Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CGAGCACCTCTCAGCTTGTGATTTATTAGCCCCCGTCTGGTATATTCGAGTTCATATTTTCCCGTAAAATAATACGGAGTAATAAAAACATAATCCTTGCCCGCTTCACCGCTACAATCACCCAGCGAATCGTTGCTGGAACACTGAATTTCCTTCTTCTCTTTCGTTTTCTCTCTCCTACTTTCTCCCCCAACTTCTTCAACCCATTTCTGGGCACTTTTCCTTCAATCAATCTAGTCAAATCGAAGTGGCCGATTGAGTAAAATGGGAAATGACGGGGTTGCTAAAAGTAACCAAATTGATCGCAAAGAATCATCAATTTCAGAGGCCAGTGTGATTGAAGAAGAAGCTGAGACAAATCCTGATTTGCTCAAGAACACGCCTTCTAATATTCGACGACTGGCCGATGAAATCGAGCAATTCGAAGGTCGGCAGAAGTATCTGGCACAAACTAGGAGCAATTCTGATGGTGGTGATGTTCGGTGGTACTTTTGCAAGGTTCCTTTGGGTCTTAATCGTGAGTTCTTTCTTTCACTTTTTATTTATAGTTTGATAATTTTTTAGTTGAATAAATATGATTATAATTTTTAAGTTGAATAAAATATGATTATAATTTTTAAGTTGTGTACAATTTTCATCCTACACCCGAATGTAATAATCTAAATTTTACACCCTCTCGGCATTCCTGCCGGGAGTGGATATAGAGGAGAATGTGGGTGGGTGTAATTTTATATTTGCTGCGTGTATGATAATGTGGGGATATTGTTGTTTGATAAATGTGATGTAATTATGGAAAGAATGAGGTTTAACTATTGATTCTGGATACTTTCAAATTATATTAATGCGTCTATTCCGGTTTAGCTTCGGTGACATTGTTTCTGATGCGTAGTGGTTGGACAGAGTTGGCTGCCTCGATTCCGCGTGCGGAGGTTGTTGGTAAAGGAGAGTATTTTCGGTTCGGTATGAGGGATTCACTTGCGATAGAGGCTGCTTTCTTCTTGACTAGTTTTTATCCAATGTGATGGGTTTCTTAATTTAAAAAAATCGGTTATATTGTCTATGTAATATAGGAGAGGATACGCAAACTTTGAAATTATAAAATATCATTCATTTGGAGTATAGTGAAATTGAAATTAGAATGTGAAATAAACAAAACTAATTTAAGGGAAAATAACTCTAATTAAGGATGAGAAGTAGAAAGGATGAATATAAATGGTGGTATATTTAGACAATAATAAAATATCAAAGAGATGACATATGGCATCATGGTATGCAAAACATCCTGTTTAAAATATGTATTTATTAGTATAGATAGATAGATTACATGAATGCCTCGGAATATATTATTATCTGATGTCAAATATGTTCCTTTCTTGCATTTTTGTCAAATCTATTTAAAATAGTTCATTTTAGGAGCCTTAAGTGTTTCTGGGTTTCGATTAAGAAGTAATTTAGGCAAGTAATATTTATACTGATGACAGAATGCCAATGAAAGTAGAAAGGGCAATTCATTGTTAAATCTGTTGTTATGTCATTATGATGACTCCCACCGAATGTATAAAAAGGCTCAATGCGCACTGAGGGATGTATCCCTCTGCGCTTCTTTTGTGTCCCATTGTATCTTGGTGCATCACTTAACAAAATTAATTGCGCATCAGATCTTAGTTACCCCTTTTTATACACTGCTCCCACCACTGTCATATATAAAAAATAGGAGGCAAGAACTTATCATCTCAGCTTCTCAGGCTAATTGGTCTTGCGTACTTTGGTCCATAAATAAAGTAAAGTGTCACTCAGACACTCACAATAACTGAATAACGCATGTCTTCTATTGTACAACAATCTTCAAGAGACCTGATGTCATGAACCTATTGCTGTGTCCTGTATAGTCTGCCATAGTTGCCATTTCTGTCTTGGGCTCATAACTATCTTATAGGGGCTTGGTTAAATAATATCCTGTCCTCGTTTATTTTGTGCAACAGAGAGAGGAAGAATTGCTGTCTTATTGGTGGAGGGAATATGCAGAATGCAGTGAAGGCCCGAAAGGACAGACCAGTGCGACTACTGAAGCAGATCTACGGAACCCTCTAACATCTGAACTATATGTTGTTGAGGAGGAGAGAGTTGGAGTCCCGGTCAAGGGTGGTCTCTATGAGGTATTATTAGCTCCAATTTCGTGGTCAATGAATGGATCAACTGCGAACTTGTGAACAATATCGCCTTCTTTAGTTCTGTATATTCTGCATTTAATAGCGGTAAATTATGTGGTCATTAAATTTGTAACCTCCAAACCTCTAAACCTAAACAAGTTGTTGTCTATTCCCCCCTGTAATGTATTTTTTCTACAAACACAACTAAGAGCATGTACATTGGGGCTCTTGGAGTGGCTCTCCAACAAGAACTATATCTTGGCCAACATTGGGGCGCTGAGGGGCTCTTGAGTAGCTCTTCATGGAGAGCTACTTCAAGATAGCTCTTGCCCAAGACACCTCCGAGAGATGATTATTGTTGAAAAATAGAGAATAACTTTGAAAAGTAGATAGTAACTTTGGTTAAAAAGACAATTAATTATGGACCACCAAATGGTAAAAAGAGTTTGAAGAGCTCACTTGGGGAACCGACAATGTTGGTTGTTTTTAGGAATGAATTCTTGAGAATGTCTTGTAGAGAGATAGTGGTAAAGAGAGAGTGGAGAGCCCTCCAAGAGCTCTTTTGAAGAGCCAACCAATGTACATGCTCTAAGAAGTTGAGGCAAAAGGTTTCTAATTTTTGTGTGAAAATTTTAGGACATCTGGGTGGGTATGGAAATTTTGACTCCAATTTGCACTTCACTCCATGTTTAGGTGGTAATGTAAATTTAAATGGACTAGGCCATAATGCCATATCCAATTAGTTTTTTTTTCTTCATATTTCTGCTTGCTTGCTGTTTAAGACGGAAACGCTTGACCATTTTAAAACTCCTGTTACCTTTATCTCCATTTACTATCTTTTTCATGTATTCCACAAGATCAATATGTTGGTTCTCATGAGTTGATGAAAGGGTTTGCTTGTAGTCAACTTCGCAATTTGTTTGTCATTAAGGATATAAGTTTACTTGGTGTGTATCATTTACTTGTTTATTGGTTTGTTTCATTGATTACACTTCCTAGATTCTCCATTCCTTCTTTGTCCTTGAGATTCTTTACTTCTATCTTCATACATATATCTTGTTGTCTAGGCATTTCATTTAGTAGAGTGTTCATCTTTGTGGCGAGCTTTTGTTGTTGAATCAAGCAGTTAAAATGGTTTTTGGGTCACATGCGGAGAGGGGTACTGATCTTTAAATCTTTAATAGGAATGAAGTGGCATGGATTGACATAAACCTTTACCAAATACAAGCCGATCAGTTGTCATAATATTTTCTTTGGAGAGTTCTTCACATATTATTGATGTGTTTCTTTGTACAACAAATATGCCATAAGAAGGTTCTATGGTTTACTAGTGATGGGTAGACAAGAATGATCTATATTTATAGTTGTTTCCCTTCAAACTTGCCTTGGTTTAAAAAGGCGCAAGGCGCACTATGGCGCACAAGGGTCCTGGTGCAAGGCTAAGGCTCAGGCGCGCTGCTTTTGGGTATGAGGCGCACATAAATTTCTAAAAAACCTTAAAAATCAATATAAAACAAAATTAACACACTTTATACTCAAAACAACATAATAATTATACGGTTTTTTCATGAAATACCCTCGAGTTTTGCCATAATTCATCAAATGCCCATCAAGTTTCTTTAATACATAAAATGCCCCTGTTTCAATACTTAATACCCCAACTACCCCTATTTCAATACTTAATACACTAAATACTTTCAATGACGTCATCGACCCTATAATAAACCAATAACGTCTAATTAAGTCACTAATCCCTAATTAACCCATTAATTAACATCCTAATCAACCCACTAACCCACCCATTTCTTTTGTTTCTCTTTCTCCCTCTCCTTCAGACTTCATCCATTGAAAGACAATCATCATTATTGGCTAGCTCCTTCACTTTAAGGTTAAGATCCTTCATGATGGAGGATTATATTGGGGATGAATACCCACAATGCAAAAATTAAATGTAAAAAAAATCCCAACTCAGAATAAAAGAATTTAAAAAGATAAAACCTTAACATTAGAATTAAAACTACGAAAGAAAAAATTAAAGGGAGAGAGGGGAAAAAAATACGGTGAAGCCAAATTGGGTAGGGCCAAGTGCAACGACAAGAACACAGAAGACAATGGAGATGTAAAATTCGCTCATATTAGCAATGAAACCTAAAATACTGGATTGTCTTTGAACCCATCACCATACTCCCACTACTGATCGGATCTTTCCCGCTGATGGAACCACTCATCCGATACCAACTCCCCGTACGAAGGAACGACTTTTTGAGCTTCGCCGCCCTCGCTTCCTCCGCATCGCCGCCGCTCATTTTTGTTTGTTCAATCCAAAATCAAAATTAGAATCAGAGAGAAAAGGAAAACATTTTCAGCGGCGAGGATTTTGGACGAAAACCTGAACAAGGATTTTGGGTGGTGAGGGCGCCGGAAAAGTTGGTGGTGGTGGTCAATTGGGCATCTGGGAAGAGGGTGAAAGGGGGCAACCATGGAGAAAAGGCTAGGGAAGAAGAAAGGGGGAGAGAGAAAGAAAAACGGGGAAATGGGTTAATGGTGGGTTAATTAGGGGTTAACGGGTTAAATTGGGGTTGATAACGTCACTAGGGTAGTTGGGGTATTAAGTATTGAAATGGGGGTATTTTATGTACTCCCTCCGTCCCAGAATACTCGTTACACTTTCCTTTTTCATCCGTCTCACAATACTCGTTACACTTTTTTTCCAACCCATTTTAGGAAAGTTTTTATTATATTTTAATAGATGTCCCTTTCTCACTTTGCCTCACGACACAAATATTTTAATTTCAACTCTCCTATCCTTCAATATAAAAATACCTTACGTTCTCTTTCCTCTAA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ATGGGAAATGACGGGGTTGCTAAAAGTAACCAAATTGATCGCAAAGAATCATCAATTTCAGAGGCCAGTGTGATTGAAGAAGAAGCTGAGACAAATCCTGATTTGCTCAAGAACACGCCTTCTAATATTCGACGACTGGCCGATGAAATCGAGCAATTCGAAGGTCGGCAGAAGTATCTGGCACAAACTAGGAGCAATTCTGATGGTGGTGATGTTCGGTGGTACTTTTGCAAGGTTCCTTTGGGTCTTAATCTGGTTGGACAGAGTTGGCTGCCTCGATTCCGCGTGCGGAGGTTGTTGGTAAAGGAGAGTATTTTCGGTTCGAGAGAGGAAGAATTGCTGTCTTATTGGTGGAGGGAATATGCAGAATGCAGTGAAGGCCCGAAAGGACAGACCAGTGCGACTACTGAAGCAGATCTACGGAACCCTCTAACATCTGAACTATATGTTGTTGAGGAGGAGAGAGTTGGAGTCCCGGTCAAGGGTGGTCTCTATGAGGTGGATTTGGTGAAACGACACTGCTTTCCAGTGTACTGGAGTGGGGAGAATCGGCGTGTTCTAAGAGGTCATTGGTTTGCGCAAAGTGGAGGACTTGATTGGCTTCCCCTTCGGGAAGATATTGCTGAACAGCTGGAATTTGCATACCGTAGACAGGTTTGGCACCGGAGGACATTTCAACCATCTGGACTTTTTGCCGCTCGTGTTGATTTGCAAGGCTATACCCCAGGTCTGCATGCCCTCTTCACTGGAGAGGACAGCACATGGGAGGCGTGGCTGAATGTTGATGCTTCAGGCTTTTCCAGTATCATCAATTTGGGGGGAAATGGTGTGAAACTAAGACGAGGATATGCTGCATCTCTGTCTCCGAAGCCAACACAGGATGAGTTGCGTCAGCAAAAGGAAGAGGAGATGGACGACTATTGTTCGGAGGTTCCGGTTCGTCATTTGGTATTTATGGTCCATGGCATTGGTCAAAGACTGGAGAAATCTAATTTGGTTGACGATGTAGCGACTTATCGCCATATCACCTCAAGTCTAGCTGAAAAACACCTGACTTCATATCAACGTGGCATTCAGAGAGTCCTTTTTATTCCCTGTCAATGGAGAAAGGGTTTGAAGCTCAGTGGCGAATCTGCTGTGGAGAAAATTACTTTAGATGGTGTACGAGGCTTGCGCACTACACTAAGTGCAACTGTTCATGATGTATTGTACTATATGAGCCCCATCTATTGCCAAGAGATCATTGACTCGGTCTCAAACCAACTGAATCGTTTATACCTGAAGTTCCTGAAGAGAAATCCAGGGTACGATGGAAAGGTTTCCTTGTATGGCCATTCCTTGGGAAGTGTTCTCTCATATGATATTCTCTGCCACCAAGAGAATTTGTCGTCTCCCTTTCCGATGGAGTTTATGTACACAAAGCATGAGAAAGAAGATGAATCATCAGAAAATATTTCCAAATTACCCTCTGACATCAACTCCAAGGATGGTTGTCCTAGAATCTCACAGGAAATTTCAAATGAAGACAAGTCAGGAGGATCGTTGCTTGAAAATGTTATGACTGAAGATCGTCTAGTTACGGATATTTGTCCAACTTCCTTCCCGATTAGAGATGAAAGCCCTATGGTGAAAGTGAGTGAAATGCAAGTTGGCACTGAATCTTTAGTGGCAGATGGTCAGGATCCACCTTGCAGTCGCAGTGACTCCTGTCCCGAAGAAATCGGAACCCTGAGTGAAGTGAGTGATATCTATCAGGGCTCCACTGAAGACTTGGAAGCGATTACCAATCTGAATAAAGTTAATCCTGAAGTTTCAGAAAATGTAGCCGAATTTCTGCATAAATTAGATTCTATTGACAATGACAAAAACAAAGACAAGGATATACAAGCTCTGAAGTCAGAGCTTGACTTTCTAAAAGGACGAGTTGCAGAATTGGAAGCTCAGGTTGGTTGGAACGATGCTAGTGACAGGTCTAATGAAGTCCTCTTCTTCATACACTTCCTCTGCATTGATGTCTTTAAGTCTGTATTTTATTCTACGTTGTGTGTTTTCTTTTGTGCAGGGAGGCATCCAGGCATTTCAGATCAAGATGAATCCGGAAAGATTTTAACTAGTCAAAACAACTTATCCACAAGCTATAAACCTTTCATCAAGTACACCAAGCTTGAATTCAAGGTACATACATTTTTTGCGGCTGGATCTCCTCTTGGTGTCTTCCTTTCCATTCGAAATGTCCGCATTGGAATTGGTGAAGGAAGGGAATACTGGGGGGAAGAGAATATTAATGAAGAGATGCCTGCTTGTCAGCAAATGTTCAACATCTTCCACCCTTTTGATCCTGTGGCATATAGAATAGAACCACTGGTATGTAAAGAATATGTCAGCAGACGCCCTGTCATTATTCCTTATCACAAAGGTGGCAAGCGATTGCATATTGGACTACAGGAATTTGCTGAAGACTTTGCTGCACGATCTCAGTCAATTGTGAAACGCCTTAATTATGTCAAGGTTCAGGTGCTCACAGTATGTCAATCAAGAAAAGACAGCCTCGAAGAATCGGTGGAGGATGTCAATGAAGAAGTCCGATCTTACGGATCCTATATGATGGAGAGATTAACTGGAAGTGAAGATGGACGAATTGATCATGTTCTTCAGGATAAAACTTTTCAGCATCAATATATTTCAGCTATTGGAGCGCACACAAACTATTGGCGCGACTATGATACTGCTCTCTTTGTGTTAAATCACTTGTACCGAGACATTCCTGAAGACCCTGAGCAAACAAAGTTGCATCGAAGCAAAACCAAAGATGATAAGGTCTCTGATAGGTTGCCAGATACCGAAATTATTGCTGAAGAAGAATTGCCGTTAACATTCTCTAGCAGCAATCTAATAAAAAATTCACCCAAGAAAACCAAAAAAGTGGGCAAGTCATCGTGGTAG