Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAAAAAGTTGTGGTTTGTAATCAAATACGAAAGTAACCAACTTTCGTTATCCACTTCCTGTGGGCATGTAACACTCTCTTTCCTCTGTTTTCCCAACCTCACTTCCCCCATCTTCACCAAAACCTTCCTTTCAACTTCCATGGCTGCCACCACAACTTCACCCTTCAAATCCATCTCCACTATACTTTCTCTCTTCTCTCCCTCAAAACCCTCTCTTCCAAATCCCTTTGCCTCCGTAAACTCCCACCTCACCACCTCCAAACTCTCCATTTCCACCCGGAATTTGACAACTTTTAAACGGACTATAGGATGCAAGGCGGCGGAAGTGTCGGTTGCGGAAGAATCTCCGGCGTCGGACGGTGGTGGGAAAAATTGGGTTCCGGTGGTGCCGTTGTCGGCGTTGCCTAGAGGAGAGAGAAGAGTGATCATTCAAGATGGGGAGACAATTTTGCTTTTGTGGTACAAAGATGCGGTTTTCGCTATTGAAAATCGGTCCCCGGCTGAAGGTGCTTATAGTGAGGGTTTGCTTAATGCCAAACTTACCCAAGTGAGTTATGCTCTTTTCAATCTAATTAAGAATTATGCAATTTTAAGAACTAAAAAAAACATGTATTATAATATCATCGTGTTGACACGGCTTACAGATCACAACAATAATTAAATCATTTTCAATAGAACAATACTATAAAAATTAAAAATTTCCACTAAGAAATTGCATTTCTCGAAATTTCTCTTCACTTCCCCCCGAACTTCCCCATGCGTCATGAATTTAAATTAGAAAATAAAATATGTAACTTATATAATCGATTAGCATAAATGATTTTTTACCACCTACAAAAACTGAAAAATTGTTTTTTACCACCTAACAAACTAAAACTTGTATTTTACCACCTACGAAAAATTTAAAACTTGTTTTTTACCACCTGGAAAATGAAAAATGTATGAAAATGTTATGTAGAGGCGACAATAACGGTAATAATTCTTATATGTTCTATTCTTCCACAATTTCATGTATTTAACTCTCTTGACTTCCCCAACTTTCTTATGTTTAATGAATTTGCATAATTTTTCACCATCATTCATTCACAAAATTGACAAAATTTAATGAAAGTAAAGCAAGAAAGGTGAAAGAGTTAAAGAAAATCATATAGGGAGTGTAAAAAATTGGAGGCAATTTGAATTAGACAGCCATACATAAAGGATTATCTAATTTTTCACTTTCAGGTGGTAAAAATTAAGTTTTAATATTTTTTTAGTTGGTAAAATACAAGTTTTAATTTTTTATGTGGTAAAAAATAATTTTTCGATTTTTGTAGGTGGTAAAATCAATTTGTCCAATCTATTATTCAGGTTAAATAAAAGGTAGGAAAATATTAATATTTAATTTGTTTTATTTTTCGTATCGACTCCCTTATTTACATATTTTCATATTAAAAATATTGCATTGATAATAAAAATATTCTGATGACTTATAGCCTATGTGGCGCCTATATATACCTATTAAACTCCGACACGTAAGATTGCGACAACTAAATATTGTCGCAACTTGCGACCTTTATCACCGCCCTTGTTCTATTTCATTTCAATTTTTATAAAATGCATTGCTTGTACTTATGATTTCAATTTAGATAGAATTTGAATTTTATATGATAGAGGAAGAATAAAGGAATGAGGTATGAGGTTGATATGTGTTAGATTACGAGCCTGTTTGGCCAAGCTTCTAGGAAACAGTTTCTGTTTCCTAAAAGTAGTTTTCTAGAAACTGTTTCTAGAGAAACCGTGAAGGTGTTTGGCCACACAGTTTAAGAAGCACTTCTTAGAAACAGAAACACTTTTACATTGTTTGGCCCATTGCTTTTGTTATAACTTCTTGTCTATTATTAACTAATTCTTAAAAGATGTTATTGTTGATTCTAAATCATACTATTATAAATAATTTCCATGTTAACTTTTACCTAAAAAAAATATTATCCTTATTATGCATTAATTATTTTGTTAAACCAAAATTTATTCCAACNTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAATAATAATATATTGAGAAAAGATAGCTCGAGTATTTTTTTTAATTTAAACCAATTTCCACCAAACTATTTTAAGTTAATATAATATGTTTAATACACAACTAGTAATAACCTTTTATACACATTGCTCTTGCAAATCTTGTTTCAACATAGAAGATGCAATGTTGTGCCGGACAGACTCCATGCTATCATCATCCATTGAGCCATCGTGATCTTCTCGTAAAGTACTCGAAGAACCACCACCAATATCTTGAGCATCTTCTTCCACCACAGGAATATAATTTGGGTCCGCATCGCATTTGTCGAATTCCAAATCTTCAAGTGCATGTCTTCTAATGTAGTTGTGCATAGCCATAGTTGCAACAACAATCTTGTTTTGTGTTTCTAGTGGAAAATTTGGCATCATGGATAGTATCCTCCATCTACTNTCTAGTGGAAAATTTGGCATCATGGATAGTATCCTCCATCTACTTTTCCATACTCCAAATGTTCGCTCAATCACATTCCTTAATGAAGAGTGTTTATAATTATAGACTTCGTAATAACCGGTTGGTGCCTCTAACTACCACGAGCTACCATGCTTCAATGTCAGCATAACTAACTCCCTAAGAATCAGGGGTATGTAGTAACAAACTAGGAATATTCTAGATCATTACTTGCTGCTGATCACTGTTGATCATTGCAGTTTCGCTGCTGCTATATATACCATGTATTAAGCTCTTATTCATTTAATTAACGCAGGAAATCATTTTCAGTTTTTCCCTAAATTCTATCATGGTATCAAAGCAGGTCTAAAATCCTGCATTTTCCTGTGAAATTCCGCGGAAAAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAGCCTTAGTCCCAAAATGATTTGGGGTCGGCTAACATGAATCGTCGTAGGAGATCGTCATTGTCACCAATTAAACCAGAAAGGAGCAAGAAGTAATAAGAAAAACAAGGAAGAGAAAGTGGAATTAATGAAAGTAAGATAAGAGAAAAATGTATATATATATATATATTATAGAAAAAAATATTGTAATAGCTAATAAAAAATAAGTAAAGTTTAAAATAAATGAGTAAGTAAAATAAGTACATTTCAAAATAGCATGTAAAATTAAAAAATTTGAAAGAATTTTAAACATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATAGAGAGCATCAGAAACATTGAAGCTGTATAAATCAAATGAAGTCATCAATGTATATTCTCTCCCTCCACTATGTCCTATCCAACACCATATTTTCCTCAATCCCAAGAAAGCTCATATCGTGCTCAATCACCTTCCTCCAAGTTTTCTTAGGTCTTCCCCTACCCCTTGCAATTCTATCACTTTGCCACCCTTCTATCCTCCTAACCGAGGCATCACTTGATCTTCTTGTTACATGTCCAAACCATCTTAAACGATTTTCCATCATCTTAAACTCAATCGGTGCAACCCCTACTTTCTTCCTAATAATCTCATTCCTCAAATGATCCTTTCTTGTATGCCCACATATCCAACGTAACATGCGCATCTCCGCCACATTCATCTTGTGCACGTGACAATGTTTCACTGCCCAATATTCTGTGCCGTATAACAAAGCCGGTCGAATTGTCGTGCGGTAAAATTTTCCCTTCAATCTTTGGGTCATGCCTGAATCACATAGGAACCCCGTGACACCTTTCCACTTCAACCAACCTGCTTTGATTCTATGGGCCACATCGCCATCCAATTCTCCATCCTTTTGGATAATAGACCCTAATTAACGGAACATTTCAGAGCCTTGGACAATTTTCCCATCTAAGGTAATCGCCCCTGTCTCTCTATCTTGGACTCCACTAAACTTACACTCCATATATTCCGTCTTGTTTCTACTCAGCCTAAAACCCCGAGATTCCAAAGTATGTCTCCATAACTCCAACTTACTTTCCACTCCTTCTTTTGTTTCATCAATCAACACAATATCATCTGCAAACATCATGCACCAGGGTATACCATCTTGGATTGACCTCGACAATTCGTCCATGACTATAGCAAAAAGAAACGGGCTAAGTGCGGAACCTTGATGTACTCCAATCGTAATGGGGAAGTCTTCGGTCTTACAAACACTAGTTCTCACACTCGTGCTAACTCCCTCTACACAACATCCCATCTTCAGTGCGCTTCTTACGATCCGCAACCATCCCTTCGGTGTCCTTGTCTGATGGTTCTTGTAAGGGCCCTAGCTTCGGATCCAAAACATAGAAAATCTTCAAAACAATAAGCAAGAACGAAATCTTCTCCTTCCAACGTAGAAAGTTGGTTCCATCAAAACTATCTAGTTTCATAGTATCATTACCGAACATCTTCAACGTGCTCTCCATAATATTATCCTAAGATTGTTAAATACTATACTTTGAATTATGAAAAACGTAAATACAGAAAACTAGATTAGGACGAGATAATCTATGTCCTTAGGATAATATTAGCCCCCACTATATTGCTGATAGGATTCAAAGCTAATCTACCCTAGGATTCCCTAATCACGAATGGAATACAGCAAATTCAACCATTCCCATGAACACGTGTTTTGAAGAAAACTGACATTGTGAGAAATATGATAAAACGTAATCAACAATATCATTATGCATTAGATTAAATAGGGAACCAATATGACAGTTACTAAATAAATGCCCTTTGGTATTATCCTATTTAAAATAAATAATTAATTAATACGAAATATTAATTAATTAATAACTGCAAAAAGATTAACGTTAATTATGCAAAGTGCTAAGTGCTAAGTCTTGATTAATAATATATAGCTATATTAGCAACCCAATACTAGCACACCAAG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TAAAAAGTTGTGGTTTGTAATCAAATACGAAAGTAACCAACTTTCGTTATCCACTTCCTGTGGGCATGTAACACTCTCTTTCCTCTGTTTTCCCAACCTCACTTCCCCCATCTTCACCAAAACCTTCCTTTCAACTTCCATGGCTGCCACCACAACTTCACCCTTCAAATCCATCTCCACTATACTTTCTCTCTTCTCTCCCTCAAAACCCTCTCTTCCAAATCCCTTTGCCTCCGTAAACTCCCACCTCACCACCTCCAAACTCTCCATTTCCACCCGGAATTTGACAACTTTTAAACGGACTATAGGATGCAAGGCGGCGGAAGTGTCGGTTGCGGAAGAATCTCCGGCGTCGGACGGTGGTGGGAAAAATTGGGTTCCGGTGGTGCCGTTGTCGGCGTTGCCTAGAGGAGAGAGAAGAGTGATCATTCAAGATGGGGAGACAATTTTGCTTTTGTGGTACAAAGATGCGGTTTTCGCTATTGAAAATCGGTCCCCGGCTGAAGGTGCTTATAGTGAGGGTTTGCTTAATGCCAAACTTACCCAAGATGGGTGCATAGTCTGCCCGACAACAGACAGTACATTTGATCTTCGAACTGGAGAAATTAAGGACTGGTATCCAAATAACGCAGTGCTTAGAGTTCTCACTCCTGCTTTGAGGGGATTGTTCGTCTACCCAGTGAAATTTGATGATCAAAATATCTACATCAGCATGGGTGTTAGTTCAAATATGGATGCTTCTGCAGAGATCGTGTTTAGTGGGAAGGCTCAACCTGGTATAACTGCTACAGATGTTAACGTGGAAGAGGTGAAAATGGTGGTTGATGAAAGTTCAGGAGGATTTGGTTTCACACGGAAGAACGAACGCCATGCACTCGCCAAAAAGGCGAGGGGGGCGCTAGCATTCCTTCCCCATCGTAGGCGCAAGCCATGCGCAAATACACATCTCGCAGCTCTTGCCCCTCGTCTCGCCGCATGCATGCACACAACCATGTCACGGGGCCATGTCGTGCACAGCGCACATGCACGAACAGAAGTCCCTCGCCTTTGTACGAGTAAACCTAAACATTTTCACGCAAACCCCTCTACAAATCTTTGGCTCTTGAATTATCGTCGGCCGTCGCCCAACTCCCAACCGTTGTCTCCTTGTCGGAGTGACCCAGCACCGTTCCACCGCCGACCGCTGGTCACCCACGATCCACAAAGAAACAAAGTTACGAGCCAGGGTCACTCAAAGAAACAGCAGCGAAGCAACCAACCAGTTTTGAAGCCGTCGTCGGCTCGTGGCCCTCGCTTCTCCGCCACCGCGCCACTGGTCGACTCGCCGCTTCTCGCTGACTCGTCGTTCCTCGCCGACTCGCCGTTGCAG 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MAATTTSPFKSISTILSLFSPSKPSLPNPFASVNSHLTTSKLSISTRNLTTFKRTIGCKAAEVSVAEESPASDGGGKNWVPVVPLSALPRGERRVIIQDGETILLLWYKDAVFAIENRSPAEGAYSEGLLNAKLTQDGCIVCPTTDSTFDLRTGEIKDWYPNNAVLRVLTPALRGLFVYPVKFDDQNIYISMGVSSNMDASAEIVFSGKAQPGITATDVNVEEVKMVVDESSGGFGFTRKNERHALAKKARGALAFLPHRRRKPCANTHLAALAPRLAACMHTTMSRGHVVHSAHARTEVPRLCTSKPKHFHANPSTNLWLLNYRRPSPNSQPLSPCRSDPAPFHRRPLVTHDPQRNKVTSQGHSKKQQRSNQPVLKPSSARGPRFSATAPLVDSPLLADSSFLADSPLQ Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo05103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902229020|gb|KNA21355.1| (hypothetical protein SOVF_044140, partial [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 478.8 bits (1231), Expect = 9.600e-132 Identity = 242/242 (100.00%), Postives = 242/242 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731361907|ref|XP_010692609.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104905697 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 6.000e-110 Identity = 208/242 (85.95%), Postives = 221/242 (91.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1021517406|ref|XP_016202207.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107643147 [Arachis ipaensis]) HSP 1 Score: 326.2 bits (835), Expect = 7.900e-86 Identity = 176/247 (71.26%), Postives = 196/247 (79.