Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCTAAATCTTAATCAAAGACTTCTGTGACGGACTGACGGGTTATCAAAATAGCCTTGAGATTGGCTCATCTGAGCAAATTCTCGGCGATTAACTAACGGATCATACCTCAGTCGCCAACACCCCCCTCCCCAATTATATCGCAGTTGGCCTGCAGAGGAGGAACTCAGGCGATGCCACCGCGACGGTAGCAGTGCGCTACCCATGCCAATGGTTGCTCTGACTGATCCTATATACCTCTGAGGGTGACCATTCATTCAGTTTTAATATCAATGGCGTCGAAGTCCAGGGGAAAGCAGCTCTCTTTCGAGATCCTCTCCTCCACTTATGCAGTCAACTCCGACTCAATCATCGATCGATCTTCTAACTCCGATCCCCTTATTCAAAACAATAAGTCCAATCGCCGGAGGCGGAAGCGAAAGCGGAAGAAATCCACCCCGAATTCACCAGCACCACATGAATTCTATACGATCTTCGATAACGGCGGCATTGATGAATTGGAGGAGAGGGAGTCTCCGTCGATGAACTCTCACAGTTACGCGGCATCGAGTTTCGTGGTTTGTGAGGTGAGAGAAGAGAGTTTGGGCACAGTTTGCCAGGTTTCGCAGGGGGAATTAAGGCAGAGAAATGTGAGTAGTGGTGGCAGTGGCGGAGATTTAGTGCCCCCGGTAGAGATACCGGAGGCGGAGGTGAAATCTAGACCTAATCTTATTAATGGCGGTAAATTGGATAAATCCGAGTCTTTAGATTGGAAGCGCTTTATGGCTGAAGAAGATCCTATGTGTAAGAAATTCTTCTTCTTTTTATTTTTGCTTCTTGTTACTTCAATTTGATTCTTCATGTCCTAGTGAGTAACTAGAGCTCCAATTCTTGAACTATTTGGTAATTCATACTTGGATAGTTATTTTATGGAGTGGCGCATTTTAGGAAGTTCATTAATATTTAACTCTTTCAAGTTGTTAATTTTGTTTGAGTTGATACCGTTATTGGATGCCTGCTAGTAGTGCTGTAATCCCATCCGACCTCCAAATTGGTTGCTTTTATATTGCCCTTTCTCGTGATGGAGAGATAAATAACAGAATTCAATGTTGCATACAGACTGAAATTTCTCTTGCAATTCACAGTCTTGCTTATTGACATGACCATCTTGTATAGGTACCAGACCATCAGGGTTTTTCTCCTCTTGGTACCGACTATTTCCTTCTTCAAATGAGGTCATATGATGTCCTGATCTCATGCGCTTGAATTGGTGCTTGTTAGCCTTCATCTATTTCTAGTATTCTTCAATCTTTGGGTTCACTTGAACTTTTTCAAATATGGTAAAGCATGGGATTAAACCATATGCTATACCTTTGTTACGTGGACTCTCCATTTTATCTCAAGTACCCATGTCAGATCCTAGACACTCATACATGGATACAGACAATACATTTTGGACCAAAATTATGAATATTTTTCGCAAATAGCTGAGTCAAGCACTTTGACAAGTACTCGTGTCCGGATGGGTACACGAGTCCGACTAAACATAGTGTGATACTATAAAGAATTTGTTTGGAGACAATCTTGCTAATGAAATCAATTCCCTTTTCAAATATTATCCCTTCCAATGATGAGCGGATGCTACATGTTATGGTTTTTCATTGTGCTGATAGCTTATACTTACTCCGTTTCTTATTAGATAACACAATTTGATTGTGACACTATTGACTGTTCACACAAGCTCCTTTTGACTTGTGTGATTTATACAATTATACTTAAGAAAAAACATAGTCATGTGGGGTCTTATTAGGTTCGTCTCAATGAATATTTTTTAAATATCAACTTTATATAATTGTTTCTTATCCATAATTGTAGATATTAATGCTTTAAATCGTGCATTGGTAAATGTGCATAAAAAATTGTGTCATCTAAACAAGAACGGAGGAAGTATGTTTTTTCTCTACCTTCGCTTGTAACCTAAGTTCTTGGCTGCTAATAAGTCTTTCCAATGCGATGCATTTTCCCGACATTATCATGTTTCAATGTGTCCACAACTAGGGTTCTTTGTTTTCTTCCATGTTAAGCCATAGGTTAGTGAGGTCAATCTCTTGCAACACTGTTGTTATGACACTATTGATAAGACACTTTTAGCCCTGTCAGTTTCACTTGGACCTGCTCAATTTATTCATATGTATGTGCCAAAATATTACTCCCTCTGTCCCATTTTATTCCTTACGTTTGGTATCATGCATGTGAATTTAAGCATAATAAAAAAGAGCTTTAATTCCTTAATTTTTTTAATTAATAATAAAATCTAGTTTCCTCATTAATTAAATGAGGTGAGTGGAGGGCTATGTTACTCGGACTCGGGTACCCATGTTGGACTCGGGTATGTATCCAAGTGTCCGACTTGGCTATTTTGTGAAAATATTTCATGATTTTGGTCCAAAATGAAGTTTCCATTGTCCGTATCCATGTCCGAGGTTCAAGGATATAACATGGGTACTTAAGATGAAATAAAGAGTCCTAAGTAACACTGGTGGAGTGAAGGAACGAGGAATGGTGAAGTGAATTCGTTTTTTGAGTATTTTGTTATATTTGTACACGTTTTTTTGTTGGAATCAACAACAACTAGACCTGTCAAACGGGTCGGTCGGGTCGGGTTGTAAAAAATTACTTTCGGGTTCGGGTTGAATCGGGTCGGTCACTTTCGGGTTTACAAATGCTTGTTCAAGACCCAGAACTTTCGGGTTCGGGTCGACCCAACGGGTTGAGGGATTTTAAAACGCGCATTATATTTTCATTAATTTATGTGATAAATATACAAAATATTGGCACAAATTAACAAATTTTCCTACGAAAATTCATATTTAGTCAAATTCAACCATAAAATGGCGTATAATTCAAATTAAAATCATATTACACACAACAATAGTAAAAACAACGTGTCTATTATGCTTAAATTTTCTCATAATGTCATTTATTACTATAAATACAATGATTTTCAATCGGTCGGGTCCAAAACGGGTTCGGTCGGGTTTTGACCCATTCCTTTTCGGGTTGCTCGGGTTCGGATAAAATCGGGTTACGGGTCACAAAATCTTGTTCAAGACCCAGTGTTTTCGGGTCGGGTTCTGGTCGGTTTTCGGGTCGGGTCGATTTTTGACAGCTCTAACAACAACAAAGCCTTAGTCCCAAAATGATTTGGGGTCGGCTAAAATGAATCGTCATAGGAGATCGTCATAAGGGATAATAAAAATAAATAAAGTTTAAAATGAATAAAATAATTAAAATAAGCACATTTCAAAAAAGCATTTTAAAAATAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAAATAAAATAAAAAAAAGGAGTCAAAATGGAAGATATATAAGTCACATGAACTCATCAACGTATATTCTCTCCCTCCACTCTTTCCTATCTAACGCCATACTCTCCTCAATCTCAAGTAGGCTCATATCGCGCTCAATCACCTTCCTCCAAGTTTTCTTAGGTCTTCCCCTACCGCTTGCAATTCTATCACTTTGCCAACCTTCTAGCCTCCTAACCGGGGCATCACTTGATCTTCTGCTTACATGCCAAAACCATCTTAAACGATTTTCCAGCATCTTAAACTCAATTGGTGCAACCCCTACTTTCTTCCTAATAATCTCATTACTCAAACGATCCTTTCTTGTATGCCCACACATCCAACGTAACATGCGCATCTCCGCCACATTCATCTTATGCACGTGACAATGTTTCACTGCCCAACATTCCGTGTTGTATAACAACGCCGGTCAAATTGCCGTTCGGTAGAGTTTTCTCTTCAATCTTTTTGGGGCATGCCTGGATCACATAGGAACCCCGTGACACTTTTCCACTTTAACCAGCCTGCTTTGATTCTATGAGCCACATCGCCATCCAATTCCCCATCCTTTTGGATAATAGATCTTAAATAACGGAACATTTCAGAACCTTGGACAATTTTCCAATCTAAGGTAATCGCCCCTGTCTCTCTGTCTTGGACTCCACTAAACTTACACTCCATATATTCCGTCTTGTTTCTACTCAGCCTAAAACCCCGAGATTCCAAAGTTCGTCTCCATAACTCCAACTTACTTTCCACTCCTTCTCTGGTTTGGAATATTGAAAGGAAATACTCCAAACGTAAAGAACATAAGGGGATGCGCAAACGAAATTACGTAAAGAAAAAAAAGGGACGATGAGAGTGGAAAGTAACTATTATGTTCATCTTAATTTAAGTCGGAAAAACCTTATAACACTTTTAAATTCCAAATTCCTGAAAACCTAACAACAACTTTTGCAATCTAATAGAGATCCCACACATCTTCACAATATATATGTGTGAAGATGTGTGGGATCTTCACAAAAGAGAGAAAAATGTTAGGTAACAATGCCAAATGTGACATGTAAGTAGGGGTAAAGTGGGTATTTAGCTTGTGAACACACCAAAAAGAATGTGAAAACATACCATGAGAGGAACTGGGGCAAGTAATGTAACTTCCATAAAAGGAAAATGGTGCAAGTAAAAAAACGGAGGAAGTACTTATATATCCCACTCATGGTAGTAAGTATCCTTTTCCTTTACCAGGAAAAGAGACTTTCTGATACACCGGTAGAGATTTAAGTAGCCTTCAAAACATACAAATTAAAGTTGAACCCCTTACTAGGTATTGAGCGTGTAGCGTGACAAATGAGGATCAGCTGGTAATTTATCAAACCCATACTCGCTTCACCACCCATGGCATGTGATTTCTCTATATCTTCCTCATTACTTATTATATACACATAATCAACATATTCTACATTGTATGTCATAACTGTTGGTTATCTGCTTGCAGTACTTAATCTTATCACAAAGTGTTGACACATTATCATGTCCAACCTTTTGCGTAAAGCAGAGGGGGTAAATTATGAAAACCCACTCCTCGTTTGTCCTTCATAGTTTGTATTAGGGAAGGGCTAAGGCCCTGATCTACTGCGTAAGTTCCTTGGTTTG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GCTAAATCTTAATCAAAGACTTCTGTGACGGACTGACGGGTTATCAAAATAGCCTTGAGATTGGCTCATCTGAGCAAATTCTCGGCGATTAACTAACGGATCATACCTCAGTCGCCAACACCCCCCTCCCCAATTATATCGCAGTTGGCCTGCAGAGGAGGAACTCAGGCGATGCCACCGCGACGGTAGCAGTGCGCTACCCATGCCAATGGTTGCTCTGACTGATCCTATATACCTCTGAGGGTGACCATTCATTCAGTTTTAATATCAATGGCGTCGAAGTCCAGGGGAAAGCAGCTCTCTTTCGAGATCCTCTCCTCCACTTATGCAGTCAACTCCGACTCAATCATCGATCGATCTTCTAACTCCGATCCCCTTATTCAAAACAATAAGTCCAATCGCCGGAGGCGGAAGCGAAAGCGGAAGAAATCCACCCCGAATTCACCAGCACCACATGAATTCTATACGATCTTCGATAACGGCGGCATTGATGAATTGGAGGAGAGGGAGTCTCCGTCGATGAACTCTCACAGTTACGCGGCATCGAGTTTCGTGGTTTGTGAGGTGAGAGAAGAGAGTTTGGGCACAGTTTGCCAGGTTTCGCAGGGGGAATTAAGGCAGAGAAATGTGAGTAGTGGTGGCAGTGGCGGAGATTTAGTGCCCCCGGTAGAGATACCGGAGGCGGAGGTGAAATCTAGACCTAATCTTATTAATGGCGGTAAATTGGATAAATCCGAGTCTTTAGATTGGAAGCGCTTTATGGCTGAAGAAGATCCTATGTATCCTTTTCCCGTGGAGAATTCGCCAATAAAATTCTTCATGGAAGAAATGTACAATGGAAATTCTATTAGAAGCACAACAACGCGAGGAACTGAGAAAGAAAGAGAGAGGGTTTATGATACTATCTTCCGCTTGCCATGGAGGTGTGAACTGCTTATTGACGTGGGCTACTTCGTTTGTTTAAATTCATTTTTGTCGTTGCTGACAATCATACCTATGAGAGCTCTGATGACGCTGTGGAGGTTCCTTACGAAAAGGCAGCCCAGAACACCTTCTGCAGCTGAGCTGTCAGATTTTGGTTGTCTTCTTGTACTAGCTGTTGGAGTTACGATTTTGGGGCGGACAGATATCAGCCTTATATACCATATGATTCGCGGTCAAGGAATTGTCAAGCTTTATGTTGTCTATAATGTTTTAGAGATCTTTGATAAACTAGGGCAAAGTTTTGGAGGTGATGTGTTTCAGACATTATTTAATTCTGCTGAGGGGCTTGCATGTTCTTCACCAGAGTCATCAGGATATTGGCTTGAAAGATACACAATTGATTTAATATTGGCTGCAGCTGCTTCAATTGTTCATTCTTTTATATTATTAGCTCAGGCAATCACCCTGTCAACCTGTATAGTGGCTCATAATAATGCTTTACTTGCTCTGCTAGTCTCAAACAATTTTGCGGAGATAAAAAGCAATGTATTCAAAAGACTCAGTAAAGATAATGTTCATGGCATTGTATATTCTGATTCAATAGAGAGGTTCCATATTTCAGCATTTGTCATATTTGTTCTGGCACAAAATATTCAGGAAGCTGAGGGCCCATGGTTTGGAAATTTCCTTTCCAATGCTCTCTTGGTTTATTTCTCTGAAATGGTAATTGATATCATCAAGCATTCATTTATTGCCAAATTCAATGACATAAAGCCCATTGTGTACTCGGAATTTCTTGAAGATCTATGCAAACAGACTATGAACATTGAGACTGACGGCGCAAAAAAGACACTTACTTTCGTTCCCGTGGCCCCAGCTTGTGTGGTCATCAGGGTGATCACCCCAGTATATGCTGCTCGTCTTCCATGCAGTCCCCTGCCTTGGAGATATTTCTGGATGATTTGTTTGACAATGTTGAGCTATGTGATGCTTGTGAGCCTGAAGGTGATGATAGGGATGGGTCTTCAGAAGCATGCAGCTTGGTACATCAAAAGGTGCCAGAAGAGGAAACTTCACTCTGATTAAATGTACATTGTTAAAGAAAAATGGACCTGGTTGCTGATGATGGGAAGTGGAGATCACCGCAGAAATGGTTTGCCTTTTAGGTATGGGATTGGTAAACACAGTTTGAGATTATACTCTGATTTAGATTACGAGTGAACTGTGCTGCAGAAATACCCGAGTTGATGGCATTACCTTAAAACTTCACAGTTGAACCACTGGAATTGCTTCAACAGGATTGTGTATTTAGTGGAAGAAGACACAAGTTAGTCATTCATGGCAACATTTGTTTGGGGTGAAAGCGATGAAATTTCACAAGGCCTATTGGTTGAACTCTGGGACAGGGAGAAAGGTTGCTCTAAGTTCATCCAAAGATGACTCAACTTGTAAAACTATTCGAGGTTCTTCGACATGAAATTGATATTGTCATTTGTGTATTGGACAGGGGGAAAAAAAGGTGGGAATGGAGATCATTGTTAATTAACAGAGAGCTCAATGCCTGAATATTGTTAATGTAATGGTGATGAGAAACTGAGAACAACTTGCTAGGTTTCCGATTAGCACAAGTCATACATACATATATCTCATAGAGAGGTTTTCTTGAAACAACTAGTTACATTAAAATATTAACCTAGACTTTCAGCATTTTGGCAAAAGAAAACGAAAAAGTATCTTCTAAAAGGCTTTAGAAGCTACCATATAAACGTAAACCTGGAGTTCATTTCATTTCAGGTTATCTGGGCTGCATGGAAAATTCAGGTGGATAAACTTCATAATAAATGCATCTATTGGACTTTTGCATTAT ATGGCGTCGAAGTCCAGGGGAAAGCAGCTCTCTTTCGAGATCCTCTCCTCCACTTATGCAGTCAACTCCGACTCAATCATCGATCGATCTTCTAACTCCGATCCCCTTATTCAAAACAATAAGTCCAATCGCCGGAGGCGGAAGCGAAAGCGGAAGAAATCCACCCCGAATTCACCAGCACCACATGAATTCTATACGATCTTCGATAACGGCGGCATTGATGAATTGGAGGAGAGGGAGTCTCCGTCGATGAACTCTCACAGTTACGCGGCATCGAGTTTCGTGGTTTGTGAGGTGAGAGAAGAGAGTTTGGGCACAGTTTGCCAGGTTTCGCAGGGGGAATTAAGGCAGAGAAATGTGAGTAGTGGTGGCAGTGGCGGAGATTTAGTGCCCCCGGTAGAGATACCGGAGGCGGAGGTGAAATCTAGACCTAATCTTATTAATGGCGGTAAATTGGATAAATCCGAGTCTTTAGATTGGAAGCGCTTTATGGCTGAAGAAGATCCTATGTATCCTTTTCCCGTGGAGAATTCGCCAATAAAATTCTTCATGGAAGAAATGTACAATGGAAATTCTATTAGAAGCACAACAACGCGAGGAACTGAGAAAGAAAGAGAGAGGGTTTATGATACTATCTTCCGCTTGCCATGGAGGTGTGAACTGCTTATTGACGTGGGCTACTTCGTTTGTTTAAATTCATTTTTGTCGTTGCTGACAATCATACCTATGAGAGCTCTGATGACGCTGTGGAGGTTCCTTACGAAAAGGCAGCCCAGAACACCTTCTGCAGCTGAGCTGTCAGATTTTGGTTGTCTTCTTGTACTAGCTGTTGGAGTTACGATTTTGGGGCGGACAGATATCAGCCTTATATACCATATGATTCGCGGTCAAGGAATTGTCAAGCTTTATGTTGTCTATAATGTTTTAGAGATCTTTGATAAACTAGGGCAAAGTTTTGGAGGTGATGTGTTTCAGACATTATTTAATTCTGCTGAGGGGCTTGCATGTTCTTCACCAGAGTCATCAGGATATTGGCTTGAAAGATACACAATTGATTTAATATTGGCTGCAGCTGCTTCAATTGTTCATTCTTTTATATTATTAGCTCAGGCAATCACCCTGTCAACCTGTATAGTGGCTCATAATAATGCTTTACTTGCTCTGCTAGTCTCAAACAATTTTGCGGAGATAAAAAGCAATGTATTCAAAAGACTCAGTAAAGATAATGTTCATGGCATTGTATATTCTGATTCAATAGAGAGGTTCCATATTTCAGCATTTGTCATATTTGTTCTGGCACAAAATATTCAGGAAGCTGAGGGCCCATGGTTTGGAAATTTCCTTTCCAATGCTCTCTTGGTTTATTTCTCTGAAATGGTAATTGATATCATCAAGCATTCATTTATTGCCAAATTCAATGACATAAAGCCCATTGTGTACTCGGAATTTCTTGAAGATCTATGCAAACAGACTATGAACATTGAGACTGACGGCGCAAAAAAGACACTTACTTTCGTTCCCGTGGCCCCAGCTTGTGTGGTCATCAGGGTGATCACCCCAGTATATGCTGCTCGTCTTCCATGCAGTCCCCTGCCTTGGAGATATTTCTGGATGATTTGTTTGACAATGTTGAGCTATGTGATGCTTGTGAGCCTGAAGGTGATGATAGGGATGGGTCTTCAGAAGCATGCAGCTTGGTACATCAAAAGGTGCCAGAAGAGGAAACTTCACTCTGATTAA MASKSRGKQLSFEILSSTYAVNSDSIIDRSSNSDPLIQNNKSNRRRRKRKRKKSTPNSPAPHEFYTIFDNGGIDELEERESPSMNSHSYAASSFVVCEVREESLGTVCQVSQGELRQRNVSSGGSGGDLVPPVEIPEAEVKSRPNLINGGKLDKSESLDWKRFMAEEDPMYPFPVENSPIKFFMEEMYNGNSIRSTTTRGTEKERERVYDTIFRLPWRCELLIDVGYFVCLNSFLSLLTIIPMRALMTLWRFLTKRQPRTPSAAELSDFGCLLVLAVGVTILGRTDISLIYHMIRGQGIVKLYVVYNVLEIFDKLGQSFGGDVFQTLFNSAEGLACSSPESSGYWLERYTIDLILAAAASIVHSFILLAQAITLSTCIVAHNNALLALLVSNNFAEIKSNVFKRLSKDNVHGIVYSDSIERFHISAFVIFVLAQNIQEAEGPWFGNFLSNALLVYFSEMVIDIIKHSFIAKFNDIKPIVYSEFLEDLCKQTMNIETDGAKKTLTFVPVAPACVVIRVITPVYAARLPCSPLPWRYFWMICLTMLSYVMLVSLKVMIGMGLQKHAAWYIKRCQKRKLHSD Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo04540.