Spo02403 (gene)

Overview
NameSpo02403
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionNuclear pore complex protein NUP98A (Nucleoporin 98A) (Nucleoporin autopeptidase)
Locationchr5 : 2258728 .. 2265148 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATTCAACTAAATTTTGGTATTAAATAAAATCCTGCTTTGTTTTCAAGCTATCTAACATAACCAATTTCCCATATAAGTATCACAAAAAGTTAAATTCAAACAAATTCATCCGCATCCGTTATCAATCAATCCCAATACAGAAAAACCTTTGAGATTTTAAGGTCAGTTTTTCTCTCTGTTTTCCCCAACTTTCAATTTTGCAGTAAAATCATTTTTTCTTGTAAAAATCTTCATACAATTTGTTTGCGTCCTCAATTTTGTATCTTGTAATCCTTACTGCACAATTTCCCCCCTTTGAATTATCCTTAATTTTGTAATTTTTATATTTTTTTGTTCTAATTTTCTGCATGTTGGTAATCAAGGGAACATTCTGTTAATAATTTTGATTTTTGACATCTAATTTGCTTCTAATTTTGCTAAATTATCGACATAAAAAAAGGTCACTATCAAATTCGAATTATAAACCCACAAATCTAAGATGATTATACATTTATGTTGTTAATCATAAATGTAATTTGGTCCAATTTATTGTTTTTGTTGTTCAGTATATCCTGATAATTAATTCAAGTATGAATTTTTCGAATTATGTTGCAGCAATGGGGTTTCCCCTAGACCGTGTGCGATATCTCGATAGAACAGGAGCTTCTCAGTCACAGTCAACATCATTCTCTTTTGGTAAACTTTGTACTCATTTCTTTTGATTTATTCCTGATATCGAATTGCGATTAGTGTGCCGATTTAAGTTTAGTACTAATTTTGATGGTGAAATCTGTGGTTTTTAAAGCATGAAAGATAGACATAACTGCAAAATTATGTTTTGATAATAGTTATTGGTACCCTAGGTTATACATAGATTATTTTGGTTGGTTTGTGTATAATTGTGTTAGCTTAGTGCTTGTTTGGTTCACTTAGGTAGTAACTTTACATGGGAAGTTTCATTTCATCCGAAGTTAATTCACTTTTTACTAGGAAATAGGTTGATCATGTTTGGTTGAACTTGAGAGTTTATAATTGATGGGAATTGACATGGGAAGTATGACTTACCAAGAGGAGGGTATGTAAGCCACTTTCCATCATCATAGGAAGTTTCATGCCAACCAAACAAGTAGTAATATATACACTTCCTAAGAACTCACACTTCCCTTTATTTACATGCAACCAAACATCTCCTAGATGTACTCCCATGGTTAGTGGCGGACCTTGAACGGTTTTACGAGGAGGGCCGGTAGAAAAAATTAAGCAATATACTATGTAATTATACAATTATATACAAATTTTAGGGGGGGCCGTAACTAAAAATACACTACAAAATTTTCCGGCCGGGGGGCCAGGCCCACCCCAGCCACACCCAAGATCCGCCCCTGCCCATGGTACTACTATCTCCGTTCTACAATACATACAATATTTTTTTTTCACGCATTACAAATTTAACAAGATCTCACTTGATTATGTTTTTTTCTTACATAATGCTGGAAGAAAGATTGTCAAAGTTGATTGATGCTGTATTGTGAAAATGAGAAATGATGCATGTATTGTGAAACGTGGTAGTAGTTACGAGTAGTAATTTAATCCGATTGGGGAAATATTTAAGGGACGGAGGGGTAGAAAACAAGACTGCCCAAAGAGTGAAGTTTGGTGATTAACTGATTATTACTACTGATAGATTTCGCGACAATAAGCACTATTTAGCGCGTCCTGAGGAACAATAGTGCAGGACAGTCATAATTTATGAGTATTTACCAAAGTTACCACATGCATTGCAATGTCCTTTTAACACGATCTTAATAAAATCAAATGTTAGCTCGATCGTACCATAGGCGCAATGTCTGTAAAACCAAAGGTTGCACTGTTGGGTAAAACGAGGCAATAAGCAAGCAATTAACTAAGAGCATATATGAGATTTAGTTGATCAAAAGTTTGAGGTTTCCATGATGTTACTCTGTAATTTATTAGCTTCCAAATTTCCAAACCCGATGGTTAGTTGCTTATCACTGACAAATAATGCTTGTATCTTAATCATTGTGTTCTAGTTTTGAACTTCGAGTTTTTAGATTATATACATGTAATTTTGTAATTTTGTTTTTAGATTATATACATGTATCTTAATCATTTTGTAATTTTGTTCTAGTTTTGATGTTTGAGTTTTTAGATTATGTATTTGTATGTCTATAAGGTGTTAGACTGTTGTGGTATATCCGATTGTCCTAATAATGGAACATGTATCTAAACCGGATGGTTAATTGCTTATTACTGACAAATATTCTAGTTTTGATGTCCGAGTTTTTAGATTATATACTTGTATGTCTATAAGGTGTTAGCCTGTATATATCCGGTTGTCCTAATAATGGAACATGTATCTTTATGTTTCCTGACATACATTACAGATCTTAATCTTACAATTTTTGGTGATCAGGTCCTGGTTTTGTAAACAACGAACAGATAGGGAGTAACAAAACTCCTTACACTCCAACATATGGTGGATCAAGTGAGAGGTTCATGTCATTATCAGCTATGAACGACTACTCCAACAAGAGCCATGAAGAGTTAAGATACGAGGATTACCAGCTGGGTATCAAAGGTAAATTGTCGTTACTTGTCCTGTTTCTGTATTTATACAAGCCTTAATGAAATTTAACATTTTCACCTGTAACACTACGACACATTAGGAATTGGGGTTGACTCAAGTGGTGAGTTTTCCCTTCTTCCCTAGCAGTCTTTGGTTCGATTCCTACCCCAAGCAAATACTTGGGTGGGGTCCGTGGGGACCCTGTGCGAGGGCAGCCTAGAGGACTTTTTCTTACGTGTTAAAAAAAATATATAAAAAATATGATACATTGATACACATTATTCTTATATGGGATGGCTTTGTGCAGGTACTAGTTCTGAGACCGAATATAGCGAACCGGTACAAGCCCCTCTCCCGAGCAGTTTATTCTCATCTTCACCATTTAGCAATATTGAGAATAAGAGAGATCATAGCAAACAGCAACAAGCTTCTTTCCCAAGCACTGTATTCTCAGCACTACCATCTCAAAGCGGTCTGTTGAGTGCTTTTCCAGGGTTTCCGATACCAGGTTCACCACCCACTGCAGCATACGCCCCACCCTTTGGAAAATCAACCTCAACACCACAACATGTTTCGCAGATAGGTAAAAATATATATATATTACAAATTTTCAATCAGGCTATTATATGGTATTGTTTACTACCTAGTATGTTACAACATTTATATTTTTGTATTGTGCCTTGGTTTTTATCTGGACACAATAGTCACGTTATCCCAAACCTTCGTAATCAAAGAGTTTGCCATGATTTCACTAAAATATCCTTCATTATGTGTCACCTTTCTCCATAACTCCAGATTTCTTTGAGTTTGGGTATATTTGAAAATCTGACCATGCATTATCAATATCTTTTCTTTCTTTGTGTGAGATTGTAGGCTTATTAGCGTATTCTATCTTTTTTGCAGGTACTCCAAGCTCAAGTGCACAACCCGTGTTTGGTGGGTTTAGAGGTTGTAATTGCAAATGCAATTGCAACCAACGTGCTTTTCCTCAAATCAACTCAACTGCTCCCAGCACAAATGTATTTGCGAATGCCGGGTACCCCTACCCTGTTTATAGTTTCCCTGCATTTGTTACTATTCGACCAGATGCTGCAGCTGCCCAACATTTTGGTAACTTTGGCCTCACATTTGGTGAATCAACAACGCCATCATTTCTTGCATCAACAATGCTACCATTTGGTACACCAGCATTGGGTGCATCAATAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAATGTCAGCATTTCCTGGATCAACAATGCTAGCATTTGGTGCTTCAACAACACCAGCATTTGGTGTATCAACAACGGCAACATTTGGTGCAACCACAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAACGCCATTTGGTGCGTCAATAACGCCAGCCTTTGGTGCATCAACAACGCCATTTGGTTTATCAACAGCACCAGCATTTGGTGTATCAACAGCACCATCATTTCCTGCATCAACACCACCAGCATTTGGTTCATCAACAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAACACCAGTATCTGGTTTTGCTCCATCTGTTTTTCCTCCATCAACATCAGCATTTGGTGCACCAACACTGCCAACATTTGGTGCATCAACATTGCCAGCATCTGGTTCTGCTGCATCAGCGTCAGGTTTTGCTGCATCAACACCGTCTTCATTCTGTTTTCCTCCATCAAAGTCAGCATTTGGTGTCACTATTTCACATCCTGTTTTGGGAGAACCAAGCAAAAACCAATTTTCCTACCCCCCAAATGCAGTTCATTCAACCAATCCGATTTCTAGTAAAAATCATTTTACGTACCCCCCAAAAGCAGTTCATTCAACCAAGCCGGCGGTTGTTACAAGCCCTGTTACTGAAGACTCGGATGAGTCGTCTTCGTCCAATCATGTTCCGAAAGCTGTTTCTTACATGGTAGAAAAACTGGGTTTCAACCCATGGGATCAAAGGAAATATAGTATGAATATGAATAAGGATGATCCTAATGAAGAGATCAAAGAAGGGATCCTTGTTTGTGAAGATGCAGATAAAGATGATGATATTATAGCACTTGCTGAGTTTGCTGTTGAGCAACACAACGTCATTAGACCAGGTAAATTAATACTTACTTTCTTCCTCCGTTCTTTTTTAGATAGACAAATTTCTTTAGACACGTTTGTCATGCAAGATTTTAAACATAGATTTTAAACAATAATATCATCAATTAATTACGGATGGGAGAAAATTATAACAAATTGATATTTAAAAAATATTCATTGTGACGAATCTAACAAGACAAGAAGTAACTATATTTTTTTTCTCGAAGTATAAAATCATAAAAGAAAGTTAAATGAGCTTGTGTGAATGGTGTCAAAATCAAATTGTTTCATTTACTAAGAAATGAATAGTAATTACTCAAAACATTGCTAAAATTCCTGCTAATACGGAGTAGTACTCCGTAATTACACAAAATATTTCAACTCTTTCTGATTTGCATTTTGTTCTCATAGTGTAACCGTAAAGATCTTTCCAACATTTCAACTCTTTTGATGTATTAATACTAACTCCTTTTCAAAATAATCTTTACACTTTCCGTTTTATTCCGTTTTAGTCCATTTCATAATGTTCTTTACGTTGTGTTTTACTTTTTAATCTATCTTTTAACATGAAAATTTACTATCTTATCCCACAATATTTACAACTTTCCACTCACTTTCTCTTACTTTATTCTTTTTTTTTTCTTACACTAACCCACATTTTTACACCTCTACCTGTATTCACCCATCTTTTTACACAATTTCCCTATTTTGTCTTAATATTTGATTTGTGCAAATAATAACCGTAAAGATCATTATGAAACGGAGGTAGTAGTAAATAGTAATTACTCAAAAGATTGCTAAAAGTCCTTCTAATAGTAATTACACAAAATATTTCAACTCTTTCTGATCTGCATTTTGTTCTCATAGTGTAACCGTAAAGATCTTTCCAACATTTCAACTCTTTTCATGTATTAATACTAACTCCGTTTCAAAATGATCTTTTCATAATATTCTTTACATTATGTTTTTTATTCTACTTTTTAATGAAAATTTACTATCTTACCCCATAATATTTACAACTTTCCACTCACTTTCTTTTACTCTATTCATTTTTTCTTACACCACCTCACATTTTTCCACCTCTACCTGTATTCATCCACCTGTTTACACACTTTTCCTATTTTATCTTAATATTGTGCAAATAGTAACCGTAAAGATCATTATGAAATAGAGGTAGTAGCAAATAGTGATTACTCAAAAGATTGCTAAAAGTCCTTCTAATAGTAATTACACAAAACATTTCTAACTCTTTTCTGATTTGCATTTTGTTGTTATAGGGTAAACAAGTTCAATTTGTAAAAGTGGTAGCGGCATGTTTGGAGGCAGTTGGAGGTGGAAGGTATCACATTGTTTTGGAGGGTTCTGCTTTCCCTTTTCAGAGGAGGAGGTTCTATGCTGTGGTGTTGCGTAAGTTAACAAACCGCCCCAATCATATGTCAGTTCTTGAAAAATGGCTTCCTGGCAAGAGGCTTGGTTTTTAATATTTCTTGAGAAATTAGAATCCTCTTTTGTAGTTTTGAGAACGGTTTGTAAGCATAGTTACTTCACCCGTTTTATAATACAAAGGTTCTTCAACATTTGTAATATTAACTAGCTTTTGAGCCCGTTCTACTAGCTTTTGAGCCTGTTTACAGAACGGACGGTTGTATATTGGTTGTTTAAATGTCTTTTGAAGTTTTAATTAGTGAGTACTTGTGAATTTTGGTAACATATGAATTAAATAGAGGTGTAATTTAAAGGTTGGAAAAATATAAAAATTATAATGATGATTAAAT

