Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGAGTGGGGGCCAAAAACTAAAGAAGATGCCAACTCCATAAAATCAACGTGTTCTGCACTTTCCACTTCTCCCCCCTTCTTCCCCTTCGTTCTCTCTCCATTTTCACCTCTCCATCTTCTTCTTCCTAATTTCTTCTAATCAAATAATTAAATTACCTTTTACTTCATCATAATTCCCAGTTTCTAAAGAAAATTCAACAACCAATTCAATTTCACAAAGGTATGTACTCAATTTTCCAATTTTCTTTAATTTAATAAATTTGAAGTCTGTTCTAATGGTGGTTTGGTGAAGAAATTAAAACTTCAACTCAATTTTGCAGGATTGAAAAAAATAAACCCAGAAAAACGTGAATAATGTTAACGTGCATAGCTCGTCCGAAGCAACAACAGGGGCATAACAGTCATCATCATAATCATCAACATCAACACGACGATCCAGACTCCGTTCACACTCCCAACAGTAAACAAGCCATTAAAACCCTAACTTCTCAGGTAATTTCCAATTTACAAATTACTGAAATTATCAATTATTTTCTTCCCCATTTTATTTTTTGTTTTTTAAAAAAATTTGGTGAATAATGTAGATCAAAGGAATAGCATTAAAAGCATCAGGGGCGTACAAATGCAACCCATGTTCACACCCCAACTCGGGCGGACCAACCGGGTCAGGTTCGGGTCAACTCAAGAGCTACACCGAGTCAGAGACTGGCTCAGAGAAGTTGAAGCCGCCAAGGGCATTTAAACGGACGTTGAGCGCGAACTCGTCGTCGTCGGCGGCGACGCCGAGGTGGGGGAAAGAGATGGAGGCGCGGTTGAAAGGGCTGTCTGTTGGCGGCGAGGTAACGCCGGTGATGTCCGTGTCGGCGAGTGGGCGGCGACTTGACCCGGTTGTGTTGGTGGAGGAAGACGAACCTAAAGAGTGGGTTGCTCAGGTGGAGCCCGGCGTTTTGATCACTTTTGTTTCTTTGCCACGTGGCGGCAATGATCTTAAGCGCATTCGATTTAAGTAAGTTTTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTGTTTTACTTGATTTTTTTACTGCTTTGATTTGATTGGTTTTTGAGTTTAACGGACTTGATTTGGTTCTATGAAGTATTTATTTCTGTCAATTCTGAATTTCTGATTAATTAAACACTGTTCTTGAGAAAATCCTTCTATTTTTAGAGTACACAAGTAAGTAATTTTGGTATACTTGTTATGAGCGAGCTTATAATTTTATAACCGCTATTTTTATACGAGTGTATCAAAATCAATAAAATGGTGTGATAAAATCAATTTTCATGATTAAGTGTATTTATGTGAAGTATCTATACTAATATATTAAAAGGCGTTGCGAAAAATGTTTATGTGTCACATAGAACTCTCCTGCTTACGCCACATCATCCACTCACCAAGGTTATGTGATGTTATTGACAACCAAAAATCAATACAATAAGGTTCGAACACAAGACCTCAAGTTTGGAGAATAACTCTCATTACCATCTTAACCAACCACTAATTGTTGTTTATCCATGCACGTTAATTTATAATACATGTTAACATGAAGTCTAAAACAACTAAATTTTTTATGTTACTTCTTATTTCGTATGGACTATATTAGAATAAAAATAACCGTTACAATATTAGGAAAACCGTGAATTAAACAATTAAAACATTAAGAAAATTACTTTTCATGGTGCAGGTAATGTACATGTGTAGTTGATGAATTTAATGAATCTTTTCACTTTTATGGTCTACACGTATCTTAGTCAAATATTGAGTTGAAAAGAAAAAAAAATCGAATTTAATTATTCAAAGTAGCAACCGGGGCATCGCCCGGGCTACACACTAGTTAATACACTAATACGAGTATTTGCTAGTGGGTGAAGATATAAAGGTGCAACAAACTTGAAATTGTTTTTTTAACTTCAAAATCAACAGCCATAGATTGTTAAGTTAAATTAACATTTTAAATGGAGGACGTATCTTATTTGGTTGACAAAATGCAAGAAACGGAAATTATCTGTCGTTAAATTGTATAAAAAAAGGGAATTTTCACAAGTCTAGAGTACGAGTTTGGTTGACAAAATGCAAGAAATGGAAATTATCGGTCGTTAAAATTGCATAAAAAACGGGTATTCACAAGTCTTATAAGAATACGAGTCAAGTTTGAATTTTACTTTATTTGGACTTCAGAGCATTTATTATAAAATGATATGATTTGCAAGTTATAACCCTAATGAGAGAAATAAAGTAAATTCCGAATTACTACGGGGTATATCCTTGATTTATATTCCGTATCAGCCTATTAAGTGGTAATTTTGTGATAAAATAGAAACATATGTACCGTCGAAATGGTTGAATATTTCTCCCATTTGAATACAAGTATTTAACTATTTATCAAGGAGATTAAACTATGGTCATTTGGAGAGAGTGATTGAACCATGAAAGGTTTGAACTAAACTAGGGTCGTTTAGTGAGACTAATAATATACGGAGTAGTAATGTACGGTTTAGATTAATGTTTTGTTAAGAATAATTAAGACGGTAATTAAACTCCCTCTCCCTCCATAATGGGGTTCGATTCTGCCTAGAAAATTGGTTGGTAGAATAGGGCGTGTTTGGATTCTTTAAAATTGTTTGTCTATATTATACTCCCATATTTCGCGGGCTCCGATAATTTGAAGATTGACACTAGTTTGATCATAGGGTGGAGTCTACATTTAGCATGTAACCTAAAGAATAAAGAATAAAGAATTGTTTGTTTGTGCACAAAAGTAGTTGTGTTTCCATCATCATGATCATCGATGATGTCATATCGTCCTTATTGAAGAAATTTGATTTTTTGAGGATTTTGTTTTTGGTAGATGTACATTTCTCTTCACTATAAGACCTGAACTTATTTGAACTGAATTTATTTAATCTGAATTTATCTGAGTTTTTTAAGAATTTATAGGATCATATTTAACTTATTTAATCTTATAAGACCTTATTAAAGCTATTTATACCTTATGAAAAATTTATTAGATTAATTATCTCTAAACTTTTAGTAATTAACATATTTCACCTTTGAATACACTTATTTAGTAAAAGTAATGAATAATCATATGTTTCTATCTTTAAATAAAATTATTATCTTGCACGAATAGTACGAAAATAAAATGGGGTGGACATGTATAGTCAAATTTTTAAGTACTTGTCTTTGAAAGAGACACTTTTTAAAGCTAAGATGAGGTAAAAGAACATTGTCTTCGAAATCTTATGTCTTTTTTTGTTGATTTTTCGTAACAAAACAATTAGACTCACAAAGTAGGTTGTGTTACATTGTCTTCGAAATCTAATGTCTTTTTTTGTTGTTTCTTCGAAATCTTATGTCCTTTTCTATGCTATCATTTGTTACTCTAGCTTATTTTTTTGACTTGTGAATATGATTTTTCTCTAACACTATTTGATCAAAAGGGGTTAAAACTTTTTCCATGTCAAGATAAAGTTGGGAATTATGTTGATATGGAGTTAAAAAGAGGTTAAATGGGTAATGGATAATCTCTTTTTTCCATTTTGATGAAAAAACATGTCTATTGCCTCTAAAGGGAAGAAAAACTATCTATTAGTTCTAAAAGGAAGGAAAAATGTCACCTAGTTCTAAAAGAGGAGGAAAAAAATGTCAATCACTTTAATCTAACTTTGATAGTCCGTATTATGGACATTTTAAGCCTTGTAAGTTTATTATATTTATGCTTTCCCTTTTTTTTCTATTCCTCTTTTTATTTAGAATACAATTGAATTTGAGGATTAAACTTTAAAATGTAATAGATGTTTTAAAAAATTATTTAGGTGAGTCGTCTGATTTTCTCTTCTAACAATATACGGAGTAAAAGACTAGTCTGTGCAAAATTAATTAGAAAGATGAACTATAGGGTTTAATCAATGTATCCATCATTCCCTTTTTGGAGCAATTTTTTATTTCTTTTTGGTGTACCATCCGTTTTACCCTTAGGGCTAATTCGGATTCGGGCCGAGTTCAAAGCGGATAGATTCCAATCACCTACCAAATTCAGCCTTAATCACCACTAAACCAACCGACAATTGATTTTTTTTAAGCAAAACTTGATTGATTACAAAAGACATTAAAAACTAATAATTCAAAATCACTTTTTTGACTTAAGGGTATCCTGTCTAAAACCAGGCCTTAAAAATTACAGACAAATATGTTCTGTGTTACTCCGTAATGATTAAGATTCAACTTACTGTAAAATCTACACTTTTTGCCCAGTGGTAAATAAAATGAAAAAAAATAGTCAAAAAAAGAGGAAGTAATTGCAAGAATGGTTGGTTAGTGGGCCAATCCAATTCTGATTGTGTCTTGCATGAATTTTTATTTAATAAGCATTATGTCGATATGTCGGATGTGGGGTCCCCCTTCTTTTTTCCAAAGCTTCTTTCACGCCAAGGTTGAGTTAGCTTTGTCAGTTTCTGCTAGTTTTTCCTGTCCTTTACCATACCATAAAATAAAGGTCATCACAAATTGACATAACATTAACATACCCAAATCCAATTTTCTTGTAAAATGGGTGCGCATAGTAACGTTGGACGTACGTATGTTATAGAATGGACATGATTTTGCATCAACTATTACTATCATACACATGTACTTGTTCGAGTGTTGGGGTCCCGACCGTCCCGTTCATTAATGTCTTGTGTTTTTTGTGTGTACTCATGGTACACTGTCAGGTTCGAGTAATGTGACGGTGTGGTTAAATGTAATGAAATGAAAAAGTTATTATGGAGTACTCCTGAAGGCCTTATTCTCTTCACGTGATTCGGTTTTATTTTCTAGTTTCTGTGATGTGATCTGATCTGACCTGAATGTTCTCCAACTCATAAGTAAGAACTTACACGCGAGATGATGTAGGTCAAGAATACTAGCCAAATTGTTGGTTTGAGATGTAGGTAAAAAGTACTAGCCAATTGTTGGTTTATATTGTTACTCATTGACTCA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GGGTCGAGTATTCCGGGACGGAGGGAGTAAATAATTAAAACATACTCCGTACGTATTAGTAGAGTATATGAATAGTTCAAAAACAAAGTGTTGCATACTTGCAACTATAAAGAACGGAGGAAATATATTTCAAAATTTTTTGTTAAAAAAGTTGGTACAAGTCCTTATAGTTCTCCTAGGCAAAAAGACTAAAGTAATTAATAGTGCAAGCACCAAGTTCTTCATTTGAGTTTTTCATGCTTAGTTTTACTCCTCTGCTATTATTGAAGTTAATGATTAATCAGCATAATTTGTTTCTGTTTGAAATTAGCTAAAGCACTGAAGCCCGTAGCTATTTCCACTATGTCACAAATGAATTTCTTTGAAGTGCTATTTTGTGTGAGTAACATAAGCTATGTTACTCGGACTCTGCTACCCATATCAGACACGGATACGTGTCCAAGTATCCAACACGGCTATTTTGTGAAACAATTAAATGCTTTTGGTCCAAAATAAAGTGTCCAATTGTTCATACTCATATCCGAGTGTCGAGGATCTGACACGGGTATTTGAGGCAAAATAAAGGAGTCCGTGTAACATAGAACATAAGTACCCCAATTACATGAAATGATGAAAACGGGAGTACAGTTTGTCTTTTCCAAAACACTGATTGCTACTAAAGTTTTCCGTTGCTAAATGTCTAAGATGTACTCTTTAACATTGAGATGGCGATATATATAATAAATCAGGGTGACCTCCATATTTCATGAGGTAGTTGAGATCCGTGAATTAAGATAGTACAGTATATGCTCTTATATCTTGTGTTTCAAGTTGACAATGAGAGAACATGATAGTACACTTAACATGGAAGTCCCACCTTATAAATGCAGTGTGCAAATTAATATAAGCCCTCAAAGAGAAATGGAAATATTGATTGATAGAAGAAGAAATAAGGTCACATGGACCACTATGTACATGTCTGCTATCCACCTCAAGTTTACATCAGAAATTTCATGTTAACATCCAAAGTACAATCAATCTAAAGTTGGAAAGTGTGTAATGATAAAATCAAATCCTCACACTAATGCCTCTGTTAGTGTTTGAAAGCGACACAGTCGTGTTAGATTTAACAAGTACGGTAACAGAGATGGTTGTGGATTAATATGGACTGTTCTTTTTTCCTGGTTTGTGGATCATATTGGACTAAACTCAATTGTTCATTAGGCTATATGGGTTCCTGATTTATTGTGAAGTCACATTATTGCAGGTTAGATCAAAGATCAATGACTAAACCCCCTACTAACTTCGCCTTGACGTTCAAATAATGAGAAAACATTCACATCTTTGATTATCAAAACAAAACCTTCCTTTCATTTGCTTGATCTTCTTTTAATTTTAGGCCTTGTTCTCTTCATCTAGTCTGATCAAATTTTTCTAGTTTCTGTTCTGGTATGGTTTGGTTTTTCTGGTCTGATGTGGTCTAAAAAGCAATAAGAATAAGGTGAAGAGAACAGAGCCTAACAATCCATTTGTTGTTTTGGCATAGGGACTGGAATGTTTTGGTTTTGAAGGTTTCTGTAGATTTTGCTTGATCTTAGCTTTTCTGTACGCTTTCTTCCTTGGGATGTGATCATATTGTCATGTGAATTTGTGACTAAACTGAAATTTCTTCACTCAATGCAGTCGAGAAAAGTTTGGAGAGATGCATGCTAGAGTTTGGTGGGAAGAGAATAGAGCACGTATACACGAACAATACTTGTAATCAGAAAGATCAAACAAGTACTTGTAATTGTGAGTATTGATGAACAAAGAGGAGCAAGCTAAGTTCTATCTGTCTAGACTACATTCTTTATATGTTACTACCTCAGTATAAATACCTAAAGAGTAAAGAATGCCTTGTTATATATGGCCTTTGAAGAAGAAATATTATGAACCAACGCAAATTGGTAGAGTTGGTTACCTTGTGACTTGGAGCCCCAGTCAACTGCAAGTTCAGTAGGATCCCTATATATATATGTGCTGCATGTATCGATAACTTCAGAAGGCATTCTATNTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTCTATTTATTCTCTTTTTGTTCTGATGACTTCTGGTGTATGCAACTGGTATAAGGGAATACTGGTGAGTACAAGTTTAGAAGGATTAGACCTTAAATGTTGACAAGCAGATATGTAAACAGACAACCATGTTAATGGCAAGGTTCTTCCAAGGGAAAGAAATGATGCAATCTCAATTTGGTATATCAGAATCTATAATGAGACCTAGTATATACGAAGTATAGAGTTTTTTCCCTTTCTCACGTGGCTACAAACCCGCCCTTAGGCTCTATTTGATTTTTCATGGTTTTCAAGGAAAAATACATGTAATATATACTCCCTCCGTATTTGTAACGCCCCGACCTCTAATTCAATAATTAAAGCATAATTAGCAGCGGAATTAACCTAATTGGTCAGGGCATTACCTGCCGTAACTTCCTTTTCGGAAATTATAAGGCAAACATCAATCATAA