTAATAAACGTGTAAAATGCCAAACGTAAAGAACAAAAAGAAATGGTTGAGTTTCTTATAATAACAACTTTTTTTTTTTTTGGTGTGGGGGATAGTTGAGTTGGTTAGAGCTTCCCTCCCGNAAATGCCAAACGTAAAGAACAAAAAGAAATGGTTGAGTTTCTTATAATAACAACTTTTTTTTTTTTTGGTGTGGGGGATAGTTGAGTTGGTTAGAGCTTCCCTCCCGATTCCAAGTAATCATGGAATCGATTCTCATCCCTGCCATTGCATGTGGCTCATTTGCACCCAAAAAAAAAACTATCTTACGGAGTATAATAATTTTATGCTTTAAGATACTACCTTTGGTCCGATTCTAAGCATTGATTAAACATTTTAGGGTTAACTTTACTAATTAAGTGCATCTCACGAAAAATGAGTAATTAAATGACACATGAGATGCATGTGATAAAATTAATTCAAAATTTGGGAAAAGGTAGTAAGTTGCAACATAATTTTTTAAAATAAGATACAGTAATTTTTTGCAAAAATCAAATTTATAAAGTAGTTGTTGACAAATTTGCCTTAAAAAAAAAAAACTAACTTCAATAATGTCTACAGGTTTATGTTGAGGCTGGTCCAATAGGACCAATTGACTGGAACGTAGTCGAAGTTAAACTTGATGCATCGGAATATGCAAGTAGCTATGTGGACCCAGTTTTTGGAGGCAAGGCATGGGCTGTGATCCACCCTGGTAGCATTCTTGTTGCGGGGTTTACTAATTAAGTAATTAGCATGCTAGTCCTTATATAATCAGCATGCTACTCGTAATGGAGTTTAATTTGCTGCTAATTATATTGGATGAGCATCTAATTAAGAAGGTCATGCTGCAAGCAGGCATTTTATAAATGTAATACCCAATAATACGTCCTCTTGCATGTTACGGAGTATGTACGCATATATATGCTATAACGTTAAATAATACTCCCTTCATTTCTTTTTGATCTTCCTGTTTGGAG GACTTGAAGAAAGCTAGCAATGGTGCAATTGGGTGAGAAAGATAAGGCTGTGTTGACAAACAAGGACATCAAAAATGGTGGTCAGATTACTGCAATGGTCGTGGGCGCTATAAGAAGCAGTTTCAGCCAACGAATGAGGAAGTACAAAGAGCACAGCTGGATAGGGAGTTTCATGGCGAGGCTTCCAGAGTTCATTAATGGAGGCGATGGGGCTGTGTTTGCGCACAAGGGCTCTAAGGGAGCCGTGATTTATGGTCTCGAGCAAGATGCATCACCTCGTCCTCTTGCATGGATACTGGCCTGGTCCAAACCCGATACCCTTGGTCAACCTAACAGGGTGTATGTGGAGGGTGGGACACTAGAGAGGATCCTTAGCAAGGGTTGGAATGAAATTGAAGAGGATCTTGATAAGTCTGGAACCTACAGTCAAAACTATGACAAGGAATCAGGTGCTACCATAACTGCTCGCATCCAGGACGATAGCGAGAAAGTGGCTATCATCGATTCCACCTACATGCTCTTAGCTTCATCGTCGTATAGGCTATTTGGCTGTATTGAAATCAAGACAAAGGAAAACATGGCAGCAACCCAGCAAGTCTCGGCAATGCTTAGCAACGAAGAAAAGGCTATTTTCGAGAAGGTGATTGCGGGTGCTAAGGATAAATCAGGCATGGAAGTTAAGGGACAAGTTGTTACTAACGGCAACTTGGTTAATACTATTAAGGACAAAGCAGTGTTGCAAATAATTGATCAGCATAATTGGTCTGGGAAACCAGTGCCTCTCTACCCTGAGGTTCTTCCATTTGGTGAAGTTGTCCAATTCGAGCACCGTGGACCCCTTCCAGAAGGCTGTAAGGGTGGAGTAGTTTATGCTGATGGTACCGACTCCACTGCTCGGAAATGGCTTGTGGCTTTTCACATTCCAAACAACGAATACCATCATTCAGGGGACAAGGTTTATGTTGAGGCTGGTCCAATAGGACCAATTGACTGGAACGTAGTCGAAGTTAAACTTGATGCATCGGAATATGCAAGTAGCTATGTGGACCCAGTTTTTGGAGGCAAGGCATGGGCTGTGATCCACCCTGGTAGCATTCTTGTTGCGGGGTTTACTAATTAAGTAATTAGCATGCTAGTCCTTATATAATCAGCATGCTACTCGTAATGGAGTTTAATTTGCTGCTAATTATATTGGATGAGCATCTAATTAAGAAGGTCATGCTGCAAGCAGGCATTTTATAAATGTAATACCCAATAATACGTCCTCTTGCATGTTACGGAGTATGTACGCATATATATGCTATAACGTTAAATAATACTCCCTTCATTTCTTTTTGATCTTCCTGTTTGGAG ATGGTGCAATTGGGTGAGAAAGATAAGGCTGTGTTGACAAACAAGGACATCAAAAATGGTGGTCAGATTACTGCAATGGTCGTGGGCGCTATAAGAAGCAGTTTCAGCCAACGAATGAGGAAGTACAAAGAGCACAGCTGGATAGGGAGTTTCATGGCGAGGCTTCCAGAGTTCATTAATGGAGGCGATGGGGCTGTGTTTGCGCACAAGGGCTCTAAGGGAGCCGTGATTTATGGTCTCGAGCAAGATGCATCACCTCGTCCTCTTGCATGGATACTGGCCTGGTCCAAACCCGATACCCTTGGTCAACCTAACAGGGTGTATGTGGAGGGTGGGACACTAGAGAGGATCCTTAGCAAGGGTTGGAATGAAATTGAAGAGGATCTTGATAAGTCTGGAACCTACAGTCAAAACTATGACAAGGAATCAGGTGCTACCATAACTGCTCGCATCCAGGACGATAGCGAGAAAGTGGCTATCATCGATTCCACCTACATGCTCTTAGCTTCATCGTCGTATAGGCTATTTGGCTGTATTGAAATCAAGACAAAGGAAAACATGGCAGCAACCCAGCAAGTCTCGGCAATGCTTAGCAACGAAGAAAAGGCTATTTTCGAGAAGGTGATTGCGGGTGCTAAGGATAAATCAGGCATGGAAGTTAAGGGACAAGTTGTTACTAACGGCAACTTGGTTAATACTATTAAGGACAAAGCAGTGTTGCAAATAATTGATCAGCATAATTGGTCTGGGAAACCAGTGCCTCTCTACCCTGAGGTTCTTCCATTTGGTGAAGTTGTCCAATTCGAGCACCGTGGACCCCTTCCAGAAGGCTGTAAGGGTGGAGTAGTTTATGCTGATGGTACCGACTCCACTGCTCGGAAATGGCTTGTGGCTTTTCACATTCCAAACAACGAATACCATCATTCAGGGGACAAGGTTTATGTTGAGGCTGGTCCAATAGGACCAATTGACTGGAACGTAGTCGAAGTTAAACTTGATGCATCGGAATATGCAAGTAGCTATGTGGACCCAGTTTTTGGAGGCAAGGCATGGGCTGTGATCCACCCTGGTAGCATTCTTGTTGCGGGGTTTACTAATTAA MVQLGEKDKAVLTNKDIKNGGQITAMVVGAIRSSFSQRMRKYKEHSWIGSFMARLPEFINGGDGAVFAHKGSKGAVIYGLEQDASPRPLAWILAWSKPDTLGQPNRVYVEGGTLERILSKGWNEIEEDLDKSGTYSQNYDKESGATITARIQDDSEKVAIIDSTYMLLASSSYRLFGCIEIKTKENMAATQQVSAMLSNEEKAIFEKVIAGAKDKSGMEVKGQVVTNGNLVNTIKDKAVLQIIDQHNWSGKPVPLYPEVLPFGEVVQFEHRGPLPEGCKGGVVYADGTDSTARKWLVAFHIPNNEYHHSGDKVYVEAGPIGPIDWNVVEVKLDASEYASSYVDPVFGGKAWAVIHPGSILVAGFTN Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo15533.