Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGTTAAGCCCGGGAGTCTGGGGCCATACATCACCAATTCACCATGAACTCAAATTCATGGTAAACATTGCCCGTCATCGTTCGGTGGCGCACTAATTCGCAGCCGTCATTTTTCCCGCTCCACCTCCTCACCTCACATCACCGAGGAGGAGAGAGAGTTACGGCGGCGAAAAAAATGACCACAACCACAACAATAAAAACAAGAGAGAAGTTCTCGGCAGATTGGGTAATGGGAGGCACAGCGGCGGTGGTGGCAAAGACAGCGGCATCACCAATTGAAAGAGTTAAGCTGCTGTTACAAAACCAAGGCGAATTGGTAAAGCAAGGCCGTCTTCAAACTCCTTATCTCGGTATTTCCGATTGCTTTAAAAGGGTTCTCCGTGAAGAAGGTGTTCTCGCTTTGTGGAGGGGTAATCAAGCCAATGTCATCCGCTACTTTCCTACCCAGGTACTTTCTCTCTACTTAATGTTTGCTGGAAATGGGAATTTATTTCCGGGTTTTATGATTTGTTTGATGTTAGTTTTTGGGTTTTGTGATCTGTTTGATGTTAATTTTTGACGGCATTCTTTAATGGGATGAAACATGGGAAGATATGGAAAATGAGGACGTGCTAAATGGGGGTTATTCATACTGTTTTCAATTGATTTTTGTGGGATTTGTGGAGATAGGAAGTCAGGAAGAATACATTACATAAAATTAGTCTTATGAATTTATGAATAGAAGGGAGAAAAACTGTAAACATGAGATAGGGAAGGAAATGGGGAAGGAGATGATTTAGGGGAGAGAAAACAGAATGAAGAACGATTAACAGTGTACCTTTAGGTTTGTTTTTCGTATGAAGTACCAGGTATAGATTTGCTGTCAATTTGAAATTAGGATGTGGATATTGATCTGTTTGTCAGTTCATTAATTGTAATGATGTGGATAAGTGTAGATTTCCGCTAGCAAAGGAAAGATTAAAAATTTAGGATGTGGGTGACTGGGTGTTGCTGAAATTCAATTTCGTTTTCACTTGATGAATAGAAGTACCAAGGAATGTAGGAGATGGGATTTATGTATTTTTGTCTTGGACTTGTAGTTTTTGGTTGATAGATGTTCTTAGCCGTCTTAGGTAACAATGTGACCTTTTGTCGTGTATATCATGTTGGGTGCGACCTAAGGAAGGGTAGGGTCTTTGGTTGAACACTAGATTTCTCATACAACGAGGCTATTCCTAACATATCGATAAGAAAAGGAGTTAAAGTTAGGGAAAAACTTTAGATTTCTCACACGATGAGATTGTTGCTAACAGATTGATCATTGATCGGAAAAGAGTTGAAGTTAGGGGTCAAAAGTTATTTACCTTAACTAGATTTGGTTGAAATGACTTTATGTTTAGACAAGTGTATTGAGATGTGGGTTGATTATAGTTGTTGGACAGGAAGTACTTTAAGTTTGTTTTTATACGACCAGGCTTAGTTGAAGTAAGGAAGTGCTACTTATTTACTTAGGAGTCACCCTCGAGCGGAGGGCCTCCTAATGTATCCTTTTTCTTATCAATAAAAAAAAGGGGAAGTGCTACTTAGAGACTCACACTTCTTCACGAGCTTTGAATTAGTTTTAGTTGGGAATCTTATTTCTCTAGTTGGCGATTCTTGAATGAATTGTATATTGTAAAGAAAAATTTCAATATGCTTCCACTTGTAGATGTTGATCCCAAGTGGTCCTTTAAACAAAAACCTAGAAAATCAGAGGTGAAAAACTTGTGTCAGTAGAAAAATAGTCATATTATGTTAACACATTACTTAAAAGAGGTAATAGAAACAAGCAAGCTGCAATTAGCTGCATAGGTGGATAGGCGGAAGCAAATTGTTGCAGGAAACTTGGGTTTTGGAGAGTGCAAAAGATGGAAGTTGCTTTAGTGGAAACTTTCTTCCCTTCGATGAAGGTGTATAATTTCAGAAACTTGTATTTAGGATTCAGTGATTCACATAAGACTTCAATTGAGGCTCATTTTGATGGATTTTCTCAAATTGCTTGAGGATTTGGTAGATAAGGTAACAATATTTCTGGAAAAGATTGAAGAATCAAGGGCGGAGGTCTAGATTATTTTACTTTGAAAAGTTGCAGGTTAGGTTTTATTGCTTGTATGGGCTTCAATATCTTACAATTGGTCAAGGCTTAAGCTTGATTTGGGATTAGTTGAAGTGTACAACATGATTTTGGAGAAAGTTGTGGATTTGAGGCTAACAGACTAACACAAATTTTTTTCAAATTTTTTCCTTTCTTTGCCATCCACCATTTTCTTTAGATTGGGTTTTGGCTTTTTGAGTTGTATTCAAGCTGGGTTTTCGCCAACTCTGGTTGCTAATGTCTGAAGGGTATAACCAAATATCTGTTTGTTCTTCCTGGCCTTCACCTAGGCTGTAATTCATGCATGAGAAATTTTCAGCTTATTTCTGTGTGTGATTCTCCATTCCATGGAAGTCCACTCAATGTTTTAAAGTTTGGATCGAGAAGTCCTAGTTTAGATATGCAGAGAATGAATCTCATTTTTCTTACAATGGTCATTGCCTGTTTTATTTTGTGTTGATGTCCCTGCATTTGGTTGGAGACTGGGAGTTATCTTGGAATAACAAATATTTAGAAGTTATGATGTCATTGCAGTGCTGACCCCCTGCCTTCCCTGAAATCAGAAAAAGTAATGATCAAAGTGGAGTTGAAACATGCTTGCAATCCTTCATGTGTTCTATTTTCTATTCATTTAAAACCTAGTGAACTGGGATTTCTGATGCATGCAGGCTTTCAATTTTGCATTCAGAGGGTATTTCAAGAGTCTTTTTGGACGTTCTAAGGAAAGAGATGGCTACATCAGATGGTTTGCTGGAAATGTGGCTTCTGGAAGTGCTGCTGGAGCAACAACTTCAGTCTTTCTCTATCATCTGGATTATGCACGTACACGGCTTGCTACTGATGCACTGGGGACTTCTATGAATGGACAACGGCGGTTTAAAGGATTGGTTGATGTTTACCGTAAAACATTGTCAACCGATGGAATTGGAGGGCTTTATCGAGGATTTGGAGTATCAATTTTTGGAATTACCCTTTATCGGGGTTTGTACTTTGGGATATATGACACTTTGAAGCCCCTTGTTTTGATCGGGCCGCTGGAGGTTAGTTACTCTACTTTTCTTTTCGCAGAGCATTTTATTTCTCCTTCAGTTGTCTTCTTAGTTGTGTTATACTGGGGAGACCTTTGATGCAGCCTAAAGTTTGCTCCTATCTGGTGAATGGAAAATATTAATGCTTGGAACTGTGAGCCAAATATTAGTGGCAGAAAAAAGATTTTTGTATTCAATGTGTTTGGACCTCTCTTTTTTCTTGTTGTTTATCGGTTGATTAGTTTGGAGGAAAAAGATTAATGTGTGCGACTCATGGAATGCCATTTTACTCCATGTTCGGCCGTTGTTGGCAACAATCATCCTTTTGGAATCGTTGGATTTGATATTGATATTATTGGACCTCTCCGCAAGTCAGAGTTGACATATGGGCCGTGCCATGCCAAATTCATGTATGTGTCACAAAATAAACATGTAAAATGAAAACCTTGATACTAACATAACATGTTTAATTAAATTTCGAGACTAAACCGACCCGTTTTATTAAGTGGATTAGCTATGTTGACCTATATAGCTTGTTTAAAATATCAAGAAAATTTTAGTAAGGAAAAATTGACGCCACCAGTCCCAACTATGAGTCTATGACCGTTCTTCATTAAAAGGTCTCAATTTTTGATAATTCCTGGGCGGTCCCAACTTTAAGGGGTGTCAATTTTAAATGGGTTTCGTGACTTGTTAACAAGTTTTTTTCCTTTTGTTTTTTTTATTTCCTATACACGTGGCGCGATATCATTGGTTGTTAATTTTTAAAACTTAAATGATTTTAAAAAAATTATTAATTTAGATATTTTTTTAAAAAATAATATATATTAATTTTTTTTAATTATTTTAAAAAAAAGAGCCGAAAGCAGAGTAATTTTTTAAAGTTCCGATAAGGAACTTAATTTTTTATTTATAAGTTTGGACCGAGGCTTTATTATTAAGGAGTATTTTTTAAATTTTTTTTGATTAGGGGCTTATTTTTTTACTTCCGGTTGAGACCTTATTTAAATTATTTATATAAATCATATGGAGTTTTTAGTCACGAAAGGGGCTTAATTTTTTTTTCTAAAATAAAAAAATTTAACACTTAAAATATTTTTTTAAAAGAAACTTCAATTTTTTTTTTTAGTTTAAAATATATTTTACATGAAATAAAAAATAATTTTTTATTATAAAAATAAACAACCAAAATGAACCTGACACATGGCACAATTAACCGGTTTAGGAGGTTAATTTTTGTTGGGGACCGTTTAAAGTGGAGACCCCTAAAGTTGGAACCGCCTTTGAATAATCAAAAGTTGAGACCTTTTAAAGATGAGCGGCCTGGACTGCTGGTGTCAATTTTTCCTTTTAATAATGGTGTTGTGAGGTAATAGAAAGAAACTGAGAAATTTACTATTAGAAAGTAAGTTTGCAAAACACAGATATATTACTCGTATGAGTTGTGTGGAAAAATTACAATCCGAAGGTAAGTTTTTATAGGAGAAACTTGTTACTATTGTAGTATGACAAATTTGATTATTTACTACAATAATACAATGTGAATTGTCAATTGAATTGTCAAACATGGGGAGCTACTATTAATTTGCAGGACATTCTCCATGCACCGTCCTATGCCTCATAACACTCCCCCTTAAATGTCCATCCTTACGACGTATTAGTTGTCTCATTAAAAACCTTGCTTGGTAAAACCCAGTGGGACAAAAACCATAGCTAGGGAAAATAGTACAATTTTTGTGATTATATGCTTTGGCATACTGTCTCATCAAAAACCTTGTCAGGAAAAACCCACTGGGACAAAAACCTGATCGAAGGAAAAAATAGTGCAGTGCATATAATACTCCCCCTCAAT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MTTTTTIKTREKFSADWVMGGTAAVVAKTAASPIERVKLLLQNQGELVKQGRLQTPYLGISDCFKRVLREEGVLALWRGNQANVIRYFPTQDSVIHIRLQLRLILMDFLKLLEDLVDKAFNFAFRGYFKSLFGRSKERDGYIRWFAGNVASGSAAGATTSVFLYHLDYARTRLATDALGTSMNGQRRFKGLVDVYRKTLSTDGIGGLYRGFGVSIFGITLYRGLYFGIYDTLKPLVLIGPLEDNFFASFFLGWGVTTTSGICAYPFDTVRRRMMLTSGESVRYHNAFHALREIIRHEGFYALFRGVSANILLGMAGAGVLAGYDKLHRIAHGHGYRLSCSTVIDQTKKTYPRFYGLADASQRMCPSTELVQQKHSSAKGFIPSSEAEKLIHASLGSAKMNRLAEQHAAAAATSATTTAKPPTTTQLHKISSLALSFACSSVQLT Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo15346.