Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTCCGTCGCCGGTGCTCGCAAGAAATCGAACGGAATCAAACGAATTCAAACAAAAATTCAACCACCGGCGGTTTTTATTTCCGGCGCTCATTCTCTCTCTTCAATTCCTCTCTCTCTCCTTTTCGAACACCACCAACATTCGACCTCGCTCGCCGCAGCCGTTGCTTGTGTCTCGCTTCCGCCGCTGCTCGCGTCTCGCCGCCTCCGCTGCCCACTGCAATTCATTCGCCGGTCGCGGTGGTTGGGGATTCAGCAATTTCGATTATAAATTCCGTTCGTGGTTGTTGTGGTTCTTGAATCAGTTTTCAATTTCGGTAAGATTCTTCGAAATCAATCGAATTCGATTTCTGTAAGATTTCTTCGATTTCGATTTCTCTCAGATTTCTTTGATATCTTCGATTTCAGTTTCTTCGATTTTAAATCAATCGATTTTGTTTTTCTGAGATTCTAAAATCAATTGATTTCTTTGATTCTAATATCAATCAATTGATCCGAATTCATGTTCTAAATTAATCCGAAATTTATCCAGATTCATGTTCTAAATTCCAATTTCAAATCCTCAAATCAGATTCAAATTTAATTAACTTTTTTGTTCTTTTTCATACGTTTATTACTTCAAGTCTTGAAATGTTTGGTTGCTGTCTTCTCTGTTTGGTTATTACAGATGCATCACAAACCTACAAACATATATTAATTAATTAAAAACAAGCTATGATGTATATATTCTTGAATACATTTTAGAACATTTTTGAATAATTTTAGAACATGCTTAAATTAATTTAAAACACTCTTGGATGAAGATAGAACATTCTCGAATAAATTTAAAACACCGTTGAACAAAGTTAGAACATGTTTGAATTAATTTAGAACATCAATAAATTTAAAACATGCTTGAATAATTTTTGAAACACGGTTGAATAAAGTTAGAACATGCTTGGAAATTTTTTGAAACACGGTTGAATAAAGTTAGAACATGCTGAAACTTTGAATAAAATTTAGAACATGCTTGAATAAATTTGGAACATGTTTGAATGGATTTAGAACATGCTTGAATAAATTTATAACATGTTTAATAATTTTATAACATACTTGAATTAATTTAGATCATGAGCTTGAAATTTAGAACATGTATATATGTACATGTGTTGACTAGGTTCTCATGTTCTAAATTTAGAACATGGTTTAACAAATTTAGAACATGGTTGAACAAATTTAGAACATGGTTGAACAAATTTAGAACATGGTTGAACAAATTTAGAACATGGTTGAATAAATTTAGAACATACTTGAATAAATTTAAAACATGGGCTTGAAAATTGAGAACATGGTTGAATAATTTTAGAACATGGTTGAATAATTTTAGAACATAGTTGAATAAATTTAGCACATGGTTGAACAAATTTAGAACATAGTTGAATAAATTTAGAACATGCTTGGATAAATTTAGAACACGATCTTGAAAATTTGGAACATTTATATATGTATATGTGTTGACTTGTTCTAAATTTAGAACATGGTTGAATAAATTTAGAACATGGGTGAACAAATTTATAACATCGTCGAATAAATTTAGAACATCCGTGTATAAATTTAGAACGTGGTTGAATTTATTTAGAACTTGGTAGAACCAATTTAGAACATGGTAGAACCAATTTAGAACATGCTTGAATAATATTAGAACATGCTTGAATAATTTTATAACATGGTTGAACAAATTTAGAATATTTTTGAATAATTTTAGAACATGGTTAACAAAATTTAGAACATGCTTGATTAAATTTAGAACATGATTGAATAATTTTAGAACATGCTTGAATTAATTTAGAACATGAGCTTAAAATTTTGGAACATGGTTGAATAAAATTAAAACATGCTTGAATAAATTTAGAACATGGTTGAATAAATTTAGAACATGAGCTTGAAATTTTAGAACATTATTAAATAAATTTAGAANATATATATATATATATATATATATATATAGTGGAGGGATCCGGTAAGAACACCTCCTTATAAGTAAATGTGAATGTCACTAATTTAGTAACCCGAAGCATCGCCTGGGCCCAAAAACTAATTTTTTCATTAAAACCCCCGTGTATCGCTGCAATAGGTAAACATGTAAGAGGCCCAAAAACATGAACTACTATTAAAACTTCGGTCCAATATATAACAAATTAACAATGCATACTAGCTTGAATCTGTTTAAAAAGTATCGGAGATAGTTGAAACTATTTTGTCATTTCTCTCTAAAAGTTAGTGTACCCTCGATTAAATATGGTTGTGGGTTTGGTCGGGCTGTGTTTGGGCCGAGCCCATATTGCTTTAGCCTCAATAGGCCCGACCACACAGAACCCACTTGTTACATACAGGACCGGGCCATGTCAAAATTTTCAAAAGTACAACCCATGCACGACCCAAGCCCACATCTAGCTAGGCTGAGTCATGCTTTGTCGTCCTTTTTCCCAGCAAACAATGACAGATCTTCTTGATGGCCCGGGTGGGCCTGCACCCCAAGGCGGAATTTTCAGTAGTTTATTTTTAGTTCTGGTGCCTCCTAAAATTTTAATGTAATTGTATAAATTGCATATTATATTGCTTAATTCTTCTACTGACCCCCTCGTAAAACTGTTTCAAATCCATCACTACTAGCAAATGCGGCTCTTTGTGCTTGTGTCACGCCGTACTTTTTCCGTGCCTGTGCCGGACCTTACTTTTTGGTCTCTATGATGGACTGTTCCTTTTCATGTCGGACAGGCCCGTAACTCAGCCCGGCCCATTTCCTTTTTCACCCCATTTAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAACCCAATACTGACGTGATATGCTAATGGATGTCGTAGATGTTCGTGTCTCCTAGTTTCGTGTAATTTCTCACTTCTCAAACACCACCACAAGGCACAAGGAGTCCCTCTGCGCAAACTCCAACCCCAAAACCCCATCCTAAAACAAACAACCTAATAAAATTATACAACTAAAAACCCTTTTCAGAATTCTATCTTCTCATCAATGGCGTCTTCCTCTGCTAACATATGGGCGATGCTTGGATTGGGTTTGGCTGGTACTATTTTGCTAATGACCCAAAAGCTTAAAAAAGCCGTCAAGGAAGATTTTGGAGCATTCATTCAGAAACTTCAATTACTTCCTCCTCCTCAGCCTGCTCCGCCTAAAGCTCCCAACCCTCTTACTGGCCTCACTTTCGCTGTTTCCGATTTGTAAGTGCTTAATTTCTTTCTATTTGTGGCTTTCAGTTGTTAATTGATAGGGGATACTCGAAATGATTTTCTTTGTTGAGGGGAATTTGAAGGTAGTTTGGTTGGTTTGGCTGATTTAGAATTCAAGGGATTTGAATATGAATTTTGTGTTTTTAATGATGTTATTTAAGGCCATTGCACTGCTGTACGTCTATAGATACTGTTTGTTTAACAGGGTGCGTTTAATTTTTTATTAGTCAATGAATATACACACGGTGCAGACAAAAGTGCAGGCAACTTCTTTGGAAGATTGGCTTCATGAGTGGAACAAGATTGTCACTTTTTAGGAAATGGAGAGAGTACCTTAGACAAATGGATACAAGAAACAATATAAGTGATAAAGGTTTGCATCCTCCAACAGAAAATAGTGGCTTTCGGGTATGGTCCCTATGGAGATTGATGACACTAGAAATTATGAATTGAGCTGAGAACATATTAGCAAGAGGAAGGCATCCCTAAAGTAAAAGGATCAATAATAGAAATAATCCGAATGAAACAGGTAGAAAGAGCATGAAAATTATATTGACTTTTTTGTAGAAGATGCTCTAAACCAAAATTGACTTTTTTTTGTTCCCTCCTGAATTGTCTAAACTCTATGTTTATAAATGACATTGATAGTTTAGTAATGGTATCGAGACTCGAGAGAGACTTGGTCTTGAAGGACTACTTGGCTCCTTTTTGTAAAGGTGAGGTATCCAATAAGTACCACAAATGAACGCCATATGGATTCATGCGATACTTTGTTGGAACGCAACTTCCTTATTAGAAGGAAATAATTGTCATATAGTCCATAACCATTACAATGAAGATATGACCTGATTGATCCAAGATGCCCCTTCTAGTAGTCGTGCACTTGTTCCTCTCTACCCTCTCTTGTTTACTTACTCTAAGTGGAGCTGGCGTATGCTTCATTAGTGTATTAGGTTAGGTGCTAAGTTTTCAAGATTATAAAATTAATATATTTAAAATGTTAAGAGTATGATAAAACTTACTTCTTACTTTGTCGAATATCAAGCTCATTGCATTGCCCGAATCATGCCATAACTCTGATGCGGTTATCTATTCTTAAACTGCTGGATTTTCCTATTCCTTCATGCTATAATTTCGTGTAGTTTCAGCATGATCACAATCTTGTGATAAGTATTCACCTTTCGTCGAGCTTATTTCCTTTTCTTCATATTTCGACATAAGATGATGTAGTGATTTATTTAGGAAATCCATTTGTGAGTCACTATGTGCTCACTATATCTTTTACATAATTTGTGCTCACATTGTCCTAATATGTGTTAGCCGATCCCAATCATTTTGATATCTTGTTCTCTTGAATGTTGTCTATTTTGAGGACGCATTATGCTCTGGACTCTGTTTTACTTATCTTCATGTGTATAATTTTTTTTCTTGTCTTTAGAAATGTAGAATAGAGCAACTAACAAACAATTAAAGGGAAAGGGGTTTACTTTGTCTAGAACTATTAGTACTATATATTTTCTTGGAGTCTTGGACAATTTTGTCCAAGCAGAAAGCCTTCACCCTTTTTGATACTTTGACTTGCAAATGTAGTAGAAGTTCAAACGAGGACAAAAGTAAGCGTTAGGAGTGGGTCGCCCTTCATTTTGCATTGAAAATCATTTTCTGTCTCTCAACTATCTACTGAGATAAAATTCCACGAGGTAGTGTTGCCATTTCTAGGCATGAAACAACCATTGGATTTTATAGGGTAAAGAT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MASSSANIWAMLGLGLAGTILLMTQKLKKAVKEDFGAFIQKLQLLPPPQPAPPKAPNPLTGLTFAVSDLIDIDGHVTGFGNPDWARTHEAASRTASVVSTLVDGGATCVGKTTIDEMAYSVSGENKHYGTPTNPGAPGKVPGGSCSGAAVSVAANLVDFSVGIDAVGGVRLPSGFSGVIGFRASHGSISHSGIIPVSPSLDTIGCFAKDPNVLRRAVHVLMKLQFATQRSPRQIVIADDCFDLLKIPVDRVIEPVIKSTEKLFGRQVLKHENLGVFLSSKVPSLSEFSSPKVIDQVKTSTLSLLAHVMQSLLRYEFKENHGEWMNSVKPDVDGGIGALFHEGNVVDGSEIHKVHRIRNEMRLALNSLLKDDGVLVIPTFVDPPPKVGGKEMSSETYLSRLYSLLSIASLSGCCQVTVPLGHYNKCPISVSFIARHGADRFLIDTVQTMYSFIQEQVDVVSKTNSTSNTYSRERSAELAKEKGNQAFKDKQWQKAIVFYTEAIKLYGSNPTYYSNRAAAYLELGSFVQAEADCTKAINLDKKNVKAYLRRGTAREMIGYYKKATEDFRYALVLEPTNKRAAVSVERLKSLFQ Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo14660.