MGNDGVAKSNQIDRKESSISEASVIEEEAETNPDLLKNTPSNIRRLADEIEQFEGRQKYLAQTRSNSDGGDVRWYFCKVPLGLNLVGQSWLPRFRVRRLLVKESIFGSREEELLSYWWREYAECSEGPKGQTSATTEADLRNPLTSELYVVEEERVGVPVKGGLYEVDLVKRHCFPVYWSGENRRVLRGHWFAQSGGLDWLPLREDIAEQLEFAYRRQVWHRRTFQPSGLFAARVDLQGYTPGLHALFTGEDSTWEAWLNVDASGFSSIINLGGNGVKLRRGYAASLSPKPTQDELRQQKEEEMDDYCSEVPVRHLVFMVHGIGQRLEKSNLVDDVATYRHITSSLAEKHLTSYQRGIQRVLFIPCQWRKGLKLSGESAVEKITLDGVRGLRTTLSATVHDVLYYMSPIYCQEIIDSVSNQLNRLYLKFLKRNPGYDGKVSLYGHSLGSVLSYDILCHQENLSSPFPMEFMYTKHEKEDESSENISKLPSDINSKDGCPRISQEISNEDKSGGSLLENVMTEDRLVTDICPTSFPIRDESPMVKVSEMQVGTESLVADGQDPPCSRSDSCPEEIGTLSEVSDIYQGSTEDLEAITNLNKVNPEVSENVAEFLHKLDSIDNDKNKDKDIQALKSELDFLKGRVAELEAQVGWNDASDRSNEVLFFIHFLCIDVFKSVFYSTLCVFFCAGRHPGISDQDESGKILTSQNNLSTSYKPFIKYTKLEFKVHTFFAAGSPLGVFLSIRNVRIGIGEGREYWGEENINEEMPACQQMFNIFHPFDPVAYRIEPLVCKEYVSRRPVIIPYHKGGKRLHIGLQEFAEDFAARSQSIVKRLNYVKVQVLTVCQSRKDSLEESVEDVNEEVRSYGSYMMERLTGSEDGRIDHVLQDKTFQHQYISAIGAHTNYWRDYDTALFVLNHLYRDIPEDPEQTKLHRSKTKDDKVSDRLPDTEIIAEEELPLTFSSSNLIKNSPKKTKKVGKSSW Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo06477.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902157870|gb|KNA06171.1| (hypothetical protein SOVF_183510 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1626.7 bits (4211), Expect = 0.000e+0 Identity = 809/836 (96.77%), Postives = 809/836 (96.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902157871|gb|KNA06172.1| (hypothetical protein SOVF_183510 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1536.9 bits (3978), Expect = 0.000e+0 Identity = 778/836 (93.06%), Postives = 782/836 (93.54%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731313957|ref|XP_010683384.1| (PREDICTED: phospholipase SGR2 isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1453.7 bits (3762), Expect = 0.000e+0 Identity = 759/1003 (75.67%), Postives = 825/1003 (82.25%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731313955|ref|XP_010683380.1| (PREDICTED: phospholipase SGR2 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1449.1 bits (3750), Expect = 0.000e+0 Identity = 759/1004 (75.60%), Postives = 825/1004 (82.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731313959|ref|XP_010683388.1| (PREDICTED: phospholipase SGR2 isoform X3 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1332.4 bits (3447), Expect = 0.000e+0 Identity = 688/891 (77.22%), Postives = 746/891 (83.73%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QHY0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_183510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1626.7 bits (4211), Expect = 0.000e+0 Identity = 809/836 (96.77%), Postives = 809/836 (96.