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902232812|gb|KNA22804.1| (hypothetical protein SOVF_030730 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 607.4 bits (1565), Expect = 1.900e-170 Identity = 309/336 (91.96%), Postives = 309/336 (91.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731334729|ref|XP_010678367.1| (PREDICTED: ADP,ATP carrier protein ER-ANT1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 531.9 bits (1369), Expect = 1.000e-147 Identity = 267/338 (78.99%), Postives = 290/338 (85.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. NCBI nr
Match: gi|567896642|ref|XP_006440809.1| (hypothetical protein CICLE_v10021273mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 2.700e-132 Identity = 229/328 (69.82%), Postives = 276/328 (84.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. NCBI nr
Match: gi|703118641|ref|XP_010101651.1| (ADP,ATP carrier protein ER-ANT1 [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 479.6 bits (1233), Expect = 6.100e-132 Identity = 232/327 (70.95%), Postives = 274/327 (83.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. NCBI nr
Match: gi|595860749|ref|XP_007211202.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa008947mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 477.2 bits (1227), Expect = 3.000e-131 Identity = 231/330 (70.00%), Postives = 274/330 (83.03%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RV60_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_030730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 607.4 bits (1565), Expect = 1.300e-170 Identity = 309/336 (91.96%), Postives = 309/336 (91.96%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CFE1_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g113510 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 531.9 bits (1369), Expect = 7.200e-148 Identity = 267/338 (78.99%), Postives = 290/338 (85.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4VMJ1_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10021273mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 1.900e-132 Identity = 229/328 (69.82%), Postives = 276/328 (84.15%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: W9RG10_9ROSA (ADP,ATP carrier protein ER-ANT1 OS=Morus notabilis GN=L484_016681 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 479.6 bits (1233), Expect = 4.200e-132 Identity = 232/327 (70.95%), Postives = 274/327 (83.79%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5WGK1_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa008947mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 477.2 bits (1227), Expect = 2.100e-131 Identity = 231/330 (70.00%), Postives = 274/330 (83.03%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ADT4_ARATH (ADP,ATP carrier protein ER-ANT1 OS=Arabidopsis thaliana GN=ER-ANT1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 458.4 bits (1178), Expect = 9.100e-128 Identity = 221/323 (68.42%), Postives = 265/323 (82.