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902208278|gb|KNA15904.1| (hypothetical protein SOVF_094080 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1157.5 bits (2993), Expect = 0.000e+0 Identity = 590/591 (99.83%), Postives = 590/591 (99.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731334490|ref|XP_010678253.1| (PREDICTED: translocon at the outer membrane of chloroplasts 64 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 998.4 bits (2580), Expect = 5.200e-288 Identity = 503/591 (85.11%), Postives = 547/591 (92.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870859540|gb|KMT10967.1| (hypothetical protein BVRB_5g112600 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 998.4 bits (2580), Expect = 5.200e-288 Identity = 503/591 (85.11%), Postives = 547/591 (92.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1009131254|ref|XP_015882739.1| (PREDICTED: outer envelope protein 64, chloroplastic [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 849.4 bits (2193), Expect = 3.900e-243 Identity = 419/590 (71.02%), Postives = 504/590 (85.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225456155|ref|XP_002282402.1| (PREDICTED: translocon at the outer membrane of chloroplasts 64 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 839.0 bits (2166), Expect = 5.300e-240 Identity = 416/591 (70.39%), Postives = 490/591 (82.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RA67_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_094080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1157.5 bits (2993), Expect = 0.000e+0 Identity = 590/591 (99.83%), Postives = 590/591 (99.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CBL1_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_5g112600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 998.4 bits (2580), Expect = 3.600e-288 Identity = 503/591 (85.11%), Postives = 547/591 (92.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7SJB1_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_17s0000g02400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 839.0 bits (2166), Expect = 3.700e-240 Identity = 416/591 (70.39%), Postives = 490/591 (82.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5WFI8_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa003231mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 835.1 bits (2156), Expect = 5.300e-239 Identity = 415/591 (70.22%), Postives = 493/591 (83.42%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067JJ78_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_27097 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 2.200e-237 Identity = 413/591 (69.88%), Postives = 497/591 (84.