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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAGTTTGCTCTAACAAAAGTATAACTAATTCAATCAATTGACGTGTTGACTCAAATTATCACCGATGCAGCGATGATGCTCATCAGCTTCGACGAACACTCTCTCCACAATATCTGGTCAAATCAAACAAACAATCAATCCAGACACCATTTTCGTCTCCCAAAATTCGATCCCATTTATTCAAAATCATCTCAGTAATGCGTCGTAAATTTTGATCCAAAATTATTTGGAACTTGTATTACACATTTTCACCAAATCGAAGCTGTTTTTCAATTGCTAGAACGAAGATTACTTCCTGAAATTTAAGGGGAAACTCGAGTTCCCCTTATTCAATTGTATAAGGAGTATGTCGAAATCATTGCCTTACTCCATGAAAGATGTTGACTATGATAATGCCAAGTTCCGACAACGTTCTCTCTCTAAGGTTCGATTTTATTCCCCCTTCTAATCTTCCTCATTGATTGGATTTGTTCGCAGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTNTCTCTCTCTAAGGTTCGATTTTATTCCCCCTTCTAATCTTCCTCATTGATTGGATTTGTTCGCAGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTATTATTCTCTGCAATTTGATTTTAAAATAAGTGCAGTTATCAATGNTTCTCTGCAATTTGATTTTAAAATAAGTGCAGTTATCAATGTTTGTTGTGATCTTTGTCATACATAGACAAATCATCATAAGGGTGTGGTCTAAGTTGAGTAGATAGGTAATGACCATTAAACTACTAAATTTTAATCAACTCCCTTCCTTCAGGATGTAGTATCAGCATTGAAAGTGTATTTGAACTAGGAGTGTTATAATCCAGTTTGGAACTTGATTGATTGGTTGGAGGAAATAGTACTGAAGAAAGAAGTGGTGGTGGTTGTGGAACAATTGGTGTTGTGGGGGTAGTTCTCAGATAACCTCCTTGTTCACTTTTGAGTGAAATTCAAGTGAATCAATCGGTACCTGAGAGTAATTTACTCCGACACTCTGGATTTAGGTAGTATTAGTTCTGAACGGATGGAACATGTGTTTAAAAGGTTTGAATGGAAGTGGAGCAATTGGGGCTAACTGTTTCTTGGACGGTAGTATGGTGACCCATAGTTCGATTGGATATGCTAATATGTTAGGTTGACTATGATAATGAGTAGAAGTGTAGAAATAGAGAAATCGTATCTTCAAAATACTTGTTGCTCCTCCTTTCTTCCTTTCACATGGTCGTCATGAAGACTTCTGCATATCTTTGGTTCAGACATTATTGGGATGTGGGAAAAAGCATTCATGTTTCATATTGTTGAAAATATACTTGCTAATTTCTACGGGCTTCTAATTTTCTTGAAGTTTAGTCCCTAAGAGGAGGTGGTAACATTTTTGGGTTGTGTGTGGGAAGTGTGCATTTCTAGAACTTTAAGAGTCTTAGACCAAATGTTTCCTTAATGGATGGAATTTTGTTATGATAATAGATGGTGATACTTAATAAGCACGCTTAGTATTAATATTTGTTTGACAGTCAAAGTAGTAACAAAAAGTTGAGCCTTAGTTTTAAAAAGCGCGAAGCGCACTGAAGCGCAAAAGGGCCCTGGAGCTTAAGCGCAAAGCGAAAGCGCACGCTTTTCGTAGGCGAAGCGCATCCGAAAAGAAATAATAAAATTTCAAAAGTTTAGAAAATATGGAGAAAATATGGAAGGAAAAGATGAAAAAAAATAGAGAAATCAAAACGATGAAAGAAAAATTCAGAATCCGATGGGGAAATCCTGCGAGAAGGCTAGAGAAATCGGGCTACGGGAGAAAATTGCACTAGGATTTTCAAAAACTTCCCAAATATTCGCTTTTCAAAAAAAAGAAATCACGTGATACTTTAAAAAAGAAGATTAGAGTCACGTGGCTTTATTTTTTATAAAAAAGTAGGGTCAGATGTGCCCAGACTACAAGAAGCGCAAAAGCGCTAGGAAGCGCAGAAGCACCGAAGCGATAGGAAGCGCGCGCTTCTTGTATGTCGCTAGGCTTCGGCTGGCAGAAGCGTTTTGCTGTGAGCTTCTGAGCTTTCGAGCTTTAAGTGCAAAAAAACGCGCTTTCTAAAACTAAGAGTTCAGCAATGAATTCTTTGCAGTATAAGAAGTGGGCATATTGCAATAAAAATCTCTTCCTTTTCAAGAAAAAAGTTGTTTTAAAACTAACTTTGACCATGGGCGGATCCATATGGCAAAGAAGGTAGACAAATGTCTACCCTCTTTATAATTATTTGCTGCATATAATTACAAGTTTAAATCTCTAGCTTAGTTGGCAATCATCTCAACTATACATTCAAGCAACTTGGGTTTGAACCGTAGCTCTAACATTTTAAGTTTCATTTTTAATTTTCTCTTTTCTTTAACCCTGCTCTAGCATTTTAAGTTTTTATTTTTAATTTTCTCTTTTCTTAATAGGCTCTTAGCTTTTACCGAGTTTGTCAATGCATTTACTTTTTCAACGTTTCATTATTTAACCTTTATGGACTATGGAGTATTATCAGGTTTTAAGATTTAAATTTTTCCTCAAAAAATTTATGGACTATGGATATTTTATTATATCGTAAGGAAAATATTTAAAATGCATAAATAGGTTATCTTAATGGGGTTTACATGTTCAATAAAGAAAATTGGAACAACTCGAATTATATAAAGTATTTTCTTAATTTGTATTCCATGGTTTTAAAAGGAGGTCGTGGGTTCAATGACTAATATAAGGCAATACTTTTTAAAACGTAACTATTAGTGTCATGACATATATTATGCTTATATAGACACTGACTTTTGCATAGTATTTTTTTTTAAAAGGAGCTAATTTTATTTTACTTCATGCTCCATATTAAGTACTTATTAGAAAATGTCTACCCTATTTCAAAATCCTGGATACGCCACTGACTTTGACTGTGACCAAGTATACTGCAATCACCATGTTTGGCTTCATGAGTCATGAGATACACATAACCCTTACTGGCTTACTCTATGGTGGCTTGATGAGACCCGCTGATGACATCTATTAACATGCACCTCTTGTTGTTTGAAGGACATTGGGATACACATACCCCCTTTAACAAATGATTTAAGGTATGAAACTGGATGTTAACTCTTCAGTATAGATAATTTCATCTAATTGTAGGTAAGGGGTCATTGATCATGCTCTCAGCTTCTTACTAGCTTTTTGGAATTACAGCATTGCCTAAGGTTAGCATTTTTCTCATTCTTGTTATTGACTAATGTTTACGGCACTGCACCTTGCAAAATTATCGTTGGATATGTTATAGATAGCTTTTCCACTTTTGAATCTTCAATCTGCTTAGGAAACAAATATTATGTACCCTACCTTTATAGTAAGCCAAACATATCCCAGTGCCTTCGTTGTGGTTCTTGCTTAAGGTGGGGCATATAGTAGGGTCAACTTTATGCTAGTCTACCTTGTAAGAGAGGCTGTTGAACAGCTAACTGAAACGCGATTCCATTGCGATACATACTTGTAAACCGTGAGTCAATGACAATTACAGTATGTATAGATGGATGGTAGCAAATACTTATTATAATATTGGTTCTTCAACGGAACATGAAAATCTCTGACTTCTGGTTTCTATATTGGTTTCTATACTGAAATCCCTCATTTGCACTCCAATGTACTTCCTCCGTTTATTTTTATTTGCAACACTTTGTTTTTACGCTTGCCAATGCACTACTTGAACAATTAATATCTTTAATATTGATAAGTAAAAATTTAAAAAAAAATGATATTCGGAAAATATATATTAAGACGAATCTAACAAGATCTCACATGAACATGTTTTTCCTGAAGTAGATTAAGTATAGATCATAAAAAATAAATAAATGATTTAGAATATGTGAATACTGCAAAAAGCAAAGTGTTGCAACTATGAAGAAACTGAGGAAGTAATTTATAGGATCCACAACTGAGAATTGAACATCTTTGTTAAGTTCCAGCAAGGGTTTTGTACTCCAGGCCATGATACAAAGAACAAAAAAGAATAAATCCTGGCGCAGGAAACACATCCTCTTGGAGAAGTCAACTTTTTGGGTTTTGTATGATGAAATAAATAGGACTTGGAGAATTTTTGAGTTTTAACACACCTTTTCTACCTACAAAACACGAGACTCACTATGGATTCTCTCCTTGAGGAGTTTGGGAGGTCAAGACGAAGTTGTCCCTTTCTATTAAACAGTAGTATAGAGACGTTTTCTATTCTATTCAGTTAGAAGGGAAAAAAAGGACTCAGATTAATTGGTCAAGATAATGTTGCTCCACTGGTTTTGGTTTGTTTGTAGTCTGTCTATGGATGAAATACATTGGCACTTGCATTCAATTATGAAGGGAAAACATTGAAATTTTTTCTCTTGTGACCATTGTTTTGATAAATAAAAATTGATACTCACTTTCTGGCTAGTGGAAACTTGGAACTTATTGGTTATTATGACTGTAATTAGTGTAGTCATTATCTGTATCACATACTAATATACAAATGTCTTATCGTGAATTAATGGTTAAACACTTGTGCTAACTTATACAAGTCCTACCTTTGCAGACCAGGACAACTAGTACTAATCCATGGCTATATCAGACATTGCAGATCATGTCAAAATGAAAAGTTTTGTTTGCTCGTGCACCTACGTAATAAAGAAAATGTGGTCACTAACTTTACTATTCTGCAGTACGTTTACTTTGACTTATGGATTTTATTATTTCATAGGTCCTGAACCAGACGATATTGACCAACAATGTTAAACGTGAATGTCTGCGGTGTAGCACTGGGAAATTTCTGTTGGTAATTATGCTTTTTGGCATTGCTTATCTCATTTTTACACCAACAAGACATGTTTCATCCCACAGAGCAGATCACGCTATAATAAATTCTAAAGACAATGTTACAGTAGACACTAGTACCGGATTAAGGAGATTCTTTAGAAAACCACCAAGGCTACCCCCTC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ATGTCGAAATCATTGCCTTACTCCATGAAAGATGTTGACTATGATAATGCCAAGTTCCGACAACGTTCTCTCTCTAAGGTCCTGAACCAGACGATATTGACCAACAATGTTAAACGTGAATGTCTGCGGTGTAGCACTGGGAAATTTCTGTTGGTAATTATGCTTTTTGGCATTGCTTATCTCATTTTTACACCAACAAGACATGTTTCATCCCACAGAGCAGATCACGCTATAATAAATTCTAAAGACAATGTTACAGTAGACACTAGTACCGGATTAAGGAGATTCTTTAGAAAACCACCAAGGCTACCCCCTCTATTAACACCTGATGAGATGCGTACTAGTAATACATCTGTTCACCAGATAGATGTAGATGCATCAAAATGGATGGGAAAGCAGCAGCAAGTTAGAGAGGCTTTTATTCATGCATGGTCTGGTTACAAAAAGTATGCTATGGGTTTTGATGAACTTATGCCATTAAGCAAGAGAGGAATAGATAGTTTAGGAGGTCTTGGTGCAACAGTTGTGGATGCTCTGGATACAGCCATGATAATGGGTGTTGAGGATATTGTTAATGAAGCTGGATCTTGGATTGAAACTCATCTTGCAGAAAAGATCAGTCAGAAAGGCCAGGTCAATTTATTTGAAACTACAATTCGTGTTTTGGGTGGTCTTTTAAGTGCTTATCATTTAAGTGGTGGAGCTAGTGTAGAAACTACATCTGTGGGGCCAAAACCAATTGTATATCTAAACACTGCTACAATGCTAGCCGATAAGTTGCTAGTTGCTTTTACCTCTAGCCCAAGTCCCATCCCTTTCAGTGATGTTATATTACGTGACAACTCGGCACATGCAGCCCCTGATGGATTAAGTAGTACATCAGAAGCTTCTACACTACAACTTGAATTCAATTATCTCAGTGATATATCTGGTGACCAAAAGTATAGCTTGGAAGCAATGAAGGTGCTGAAGCACATAAAGACTCTACCTAAGGTAGAAGGGCTTGTTCCTATTTATATAAGTCCTCAAACTGGCGAATTTAGTGGACAAAATATTAGGCTAGGATCACGTGGTGATAGCTATTATGAGTATCTATTGAAGGTTTGGCTGCAACAGGGAGCAAATCAAAACAGTAATTTAACATATTTACACAGCATGTATGAAGAAGCTATGAAAGGTGTTAGACACCTCCTTGTCAAAAAGTCAGTCCCAAATGGGCTAGTTTTTGTTGGGGAGTTACCCTATGGAGCAAGTGGTTCTTTTAGTCCTAAGATGGATCATCTGGTGTGTTTCCTTCCTGGTACTCTTGCACTTGGTGCCACCAAAGGCATGACTAAGTCGAAAGCTATGAGGGACAACTTGCTTACCTTTGAAGACCTGGAAAATTTGAGGCTTGCTGAAGACCTTGTTAAGACTTGTGTTGAAACATATCTTGTAACTTCAACAGGTCTTGGTCCAGAAATTGCTTACTTCCATGTGGAGGATTACTTTGAAGAAGGATATGATGGTGGAAACAAGAGTTCAAAATATTTGAACGACATAATCATCAAGCCTGCTGACCGTCACAATCTTTTACGTCCCGAGACAGTGGAATCCTTGTTTGTCTTGTATCGCATAACAGAAGATCCCAAGTATCGTGAATGGGGATGGCAGATATTTGAGGCGTTTGAGAAATATACAAAGGTTAGTTCTGGTGGGTATACTTCTCTTGATGATGTGACTTCAGTTCCTCCTAATAGAAGAGACAAGATGGAGACCTTTTTCTTAGGCGAGACACTTAAGTATCTATACTTACTGTTTGGAGACACCAATGTCGTTCCACTAGACAAATTTGTTTTCAACACAGAAGCACATCCTATTCCTGTTAATGGTGCTGATAAGAGGCAGTGA MSKSLPYSMKDVDYDNAKFRQRSLSKVLNQTILTNNVKRECLRCSTGKFLLVIMLFGIAYLIFTPTRHVSSHRADHAIINSKDNVTVDTSTGLRRFFRKPPRLPPLLTPDEMRTSNTSVHQIDVDASKWMGKQQQVREAFIHAWSGYKKYAMGFDELMPLSKRGIDSLGGLGATVVDALDTAMIMGVEDIVNEAGSWIETHLAEKISQKGQVNLFETTIRVLGGLLSAYHLSGGASVETTSVGPKPIVYLNTATMLADKLLVAFTSSPSPIPFSDVILRDNSAHAAPDGLSSTSEASTLQLEFNYLSDISGDQKYSLEAMKVLKHIKTLPKVEGLVPIYISPQTGEFSGQNIRLGSRGDSYYEYLLKVWLQQGANQNSNLTYLHSMYEEAMKGVRHLLVKKSVPNGLVFVGELPYGASGSFSPKMDHLVCFLPGTLALGATKGMTKSKAMRDNLLTFEDLENLRLAEDLVKTCVETYLVTSTGLGPEIAYFHVEDYFEEGYDGGNKSSKYLNDIIIKPADRHNLLRPETVESLFVLYRITEDPKYREWGWQIFEAFEKYTKVSSGGYTSLDDVTSVPPNRRDKMETFFLGETLKYLYLLFGDTNVVPLDKFVFNTEAHPIPVNGADKRQ Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo08978.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902229633|gb|KNA21557.1| (hypothetical protein SOVF_042150 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1260.7 bits (3261), Expect = 0.000e+0 Identity = 629/629 (100.00%), Postives = 629/629 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731373522|ref|XP_010666670.1| (PREDICTED: mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase MNS3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1117.8 bits (2890), Expect = 0.000e+0 Identity = 547/624 (87.66%), Postives = 587/624 (94.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. NCBI nr
