Spo11610 (gene)

Overview
NameSpo11610
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6 : 39793083 .. 39819144 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

ATGTATGGAGATGAAAGAAGAAGCACTCCTCGACTCCTCGACCCTCGTTGCCGTCACGGTGATAATTCCGACCTAGTACTCCATCCTTCTTTTTTCTCTCTCCAAACCACCCTGTATAAAACTAACAATCCGATCAAAACCCTAAGCCTAGATAATGTTTTTTCTTTCTTCTGTTCTTAGGTTTCGGAGGCGATTCCGGTATTCACGTGTTTCAGGCAACGAAACAGTGAAAATTACACAGAGACAGTAATGCTAGGGTTTCATCGGGGGTCATTCGGCACATTACCGTCTTCTATGGCATCGAATTCAGTCATCCCACGGTGTAAGCATTTACTGAGCTATTCGAGAGATTATGGATGCAAGAGGTCAAACATAGCTTCTTTTTCGCGGTCCTTTGTCATAACTCTCTGCTGCTTATTAAAAGAGGTCCAACTGCCCACGCGCCAAGGAACTGGTTTAGCAGATAGCTAAAGAATCCCGCTTTCCACCAGATGGCTGAGCAATTGCAGCAAACCCTTCAAGACTATCTGGAACCACAATAACCCTTCAGGACTATCTGGAACCACAATTTGATCCTCAGCAGTATTCTTGCACTTGCAGCAAGCCAACACATGATAGAGAATCCTCCTTATATGAACGTCTTGGTAGGGCTTCGAGGCAGAAGATCGATGTTAAGTAATGAAGGAAAGCTATGTTACCCTGACACTCTGGTTGAAGGAGGGTGTCGGTGTCAACACGACCCGACTCGGGGGAAGTGTCGAAACCGGTGTCGGAAAAGAATCCGAAATCAAGTATCGAGGTCACAAATTTGAAACCCTAGCTCTAGCAATTGAAGGTGCGGGAAAGCGAAAGAAGAAAAAATATGTTGGGGCTTTTGTTGTAGAAGAAAAAACGAGATGAAAGCACTTATCAATTCTTGTTTTCATTGATTAATGCTTCAGATTCAGCCGTGGCTGTTGCGTCGTCCTGCTTTCTCCTTCCATTAACGCGTTTATGTTTGCTGCCTTTTGCTGGTGGGCCTTTGATTTTTCTTTTATTTTTTTAAAAATAAGTAGGGTGGAAATCAGGAAAGGGAAACAAATCCACGT

Coding sequence (CDS)

ATGCTAGGGTTTCATCGGGGGTCATTCGGCACATTACCGTCTTCTATGGCATCGAATTCAGTCATCCCACGGTGTAAGCATTTACTGAGCTATTCGAGAGATTATGGATGCAAGAGGTCAAACATAGCTTCTTTTTCGCGGTCCTTTGTCATAACTCTCTGCTGCTTATTAAAAGAGGTCCAACTGCCCACGCGCCAAGGAACTGGTTTAGCAGATAGCTAA

Protein sequence

MLGFHRGSFGTLPSSMASNSVIPRCKHLLSYSRDYGCKRSNIASFSRSFVITLCCLLKEVQLPTRQGTGLADS
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo11610.1Spo11610.1mRNA


Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo11610.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo11610.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo11610.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo11610.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0016567 protein ubiquitination
biological_process GO:0009113 purine nucleobase biosynthetic process
biological_process GO:0045892 negative regulation of transcription, DNA-templated
biological_process GO:0007389 pattern specification process
biological_process GO:0009886 post-embryonic animal morphogenesis
biological_process GO:0035194 posttranscriptional gene silencing by RNA
biological_process GO:0050896 response to stimulus
biological_process GO:0010016 shoot system morphogenesis
biological_process GO:0006189 'de novo' IMP biosynthetic process
biological_process GO:0050790 regulation of catalytic activity
biological_process GO:0048438 floral whorl development
biological_process GO:0007165 signal transduction
biological_process GO:0008219 cell death
biological_process GO:0015996 chlorophyll catabolic process
biological_process GO:1902000 homogentisate catabolic process
biological_process GO:0042207 styrene catabolic process
biological_process GO:0006572 tyrosine catabolic process
biological_process GO:0055114 oxidation-reduction process
biological_process GO:0048507 meristem development
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