AAGAGTGGGGGCCAAAAACTAAAGAAGATGCCAACTCCATAAAATCAACGTGTTCTGCACTTTCCACTTCTCCCCCCTTCTTCCCCTTCGTTCTCTCTCCATTTTCACCTCTCCATCTTCTTCTTCCTAATTTCTTCTAATCAAATAATTAAATTACCTTTTACTTCATCATAATTCCCAGTTTCTAAAGAAAATTCAACAACCAATTCAATTTCACAAAGGATTGAAAAAAATAAACCCAGAAAAACGTGAATAATGTTAACGTGCATAGCTCGTCCGAAGCAACAACAGGGGCATAACAGTCATCATCATAATCATCAACATCAACACGACGATCCAGACTCCGTTCACACTCCCAACAGTAAACAAGCCATTAAAACCCTAACTTCTCAGATCAAAGGAATAGCATTAAAAGCATCAGGGGCGTACAAATGCAACCCATGTTCACACCCCAACTCGGGCGGACCAACCGGGTCAGGTTCGGGTCAACTCAAGAGCTACACCGAGTCAGAGACTGGCTCAGAGAAGTTGAAGCCGCCAAGGGCATTTAAACGGACGTTGAGCGCGAACTCGTCGTCGTCGGCGGCGACGCCGAGGTGGGGGAAAGAGATGGAGGCGCGGTTGAAAGGGCTGTCTGTTGGCGGCGAGGTAACGCCGGTGATGTCCGTGTCGGCGAGTGGGCGGCGACTTGACCCGGTTGTGTTGGTGGAGGAAGACGAACCTAAAGAGTGGGTTGCTCAGGTGGAGCCCGGCGTTTTGATCACTTTTGTTTCTTTGCCACGTGGCGGCAATGATCTTAAGCGCATTCGATTTAACCGAGAAATGTTCAACAAATGGCAAGCCCAAAAATGGTGGACGGATAACTACGAGAAGATCATGGAACTGTATAATGTTCAGAGGCTTAGTCGTAACGCCTTTCCTCTTCCAACTCCCCCAAGATCTGAAGATGATAACAGCTCTATGAATTCAAAAATGATGGAGTCATCAATTGGTGACAGTCCAGTTACACCACCATTAAGCAAAGAAAGTATACCACGTAACCTTTACCGTGGAATGAGCATTGGTATGGGATACTCATCCTCAGATTCTTTCGAACAACATTCAAAGCAATCACGTCAATATGAATCAAGTGGTCTAGCCTCAACACCAAAACATTCCAACATTAGTGGAGTTACTGCAAAGACAGAACTATCTTCTATGGATGAGTCACTAAGATCTACCTCTTCTAGAGAAGGAGATCGTTCTGGAGAACTGTCAATTAGTAATGGCAGTGATATGGAGAGTGAGTGGGTTGAAGAAGACGAGCCAGGAGTTTATATTACTATTCGAGCTTTGCCTGGTGGGCGAAGAGAGCTCAGACGCGTTAGGTTCAGTCGAGAAAAGTTTGGAGAGATGCATGCTAGAGTTTGGTGGGAAGAGAATAGAGCACGTATACACGAACAATACTTGTAATCAGAAAGATCAAACAAGTACTTGTAATTGTGAGTATTGATGAACAAAGAGGAGCAAGCTAAGTTCTATCTGTCTAGACTACATTCTTTATATGTTACTACCTCAGTATAAATACCTAAAGAGTAAAGAATGCCTTGTTATATATGGCCTTTGAAGAAGAAATATTATGAACCAACGCAAATTGGTAGAGTTGGTTACCTTGTGACTTGGAGCCCCAGTCAACTGCAAGTTCAGTAGGATCCCTATATATATATGTGCTGCATGTATCGATAACTTCAGAAGGCATTCTATNTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTCTATTTATTCTCTTTTTGTTCTGATGACTTCTGGTGTATGCAACTGGTATAAGGGAATACTGGTGAGTACAAGTTTAGAAGGATTAGACCTTAAATGTTGACAAGCAGATATGTAAACAGACAACCATGTTAATGGCAAGGTTCTTCCAAGGGAAAGAAATGATGCAATCTCAATTTGGTATATCAGAATCTATAATGAGACCTAGTATATACGAAGTATAGAGTTTTTTCCCTTTCTCACGTGGCTACAAACCCGCCCTTAGGCTCTATTTGATTTTTCATGGTTTTCAAGGAAAAATACATGTAATATATACTCCCTCCGTATTTGTAACGCCCCGACCTCTAATTCAATAATTAAAGCATAATTAGCAGCGGAATTAACCTAATTGGTCAGGGCATTACCTGCCGTAACTTCCTTTTCGGAAATTATAAGGCAAACATCAATCATAA