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QFY6_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_183510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1536.9 bits (3978), Expect = 0.000e+0 Identity = 778/836 (93.06%), Postives = 782/836 (93.54%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8D5G2_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_1g012730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1453.7 bits (3762), Expect = 0.000e+0 Identity = 759/1003 (75.67%), Postives = 825/1003 (82.25%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8D541_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_1g012730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1449.1 bits (3750), Expect = 0.000e+0 Identity = 759/1004 (75.60%), Postives = 825/1004 (82.17%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0D2QNR0_GOSRA (Uncharacterized protein OS=Gossypium raimondii GN=B456_009G267200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1105.1 bits (2857), Expect = 0.000e+0 Identity = 582/980 (59.39%), Postives = 708/980 (72.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SHGR2_ARATH (Phospholipase SGR2 OS=Arabidopsis thaliana GN=SGR2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 4.400e-199 Identity = 380/664 (57.23%), Postives = 456/664 (68.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DDHD1_BOVIN (Phospholipase DDHD1 OS=Bos taurus GN=DDHD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 2.400e-40 Identity = 104/322 (32.30%), Postives = 166/322 (51.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DDHD1_HUMAN (Phospholipase DDHD1 OS=Homo sapiens GN=DDHD1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 1.200e-39 Identity = 103/322 (31.99%), Postives = 165/322 (51.24%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DDHD1_MOUSE (Phospholipase DDHD1 OS=Mus musculus GN=Ddhd1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 132.9 bits (333), Expect = 1.900e-29 Identity = 72/197 (36.55%), Postives = 112/197 (56.85%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: DDHD2_MOUSE (Phospholipase DDHD2 OS=Mus musculus GN=Ddhd2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 3.100e-27 Identity = 66/164 (40.24%), Postives = 103/164 (62.80%), Query Frame = 1
BLAST of Spo06477.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G31480.1 (shoot gravitropism 2 (SGR2)) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 2.500e-200 Identity = 380/664 (57.23%), Postives = 456/664 (68.67%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo06477.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo06477.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo06477.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo06477.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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