Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAGAAAAAAACCTGAACTGCCGAGGCCGCTAGGCACGGACCTGTTGGGGACCGAACTGCCGAAGGCATATGCGCGCGGGGTTCAACTGCGATTTACCAAATTACGCCTTACTCTAGTTTTACACAACCCTTAAAGGTAATTTCTCTCAATTCCTATTTCCTGGGGTTCTACAGTTATTAATTCACGAGATATCTGCGAAGTTAGGTTTTTTTTTTTTTATTGAATTTTGGCGCTTTTTTTCTCTCCAGATGGGCAGGATTAAGAAGAAACCCCGGCGTTCTGTGAGAGTTTTGGAAAATGGGAGTACCAGCAATTCTGGAGATAATTCAGCAAACCCAGATTTTAATTTAGTTGATGAGCTCAAAGTTGGTGATCATGGTAATATTCAAGATACCCCCTTTATTGTTGATGTTGATAGGAGTAGTTGGGATTCATTGGAACATAGAGATTTATCTGAAATTGTGCTCAGTAATTTAAATTTTAGTCCTGAATTTATTGGGTTTGAGCTGAATGAGGAAACTTGCTTAAGGGTTAGGATATGTAACGTGAATGAGCATTTGGCTCGGATGAAATCAGGGCATTGGCCTGTGTTTTTGTCTGAAAACATATTTTTGGAGATTATTAATAAGAGGGTAGTTGACGAAATTGAAGCCGGTGATGTGATTGTAAGTGGGCAGTTTGATGGGAGTGATGATGGGATCACTGGGTTAGTTCATCTAGTTAGTATGAAGTTTTTGACTCTGAGGCCGGTTTTTGGGGTTTGGTTATGCGAGGATGTGTCTTCTCTTAGGATTAGGGTGGAGATTCTTCAGAATACATTTAGTGCTTGCAAATCACTTCAAGATAACACTAGGCACGCATGGAAGAAAAGCATGATGAGTGTAATGGCTTGGCTTCGGCCTGAGCTGACAACCTCTGAGGCTCGGTATGGGGTTCATGTATCTAGTGAAATTGAAGAAGATTCGATTTCAAAGGTAGATAACAGCAGTTCCGAACGTTCTAATTTTGATGTTAGTAGATTTTATGAAGCCATTAAGCGATCAAAGTGAGTGTCTATATGGAACTTTTGAAATATGTGTGCTTCTATGAGTTACTTCACCATTTATGCTTATTGTATTACATTCATTTCTGTAGAGATTGTCCTATGTTGGATGCTGAGTTGACCGACTTGCTCCCTGAGCTTAGACCATATCAACGTCGGGCTGCTTATTGGATGGTACAAAGGGAGAGGGGTTTTTTGCAGAATTCGTCTGCATGGGAACGTACAATTTCTTGTTCTCCTTTGTGTGTGGCTGTGTATTTTCTGGATTCTCCGTCGAAGATGTTCTACAACCCATTTTGGTATGTCTTTGGAGTTCTTGTTTTTTGGTAACATATTCTCTATACCCTCTCCCACCAAAAACAACTCATTTACTTCAGAAGATGAAGAGGAAATCCCTATTATTTTAGGTAATTTATGAGTAGAAATTGGGTCCAGTAATTAGTAATTACATAAATGATTGGACAATGGCACTTACTCTAGTCTGGGACTGGTAGTACCCATTATTACCATAAGCAAGGTTTTTGCGAAGGTCAATATGCACACAACTTTACCCTTTAACTATTTGAGCGGTTGTTTCGAACTAATAATCGTAATTAACATTTTCTTTGAGCAATAAAGTCATAATGAAACATTCTGGGATAAGCATGAGTGATAAGGAAAGGATGATGGTGGTAAAATTTGCTACTAATAATTCATTTAATAGTGATAATGATGTTAACACAATAACACTAGTAATCTTATACTGTTAACTATGAGAATGAAAATGCAATGACAAACTAAAGAATAAATGCTAGATGAACAACAGTGTGATATCAGGGAAAAGATAAAGGTAATATAAGATGTACACTCTGGTAGAAAAGTTTAAGAAATAATCTTACGTACCTGCTAAACGTAAAGCACGGCTTCTGGAGGGGAAGGGTAGACAAGAAACATAGATTGTAATTACCCTCCATTTTGTGAAACCAATAAAAATTTGTTTTTATATAAAAGAACACGAGGAATAGGATCTAGCTAATTGGTATTTTTCATTAAGTGGAAAAAATCATTTGGTAAGGTTGCGGTTATCCATTACGCATTGCAATGTCAAGAGATTTGCTGGGAGAAATTGAAGAAACATGAATCACATGTGCAAAATTTTAGAATCACTATTTGGATGCCTATCATAATAGGTACTCCCTCCGTCCCGGATTACTCGACCCGGTTTGACCGGCACAGAGTTTAAGGGACTTGAATTGACTTATTTAATTTAATAGGTAGTAGTTGATAGTGGGGTATTATTTTAATGTAGTTAGTGGGAAATGGGTAAAGGGGTGGGGTTGGAGGAGAGTAGGGGTTGAATTTTTAATTATTTTTTGTATGTAGTAGGGGTAGGTGGGTTAATAGGGTTGGAGTGAGAAATAATATAATATTGTTAGAATATTTCCATTTTTAGAAACAGGTCAAGTATTAAGGGACGGCCCGATAAGGAAAACAGGTCAAGTATTCCGGGACGGAGGGAGTATTCAAGAGGTGATCTTTGTGGAATTTGTAAGATGTTGTTGGTATTAGCCCTCTTATGTGTTAATACTTGCGATTTCATTTTGCTTCTATGTTTAGTGTTGACAATACACAACATATAGATTGCTTAATGGATCATATAATTTGTATATTATATTACTACTTGAAGCTAAATTACGAAGTTAACAATTCTTAAGTTTCTAATTTATATGAAGATATTTGGAAAGGGTGATTGTGGTTCTGATCATCGTATATTGAAGGCTTACCTATGAGGGGATGCAATAGGATTTTGTGGAGTGAAGAAGAATGTTATCTTACTAGGAATTACTAGACCAAATAAATGAATTCGCCTTGTAGAGGACTAGATGAGGGTTGGGGAGTCATTTAAGCATTAGTTATAAAGACCAAACTCTTAGGATGGGGATCAATTGACATGTGGAAAGTTTAATTGATTTGTTGTTTAACCTTTTGAGTCTCACCTTTGCAAGATGGTCATACTTTATTATTTTCATCTCAACTCATGAGTTCCATCTCATATATATTAGGGTTATTTATGTACTCCTATAATTGCCATTGCCGTTTAAGTTTCATTTTATTTTCAGGAGGACAAATTCTTTAGAACCAACTTTGAGATATGGGAGTCCACAAATTTTGTTAGTTTAAAGTTTTTGTTTGGGTGTAGCATTGAGAAAAAGAATAATGCAAAGTAATACATCAATGAACTTTATATTCTAATGTATTAATTCAGTGTGAAACAAGCTTAATTCAGTGTGAAACAAGCAATTTCCTCTACTTATGGCTCATGTGAGCCATTTGAGATTTCTAAATACTTATAGGATCAACGGTCATTCTGGATTTGTCAAAGTATCACCGCAGAGACGTAGACTAGACTCATGTGCCATGTTTCAAGTGGTTAATTATCTTTGATTGTTATCCTTTTTGATGCCTTTACTGCCCTAGTTGTCAAGTTAAGCATTTTAGTAACAACATTGTGGAACGAGTAGCCAAAATGCTTGTAAAAAGTCCTTTCCTCTTGCTGTGAATGGCTACTGAATGGAATTATTCAAGTGACGATCCTCTTATGTGGTTGCTGCGAATGGCTACTTAATGGAGTTATTCAAATGCATCACCACTAACTTTTACTATGTGTTTGGATAGGAAGATAGAAGGGAAAGAGAGAAAGGGAAAAAGGAGGAAGGGAAGGGGAAAGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGNGGGGGGGGGGGGGGGTGGAGGTAAGCTCTATTTTCCCTCCAAATCTCTCCAATTTTAGAGGGATGGTGTTTATTCAATAGTGATATGGTTAACCTAGACTTTATGCGAAGAATTCAAAAGAGAGAAGTCGAAATGACATTGAAAAAGATGGAACGCAAGAGGGCAGTGGGGCCCGATGACATACCTATCGAAGTATGTAGATGTTTGGGAGAGAGAGGGGTTGTATGGTTAACAACTCTTTTCAACAAGATTTGGGGAGGTAATAGGATGCCATTAGAGTTGAGGAAAAGTACTATCAACCCCTTGTACAAGAATAAGGGTGCTATCCAGGATTGTGCCAACTATCGAGGAATCAAACTAATGAGTCATACTATGAAACTTTGGGAGCGGATTATTGAGCAATTAAGGAGAACTGTGAAGATTTCAGAGAACCAGTTTGGATTTATGCCTGGGAGATCGACTATGGAGGTCATTAATCTTATAAGGCAACTAATGGAGAATTATCGAGATAAGAAGAAGGATTTACATATGGTTTTCATTGATTTGGAGAAGGTGTATGATAAGGTACCGAGGGAAATTCTTTGGTAGGCATTAAGTAGGAAAGGAATTCCGAGGAAGTATATTGATATCATTAAGGACATGTATGAGGGAGTTAGCACGAGTGTGCGGACCAGTGTTGGTAAGACCGAAGAATTCCCCATTACGATTAGAGTGCATCAAGGTTCCGCACTTAGCCCTTTTCTTTTTGCTATAGTCATGGACGAATTGATGAGGTCAATTCAAGATGGTATACCCTGGTGCATGATGTTTGCAGATGATATTGTGTTGATTGATGAAATAAAAGAAGGAGTGGAAAGTAAGTTGGAGTTATGGAGACAAACTTTGGAATCTCGAGGTTTTAGGCTGAATAGAAACAAGACGGAATATATGGAATGTAAGTTTAGTGGTGTCCAAGACAGAGAGACAGGGGCGATTACCTTCGATGGGAAAATTGTCCAAGGCTCTGAAATGTTCCTTGTTTAGGATCTATTATCCAAAAGGATGGGGAGTTGGATGGGGAGTTGGCTCATAGAATCAAAGCTTGAAGTGGAAAAGTGTCATGGGGATCCTATGTGATCTAGGCATGCCCCAAAGATTGAAGGGAAAATTCTACCGTACGACAATTCGACCGGCGTTGTACGACACGGAATGCGGGGCAGTGAAACATTGTCACGTGCATAA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ATGGGCAGGATTAAGAAGAAACCCCGGCGTTCTGTGAGAGTTTTGGAAAATGGGAGTACCAGCAATTCTGGAGATAATTCAGCAAACCCAGATTTTAATTTAGTTGATGAGCTCAAAGTTGGTGATCATGGTAATATTCAAGATACCCCCTTTATTGTTGATGTTGATAGGAGTAGTTGGGATTCATTGGAACATAGAGATTTATCTGAAATTGTGCTCAGTAATTTAAATTTTAGTCCTGAATTTATTGGGTTTGAGCTGAATGAGGAAACTTGCTTAAGGGTTAGGATATGTAACGTGAATGAGCATTTGGCTCGGATGAAATCAGGGCATTGGCCTGTGTTTTTGTCTGAAAACATATTTTTGGAGATTATTAATAAGAGGGTAGTTGACGAAATTGAAGCCGGTGATGTGATTGTAAGTGGGCAGTTTGATGGGAGTGATGATGGGATCACTGGGTTAGTTCATCTAGTTAGTATGAAGTTTTTGACTCTGAGGCCGGTTTTTGGGGTTTGGTTATGCGAGGATGTGTCTTCTCTTAGGATTAGGGTGGAGATTCTTCAGAATACATTTAGTGCTTGCAAATCACTTCAAGATAACACTAGGCACGCATGGAAGAAAAGCATGATGAGTGTAATGGCTTGGCTTCGGCCTGAGCTGACAACCTCTGAGGCTCGGTATGGGGTTCATGTATCTAGTGAAATTGAAGAAGATTCGATTTCAAAGGTAGATAACAGCAGTTCCGAACGTTCTAATTTTGATGTTAGTAGATTTTATGAAGCCATTAAGCGATCAAAAGATTGTCCTATGTTGGATGCTGAGTTGACCGACTTGCTCCCTGAGCTTAGACCATATCAACGTCGGGCTGCTTATTGGATGGTACAAAGGGAGAGGGGTTTTTTGCAGAATTCGTCTGCATGGGAACGTACAATTTCTTGTTCTCCTTTGTGTGTGGCTGTGTATTTTCTGGATTCTCCGTCGAAGATGTTCTACAACCCATTTTGTGGGAACGTTTCCGCTTGTGAAGAGATCCCCCCTTCGGTCGTTGGCGGTATTCTTGCTGATGAAATGGGCATGGGGAAAACTGTTGAGCTTCTTGCATGTATATTAGCTCATCGCAAGTCATTACCTGAACAAGGTTGTTGTCCAGGAGGTAAATCAGATAATACCGAGACGGAGAAAACCAGGCTTAAAAGACTGAAAAGAGAGCGTGTTGAATGTGTATGTGGTGCACTTAGTGAAAGTTACAAGTATGAAGGATTGTGGGTCCAGTGTGATGTCTGTGATGCGTGGCAGCATGCAGATTGTGTTGGTTATTCACCCTCCAAAGGAATAAACGGAACTAAGGAAGCTTCTGAAGGACAACACAATAATAAGAGAAGGAAAAAGAATGTTGCTGACATTATCATGATGAATGACGAGTATGTGTGCCAAATTTGCTTGCAGTTGATGCAAGCTACTAGCTCTCCGATTGAGTCTGCAGCAACCCTTATTATATGTCCTGCTCCCATACTGCCTCAGTGGCATGCTGAAATACTTCGTCATACAAATCCAGGGTCCATGAGAACTTATATCTACGAAGGTGTGAAAGAAATTTCGTTATCAAATTCCTCTACTATTGATATTAGTGAACTAGTCTCTGCTGACATTGTGCTGACGACATATGATGTGCTGAGAGATGATCTATCACATGATTCAGAGAGGCATGAAGGGGATCGTCGCTTAATGAGATATGGAAAAAGGTATCCTGTGGTTCCAACCCTTCTGACCAGGGTGTTATGGTGGAGAATTTGCTTAGATGAGGCTCAAATGGTGGAGAATAATGTTGTTGCCGCAGCAGAGATGGCACTGCGTCTACGTGCAACACATCGCTGGTGTATTACTGGAACACCTATCCAAAGGAAACTAGATGATTTATATGGTCTCCTCAAATTCCTTAAAGCGAGTCCATTTGATATTTCTAGGTGGTGGGCTGAAGTTATACGAGAACCATATGAGCGAAAGAATGTGGCAGCTATGGCATTCACACATCGGTTATTCAGACAATTGATGTGGCGCTCCTCAAAGTCACACGTTGCAGATGAGCTTGAACTTCCTCCACAAGAGGAACAGGTCTCCTGGCTTTCTTTTTATGCAGTTGAAGAGCACTTCTACCAGAGGCAACATGAAACTTGTGTGCATTTTGCTCGTGAAGTTCTTGAAAGGTTCAAAAGTGATATTCTGAATAGAAATTGCTCAGCCTCTTCGTCGTCTGTATCTGATCCCTTTATTACCCATTTGGAGGCCACAAAGTTGCTTAACTCACTTCTGAAGCTTCGTCAAGCTTGCTGCCACCCTCAAGTTGGAGGATCTGGAATACGTTCTCTCCAACGGTCGCCCATGACCATGGATGAAATATTATCTGTCCTTATTAGTAAAACTAAGTTAGAGGGGGAGGATGCGTTAAGGAAAGTAGTTTCTTCATTGAATGGGCTTGCGGGTATAGCGATTCTCCAAGGTGAACTATCTAATGCAGCATCTTTTTACAAAGAAGCATTAGCTTTAGCTGAAGACCATGCTGAAGATTTCCGCGTGGACCCTTTGTTAAATCTTCACATACATCACAATCTTTCTGAGGTTATCAAATCTGCTTCAAATACCTTGCAACAAGTATCCTTTTGTGGGGGCCAGCTAAAAGGAATAATTGAAGACACGCCTTCTCAAACTGCAGGTCCTGATCGCATAAAGAAGAAACAAAAAGTTACTGAGGATATCTTGGAGAGGGTCGGGCATACTGATGAACCCTCTGGACTGAACTGTAGTTCTTCAACAGATGGATCAGAAGGGGTTAAAGTTTTTCATTTAAATCCCCATGCACCACATGTCTCTAGTACTGAAAGCCTGATCATTATATGTGAGGATCTAAGACAAAAGTACTTATCTGGATTTTACACAAGGTTGTCACAAGCTCAGCAGGAGTTCCAGAAGTCATATATGCAGGTTTGTGACTCTTTAAACAACAGTGAAAATAAGAACAGAGTCTGGTGGCTGGGAGCCCTCCAACAAATTGAACAGAACAAAGATGCAGCTAATGAGTTGTCACGGAGGATTGAAAATGCTATTTTAGACAACCAGAACATCACAAAATCATCAAAAACTTCCTCCTGTTTCCGGAGTATTAGTGCACTTAAATATTCCATTCAAAGTGGTTTAGACTCACTTGAAGCTTCTCGGAAAAGGTTATTAGCTAAACTGTTGGAAGTTGATCAGACAATGGAGAAACCAAGAGATGAAGATGTTGAACGTGTACGGTACTGTCCAAATTGCTATGAGAATGTGGATGGTAGTCTGTGTGTTCATTGTGAATTGGATAAGTTATTCCAGGCTTATGAGGCTAGGCTCTTTCTAAGAAAAGAGAAAAATGGAGGAGTTATCTCGTCCGCTGAGGAGGCAGTAGATCTACAGATGAAAAGGTTAGAGAGGAATCATTTTTACTGGAATCTGGAGCAGAAGTCGAACAATTATACATCATCAAGTGCAGATAATCTAGGCAAAAGTAAAAGGGATTCTGGGAAAATGTCCATGGATTCAAAATTCCCCTCTGAGCTAGAAATAATCCTTGGTGTTATAAGGAGTTATTTTAGGGCAAACTTAGGGAGAGAAGGTGTATCAGCGGCCAGCAGACACCTGGTTCTTCTTGAGGGAATGAAGAAGGAATATGCTCATGCAAGATCGTTGGCTACTGCTCAAGCTCAGATTCTTCGTGCATATGATGAAATTAAGATGGCAACTTCAAGATTACGCTTAAAAGAAAATGATGATGATAACTCTATTGATGCTCTAAGCCTAGAAGAACTTGATGTTGCTAACGTCGAGAATTCGAGTGAAAAATTTGTGTCATTGGCAACATTATCGCGTATACGAGGAAAACTTCGTTATTTACAGGGACTAGTAGTTTCTAAACATAAAGCAGAATCAGATAATGAGGTAGCTGCTTCAATAGATTCTCCTCCATCAGATAACAACAATATCAGAGTGGTTGAGGAAATGTGTCCTGTATGTCAAGAAATTCTTCAAAATCAAAAAATGGTGTTTCAGTGTGGACATTTAACGTGCTGCAAATGTTTATTTGCAATAACTGAGCGAAAGATGGTTTCCCATGGAAAGATGAGTGATAATTGGGTGATTTGCCCTACTTGCCGGCAACCTTCAGATTTTGAGAGTATTGCCTTTGCTGATGATAGCCAGAACAAGTGCTCGGTTGGGAGGAGTGAAAATCTAGAGGCTTCTGTATCTGTCCGGGGATCATATGGTACAAAGATTGAAGCAATTACGAGGAGAATCTTGTGGATTAAATCGAGCGACCCAAAGGCTAAAGTTCTTGTTTTCTCTAGTTGGAATGACGTCCTTGACGTGTTGGAGCATGCGTTTTCTACTAATGAGATTAGCTACGTTCGTATGAAAGGAGGAAGAAAACCATCACAAGCTGCTTTAAGCATATTCAAAGGAGAAAAGATGACACAAAAGGGTTGTGGCAAGATGAATGACAAACAGAAGCAAGATGCTAAGTTTATTCAAGTGTTACTCCTCTTAATTCAGCATGGAGCAAATGGCTTGAATCTCCTCGAAGCACAGCATGTCATTCTGGTTGAGCCCCTACTCAATCCAGCAGCTGAAGCTCAAGCAATCAGCAGAGTGCATCGGGTTGGGCAGACTAGAAAAACACTCGTTCATCGGTTCCTAATTAAGGATACAGTTGAAGAAAGCATTTACAAGTTGAACAAAAGTAGAAATTCCAGTTGTTTCATTAGTGGAAATAAGAAGAATCAAGATGAGCCTATTTTGACACTGAAAGATGTCGAGTCCTTGTTTGCAGTATCACCGGATAGTAATAACGAGCAAAGCAGTAGTCTAACACATTTACCGCCTTCTGTGGCTGCTGCCATTGCGGCTGAGAGAAGGCTTGACCAATCTACAATGCCATTATAG