mRNA sequence

ATTCAACTAAATTTTGGTATTAAATAAAATCCTGCTTTGTTTTCAAGCTATCTAACATAACCAATTTCCCATATAAGTATCACAAAAAGTTAAATTCAAACAAATTCATCCGCATCCGTTATCAATCAATCCCAATACAGAAAAACCTTTGAGATTTTAAGCAATGGGGTTTCCCCTAGACCGTGTGCGATATCTCGATAGAACAGGAGCTTCTCAGTCACAGTCAACATCATTCTCTTTTGGTCCTGGTTTTGTAAACAACGAACAGATAGGGAGTAACAAAACTCCTTACACTCCAACATATGGTGGATCAAGTGAGAGGTTCATGTCATTATCAGCTATGAACGACTACTCCAACAAGAGCCATGAAGAGTTAAGATACGAGGATTACCAGCTGGGTATCAAAGGTACTAGTTCTGAGACCGAATATAGCGAACCGGTACAAGCCCCTCTCCCGAGCAGTTTATTCTCATCTTCACCATTTAGCAATATTGAGAATAAGAGAGATCATAGCAAACAGCAACAAGCTTCTTTCCCAAGCACTGTATTCTCAGCACTACCATCTCAAAGCGGTCTGTTGAGTGCTTTTCCAGGGTTTCCGATACCAGGTTCACCACCCACTGCAGCATACGCCCCACCCTTTGGAAAATCAACCTCAACACCACAACATGTTTCGCAGATAGGTACTCCAAGCTCAAGTGCACAACCCGTGTTTGGTGGGTTTAGAGGTTGTAATTGCAAATGCAATTGCAACCAACGTGCTTTTCCTCAAATCAACTCAACTGCTCCCAGCACAAATGTATTTGCGAATGCCGGGTACCCCTACCCTGTTTATAGTTTCCCTGCATTTGTTACTATTCGACCAGATGCTGCAGCTGCCCAACATTTTGGTAACTTTGGCCTCACATTTGGTGAATCAACAACGCCATCATTTCTTGCATCAACAATGCTACCATTTGGTACACCAGCATTGGGTGCATCAATAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAATGTCAGCATTTCCTGGATCAACAATGCTAGCATTTGGTGCTTCAACAACACCAGCATTTGGTGTATCAACAACGGCAACATTTGGTGCAACCACAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAACGCCATTTGGTGCGTCAATAACGCCAGCCTTTGGTGCATCAACAACGCCATTTGGTTTATCAACAGCACCAGCATTTGGTGTATCAACAGCACCATCATTTCCTGCATCAACACCACCAGCATTTGGTTCATCAACAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAACACCAGTATCTGGTTTTGCTCCATCTGTTTTTCCTCCATCAACATCAGCATTTGGTGCACCAACACTGCCAACATTTGGTGCATCAACATTGCCAGCATCTGGTTCTGCTGCATCAGCGTCAGGTTTTGCTGCATCAACACCGTCTTCATTCTGTTTTCCTCCATCAAAGTCAGCATTTGGTGTCACTATTTCACATCCTGTTTTGGGAGAACCAAGCAAAAACCAATTTTCCTACCCCCCAAATGCAGTTCATTCAACCAATCCGATTTCTAGTAAAAATCATTTTACGTACCCCCCAAAAGCAGTTCATTCAACCAAGCCGGCGGTTGTTACAAGCCCTGTTACTGAAGACTCGGATGAGTCGTCTTCGTCCAATCATGTTCCGAAAGCTGTTTCTTACATGGTAGAAAAACTGGGTTTCAACCCATGGGATCAAAGGAAATATAGTATGAATATGAATAAGGATGATCCTAATGAAGAGATCAAAGAAGGGATCCTTGTTTGTGAAGATGCAGATAAAGATGATGATATTATAGCACTTGCTGAGTTTGCTGTTGAGCAACACAACGTCATTAGACCAGGGTAAACAAGTTCAATTTGTAAAAGTGGTAGCGGCATGTTTGGAGGCAGTTGGAGGTGGAAGGTATCACATTGTTTTGGAGGGTTCTGCTTTCCCTTTTCAGAGGAGGAGGTTCTATGCTGTGGTGTTGCGTAAGTTAACAAACCGCCCCAATCATATGTCAGTTCTTGAAAAATGGCTTCCTGGCAAGAGGCTTGGTTTTTAATATTTCTTGAGAAATTAGAATCCTCTTTTGTAGTTTTGAGAACGGTTTGTAAGCATAGTTACTTCACCCGTTTTATAATACAAAGGTTCTTCAACATTTGTAATATTAACTAGCTTTTGAGCCCGTTCTACTAGCTTTTGAGCCTGTTTACAGAACGGACGGTTGTATATTGGTTGTTTAAATGTCTTTTGAAGTTTTAATTAGTGAGTACTTGTGAATTTTGGTAACATATGAATTAAATAGAGGTGTAATTTAAAGGTTGGAAAAATATAAAAATTATAATGATGATTAAAT

Coding sequence (CDS)

ATGGGGTTTCCCCTAGACCGTGTGCGATATCTCGATAGAACAGGAGCTTCTCAGTCACAGTCAACATCATTCTCTTTTGGTCCTGGTTTTGTAAACAACGAACAGATAGGGAGTAACAAAACTCCTTACACTCCAACATATGGTGGATCAAGTGAGAGGTTCATGTCATTATCAGCTATGAACGACTACTCCAACAAGAGCCATGAAGAGTTAAGATACGAGGATTACCAGCTGGGTATCAAAGGTACTAGTTCTGAGACCGAATATAGCGAACCGGTACAAGCCCCTCTCCCGAGCAGTTTATTCTCATCTTCACCATTTAGCAATATTGAGAATAAGAGAGATCATAGCAAACAGCAACAAGCTTCTTTCCCAAGCACTGTATTCTCAGCACTACCATCTCAAAGCGGTCTGTTGAGTGCTTTTCCAGGGTTTCCGATACCAGGTTCACCACCCACTGCAGCATACGCCCCACCCTTTGGAAAATCAACCTCAACACCACAACATGTTTCGCAGATAGGTACTCCAAGCTCAAGTGCACAACCCGTGTTTGGTGGGTTTAGAGGTTGTAATTGCAAATGCAATTGCAACCAACGTGCTTTTCCTCAAATCAACTCAACTGCTCCCAGCACAAATGTATTTGCGAATGCCGGGTACCCCTACCCTGTTTATAGTTTCCCTGCATTTGTTACTATTCGACCAGATGCTGCAGCTGCCCAACATTTTGGTAACTTTGGCCTCACATTTGGTGAATCAACAACGCCATCATTTCTTGCATCAACAATGCTACCATTTGGTACACCAGCATTGGGTGCATCAATAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAATGTCAGCATTTCCTGGATCAACAATGCTAGCATTTGGTGCTTCAACAACACCAGCATTTGGTGTATCAACAACGGCAACATTTGGTGCAACCACAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAACGCCATTTGGTGCGTCAATAACGCCAGCCTTTGGTGCATCAACAACGCCATTTGGTTTATCAACAGCACCAGCATTTGGTGTATCAACAGCACCATCATTTCCTGCATCAACACCACCAGCATTTGGTTCATCAACAACACCAGCATTTGGTGCATCAACAACACCAGTATCTGGTTTTGCTCCATCTGTTTTTCCTCCATCAACATCAGCATTTGGTGCACCAACACTGCCAACATTTGGTGCATCAACATTGCCAGCATCTGGTTCTGCTGCATCAGCGTCAGGTTTTGCTGCATCAACACCGTCTTCATTCTGTTTTCCTCCATCAAAGTCAGCATTTGGTGTCACTATTTCACATCCTGTTTTGGGAGAACCAAGCAAAAACCAATTTTCCTACCCCCCAAATGCAGTTCATTCAACCAATCCGATTTCTAGTAAAAATCATTTTACGTACCCCCCAAAAGCAGTTCATTCAACCAAGCCGGCGGTTGTTACAAGCCCTGTTACTGAAGACTCGGATGAGTCGTCTTCGTCCAATCATGTTCCGAAAGCTGTTTCTTACATGGTAGAAAAACTGGGTTTCAACCCATGGGATCAAAGGAAATATAGTATGAATATGAATAAGGATGATCCTAATGAAGAGATCAAAGAAGGGATCCTTGTTTGTGAAGATGCAGATAAAGATGATGATATTATAGCACTTGCTGAGTTTGCTGTTGAGCAACACAACGTCATTAGACCAGGGTAA