Match: gi|568826228|ref|XP_006467475.1| (PREDICTED: mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase MNS3 [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 958.7 bits (2477), Expect = 4.800e-276 Identity = 471/629 (74.88%), Postives = 543/629 (86.33%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. NCBI nr
Match: gi|567914745|ref|XP_006449686.1| (hypothetical protein CICLE_v10014607mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 955.3 bits (2468), Expect = 5.400e-275 Identity = 470/629 (74.72%), Postives = 541/629 (86.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225444543|ref|XP_002275664.1| (PREDICTED: mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase MNS3 isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 954.9 bits (2467), Expect = 7.000e-275 Identity = 468/639 (73.24%), Postives = 541/639 (84.66%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RRW2_SPIOL (alpha-1,2-Mannosidase OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_042150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1260.7 bits (3261), Expect = 0.000e+0 Identity = 629/629 (100.00%), Postives = 629/629 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B426_BETVU (alpha-1,2-Mannosidase OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_003750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1117.8 bits (2890), Expect = 0.000e+0 Identity = 547/624 (87.66%), Postives = 587/624 (94.07%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4UKR3_9ROSI (alpha-1,2-Mannosidase OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10014607mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 955.3 bits (2468), Expect = 3.700e-275 Identity = 470/629 (74.72%), Postives = 541/629 (86.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HLR4_VITVI (alpha-1,2-Mannosidase OS=Vitis vinifera GN=VIT_10s0003g03280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 954.9 bits (2467), Expect = 4.900e-275 Identity = 468/639 (73.24%), Postives = 541/639 (84.66%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067L0E5_JATCU (alpha-1,2-Mannosidase OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_04608 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 951.8 bits (2459), Expect = 4.100e-274 Identity = 468/630 (74.29%), Postives = 544/630 (86.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MNS3_ARATH (Mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase MNS3 OS=Arabidopsis thaliana GN=MNS3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 918.7 bits (2373), Expect = 3.500e-266 Identity = 454/626 (72.52%), Postives = 523/626 (83.