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902154171|gb|KNA05789.1| (hypothetical protein SOVF_187150 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 2.300e-100 Identity = 179/180 (99.44%), Postives = 180/180 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902223432|gb|KNA19449.1| (hypothetical protein SOVF_061600, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 2.100e-90 Identity = 162/170 (95.29%), Postives = 165/170 (97.06%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902073892|gb|KNA02993.1| (hypothetical protein SOVF_213380 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 1.200e-88 Identity = 165/167 (98.80%), Postives = 166/167 (99.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902183787|gb|KNA10172.1| (hypothetical protein SOVF_146870 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 2.200e-42 Identity = 92/117 (78.63%), Postives = 95/117 (81.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731322098|ref|XP_010671705.1| (PREDICTED: jasmonate-induced protein homolog [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 8.200e-42 Identity = 101/186 (54.30%), Postives = 126/186 (67.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QET6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_187150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 374.4 bits (960), Expect = 1.600e-100 Identity = 179/180 (99.44%), Postives = 180/180 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RKJ7_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_061600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 1.500e-90 Identity = 162/170 (95.29%), Postives = 165/170 (97.06%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9Q8G5_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_213380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 335.5 bits (859), Expect = 8.100e-89 Identity = 165/167 (98.80%), Postives = 166/167 (99.40%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QSB1_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_146870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 1.500e-42 Identity = 92/117 (78.63%), Postives = 95/117 (81.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CR36_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_3g054040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 5.700e-42 Identity = 101/186 (54.30%), Postives = 126/186 (67.74%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15533.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: JIPH_ATRCA (Jasmonate-induced protein homolog OS=Atriplex canescens PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 1.300e-7 Identity = 45/151 (29.80%), Postives = 72/151 (47.68%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo15533.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo15533.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo15533.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 1
BLAST of Spo15533.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 0
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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