Protein sequence

MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAMNDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQQASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASITPAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPSSFCFPPSKSAFGVTISHPVLGEPSKNQFSYPPNAVHSTNPISSKNHFTYPPKAVHSTKPAVVTSPVTEDSDESSSSNHVPKAVSYMVEKLGFNPWDQRKYSMNMNKDDPNEEIKEGILVCEDADKDDDIIALAEFAVEQHNVIRPG
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo02403.1Spo02403.1mRNA


Homology
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902228145|gb|KNA20994.1| (hypothetical protein SOVF_047450 [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 7.600e-220
Identity = 404/410 (98.54%), Postives = 404/410 (98.54%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1   MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAM 60
           MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAM
Sbjct: 1   MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAM 60

Query: 61  NDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQ 120
           NDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQ
Sbjct: 61  NDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQ 120

Query: 121 QASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQHVSQIGTPSSSA 180
           QASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQH SQIGTPSSSA
Sbjct: 121 QASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQHASQIGTPSSSA 180

Query: 181 QPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQ 240
           QPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQ
Sbjct: 181 QPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQ 240

Query: 241 HFGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTP 300
           HFGNFGLTFGESTTPSF AS MLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFP STMLAFGASTTP
Sbjct: 241 HFGNFGLTFGESTTPSFPASAMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPASTMLAFGASTTP 300

Query: 301 AFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASITPAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPAST 360
           AFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASI PAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPAST
Sbjct: 301 AFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASIRPAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPAST 360

Query: 361 PPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPAS 411
            PAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPAS
Sbjct: 361 TPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPAS 410
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. NCBI nr
Match: gi|567880195|ref|XP_006432656.1| (hypothetical protein CICLE_v10000333mg [Citrus clementina])

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 2.300e-27
Identity = 144/390 (36.92%), Postives = 199/390 (51.03%), Query Frame = 1 

		  

Query: 103 SSSPFSNIENKRDHSKQQQA-SFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFG 162
           SSSPFS+       S    A S P+   S+ PS     S+F G  I    P   +     
Sbjct: 39  SSSPFSSTTTFGASSSPAFAISVPTFGASSTPSFGSSTSSFGGSSIFSQKPAFGFG---- 98

Query: 163 KSTSTPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYP- 222
            STST    S  G+ +  +QP FG                   +S   S+  F  +  P 
Sbjct: 99  -STST--QASPFGSTTQQSQPAFG-------------------SSLFSSSTPFEASSQPA 158

Query: 223 YPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLT------------FGESTTPSFLASTMLPFG-- 282
           +   S PAF      A  A +   FG T            FG ++TP+F A+    FG  
Sbjct: 159 FGATSLPAFGATSSPAFGATNTPPFGATSTPPFGSSSTSAFGATSTPAFRATRSPAFGSS 218

Query: 283 TPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATTTPAFGASTTP-F 342
           T A GA+ T AFGA++  AF  ++   FGA++TP FG S+T+ FGAT+T AFGA+++P F
Sbjct: 219 TSAFGATSTSAFGATSSPAFGATSTPPFGATSTPPFGSSSTSAFGATSTSAFGATSSPAF 278

Query: 343 GASITPAFGA-STTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAP 402
           GA+ TP FGA ST PFG S+  AFG ++ P+F A++ PAFG++++PAFG+ST+ +   + 
Sbjct: 279 GATNTPPFGATSTPPFGSSSTSAFGATSTPAFGATSSPAFGATSSPAFGSSTSAIGATST 338

Query: 403 SVFPPSTS-AFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPSSFCFPPSKSAFGVTISHP 462
           S F  ++S AFGA + P FGA++ P    A +   F AS+ S+F    S SAFG T S P
Sbjct: 339 SAFGATSSPAFGATSSPIFGATSTPPF-RATNTPPFGASSTSTF-GATSTSAFGAT-SLP 398

Query: 463 VLGEPSKNQF---SYPPNAVHSTNPISSKN 471
             G  S   F   + PP    ST P  S +
Sbjct: 399 AFGATSSPAFGATNTPPFGTTSTPPFGSSS 399
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. NCBI nr
Match: gi|658063077|ref|XP_008367451.1| (PREDICTED: uncharacterized protein DDB_G0274915-like [Malus domestica])

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 2.300e-27
Identity = 121/295 (41.02%), Postives = 160/295 (54.24%), Query Frame = 1 

		  

Query: 146 PIPGSPPT-AAYAPPFGKSTSTPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQI 205
           P P S    AA +P FG +T         G  SS +   FGG  G   K       F   
Sbjct: 69  PFPSSTTFGAASSPAFGNTTPA------FGATSSPSPSPFGGSSGFGQK-----PVFGAF 128

Query: 206 NSTAPSTNVFANAGYP-YPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLTFGESTTPSFLASTML 265
            S    T+ F +   P  P +    F +  P   ++Q        FG +TTP+F A++  
Sbjct: 129 GSNPAQTSPFGSTTQPSQPAFGSSVFGSSTPFGGSSQP------AFGATTTPAFGATS-- 188

Query: 266 PFGTPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATTTPAFGASTT 325
              TPA GA+ TPAFGA++  AF  ++  AFGA+TTPAFG +TT  FGAT+TPAFGA+TT
Sbjct: 189 ---TPAFGATSTPAFGATSSPAFGATSSPAFGATTTPAFGATTTPAFGATSTPAFGAATT 248