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1012129628|ref|XP_015964610.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107488379 [Arachis duranensis]) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 6.700e-85 Identity = 174/247 (70.45%), Postives = 196/247 (79.35%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. NCBI nr
Match: gi|359495241|ref|XP_003634942.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100248314 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 317.0 bits (811), Expect = 4.800e-83 Identity = 171/242 (70.66%), Postives = 188/242 (77.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RP90_SPIOL (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_044140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 478.8 bits (1231), Expect = 6.700e-132 Identity = 242/242 (100.00%), Postives = 242/242 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BFI6_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_1g021480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 4.200e-110 Identity = 208/242 (85.95%), Postives = 221/242 (91.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7TLI1_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_18s0001g06720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 317.0 bits (811), Expect = 3.400e-83 Identity = 171/242 (70.66%), Postives = 188/242 (77.69%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A5C791_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VITISV_018103 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 312.4 bits (799), Expect = 8.300e-82 Identity = 169/242 (69.83%), Postives = 186/242 (76.86%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0L9TAV7_PHAAN (Uncharacterized protein OS=Phaseolus angularis GN=LR48_Vigan442s010800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 5.400e-81 Identity = 155/188 (82.45%), Postives = 166/188 (88.30%), Query Frame = 1
BLAST of Spo05103.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G71500.1 (Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 1.500e-79 Identity = 141/187 (75.40%), Postives = 164/187 (87.70%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo05103.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo05103.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo05103.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 0
BLAST of Spo05103.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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