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902191295|gb|KNA11813.1| (hypothetical protein SOVF_131650 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1130.5 bits (2923), Expect = 0.000e+0 Identity = 579/579 (100.00%), Postives = 579/579 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731351940|ref|XP_010687285.1| (PREDICTED: protein POLLEN DEFECTIVE IN GUIDANCE 1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 923.7 bits (2386), Expect = 1.600e-265 Identity = 487/592 (82.26%), Postives = 525/592 (88.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225424426|ref|XP_002281514.1| (PREDICTED: protein POLLEN DEFECTIVE IN GUIDANCE 1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 690.6 bits (1781), Expect = 2.300e-195 Identity = 386/619 (62.36%), Postives = 460/619 (74.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. NCBI nr
Match: gi|596127626|ref|XP_007222038.1| (hypothetical protein PRUPE_ppa003049mg [Prunus persica]) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 3.000e-195 Identity = 381/605 (62.98%), Postives = 446/605 (73.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. NCBI nr
Match: gi|297737600|emb|CBI26801.3| (unnamed protein product [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 684.1 bits (1764), Expect = 2.100e-193 Identity = 385/623 (61.80%), Postives = 460/623 (73.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QYP0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_131650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1130.5 bits (2923), Expect = 0.000e+0 Identity = 579/579 (100.00%), Postives = 579/579 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8BQJ0_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_8g189080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 923.7 bits (2386), Expect = 1.100e-265 Identity = 487/592 (82.26%), Postives = 525/592 (88.68%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: M5XAV8_PRUPE (Uncharacterized protein OS=Prunus persica GN=PRUPE_ppa003049mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 2.100e-195 Identity = 381/605 (62.98%), Postives = 446/605 (73.