Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGTGAGGACGTGGTGAACGAGGAAATGGTCAGAGTGGAAGAAGAGAATAATGATGTTGAGAATGAAAAAGATGAAGACAATGGTGATGACAATCTAGAACAGTCACAACCACAATTAAGGAGGTCAACAAGACCTATTATAAAGCCTGCATATTTGAATGATTTCGTTCATACTGCTGAGGTAGAGTGTGAACGACTCTTGATGGTAATAAACGAGGAACCTTGGGATTTAAGTGACGTAAGAGAGCTGAAAGTTTGCATAGATGCATGTAAAGATGAGCTTTCATCGATAGAGAAGAATAAAAAATGGAATTTGGTTGATCTTCCCATCGGAGTCAAACCAATCGGGTTGAAATGGGTGTTCAAAATAATACGCAATTATGATGGAAGTATCAACAAGTACAAAGCACGACTAGTGGCGAAAGGGTACGTTCAAAGACATGACGTTGATCTGATGAGGTATTTGCTCCGGTGGCGCGCATTGAATCAATTCGTTTTATCATTGCCCTAGCAGCTTCAAACGGTTGGGAAGTACATCATCTTGATGTGAAAACTGCGTTTCTCCATGGTGAATTGAAAGAGGATGTTTATGTCACTCAGCTGGAAGGATTTGTATCCCTAGGAAGTGAAGACAAGGTTTACAAGTTGAATAAAGCTCTCTATGGCTTAAAAAAAGCACCTAGAGCATGGAATGCCAAGCTAAACAAAACTCTCAGGGATTTGAAGTTTCATAGATGTTCAAAGGAACAATCATTATATCAAAAGCAAGAGAAAGAGAAACTCCTTATTGTGGCTGTGTACGTGCATGATTTACTTGTTACAGGATCATCTTTGAAGTCGATGCTTGAGTTTAAAAGAGAGATGGCAACCAAATTTGAGATGAGTGATCTTGGCAAATTAACATATTATCTTAGGATTGAAGTGCATCAGCATGAAGGAGACATTATTCTGAAGCAAGAGAGATATGCACAAAAGATATTAGGAAAAACTGGAATGGAAGGGTGTAATCTATCTCATGTGTCGATGGACTCAAACTTAAAACTATCTAAATCTCAAAAGGAGAAAGATATCGATGAAAGGGAATATAGAAAAAGCATAGAATGTCTTCGATATTTGCTCCACACACGTCCAGATCTGTCTTATAGTGTTGGAGTCTTAAGCAGATACATGCAAGAGCCTAAGGAATCCCATGGAGCAGCATTGAAGCAAGTGTTGAAGTATTTACGTGGAACACTTTCTCATGGTCTCTTGTTTAAACGTGCGGACAAGATAAACTTGATGGGATATAGTGACAGTTCACATAATGTTGATGTTGATGATGGTAAGAGCATAACGAGCCATATATTCTATCTTGATGATTGTCTAATTACATGGTGTTCACAAAAGCAAGAAACAGTTGCGTTGTCCTTTTGCGAAGCTGAGTTCATGGCAGCTACAGAGGCACCTAAACAAGCAATCTGGCTTCAAGAGCTTCTAGGGGAGTTCGTTGGAAAAGCTTGTGAGAAAGTGACCATACGAGTCGACAATAAATCTGCGATTGCACTTACCAAGAATCTAGTATTCCATGGACGAAGCAAACACATACACACTAGATATCATTTCATAAGGGAGTGTGTTGAGAATGAACAAGTGGAGGTAGAGCATGTTCCCGACAATGAGCAAAAGGCGGCTATCCTAACAAAGGCACTGGGAAGGATCAAGTTTAAACAGATGAGAAGTCTCATTGGAGTTCAAGATGTGGGAGAAGATAATTTCAAGCTTAAGGGGGAGAATGTTGTTGTAAGCTTGAAATAGCTTGAGGTCCAAGCCAAGTACATTTAGGAGAATCTAAATATACATATCTAAGATTTAGGAGTTATCTAATATGTGAGTTTACCTTTTATTTAGGAGTTATCTAATAGAAGGTCTAGAATACTCTTCGATCTTATATATAAGGAGATACCAAGTTGTGGTATAACATATGAGATTGTGAGTTTAAGGTTTCGAGTTATTTTCCTTAAGATTAATAAGAGAGTTATTCTTATTAAACGTTGATTTCATAATCTTAAGATTCTATATAAACCAATCCTGATATTTTGAAAAGGGTTTTGAAAACAAAGCTTTAAAATTGCAGGAGTGTAGAAAATTATGTGGAGGAAACAATCAATTGTGTTGTTCCTCCAAAGCTTACTCTTAAATAAACATGTTTCTAGTTCAAGAGAATTATGAACTTAAGTTGAACGCCCATGGACTTGCATAAACTTTGAAATGAAATGACATGAAATCAAAAGAGAAGTAAAACCGCAGATTTAAAAGGTGTTCGATTGATTTTCATGCTTGGGCTCCCAAATTGCTTAGGACATTAGAACGTTGAACTTTGATTTTTTAAAACTTTTGATGATTGATTTTGAAAATTGATAGAGTGTTTTTTGTGCTTAAATGTCACTAGAAAAGGGCACAACTTCGTTGTTGTGCTTGGATCAGTTTTTGCCTCTTTTCCTACTAGAACAATGAGGGTATTTATAGAGTTTTCGGGGTGGTGAAGAGTCGGTGGTTGCCCTAGCGCGAGGTAGTTGCGTGTGGGTATTGCGCAAGGGTCTTGTTCACTTCCCCACACAAATACGCGTGGTTTCGGCTTGGTGCTTAGTACGTTTGAGCATTAAATGTTTGTATTTTTGGCTCGTTTGACATTAGATGGGGATAAAGATTGAGATAAGGATAGAGAATTTAGAATGTGGAATTCATGAAATTTTTCCCTGTCACTTGTTTGGCACGGTAATGGATTATATTCTAGATATAATAACTTACTATATTCTAGAAATCCTCATATTAATACCTGCCCCCCTCAAGTACAAGATTGGAGGGAGAATAGCCTATTTAGTCCCTATTTAGGAGAATGATGTAGAGAGGTTAAGGAGTTTGACAATGATTATTCAACATTAATGGGTGTCAAAGTGGAAAAAAAATTCTTGTTCATGATTTGTTTTCTTGTATTGGCAAAATTCGAGGTCGGATTTTCTTCAAAGAAGGGAGATTGATACGTATTTGAAAAGGAAAATAAAAATAATTTAATTAGCTTATCTTTTTTTTAATTGGATTTGGGTTATTTTGCAATTGAAGGTTGCAAGTAGTGTTTTGGACTGGCCCTAGTTAACGGGTAACTGTTACTCATACTTTAGAAATTATCTTGTTTAGGTAATCTATTTATCTAGGACTTTATTTTCTAGTATCTTATTTTATTTAACTAGGATAGCTTTTAGAGTTTTTTTTCATATAGGACTACTATTAGTCATACTCCTATATAATAAGACTTGTAATTTCTATTACAGAGATTATTGAGAATTAAATAAAAACTATGAGCTAGACGTGTAATTTCTATTATAGAGATTATTGAGAATTAAATAAAATTAGGAGCTTTGCTTAATTGAAATTTTTATTCTTTCGTTGCTTGTGTTTAATTCCACGAGTGGTTTGAACGTAAGTAAGCCTTTGCATAGATTCAGAAGTGTTTCTAGGACTTGGGTCTCATACTTGGGAGTTTTAAGAGTGATCTTCTAAGCTTCGGGGATTCGATTAGGATTTCAGTGTGATTTACCAACTCGAAATATCAGTTTATAATTTGTGTGAGTTAGATTGCAATTTAATGGTCTTATTTACGCATCACTCTATCCCTAATAAAAACCCAATTCTTTGCAAACAAACATAGGATGAAGGGGAGTTGGGATAAGAAAAAATTTATCCCTTCCATCCCTTCAAACAAGCAACCCGTTTGTGTCGTTGCTTGGTGGGCCAAGTTTGAGACAACATTTGCGTCTTGTAACCGACTTGTATAAATTTATTTTTGATTCGGATAAGATGCTCCGGATTTCTTTTTGCCCGGCTTTCGGAACCGGGGCTCAGGGTGCTCGGTTTTGGGGCCGGTACCCGTTTTTTTGAGTTGGTACATGATTTTGTTTGGAATTGTGGCTCGGAGTTGGGGTTTGGCATCGATTTTGTAAATGAGGCCCGGAAATGTAACTTACTTTGACTTTGAGTCTGAATTTAGGATTTGGACTCGAGGATTTGAATTTTGTAGCTTTGAATTGGAATTTCGGATTGAAAATTGGACTGGCAGATTAAATTTTGGAGCCTTGAATTAGGGACCGGAATTGAAAATTCGGACTCGGAATGTGTTTGACCTAGAAATGTGTTTACTTGGAATTTGTATTCGGGTTTTGAATGGAAGTTTGGTTTTGAATCGAGATTTGTCCTTTGCAATCAGTTGCTTATGCTTAGAGATCATCCACCTCAATCTATTTGTGGTATTGTCATTTACTACTTTATAGTTGCTACATCGTAGGTAGAATGAAAGAATTATTTCCTCCGTTCTTGAATGTTAGTTCTCTTTCTGTATTGAGTTGTTCCTTTTTCTTAGTCCATTTTGAAATCTTTTCTTATGTATCCAATAGTTATCCCCATGATACCCTTATAAATATCCAAACGGCCCACTTGTTTACTCCTAAATAAACTTTTAACCCCATTAAATCTCTTAATTATTTCTTTTTCCTACCCACATGAGTTAGATTCTATTGAGATTCATGTGACAAGTGTACTTATATTGGATTGTCTTAAAACGGACCGATAAAAACATTCAAGAATGTAGGCGGTATCATTATTGCATCATTAGTGACATCTTCAAAATGATGATTTTGATTCCTTACAAAGTGGAAATTTTGGGGTGGGTTCTGAGGTGTTTAATGTCTCGTACAATATGAAAAAAAAATATGGCATTTGCACATTAAAGAAAATAGTAGGGGAATGGCGCGGAGAATCCAACCTTTTTTAATTGTATTTTCCTCATTTAATGCTTCCAGGATGCTTCTCTAAGTTTTGTAGGCTTTAGATTATATTGTAACTGCCTCGTATAGTTAGATCCAATTTGAATTGTTTGTGGTGATCTAATGTAATAACTTCCTCAACTGGCATGATAAATCAGGCATTCATCCCAAAACAGCTAATTTGCTCTTTCGAGTA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ATGAGTGAGGACGTGGTGAACGAGGAAATGGTCAGAGTGGAAGAAGAGAATAATGATGTTGAGAATGAAAAAGATGAAGACAATGGTGATGACAATCTAGAACAGTCACAACCACAATTAAGGAGGTCAACAAGACCTATTATAAAGCCTGCATATTTGAATGATTTCGTTCATACTGCTGAGATGCTCCGGATTTCTTTTTGCCCGGCTTTCGGAACCGGGGCTCAGGGTGCTCGGTTTTGGGGCCGTGGACTTGACCGTTTTGAGGCCAGGGAAAAACTTTGGAAAGATCTTACCGAGACAGGCTTAGCTGTCAAAAAACAACCCCACACTTTGCGAGTTCCTAGGTCACAGCGAGGTGGAGAAGTGCGTATAATTGAGCCACTTGTTAGCAAGCAGTGGTTTGTAACTATGGAGGCCTTGGCAGAGAAAGCCCTTCATGCTGTTGAGAAAGGAGACCTAACCATCATTCCTGATAGGTTTGAGAAGATCTATAACCACTGGCTAACAAATATCAAGGATTGGTGTATAAGCAGACAATTGTGGTGGGGACACCGCATACCAGTTTGGTATATCGTGGGAAGAGATTGTGAAGAAGAATATATAGTTGCCAGGAGTCAAGAAGAAGCACTTCATAAGGCTCAACAGAAATATGGAAAAGATGCAGAAATCTATCAGGACCCAGATGTTCTTGATACTTGGTTTTCCAGCGCTTTATGGCCCTTCAGCACACTGGGATGGCCTGACGTGTCACAGGAGGAATATAAAATGTTCTATCCGACAACAATGCTTGAAACAGGGCATGACATATTGTTCTTTTGGGTGGCGAGAATGGTTATGATGGGAATAGAGTTTACAGGAAACGTACCTTTTCGTTATGTATACTTGCATGGCCTCATTCGAGACTCTCAAGGAAGAAAGATGTCTAAAACATTGGGTAATGTAATCGATCCCGTTGACACAATCAAGGATTTCGGAACTGATGCTTTACGATTTACTCTTGCACTAGGAACTGCTGGTCAGTTCGATAAAGAAGAGTCAGTGCTCAGTTTGCGATTACCCGAGTGTTGGGTGGTGTCAAAACTTCATTTGCTGATTGACCTAGTTACCACAAGTTACGACAAGTTTTACTTTGGAGATGTTGCAAGAGAAACTTATGATTTCTTCTGGGGAGATTTTGCTGATTGGTATGCTTATTCCAACAGTCTTTGTGCTCAAATACTACTGAACCTAAAATTACAACAACAACTTTACTTGTTGTCCATACTAATGAAAGTTTCTTTATTCGATTTTTTTGACATGAACGCTTGCCTTATTAGGTACATTGAAGCTAGTAAGGCTCGCCTCTACCAGTCTGAAGATAACTCTGTAACCACTGCAGCACAAGCAGTGCTTCTGTATGTCTTTGAGAACATTTTGAAAATACTGCATCCATTCATGCCGTTTGTTACTGAGGCTCTTTGGCAGGCAATCCCCAACCAGAAAGAGCCTCTGATTGTATCTTCATGGCCAAAAACTTCACTTCCATCATATTCAAATGCGACTAGGGCTATTCGTAATGTCCGAGCTGAGTACTCGGTTGAGCCAGTGAAACGGATATCTGCAACTATAGTTGCAAACCCCGATGTTCTTCAGTATATGTCTGAAGAGAAAGAAGTTCTAGCTCTCCTATCCAAGCTAGACCTGCAAGTCTTGAGCTTTGCAGAATCACTTCCAGAAGATGCAAACCAATCAGTTCACCTAGTTGCCAGTGAAGGTTTGGAAGCATATCTACCTCTTGCCGATATGGTAGATATATCTGCTGAATTGCCGCGGCTTCACAAGCGTCTTCTTAAGATGGATGGGGAGTATAAAGGGATTAAAGCACGCCTTGGTTCACCAAAGTTTCTAGAGAAAGCGCCAGAAGAAATCGTTAGGGCAGCTCAAGAAAAGGCCGACGAAATGGAAGAGAAGATAAATTTGACACAAAAGCGTATAGCTTTTCTTGAATCAACAGCTTTGGTTGAAAACGTTTTAGCTGTCAGAAGAAAAGATGTAGATGTTCAGGAGATTTTGGACATGTCACCTGTGATAGCTAGGTACCATTCAAGGCTTAATATGGTGATTCAAAGCAACGCTATCATGCAATTTTGA MSEDVVNEEMVRVEEENNDVENEKDEDNGDDNLEQSQPQLRRSTRPIIKPAYLNDFVHTAEMLRISFCPAFGTGAQGARFWGRGLDRFEAREKLWKDLTETGLAVKKQPHTLRVPRSQRGGEVRIIEPLVSKQWFVTMEALAEKALHAVEKGDLTIIPDRFEKIYNHWLTNIKDWCISRQLWWGHRIPVWYIVGRDCEEEYIVARSQEEALHKAQQKYGKDAEIYQDPDVLDTWFSSALWPFSTLGWPDVSQEEYKMFYPTTMLETGHDILFFWVARMVMMGIEFTGNVPFRYVYLHGLIRDSQGRKMSKTLGNVIDPVDTIKDFGTDALRFTLALGTAGQFDKEESVLSLRLPECWVVSKLHLLIDLVTTSYDKFYFGDVARETYDFFWGDFADWYAYSNSLCAQILLNLKLQQQLYLLSILMKVSLFDFFDMNACLIRYIEASKARLYQSEDNSVTTAAQAVLLYVFENILKILHPFMPFVTEALWQAIPNQKEPLIVSSWPKTSLPSYSNATRAIRNVRAEYSVEPVKRISATIVANPDVLQYMSEEKEVLALLSKLDLQVLSFAESLPEDANQSVHLVASEGLEAYLPLADMVDISAELPRLHKRLLKMDGEYKGIKARLGSPKFLEKAPEEIVRAAQEKADEMEEKINLTQKRIAFLESTALVENVLAVRRKDVDVQEILDMSPVIARYHSRLNMVIQSNAIMQF Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo13623.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319208|ref|XP_010670137.1| (PREDICTED: valine--tRNA ligase, mitochondrial isoform X3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 851.7 bits (2199), Expect = 9.400e-244 Identity = 459/608 (75.49%), Postives = 496/608 (81.