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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGCTGACTGAAGCACAATTTGTTGCAGCCATTATTTCTTCAACGGTGCTTGCATTACAAAGTACAGGCAAGGCACCACAGAAGGTATATTGTTGTCGTCTTGATTATTGATATTGTTATTATCACCATTGACATATTGATGTTTCTGTTACTAGTCTTGCTGTTACTGTCAGTGTTGTCATTTCTGTTACTTTGTTATTAGTACGAGTCTACAACCACTTGTAGTGGTACAGTTGTTGCAGCAGTAATTGTCATTCCCTATATTGTTATAGCTAGCTTCTTTTGTCTCCTGGTTTGAAGTTATATTGTTTCCTTCTTGTTTTGGCATGTTTAAGCTTGAGTTGCTCAGATCATAGATGCCAAAACTTGAGTTTAAGCTAAGGGTATCCACTAGCAAATTTAAAGTTTCAATCCATCAATCCAAAATTTGGGTAATCATTGATTCTTATTGAAACTCAGAGTGAATTTAGCGAGCTTTTGTTTATGAACCATGCTGGTTATCAGATATAAAAATAAAAATAAGGTTGGTAATTTCCTAATAATTTGTTAAAGTCTTAATGTATTCTTGGTGCATATGGGTCGGTTAAATGAACAAATCTTAGTTCTAATAGTACTAAAATAAATAATACTCCATCCGTCCCTTAATACTCGCCCCGGTTTGACCGGTACAGATTTTTAGGCAATTTAATTGACTTATTAATTTATTAGGTGGTAGTTGATAGTGAGGTATTTTTTTAATATACTTAGTTGGAAATGTGTCCAACTTTTTTGAGTGGAGAGTGTGTAGTTGAAAATTTTAATGTTTTTTAGAAAGTGTGAATATAAGTGGGTCCTTGATTAAGTGAGAGAAATAATATAATATTAGTAAAAGTATGTCATTTATAGAAACGGGGCGAGTATTAAGGGACGGCTTTATAAGGAAAGCGGTGTGAGTATTAAGGGACAGAGGGAGTAGTATAGTACTATAGTATTTATTCATAGAAGGAAATTAAAAAAACATCGAAATGGTCCGAACTAGCAGCCTCTTCCTATGGCCTAAAAAATGTTTGAGAAGCTACTTTGGAAGAGCTCAATAATTTGCAAAGGATTGGGGTTGGTAGGCTTTACAACTAACAAGGCTGTCACTCATGTGCCTATCTTGTGTTATGCGTGCAGAGAGACAGAGAATCACTTATTCTTGCTTTGTTATGTAATCTTTGTTAGAGAGCATTTATTTTTTGTTGCCTCGTTGGCCTTAACTGGTTGCTCCATCAATTGTTTTTGTTGATTTTCGGACTTCGTTTGTGGAGGTATATAGGGAACTAAATCTTTTGGAATTCTGGTTCTTTAGTATTTTGCCCGTCTTATGAGTGATTTTGGTTGAAGATGAGTGATAGGGTATACTCCGTATCAAAATTGATTGTGTAGTCTTGCGCTTTTCTTGAGGCTCATGCTTATGGGGCTCTGGCTTGTCTCACTCAGATATAACTGGTGATCATACCTTTTTAATATATGTACTCCCTCCGTCCCGGAATACTCGACCCGGTTTGACCGGCACAGAGTTTAAGAGACTTGAATTGACTTATTTAATTTAATAGATAGTAGTTGATAGTGGGGTATTATTTTAATTTAGTTAGTGGGAGGTGGGTTAAGAGGTGGGGTTGGGGGAGAGTAGGGGTTGAATTTTTAATTATTTTTTGTATGGAGTAGGGGGTAGGTGGGTTAATAGGAGTGGAGTGAGAAATAATATAATATTGTTAGAATATTTCCATTTTTAGAAACAGGTCAAGTATTAAGGGACGACCCGATAAGGAAAACAGGTCAAGTATTCCGGGACGGAGGGAGTATATATTTTCTATTCTGCTTGGTCTAAGTTGGCTTTTGGTCCCATTCTTAGTATCATCTTCTCCCCTTCTCCTCTACACAATAAAAGATTATGAAATTGTCAAGCCTTGCATTCTGCATTTCCCATTCCCATGTTTTTTTTCCTCCATGCAGAAAGGTTCCTGGCAACATCACTTCGATCAAGGTTTACTTTTTTTTTTCATAATATAAATTCTTAAGGCACATTCTTTGATGATTTGTAGGATACAAATGGAAGTTTCTCTGTCAGGGACGTCGGGTGATGGATTGCAAATGCGGAATCTGTGTCCAATGCATATCATATTGGCTAGAGTGCTATCTGATGCACCTCAGTTAAAGGTAGAATTTTAGAATACGTCATTGTTGCTTTATGTCGCAGATTGTACTAGTGATAGCCAGGGTCACCTAATACGTAGTACGATTTAGTACGAAAACGCAATACGAATACGGAATACGAGAGGTGGTCGTATTACAAATACGTTTTGAGGAATTTTAAATACGATTTTTTATAATATAATACGATACAATTCAATTTTAAGAAAAAATAATGTTAAAAAATAACCAGACTTTAGATACCAGCTGTCTTATTTCAAGAAAGTAAAATATAAAATATAACCAGCCTTTAGATAACAGCTGTCTTATTTCCATTATAAGACCAGCTGACAATCTGTCAAATTTCAGAAGAAAAAAGAGGAAAAGAATAAGATGCCAGCTGTCTTCTAGTAATAAAGATAAAGAGAAAAGGGCTTATTTCAAAAAAATAAAAGTAAAAATAAAGACAGAACGGCTAATTAAGGTATGCTCCTCGCCTCCTCATTCTCTTCACCTTCCTCTTTCTTTCTTTCTCCGTCCCCGTTCTCAAGCAGAAGACAAAGCTTCAAAATCAGCAATGGTGAAAAAGTTTAGAAATCGATCAGATCGGTTATTGGGTCGAATTAGATCGAATTCGTACTCGAATTAGTACGAATCGTATTAAATCGGAGTACGAAGGGGTATCAACCGTATTATGTGACCCTGGTGATAGCCATAAGTACTCCTGAATTTAAACAGCCTTGTGCAATCTGTGTCGTAGTACAGTGGTTGAAATTGGTTCATCATGCGATGTTAAATCAACTAATATGAACTTAAACATTTAGGATTTTTTTTAATGCTGTTGTCAATAGCACTCTGCAGTTTATCGCTACACTAAGGCTCGACTGCTCAGGACTCCAAGCACAGGAGGAGGCAATGTAGGACAAGTAAATTTCATTCTACCTGAGATGAATAAGCTACTGAGGGAAGCCAAATCTGGATCATATTTCATCTTATTTGTTAGTTATGGTATGATATCAGTTTAATAGATTAGCAGAGTGATTCAGAAATTCTTGGTGTGTTTACTGCTTGACTTTGGATACATTTCGTGATGCGTTATTCTATTTCTGTAATTGCAGCAGGGGCATTTACATCGCATGAATTTGATACATCCAGGGAACATTTGGATAACATATCCCTTTCAAGTAAGATGTTTCACCTTTGGACACTTGAGTGGAATTGAAAGTTTCTGATTTAGAGCCAGGGAGATTAAGAAGATTAGAGTAAACAAAAAAATATTTTGTATTAGTCTTTTTTGTTTTTATTACGTTCATAGTGCTAGTTAAAGTTTTCCCTTGATTCAAAACTGTGGCATCAGAATCACTTGGGGGTGTTTGTTTCATTTGGAATGGGTAACATACCTAGACTAACCTAGTGTTTGTTTAAGAAAATTTCTATTTCCAAACCATACCTCTAACCCAAGGGGTAAATGGATATAATATTCATTCTAAAATAGACCTTGATTTCATTCCTTTCCTAATGCATTACCACTCTGATTTCATTCTTGATTCCAAAGCCATACCACTGTGCTGACGAAACACCCCCTTATTGTATATTGCTTTTGAAACTGAATGATGGTGCTGCTGTTAGATACATTTTCATGATTGACAGTGTTTGTGGAATGAATGTGGAAAAGGAAGAATGAACAGTATGATTGAATTTAAAGAATTTTGGAGAAGAGAACAAAGGAGAGGGATGTACAACCAAAGTTGCCGTCCCTATCTATTACATTATACTAAAACAGACACCAGAAGTGATATTGATGCAAAATTTTCCCGCCGAAAACAAAATTCTCTTAAAAATCTCTACGTTATTTTTTTTATATAGTTTCTATCCTTTTCAATTTATTATGTTTGGAAAAAAAAAATATTTGTTTATAGATTATGGAAATATTATACTATATGCCACATACTAATAATTTGCTAAAATGATTTTTGGTAATAGTTTAGTTAAATCGTTCGTATTACAAATGAGTATGTTCAAGATTTATTAATTATGCAGAAACTTTAGGGAGAGATCAGTCAAATATATTCTAAAAAATTAGTCAAATAATTTTAGAATATCCGTGCATGCACCGGACCTAATCTAGTTGTTGGATATTCGGAACTTGTTTGACAAGCAATAGCTTGGACATCATTTAGTGGAATTGGGGTACATTAGCATATTTAACCAGTTAATCCCTTATTTTAAGTGTTACATTTACTTGGCAGGTTTACTGAACCTAAACAGAGGCAAAGAAGTCTGCTGTCTTATGTATTAGGCGACGTTGGTGATAGTTTCTTGTTGTATCATAGGTTTGGACAACTGGTTTGAGTTTAGAATTTATTTTTATTAGGTATTACTGTATTCTCTTGAGTTTCAAACCACTTCAATTAAGTTTTTTAGAAAATAAAAAACTATGGATCATGTTCAGTACTAGTAGGTAGTGCTAATAAAATATTTTTGAAGTTAGGATGTGATTGTTATGGAGGCAAAAGAAATTGTGTTTGGTTTACAGATGGCGCTGCAATTTAATGGAAAAATTATAATATGAAGAATGGCAACATAAAAGTGATAAAAAAGCTCATGAGAAGTCATGTGGTGGGTCTTACTTTGGAGTTATAATTAGAGAAATTATTTCTCTTGTTAGTTTATTTGAGGTTGTTAATATTGTTTATGTGTTTAGGGAGGCTAATGAAGCAGCATGCAATGACTCACCTTAGACTACTTTACTAGAGTATGTGCAGGCGGTTGTCCGTCTGTTATTTAAGATGTAATTGCCGCGGATTATTGTTTAGCCATTAATATAAGTTAGTCGT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MLLTEAQFVAAIISSTVLALQSTGKAPQKAHSLMICRIQMEVSLSGTSGDGLQMRNLCPMHIILARVLSDAPQLKHSAVYRYTKARLLRTPSTGGGNVGQVNFILPEMNKLLREAKSGSYFILFVSYAGAFTSHEFDTSREHLDNISLSTSVQKSCLWGKISMESLFSSWEKFPNLNRGERVEMLTTIDLHPCLLKCCFLGEEKCISFQMPENSSRMVTQEYQAVNVSVKIDPQRLEYLEADKLIAGNCIMDVISGLQDSFVSSLKRQIRRKTKLLADKTNYMQPLTLTSDVAAAASDLLNKADDDYSSRIERARSSSVNDSLNAVPDPDCIQSVSGSSLAPPTLLQFAKSRKLSIERSDFRNFSCMDIPVRNSSYVDMLSIYVQTS Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo12704.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902233341|gb|KNA23010.1| (hypothetical protein SOVF_028680 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.400e-100 Identity = 184/194 (94.85%), Postives = 188/194 (96.