MGRIKKKPRRSVRVLENGSTSNSGDNSANPDFNLVDELKVGDHGNIQDTPFIVDVDRSSWDSLEHRDLSEIVLSNLNFSPEFIGFELNEETCLRVRICNVNEHLARMKSGHWPVFLSENIFLEIINKRVVDEIEAGDVIVSGQFDGSDDGITGLVHLVSMKFLTLRPVFGVWLCEDVSSLRIRVEILQNTFSACKSLQDNTRHAWKKSMMSVMAWLRPELTTSEARYGVHVSSEIEEDSISKVDNSSSERSNFDVSRFYEAIKRSKDCPMLDAELTDLLPELRPYQRRAAYWMVQRERGFLQNSSAWERTISCSPLCVAVYFLDSPSKMFYNPFCGNVSACEEIPPSVVGGILADEMGMGKTVELLACILAHRKSLPEQGCCPGGKSDNTETEKTRLKRLKRERVECVCGALSESYKYEGLWVQCDVCDAWQHADCVGYSPSKGINGTKEASEGQHNNKRRKKNVADIIMMNDEYVCQICLQLMQATSSPIESAATLIICPAPILPQWHAEILRHTNPGSMRTYIYEGVKEISLSNSSTIDISELVSADIVLTTYDVLRDDLSHDSERHEGDRRLMRYGKRYPVVPTLLTRVLWWRICLDEAQMVENNVVAAAEMALRLRATHRWCITGTPIQRKLDDLYGLLKFLKASPFDISRWWAEVIREPYERKNVAAMAFTHRLFRQLMWRSSKSHVADELELPPQEEQVSWLSFYAVEEHFYQRQHETCVHFAREVLERFKSDILNRNCSASSSSVSDPFITHLEATKLLNSLLKLRQACCHPQVGGSGIRSLQRSPMTMDEILSVLISKTKLEGEDALRKVVSSLNGLAGIAILQGELSNAASFYKEALALAEDHAEDFRVDPLLNLHIHHNLSEVIKSASNTLQQVSFCGGQLKGIIEDTPSQTAGPDRIKKKQKVTEDILERVGHTDEPSGLNCSSSTDGSEGVKVFHLNPHAPHVSSTESLIIICEDLRQKYLSGFYTRLSQAQQEFQKSYMQVCDSLNNSENKNRVWWLGALQQIEQNKDAANELSRRIENAILDNQNITKSSKTSSCFRSISALKYSIQSGLDSLEASRKRLLAKLLEVDQTMEKPRDEDVERVRYCPNCYENVDGSLCVHCELDKLFQAYEARLFLRKEKNGGVISSAEEAVDLQMKRLERNHFYWNLEQKSNNYTSSSADNLGKSKRDSGKMSMDSKFPSELEIILGVIRSYFRANLGREGVSAASRHLVLLEGMKKEYAHARSLATAQAQILRAYDEIKMATSRLRLKENDDDNSIDALSLEELDVANVENSSEKFVSLATLSRIRGKLRYLQGLVVSKHKAESDNEVAASIDSPPSDNNNIRVVEEMCPVCQEILQNQKMVFQCGHLTCCKCLFAITERKMVSHGKMSDNWVICPTCRQPSDFESIAFADDSQNKCSVGRSENLEASVSVRGSYGTKIEAITRRILWIKSSDPKAKVLVFSSWNDVLDVLEHAFSTNEISYVRMKGGRKPSQAALSIFKGEKMTQKGCGKMNDKQKQDAKFIQVLLLLIQHGANGLNLLEAQHVILVEPLLNPAAEAQAISRVHRVGQTRKTLVHRFLIKDTVEESIYKLNKSRNSSCFISGNKKNQDEPILTLKDVESLFAVSPDSNNEQSSSLTHLPPSVAAAIAAERRLDQSTMPL Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo04258.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902171617|gb|KNA08021.1| (hypothetical protein SOVF_166360 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 3275.3 bits (8491), Expect = 0.000e+0 Identity = 1655/1655 (100.00%), Postives = 1655/1655 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731319064|ref|XP_010670056.1| (PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 2534.6 bits (6568), Expect = 0.000e+0 Identity = 1293/1665 (77.66%), Postives = 1450/1665 (87.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731411876|ref|XP_010658167.1| (PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1904.0 bits (4931), Expect = 0.000e+0 Identity = 1014/1706 (59.44%), Postives = 1264/1706 (74.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. NCBI nr