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319204|ref|XP_010670135.1| (PREDICTED: valine--tRNA ligase, mitochondrial isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 851.7 bits (2199), Expect = 9.400e-244 Identity = 459/608 (75.49%), Postives = 496/608 (81.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319210|ref|XP_010670138.1| (PREDICTED: valine--tRNA ligase, mitochondrial isoform X4 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 851.7 bits (2199), Expect = 9.400e-244 Identity = 459/608 (75.49%), Postives = 496/608 (81.58%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. NCBI nr
Match: gi|590651897|ref|XP_007033012.1| (ATP binding,valine-tRNA ligase isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 2.300e-218 Identity = 420/643 (65.32%), Postives = 468/643 (72.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. NCBI nr
Match: gi|590651908|ref|XP_007033015.1| (ATP binding,valine-tRNA ligase isoform 4 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 2.300e-218 Identity = 420/643 (65.32%), Postives = 468/643 (72.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061EGC7_THECC (ATP binding,valine-tRNA ligase isoform 4 OS=Theobroma cacao GN=TCM_019154 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 1.600e-218 Identity = 420/643 (65.32%), Postives = 468/643 (72.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061EGZ7_THECC (ATP binding,valine-tRNA ligase isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_019154 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 767.3 bits (1980), Expect = 1.600e-218 Identity = 420/643 (65.32%), Postives = 468/643 (72.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067KDU4_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_13438 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 761.5 bits (1965), Expect = 8.900e-217 Identity = 409/643 (63.61%), Postives = 465/643 (72.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: U5GC79_POPTR (Uncharacterized protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0005s14610g PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 1.500e-216 Identity = 408/614 (66.45%), Postives = 478/614 (77.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A022RVQ9_ERYGU (Uncharacterized protein OS=Erythranthe guttata GN=MIMGU_mgv1a001930mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 757.7 bits (1955), Expect = 1.300e-215 Identity = 405/644 (62.89%), Postives = 469/644 (72.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYVM2_ARATH (Valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EMB2247 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 718.8 bits (1854), Expect = 6.000e-206 Identity = 389/601 (64.73%), Postives = 453/601 (75.