Query: 326 P-FGASITPAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGF 385
           P FGA+ +PAFG++T+P   ST  AFGVS++P F   +  AFG+S+TPAFG+        
Sbjct: 249 PAFGATSSPAFGSTTSPTFGSTGAAFGVSSSPLF--GSGGAFGASSTPAFGS-------- 308

Query: 386 APSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPSSFCFPPSKSAFG 438
                  S+S FG  T P FGAS+ P  GS+++ S    STP+   F  S SAFG
Sbjct: 309 -------SSSTFGTSTNPAFGASSAPGFGSSSTPSFSFPSTPT---FGQSSSAFG 321
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. NCBI nr
Match: gi|1012238991|ref|XP_015940383.1| (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 [Arachis duranensis])

HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 4.000e-27
Identity = 132/338 (39.05%), Postives = 175/338 (51.78%), Query Frame = 1 

		  

Query: 99  SSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQQASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAP 158
           S+ F+  PF +       +        ST        S   S+   F    SP   + AP
Sbjct: 29  SNPFAPKPFGSTNPFGSQTGSSIFGGTSTGVFGAAQPSSPFSSTTTFGASSSPAFGSSAP 88

Query: 159 PFGKSTSTPQH---VSQIGTPSSSAQ-PVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVF 218
            FG S+STP      S  G  S   Q PVFGGF                  ST   T+ F
Sbjct: 89  AFGASSSTPAFGGSSSSFGGSSVFGQKPVFGGF-----------------GSTPTQTSPF 148

Query: 219 ANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFGTPALGASI 278
            +A  P    S PAF         +  FG+    FG S+ P+F ++     GTPA GA+ 
Sbjct: 149 GSATQP----SQPAF--------GSSIFGS-STPFGASSQPAFGST-----GTPAFGATS 208

Query: 279 TPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASITP--- 338
           TPAFGAS+  AF  ++  AFGA++TPAFG ++T  FG+T++P+FG + + FG S T    
Sbjct: 209 TPAFGASSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSTPAFGSTSSPSFGNTGSAFGGSNTSVFG 268

Query: 339 ---AFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPS-VF 398
              AFGAST+PFG S+APAFG S+ P F AS+ PAFG+S+TPAFGAS+TP   F  +  F
Sbjct: 269 GGGAFGASTSPFGASSAPAFGTSSTP-FGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFSFGSTPAF 325

Query: 399 PPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPS 426
             S+SAFG  T   FG+++ P  G    +S F + TPS
Sbjct: 329 GQSSSAFGGST--PFGSTSSPFGG---QSSAFGSQTPS 325
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. NCBI nr
Match: gi|769816616|ref|XP_011621883.1| (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP98A [Amborella trichopoda])

HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 1.200e-26
Identity = 130/323 (40.25%), Postives = 167/323 (51.70%), Query Frame = 1 

		  

Query: 159 PFGKSTSTP-QHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANA 218
           PFG+S+S+P    S  G P+++    F      +     +Q        T  ST VF   
Sbjct: 7   PFGQSSSSPFGSPSVFGQPTNANNNPFAPKPFGSPTPFGSQTGSSIFGGT--STGVFGAT 66

Query: 219 GYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQH---FGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFG-------T 278
               P+ S PAF      A  A     FG+    FG ++TP+F A +   FG        
Sbjct: 67  QPSSPLGSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGSSTPAFGATSTPAFGAGSSSAFGGSSIFGQK 126

Query: 279 PALGA-----SITPAFGASTMSAFP--GSTMLA----FGASTTPAFGVSTTATFGATTTP 338
           PA G      S T  FG +     P  GST+      FGAS+ PAFG + T  FG+TTTP
Sbjct: 127 PAFGGFGSSPSQTSPFGGAFQQTQPAFGSTLFGSTSPFGASSQPAFGATGTPGFGSTTTP 186

Query: 339 AFGASTTP-FGASITPAFGASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGA 398
           AFG++TTP FGAS TPAFG S++P FG S+APAFG S+ P F  S+ PAFG+S+TPAFGA
Sbjct: 187 AFGSTTTPAFGASSTPAFGVSSSPAFGASSAPAFGASSTPVFGGSSIPAFGTSSTPAFGA 246

Query: 399 STTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFA--ASTPSSFCFPPS 456
           S+TP  G +      ST AFGA + P+FG  + PA G   S  G A   +TP+S  F   
Sbjct: 247 SSTPAFGAS------STPAFGASSTPSFGFGSTPAFGQTTSTFGSAPFGTTPTS--FGAQ 306
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9RQ08_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_047450 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 5.300e-220
Identity = 404/410 (98.54%), Postives = 404/410 (98.54%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1   MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAM 60
           MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAM
Sbjct: 1   MGFPLDRVRYLDRTGASQSQSTSFSFGPGFVNNEQIGSNKTPYTPTYGGSSERFMSLSAM 60

Query: 61  NDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQ 120
           NDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQ
Sbjct: 61  NDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFSNIENKRDHSKQQ 120

Query: 121 QASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQHVSQIGTPSSSA 180
           QASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQH SQIGTPSSSA
Sbjct: 121 QASFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQHASQIGTPSSSA 180

Query: 181 QPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQ 240
           QPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQ
Sbjct: 181 QPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQ 240

Query: 241 HFGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTP 300
           HFGNFGLTFGESTTPSF AS MLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFP STMLAFGASTTP
Sbjct: 241 HFGNFGLTFGESTTPSFPASAMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPASTMLAFGASTTP 300

Query: 301 AFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASITPAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPAST 360
           AFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASI PAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPAST
Sbjct: 301 AFGVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASIRPAFGASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPAST 360

Query: 361 PPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPAS 411
            PAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPAS
Sbjct: 361 TPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPAS 410
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: V4T8K5_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10000333mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 1.600e-27
Identity = 144/390 (36.92%), Postives = 199/390 (51.03%), Query Frame = 1 

		  

Query: 103 SSSPFSNIENKRDHSKQQQA-SFPSTVFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFG 162
           SSSPFS+       S    A S P+   S+ PS     S+F G  I    P   +     
Sbjct: 39  SSSPFSSTTTFGASSSPAFAISVPTFGASSTPSFGSSTSSFGGSSIFSQKPAFGFG---- 98

Query: 163 KSTSTPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYP- 222
            STST    S  G+ +  +QP FG                   +S   S+  F  +  P 
Sbjct: 99  -STST--QASPFGSTTQQSQPAFG-------------------SSLFSSSTPFEASSQPA 158

Query: 223 YPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLT------------FGESTTPSFLASTMLPFG-- 282
           +   S PAF      A  A +   FG T            FG ++TP+F A+    FG  
Sbjct: 159 FGATSLPAFGATSSPAFGATNTPPFGATSTPPFGSSSTSAFGATSTPAFRATRSPAFGSS 218