ATGTTAACGTGCATAGCTCGTCCGAAGCAACAACAGGGGCATAACAGTCATCATCATAATCATCAACATCAACACGACGATCCAGACTCCGTTCACACTCCCAACAGTAAACAAGCCATTAAAACCCTAACTTCTCAGATCAAAGGAATAGCATTAAAAGCATCAGGGGCGTACAAATGCAACCCATGTTCACACCCCAACTCGGGCGGACCAACCGGGTCAGGTTCGGGTCAACTCAAGAGCTACACCGAGTCAGAGACTGGCTCAGAGAAGTTGAAGCCGCCAAGGGCATTTAAACGGACGTTGAGCGCGAACTCGTCGTCGTCGGCGGCGACGCCGAGGTGGGGGAAAGAGATGGAGGCGCGGTTGAAAGGGCTGTCTGTTGGCGGCGAGGTAACGCCGGTGATGTCCGTGTCGGCGAGTGGGCGGCGACTTGACCCGGTTGTGTTGGTGGAGGAAGACGAACCTAAAGAGTGGGTTGCTCAGGTGGAGCCCGGCGTTTTGATCACTTTTGTTTCTTTGCCACGTGGCGGCAATGATCTTAAGCGCATTCGATTTAACCGAGAAATGTTCAACAAATGGCAAGCCCAAAAATGGTGGACGGATAACTACGAGAAGATCATGGAACTGTATAATGTTCAGAGGCTTAGTCGTAACGCCTTTCCTCTTCCAACTCCCCCAAGATCTGAAGATGATAACAGCTCTATGAATTCAAAAATGATGGAGTCATCAATTGGTGACAGTCCAGTTACACCACCATTAAGCAAAGAAAGTATACCACGTAACCTTTACCGTGGAATGAGCATTGGTATGGGATACTCATCCTCAGATTCTTTCGAACAACATTCAAAGCAATCACGTCAATATGAATCAAGTGGTCTAGCCTCAACACCAAAACATTCCAACATTAGTGGAGTTACTGCAAAGACAGAACTATCTTCTATGGATGAGTCACTAAGATCTACCTCTTCTAGAGAAGGAGATCGTTCTGGAGAACTGTCAATTAGTAATGGCAGTGATATGGAGAGTGAGTGGGTTGAAGAAGACGAGCCAGGAGTTTATATTACTATTCGAGCTTTGCCTGGTGGGCGAAGAGAGCTCAGACGCGTTAGGTTCAGTCGAGAAAAGTTTGGAGAGATGCATGCTAGAGTTTGGTGGGAAGAGAATAGAGCACGTATACACGAACAATACTTGTAA MLTCIARPKQQQGHNSHHHNHQHQHDDPDSVHTPNSKQAIKTLTSQIKGIALKASGAYKCNPCSHPNSGGPTGSGSGQLKSYTESETGSEKLKPPRAFKRTLSANSSSSAATPRWGKEMEARLKGLSVGGEVTPVMSVSASGRRLDPVVLVEEDEPKEWVAQVEPGVLITFVSLPRGGNDLKRIRFNREMFNKWQAQKWWTDNYEKIMELYNVQRLSRNAFPLPTPPRSEDDNSSMNSKMMESSIGDSPVTPPLSKESIPRNLYRGMSIGMGYSSSDSFEQHSKQSRQYESSGLASTPKHSNISGVTAKTELSSMDESLRSTSSREGDRSGELSISNGSDMESEWVEEDEPGVYITIRALPGGRRELRRVRFSREKFGEMHARVWWEENRARIHEQYL Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo03180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902161449|gb|KNA06578.1| (hypothetical protein SOVF_179720 [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 3.900e-223 Identity = 397/398 (99.75%), Postives = 398/398 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731372806|ref|XP_010666454.1| (PREDICTED: protein Brevis radix-like 4 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 674.5 bits (1739), Expect = 1.200e-190 Identity = 355/403 (88.09%), Postives = 366/403 (90.