Match: gi|590570575|ref|XP_007011377.1| (Zinc ion binding,DNA binding,helicases,ATP binding,nucleic acid binding isoform 1 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 1838.5 bits (4761), Expect = 0.000e+0 Identity = 973/1695 (57.40%), Postives = 1239/1695 (73.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. NCBI nr
Match: gi|567886852|ref|XP_006435948.1| (hypothetical protein CICLE_v10030489mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 1825.8 bits (4728), Expect = 0.000e+0 Identity = 967/1693 (57.12%), Postives = 1236/1693 (73.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QN47_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_166360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3275.3 bits (8491), Expect = 0.000e+0 Identity = 1655/1655 (100.00%), Postives = 1655/1655 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8CUZ4_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g038790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2534.6 bits (6568), Expect = 0.000e+0 Identity = 1293/1665 (77.66%), Postives = 1450/1665 (87.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061FTR3_THECC (Zinc ion binding,DNA binding,helicases,ATP binding,nucleic acid binding isoform 1 OS=Theobroma cacao GN=TCM_045563 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1838.5 bits (4761), Expect = 0.000e+0 Identity = 973/1695 (57.40%), Postives = 1239/1695 (73.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4SN52_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10030489mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1825.8 bits (4728), Expect = 0.000e+0 Identity = 967/1693 (57.12%), Postives = 1236/1693 (73.01%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A061FTA5_THECC (Zinc ion binding,DNA binding,helicases,ATP binding,nucleic acid binding isoform 2 OS=Theobroma cacao GN=TCM_045563 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1822.0 bits (4718), Expect = 0.000e+0 Identity = 966/1693 (57.06%), Postives = 1232/1693 (72.77%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SHPRH_HUMAN (E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH OS=Homo sapiens GN=SHPRH PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 321.6 bits (823), Expect = 4.900e-86 Identity = 186/473 (39.32%), Postives = 256/473 (54.12%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SHPRH_MOUSE (E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH OS=Mus musculus GN=Shprh PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 5.500e-85 Identity = 191/474 (40.30%), Postives = 258/474 (54.43%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: YIV5_SCHPO (Uncharacterized ATP-dependent helicase C144.05 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) GN=SPAC144.05 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 152.1 bits (383), Expect = 5.200e-35 Identity = 112/359 (31.20%), Postives = 177/359 (49.30%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SM3L2_ARATH (Putative SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 3-like 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=At5g22750 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 2.000e-31 Identity = 91/296 (30.74%), Postives = 136/296 (45.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: SM3L3_ARATH (Putative SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 3-like 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=At5g43530 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 5.600e-29 Identity = 91/302 (30.13%), Postives = 134/302 (44.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G40770.1 (zinc ion binding;DNA binding;helicases;ATP binding;nucleic acid binding) HSP 1 Score: 1679.8 bits (4349), Expect = 0.000e+0 Identity = 925/1693 (54.64%), Postives = 1194/1693 (70.53%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G22750.1 (DNA/RNA helicase protein) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 1.100e-32 Identity = 91/296 (30.74%), Postives = 136/296 (45.95%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G43530.1 (Helicase protein with RING/U-box domain) HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 3.100e-30 Identity = 91/302 (30.13%), Postives = 134/302 (44.37%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G61140.1 (SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein / zinc finger protein-related) HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 1.500e-27 Identity = 116/462 (25.11%), Postives = 184/462 (39.83%), Query Frame = 1
BLAST of Spo04258.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G20010.1 (SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein / zinc finger protein-related) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 6.100e-26 Identity = 89/327 (27.22%), Postives = 141/327 (43.12%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo04258.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo04258.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo04258.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo04258.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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