Query: 283 TPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATTTPAFGASTTP-F 342
           T A GA+ T AFGA++  AF  ++   FGA++TP FG S+T+ FGAT+T AFGA+++P F
Sbjct: 219 TSAFGATSTSAFGATSSPAFGATSTPPFGATSTPPFGSSSTSAFGATSTSAFGATSSPAF 278

Query: 343 GASITPAFGA-STTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAP 402
           GA+ TP FGA ST PFG S+  AFG ++ P+F A++ PAFG++++PAFG+ST+ +   + 
Sbjct: 279 GATNTPPFGATSTPPFGSSSTSAFGATSTPAFGATSSPAFGATSSPAFGSSTSAIGATST 338

Query: 403 SVFPPSTS-AFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPSSFCFPPSKSAFGVTISHP 462
           S F  ++S AFGA + P FGA++ P    A +   F AS+ S+F    S SAFG T S P
Sbjct: 339 SAFGATSSPAFGATSSPIFGATSTPPF-RATNTPPFGASSTSTF-GATSTSAFGAT-SLP 398

Query: 463 VLGEPSKNQF---SYPPNAVHSTNPISSKN 471
             G  S   F   + PP    ST P  S +
Sbjct: 399 AFGATSSPAFGATNTPPFGTTSTPPFGSSS 399
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: W1P2F0_AMBTC (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Amborella trichopoda GN=AMTR_s00045p00157300 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 8.100e-27
Identity = 130/323 (40.25%), Postives = 167/323 (51.70%), Query Frame = 1 

		  

Query: 159 PFGKSTSTP-QHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANA 218
           PFG+S+S+P    S  G P+++    F      +     +Q        T  ST VF   
Sbjct: 20  PFGQSSSSPFGSPSVFGQPTNANNNPFAPKPFGSPTPFGSQTGSSIFGGT--STGVFGAT 79

Query: 219 GYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQH---FGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFG-------T 278
               P+ S PAF      A  A     FG+    FG ++TP+F A +   FG        
Sbjct: 80  QPSSPLGSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGSSTPAFGATSTPAFGAGSSSAFGGSSIFGQK 139

Query: 279 PALGA-----SITPAFGASTMSAFP--GSTMLA----FGASTTPAFGVSTTATFGATTTP 338
           PA G      S T  FG +     P  GST+      FGAS+ PAFG + T  FG+TTTP
Sbjct: 140 PAFGGFGSSPSQTSPFGGAFQQTQPAFGSTLFGSTSPFGASSQPAFGATGTPGFGSTTTP 199

Query: 339 AFGASTTP-FGASITPAFGASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGA 398
           AFG++TTP FGAS TPAFG S++P FG S+APAFG S+ P F  S+ PAFG+S+TPAFGA
Sbjct: 200 AFGSTTTPAFGASSTPAFGVSSSPAFGASSAPAFGASSTPVFGGSSIPAFGTSSTPAFGA 259

Query: 399 STTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFA--ASTPSSFCFPPS 456
           S+TP  G +      ST AFGA + P+FG  + PA G   S  G A   +TP+S  F   
Sbjct: 260 SSTPAFGAS------STPAFGASSTPSFGFGSTPAFGQTTSTFGSAPFGTTPTS--FGAQ 319
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0A0LN95_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_2G433410 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 2.000e-25
Identity = 123/320 (38.44%), Postives = 167/320 (52.19%), Query Frame = 1 

		  

Query: 166 TPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAP-------------STN 225
           +P    Q  T   ++QPVFG         + N  A     ST+P             ST 
Sbjct: 4   SPNPFGQPSTSPFASQPVFGQ----TANASNNPFAPKPFGSTSPFGPQTGNTVFGGTSTG 63

Query: 226 VFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLTFGESTTPSFLASTMLPFG------ 285
           VF  A    P   FP+  T    ++ A  FG    TFG S+TP+F +S+   FG      
Sbjct: 64  VFGAAQSSSP---FPSTTTFGGSSSPA--FGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFG 123

Query: 286 ----------TPA-------LGASITPAFGASTM---SAFPGSTMLAFGASTTPAFGVST 345
                     TPA             PAFG++     S F   +  AFGA++TPAFG ++
Sbjct: 124 QKPLFGGFGSTPAQTNPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGSTS 183

Query: 346 TATFGATTTPAFGASTTP-FGASITPAFGASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAF 405
           T  FGAT+TPAFGA++TP FGA+ TPAFGA++TP FG ++ PAFG ++ P+F A++ PAF
Sbjct: 184 TPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGAASTPAFGATSSPAF 243

Query: 406 GSSTTPAFGAS-------TTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASAS 438
           GS++TPAFG++       +TPV G        ST AFGA + P FGAS+ PA G++++ S
Sbjct: 244 GSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPS 303
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: R0GUQ5_9BRAS (Uncharacterized protein OS=Capsella rubella GN=CARUB_v10008140mg PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 2.600e-25
Identity = 130/318 (40.88%), Postives = 162/318 (50.94%), Query Frame = 1 

		  

Query: 126 STVFSALPSQSGLLSAFPG-FPIPGSPPTAAYAPPFGKSTSTPQHVSQIGTPSSSAQPVF 185
           ST F+A    S   S   G F  P +    A  P FG S+S     S     +S A   F
Sbjct: 128 STPFAAQTGSSIFGSTSTGVFGAPQASSPFASTPTFGASSSPAFGNSTPAFGASPASSPF 187

Query: 186 GGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGN 245
           GG  G   K          +  + P +N F +              T++   +A   FGN
Sbjct: 188 GGSSGFGQK---------PLGFSTPQSNPFGS--------------TVQQSQSA---FGN 247

Query: 246 --FGLT--FGESTTPSFLASTMLPFG---TPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGAS 305
             FG +  FG + TP+F AS+   FG   TP+ GAS TPAFGA+   AF  S   +FG +
Sbjct: 248 STFGSSTPFGATNTPAFGASSTPSFGATSTPSFGASSTPAFGATNTPAFGASNSSSFGVT 307

Query: 306 TTPAFGVSTTATFGATTTP----------AFGASTTP-FGASITPAFGASTTP-FGLSTA 365
            TPAFG S T  FG+T T           AFGAS+TP FGAS TPAFGAS TP FG S+ 
Sbjct: 308 NTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAFGASSTPAFGASSTPAFGASGTPAFGASST 367

Query: 366 PAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPS-VFPPSTSAFGAPTLPTFGA 423
           PAFG S+ P+F AS+ PAFG+S+TP+FGAS T    F  S  F  STSAFG+     FG+
Sbjct: 368 PAFGTSSTPAFGASSTPAFGASSTPSFGASNTSSFSFGSSPAFGQSTSAFGS---SAFGS 416
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NU98B_ARATH (Nuclear pore complex protein NUP98B OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP98B PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 2.200e-25
Identity = 123/305 (40.33%), Postives = 156/305 (51.15%), Query Frame = 1 