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|225444796|ref|XP_002280093.1| (PREDICTED: protein Brevis radix-like 4 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 471.1 bits (1211), Expect = 1.900e-129 Identity = 263/401 (65.59%), Postives = 308/401 (76.81%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|764510148|ref|XP_011460503.1| (PREDICTED: protein Brevis radix-like 4 [Fragaria vesca subsp. vesca]) HSP 1 Score: 469.5 bits (1207), Expect = 5.600e-129 Identity = 266/401 (66.33%), Postives = 315/401 (78.55%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. NCBI nr
Match: gi|566176459|ref|XP_002309199.2| (zinc finger family protein [Populus trichocarpa]) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 1.300e-128 Identity = 272/414 (65.70%), Postives = 313/414 (75.60%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QIP3_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_179720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 2.700e-223 Identity = 397/398 (99.75%), Postives = 398/398 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8B828_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_002150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 674.5 bits (1739), Expect = 8.000e-191 Identity = 355/403 (88.09%), Postives = 366/403 (90.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: F6HGU3_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VIT_11s0016g01460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 471.1 bits (1211), Expect = 1.400e-129 Identity = 263/401 (65.59%), Postives = 308/401 (76.81%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9HDV5_POPTR (Zinc finger family protein OS=Populus trichocarpa GN=POPTR_0006s14720g PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 8.800e-129 Identity = 272/414 (65.70%), Postives = 313/414 (75.60%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A067F9G8_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g017074mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 466.8 bits (1200), Expect = 2.500e-128 Identity = 262/404 (64.85%), Postives = 317/404 (78.47%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BRXL4_ARATH (Protein Brevis radix-like 4 OS=Arabidopsis thaliana GN=BRXL4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 416.4 bits (1069), Expect = 3.500e-115 Identity = 244/412 (59.22%), Postives = 296/412 (71.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BRXL2_ARATH (Protein Brevis radix-like 2 OS=Arabidopsis thaliana GN=BRXL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 2.700e-99 Identity = 228/408 (55.88%), Postives = 278/408 (68.