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MA1B1_HUMAN (Endoplasmic reticulum mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase OS=Homo sapiens GN=MAN1B1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 398.3 bits (1022), Expect = 1.600e-109 Identity = 241/529 (45.56%), Postives = 323/529 (61.06%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MA1B1_RAT (Endoplasmic reticulum mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase OS=Rattus norvegicus GN=Man1b1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 396.4 bits (1017), Expect = 6.000e-109 Identity = 229/496 (46.17%), Postives = 314/496 (63.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MA1B1_MOUSE (Endoplasmic reticulum mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase OS=Mus musculus GN=Man1b1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 5.100e-108 Identity = 227/496 (45.77%), Postives = 311/496 (62.70%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: MNS1_CANAX (Mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase OS=Candida albicans GN=MNS1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 392.1 bits (1006), Expect = 1.100e-107 Identity = 237/508 (46.65%), Postives = 306/508 (60.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G30000.1 (alpha-mannosidase 3) HSP 1 Score: 918.7 bits (2373), Expect = 2.000e-267 Identity = 454/626 (72.52%), Postives = 523/626 (83.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G21160.1 (alpha-mannosidase 2) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 3.400e-94 Identity = 218/519 (42.00%), Postives = 294/519 (56.65%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G51590.1 (alpha-mannosidase 1) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 1.600e-91 Identity = 211/494 (42.71%), Postives = 290/494 (58.70%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G43710.1 (Glycosyl hydrolase family 47 protein) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 8.500e-29 Identity = 99/306 (32.35%), Postives = 152/306 (49.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo08978.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G27520.1 (Glycosyl hydrolase family 47 protein) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 1.100e-23 Identity = 86/279 (30.82%), Postives = 134/279 (48.03%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo08978.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo08978.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo08978.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo08978.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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