		  

Query: 160 FGKSTSTPQHVSQIGTP-SSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAP---STNVFA 219
           FG S + P   S I +P  +    +FG     N   + N  A     ++ P    T    
Sbjct: 2   FGSSNNNPFGQSSISSPFGTQTHSLFGQ---TNNNASNNPFATKPFGTSTPFGAQTGSSM 61

Query: 220 NAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLTFGESTTPSFLASTM-----LPFGTPAL 279
             G    V+  P   T  P  A+ Q FG+    FG S+TPSF +S         FG  + 
Sbjct: 62  FGGTSTGVFGAPQ--TSSPFGASPQAFGSSTQAFGASSTPSFGSSNSPFGGTSTFGQKSF 121

Query: 280 GASIT-------------PAFGASTMSA---FPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATT 339
           G S               PAFG ST  +   F  ST  AFGAS+TPAFGVS T+ FGAT 
Sbjct: 122 GLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAFGASSTPAFGVSNTSGFGATN 181

Query: 340 TPAFGA-STTPFGASITPAFGASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAF 399
           TP FGA +TT FG S TP FGAS+TP FG +  PAFG S+ P F +S+ PAFG+S  PAF
Sbjct: 182 TPGFGATNTTGFGGSSTPGFGASSTPAFGSTNTPAFGASSTPLFGSSSSPAFGASPAPAF 241

Query: 400 GASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPSSFCFPPS 438
           G+S    + F  + F  S  AFG+ + PTFGAS   A G+++S S    S+P+   F  S
Sbjct: 242 GSSG---NAFGNNTF-SSGGAFGSSSTPTFGASNTSAFGASSSPSFNFGSSPA---FGQS 294
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NU98A_ARATH (Nuclear pore complex protein NUP98A OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP98A PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 3.700e-25
Identity = 150/397 (37.78%), Postives = 190/397 (47.86%), Query Frame = 1 

		  

Query: 49  GSSERFMSLSAMNDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFS 108
           GSS  F   S  + + ++S            + G +S T  + P     P    +S+PF+
Sbjct: 3   GSSNPFGQSSGTSPFGSQS------------LFGQTSNTSSNNPFAPATPFG--TSAPFA 62

Query: 109 NIENKRDHSKQQQASFPST---VFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTS 168
                   ++   + F ST   VF A P  S   ++ P F    SP      P FG S  
Sbjct: 63  --------AQSGSSIFGSTSTGVFGA-PQTSSPFASTPTFGASSSPAFGNSTPAFGAS-- 122

Query: 169 TPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYP-YPVY 228
                     P+SS    FGG  G   K          +  + P +N F N+     P +
Sbjct: 123 ----------PASSP---FGGSSGFGQK---------PLGFSTPQSNPFGNSTQQSQPAF 182

Query: 229 SFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLT----FGESTTPSFLASTMLPFG---TPALGASITPA 288
              +F +  P          FG T    FG  +TPSF A++   FG   TPA GA+ TPA
Sbjct: 183 GNTSFGSSTP----------FGATNTPAFGAPSTPSFGATSTPSFGASSTPAFGATNTPA 242

Query: 289 FGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGAT---TTPAFGASTTP-FGASITPAF 348
           FGAS   +F  +   AFGAS TPAFG ST  TFG T   +  AFGAS TP FGAS TPAF
Sbjct: 243 FGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFG-STGTTFGNTGFGSGGAFGASNTPAFGASGTPAF 302

Query: 349 GASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPS-VFPPST 408
           GAS TP FG S+ PAFG S+ P+F AS+ PAFG S+TP+FGAS T    F  S  F  ST
Sbjct: 303 GASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASNTSSFSFGSSPAFGQST 338

Query: 409 SAFGAPTLPTFGASTLPASGSAAS-----ASGFAAST 424
           SAFG+     FG++  P  G+ AS      SGF  ST
Sbjct: 363 SAFGS---SAFGSTPSPFGGAQASTPTFGGSGFGQST 338
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: NUP62_ARATH (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana GN=NUP62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 9.300e-8
Identity = 88/250 (35.20%), Postives = 124/250 (49.60%), Query Frame = 1 

		  

Query: 246 GLTFGESTTPS-FLASTMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGAS--TTPAF 305
           G  FG+S +   F   +     + +  ++ +P   +   S+ P ST   FG+S  +TPA 
Sbjct: 3   GFPFGQSNSVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGFGSSVSSTPAS 62

Query: 306 GVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASITPAFG----ASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPA 365
             + +  FGA++TP+FG  ++   +S TP+FG    AS TP   ST P+FG  TA S  A
Sbjct: 63  STTPSFGFGASSTPSFGFGSS--ASSSTPSFGFGSSASVTP--ASTTPSFGFGTAASSSA 122

Query: 366 STPPAFGSSTTPAFGAS--TTP---VSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSA 425
             P  FGSSTT A  A+  ++P   V+  A S   PS+S FGAP       S+ P   + 
Sbjct: 123 PAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAP 182

Query: 426 ASAS-GFAASTPSSFCFPPSKSA-----FG-----VTISHPVLGEPSKNQFSYPPNAVHS 473
           AS S     S+PS F  P S SA     FG      T + P+ G PS    + P  +V S
Sbjct: 183 ASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVAS 242
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G59660.1 (Nucleoporin autopeptidase)

HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 1.200e-26
Identity = 123/305 (40.33%), Postives = 156/305 (51.15%), Query Frame = 1 

		  

Query: 160 FGKSTSTPQHVSQIGTP-SSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAP---STNVFA 219
           FG S + P   S I +P  +    +FG     N   + N  A     ++ P    T    
Sbjct: 2   FGSSNNNPFGQSSISSPFGTQTHSLFGQ---TNNNASNNPFATKPFGTSTPFGAQTGSSM 61

Query: 220 NAGYPYPVYSFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLTFGESTTPSFLASTM-----LPFGTPAL 279
             G    V+  P   T  P  A+ Q FG+    FG S+TPSF +S         FG  + 
Sbjct: 62  FGGTSTGVFGAPQ--TSSPFGASPQAFGSSTQAFGASSTPSFGSSNSPFGGTSTFGQKSF 121

Query: 280 GASIT-------------PAFGASTMSA---FPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGATT 339
           G S               PAFG ST  +   F  ST  AFGAS+TPAFGVS T+ FGAT 
Sbjct: 122 GLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAFGASSTPAFGVSNTSGFGATN 181

Query: 340 TPAFGA-STTPFGASITPAFGASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAF 399
           TP FGA +TT FG S TP FGAS+TP FG +  PAFG S+ P F +S+ PAFG+S  PAF
Sbjct: 182 TPGFGATNTTGFGGSSTPGFGASSTPAFGSTNTPAFGASSTPLFGSSSSPAFGASPAPAF 241