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BRXL3_ARATH (Protein Brevis radix-like 3 OS=Arabidopsis thaliana GN=BRXL3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 3.900e-90 Identity = 217/426 (50.94%), Postives = 268/426 (62.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BRXL1_ORYSJ (Protein Brevis radix-like 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=BRXL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 330.9 bits (847), Expect = 2.000e-89 Identity = 220/424 (51.89%), Postives = 260/424 (61.32%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BRX_ARATH (Protein BREVIS RADIX OS=Arabidopsis thaliana GN=BRX PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 233.8 bits (595), Expect = 3.300e-60 Identity = 165/410 (40.24%), Postives = 214/410 (52.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT5G20540.1 (BREVIS RADIX-like 4) HSP 1 Score: 416.4 bits (1069), Expect = 2.000e-116 Identity = 244/412 (59.22%), Postives = 296/412 (71.84%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G14000.1 (DZC (Disease resistance/zinc finger/chromosome condensation-like region) domain containing protein) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 1.500e-100 Identity = 228/408 (55.88%), Postives = 278/408 (68.14%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G54180.1 (BREVIS RADIX-like 3) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 2.200e-91 Identity = 217/426 (50.94%), Postives = 268/426 (62.91%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G31880.1 (DZC (Disease resistance/zinc finger/chromosome condensation-like region) domain containing protein) HSP 1 Score: 233.8 bits (595), Expect = 1.800e-61 Identity = 165/410 (40.24%), Postives = 214/410 (52.20%), Query Frame = 1
BLAST of Spo03180.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G35600.1 (BREVIS RADIX-like 1) HSP 1 Score: 194.5 bits (493), Expect = 1.200e-49 Identity = 150/407 (36.86%), Postives = 204/407 (50.12%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo03180.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo03180.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo03180.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo03180.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 5
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
RNA-Seq Expression
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