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902233340|gb|KNA23009.1| (hypothetical protein SOVF_028680 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.400e-100 Identity = 184/194 (94.85%), Postives = 188/194 (96.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902233342|gb|KNA23011.1| (hypothetical protein SOVF_028680 isoform C [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.400e-100 Identity = 184/194 (94.85%), Postives = 188/194 (96.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731378219|ref|XP_010668104.1| (PREDICTED: polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2-like [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 5.600e-73 Identity = 143/185 (77.30%), Postives = 162/185 (87.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. NCBI nr
Match: gi|870840740|gb|KMS94897.1| (hypothetical protein BVRB_014300 isoform A [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 5.600e-73 Identity = 143/185 (77.30%), Postives = 162/185 (87.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RTZ2_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_028680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 9.800e-101 Identity = 184/194 (94.85%), Postives = 188/194 (96.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RVQ7_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_028680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 9.800e-101 Identity = 184/194 (94.85%), Postives = 188/194 (96.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RTZ4_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_028680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 9.800e-101 Identity = 184/194 (94.85%), Postives = 188/194 (96.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B4V7_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_014300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 3.900e-73 Identity = 143/185 (77.30%), Postives = 162/185 (87.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B1J9_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_014300 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 3.900e-73 Identity = 143/185 (77.30%), Postives = 162/185 (87.57%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EMF2_ARATH (Polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=EMF2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 1.400e-36 Identity = 83/200 (41.50%), Postives = 125/200 (62.50%), Query Frame = 1
BLAST of Spo12704.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G51230.1 (VEFS-Box of polycomb protein) HSP 1 Score: 155.2 bits (391), Expect = 8.100e-38 Identity = 83/200 (41.50%), Postives = 125/200 (62.50%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo12704.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo12704.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo12704.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 1
BLAST of Spo12704.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
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