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYV_CALS4 (Valine--tRNA ligase OS=Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis (strain DSM 15242 / JCM 11007 / NBRC 100824 / MB4) GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 387.9 bits (995), Expect = 2.400e-106 Identity = 239/602 (39.70%), Postives = 352/602 (58.47%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYV_CLOAB (Valine--tRNA ligase OS=Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / LMG 5710 / VKM B-1787) GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 378.3 bits (970), Expect = 1.900e-103 Identity = 240/601 (39.93%), Postives = 342/601 (56.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYV_BACLD (Valine--tRNA ligase OS=Bacillus licheniformis (strain ATCC 14580 / DSM 13 / JCM 2505 / NBRC 12200 / NCIMB 9375 / NRRL NRS-1264 / Gibson 46) GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 373.2 bits (957), Expect = 6.100e-102 Identity = 224/604 (37.09%), Postives = 346/604 (57.28%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SYV_BACHD (Valine--tRNA ligase OS=Bacillus halodurans (strain ATCC BAA-125 / DSM 18197 / FERM 7344 / JCM 9153 / C-125) GN=valS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 370.5 bits (950), Expect = 4.000e-101 Identity = 229/609 (37.60%), Postives = 339/609 (55.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G16715.1 (ATP binding;valine-tRNA ligases;aminoacyl-tRNA ligases;nucleotide binding;ATP binding;aminoacyl-tRNA ligases) HSP 1 Score: 718.8 bits (1854), Expect = 3.400e-207 Identity = 389/601 (64.73%), Postives = 453/601 (75.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G14610.1 (valyl-tRNA synthetase / valine--tRNA ligase (VALRS)) HSP 1 Score: 276.9 bits (707), Expect = 3.400e-74 Identity = 210/658 (31.91%), Postives = 321/658 (48.78%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G49030.1 (tRNA synthetase class I (I, L, M and V) family protein) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 3.700e-12 Identity = 74/296 (25.00%), Postives = 121/296 (40.88%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT4G10320.1 (tRNA synthetase class I (I, L, M and V) family protein) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 3.800e-9 Identity = 29/106 (27.36%), Postives = 54/106 (50.94%), Query Frame = 1
BLAST of Spo13623.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G55400.1 (methionyl-tRNA synthetase / methionine--tRNA ligase / MetRS (cpMetRS)) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 2.300e-6 Identity = 35/133 (26.32%), Postives = 60/133 (45.11%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo13623.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo13623.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo13623.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo13623.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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