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: OE64C_ARATH (Outer envelope protein 64, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana GN=OEP64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 1.900e-229 Identity = 396/587 (67.46%), Postives = 480/587 (81.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TOC64_PEA (Translocon at the outer membrane of chloroplasts 64 OS=Pisum sativum GN=TOC64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 783.1 bits (2021), Expect = 2.100e-225 Identity = 387/591 (65.48%), Postives = 477/591 (80.71%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: OE64M_ARATH (Outer envelope protein 64, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana GN=OM64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 2.800e-161 Identity = 294/593 (49.58%), Postives = 398/593 (67.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: AMI1_ARATH (Amidase 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=AMI1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 381.3 bits (978), Expect = 1.900e-104 Identity = 200/427 (46.84%), Postives = 280/427 (65.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: GATA_LEGPH (Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A OS=Legionella pneumophila subsp. pneumophila (strain Philadelphia 1 / ATCC 33152 / DSM 7513) GN=gatA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 3.200e-27 Identity = 117/412 (28.40%), Postives = 187/412 (45.39%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G17970.1 (translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-III) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 1.100e-230 Identity = 396/587 (67.46%), Postives = 480/587 (81.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G09420.1 (translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-V) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 1.600e-162 Identity = 294/593 (49.58%), Postives = 398/593 (67.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G08980.1 (amidase 1) HSP 1 Score: 381.3 bits (978), Expect = 1.100e-105 Identity = 200/427 (46.84%), Postives = 280/427 (65.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G56440.2 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.300e-18 Identity = 55/143 (38.46%), Postives = 86/143 (60.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo14660.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G64440.1 (fatty acid amide hydrolase) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 2.000e-16 Identity = 50/149 (33.56%), Postives = 75/149 (50.34%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo14660.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo14660.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo14660.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo14660.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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