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: D7T8I0_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_01s0011g06070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 684.1 bits (1764), Expect = 1.500e-193 Identity = 385/623 (61.80%), Postives = 460/623 (73.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4W5L9_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10014689mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 675.2 bits (1741), Expect = 6.900e-191 Identity = 373/598 (62.37%), Postives = 445/598 (74.41%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: POD1_ARATH (Protein POLLEN DEFECTIVE IN GUIDANCE 1 OS=Arabidopsis thaliana GN=POD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 6.600e-171 Identity = 347/625 (55.52%), Postives = 424/625 (67.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TAPT1_DICDI (Protein TAPT1 homolog OS=Dictyostelium discoideum GN=DDB_G0277313 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 7.400e-45 Identity = 126/377 (33.42%), Postives = 198/377 (52.52%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TAPT1_HUMAN (Transmembrane anterior posterior transformation protein 1 homolog OS=Homo sapiens GN=TAPT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 7.400e-45 Identity = 132/418 (31.58%), Postives = 221/418 (52.87%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TAPT1_MOUSE (Transmembrane anterior posterior transformation protein 1 OS=Mus musculus GN=Tapt1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 9.600e-45 Identity = 131/418 (31.34%), Postives = 221/418 (52.87%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: TAPT1_XENLA (Transmembrane anterior posterior transformation protein 1 homolog OS=Xenopus laevis GN=tapt1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 182.6 bits (462), Expect = 1.300e-44 Identity = 126/392 (32.14%), Postives = 213/392 (54.34%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04540.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G67960.1 (Membrane protein,Tapt1/CMV receptor (InterPro:IPR008010)) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 3.700e-172 Identity = 347/625 (55.52%), Postives = 424/625 (67.84%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04540.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo04540.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo04540.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo04540.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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