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ADT3_ARATH (ADP,ATP carrier protein 3, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=AAC3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 382.9 bits (982), Expect = 4.800e-105 Identity = 188/328 (57.32%), Postives = 238/328 (72.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ADT2_MAIZE (ADP,ATP carrier protein 2, mitochondrial OS=Zea mays GN=ANT2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 374.8 bits (961), Expect = 1.300e-102 Identity = 185/328 (56.40%), Postives = 234/328 (71.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ADT1_MAIZE (ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial OS=Zea mays GN=ANT1 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 374.0 bits (959), Expect = 2.300e-102 Identity = 185/328 (56.40%), Postives = 234/328 (71.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: ADT_SCHPO (ADP,ATP carrier protein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=anc1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 372.9 bits (956), Expect = 5.000e-102 Identity = 185/329 (56.23%), Postives = 231/329 (70.21%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G17400.1 (endoplasmic reticulum-adenine nucleotide transporter 1) HSP 1 Score: 458.4 bits (1178), Expect = 5.100e-129 Identity = 221/323 (68.42%), Postives = 265/323 (82.04%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G28390.1 (ADP/ATP carrier 3) HSP 1 Score: 382.9 bits (982), Expect = 2.700e-106 Identity = 188/328 (57.32%), Postives = 238/328 (72.56%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G08580.1 (ADP/ATP carrier 1) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 1.800e-102 Identity = 184/324 (56.79%), Postives = 233/324 (71.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G13490.1 (ADP/ATP carrier 2) HSP 1 Score: 369.4 bits (947), Expect = 3.100e-102 Identity = 183/324 (56.48%), Postives = 234/324 (72.22%), Query Frame = 1
BLAST of Spo15346.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G56450.1 (Mitochondrial substrate carrier family protein) HSP 1 Score: 167.9 bits (424), Expect = 1.400e-41 Identity = 112/339 (33.04%), Postives = 171/339 (50.44%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo15346.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo15346.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo15346.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo15346.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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