Query: 400 GASTTPVSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSAASASGFAASTPSSFCFPPS 438
           G+S    + F  + F  S  AFG+ + PTFGAS   A G+++S S    S+P+   F  S
Sbjct: 242 GSSG---NAFGNNTF-SSGGAFGSSSTPTFGASNTSAFGASSSPSFNFGSSPA---FGQS 294
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT1G10390.1 (Nucleoporin autopeptidase)

HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 2.100e-26
Identity = 150/397 (37.78%), Postives = 190/397 (47.86%), Query Frame = 1 

		  

Query: 49  GSSERFMSLSAMNDYSNKSHEELRYEDYQLGIKGTSSETEYSEPVQAPLPSSLFSSSPFS 108
           GSS  F   S  + + ++S            + G +S T  + P     P    +S+PF+
Sbjct: 3   GSSNPFGQSSGTSPFGSQS------------LFGQTSNTSSNNPFAPATPFG--TSAPFA 62

Query: 109 NIENKRDHSKQQQASFPST---VFSALPSQSGLLSAFPGFPIPGSPPTAAYAPPFGKSTS 168
                   ++   + F ST   VF A P  S   ++ P F    SP      P FG S  
Sbjct: 63  --------AQSGSSIFGSTSTGVFGA-PQTSSPFASTPTFGASSSPAFGNSTPAFGAS-- 122

Query: 169 TPQHVSQIGTPSSSAQPVFGGFRGCNCKCNCNQRAFPQINSTAPSTNVFANAGYP-YPVY 228
                     P+SS    FGG  G   K          +  + P +N F N+     P +
Sbjct: 123 ----------PASSP---FGGSSGFGQK---------PLGFSTPQSNPFGNSTQQSQPAF 182

Query: 229 SFPAFVTIRPDAAAAQHFGNFGLT----FGESTTPSFLASTMLPFG---TPALGASITPA 288
              +F +  P          FG T    FG  +TPSF A++   FG   TPA GA+ TPA
Sbjct: 183 GNTSFGSSTP----------FGATNTPAFGAPSTPSFGATSTPSFGASSTPAFGATNTPA 242

Query: 289 FGASTMSAFPGSTMLAFGASTTPAFGVSTTATFGAT---TTPAFGASTTP-FGASITPAF 348
           FGAS   +F  +   AFGAS TPAFG ST  TFG T   +  AFGAS TP FGAS TPAF
Sbjct: 243 FGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFG-STGTTFGNTGFGSGGAFGASNTPAFGASGTPAF 302

Query: 349 GASTTP-FGLSTAPAFGVSTAPSFPASTPPAFGSSTTPAFGASTTPVSGFAPS-VFPPST 408
           GAS TP FG S+ PAFG S+ P+F AS+ PAFG S+TP+FGAS T    F  S  F  ST
Sbjct: 303 GASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASNTSSFSFGSSPAFGQST 338

Query: 409 SAFGAPTLPTFGASTLPASGSAAS-----ASGFAAST 424
           SAFG+     FG++  P  G+ AS      SGF  ST
Sbjct: 363 SAFGS---SAFGSTPSPFGGAQASTPTFGGSGFGQST 338
[Close]
BLAST of Spo02403.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore)

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 5.200e-9
Identity = 88/250 (35.20%), Postives = 124/250 (49.60%), Query Frame = 1 

		  

Query: 246 GLTFGESTTPS-FLASTMLPFGTPALGASITPAFGASTMSAFPGSTMLAFGAS--TTPAF 305
           G  FG+S +   F   +     + +  ++ +P   +   S+ P ST   FG+S  +TPA 
Sbjct: 3   GFPFGQSNSVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGFGSSVSSTPAS 62

Query: 306 GVSTTATFGATTTPAFGASTTPFGASITPAFG----ASTTPFGLSTAPAFGVSTAPSFPA 365
             + +  FGA++TP+FG  ++   +S TP+FG    AS TP   ST P+FG  TA S  A
Sbjct: 63  STTPSFGFGASSTPSFGFGSS--ASSSTPSFGFGSSASVTP--ASTTPSFGFGTAASSSA 122

Query: 366 STPPAFGSSTTPAFGAS--TTP---VSGFAPSVFPPSTSAFGAPTLPTFGASTLPASGSA 425
             P  FGSSTT A  A+  ++P   V+  A S   PS+S FGAP       S+ P   + 
Sbjct: 123 PAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAP 182

Query: 426 ASAS-GFAASTPSSFCFPPSKSA-----FG-----VTISHPVLGEPSKNQFSYPPNAVHS 473
           AS S     S+PS F  P S SA     FG      T + P+ G PS    + P  +V S
Sbjct: 183 ASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVAS 242
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo02403.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 5
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|902228145|gb|KNA20994.1|7.6e-22098.5hypothetical protein SOVF_0474... [more]
gi|567880195|ref|XP_006432656.1|2.3e-2736.9hypothetical protein CICLE_v10... [more]
gi|658063077|ref|XP_008367451.1|2.3e-2741.0PREDICTED: uncharacterized pro... [more]
gi|1012238991|ref|XP_015940383.1|4.0e-2739.0PREDICTED: nuclear pore comple... [more]
gi|769816616|ref|XP_011621883.1|1.2e-2640.2PREDICTED: nuclear pore comple... [more]
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BLAST of Spo02403.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 5
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0K9RQ08_SPIOL5.3e-22098.5Uncharacterized protein OS=Spi... [more]
V4T8K5_9ROSI1.6e-2736.9Uncharacterized protein OS=Cit... [more]
W1P2F0_AMBTC8.1e-2740.2Uncharacterized protein (Fragm... [more]
A0A0A0LN95_CUCSA2.0e-2538.4Uncharacterized protein OS=Cuc... [more]
R0GUQ5_9BRAS2.6e-2540.8Uncharacterized protein OS=Cap... [more]
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BLAST of Spo02403.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 3
Match NameE-valueIdentityDescription
NU98B_ARATH2.2e-2540.3Nuclear pore complex protein N... [more]
NU98A_ARATH3.7e-2537.7Nuclear pore complex protein N... [more]
NUP62_ARATH9.3e-835.2Nuclear pore complex protein N... [more]
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BLAST of Spo02403.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 3
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G59660.11.2e-2640.3Nucleoporin autopeptidase[more]
AT1G10390.12.1e-2637.7Nucleoporin autopeptidase[more]
AT2G45000.15.2e-935.2structural constituent of nucl... [more]
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR23198NUCLEOPORINcoord: 245..455
score: 2.2
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR23198:SF4NUCLEOPORIN AUTOPEPTIDASEcoord: 245..455
score: 2.2

GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006334 nucleosome assembly
cellular_component GO:0000786 nucleosome
cellular_component GO:0005634 nucleus
molecular_function GO:0003677 DNA binding
RNA-Seq Expression