Spo01949 (gene)

Overview
NameSpo01949
Typegene
OrganismSpinacia oleracea (Spinach)
DescriptionUnknown protein
LocationSpoScf_03796 : 5350 .. 15382 (+)
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGGGAGGAAAAATATGCGAAGTTACTCCCAAACTCCATCATCGCTTCTCAAATCCGAAAGAAGACTCACATCAAAGACCCCAAGGTTTTACCCCTAATTGACCTAATCTTAAATTTATTTTTATATTATCTGGGTAATCTTTTAGAAACTTTCGTTATTTTGTGTGAGTAGGGTAAATTGTAATGTTTTTTATCGTCGATTCGTCGTGTTTCGAATACGTAGACATTGATTGTATTATTGTGTTGTAATGTTGGCGGTTTTAGCTCCTTTTTGGTGGTTATGTTTAGCATAAGAATTAAAATTGGCTCAATGCAAAACAATCATGTAAATGCTGAATTTCGATTTTAGATAAATCTTCGGTATTTATTACAGAATAAACATAAATGCTCGGTTTCTATTTCTTGGTTTGTATCTTGCTTTAGTTAAAAGTTTAATTTGAATTATGGTTATAATGTTAATTAACCATACCCCCCCTTGGTTTTAAAATACATGCACACATGTACACACACTTTGGAGAATTAATCTGAAGCTTGGTTTATATGCGAAGCTAGACTTATGATCCTGGTGGTGATGCGGGATGTGACTATATACAACAGAGGCAGCAACTTAAGTTGGCAGGCCAATCTCTTCACTTGGACTGGTAGTTACAGTAGATTTCTTGAATTTGCTGCTTTATAACCAGGGGTCTTTTTACAATGGAAGCCGGTATGACTTTTTCAACGTTAACGGAACTCTTCCGGAAGAGGTCGAGCCTTCATTTATCAACAAGGTCGAGCCCGGCCCATTGAACATGTATATGATAGGAAAATATCAAATTAGTTGTATATGATTACTTTGTACTCCATAATCCGTATATATGATGTTTCTCTAGGCTTTTTATCCTCTTTATTTTGTTTGTGCATGAGATAAAGTATTATATAATATCGTATTCTTGTTATTCAATTGACTTAGCTTATACATAGTACGGGTAGTATATACTTATTATTTTAAGATGTTTTTAAGTCAGATTACATGAACATGTTCTAATACAATTGTGTAAGTTGTTAATCTAAGGATTGGTGAACCTTCCCCTAACATTGCTTCCTTTCTCCTTGCAGATAAAACCTGTTAAAGTCCGGCAAGCTGTTGGCTTACTTCTGAAAAATAATCTTAGAACTGCGCGCTTTCAAAACTATGGCCCCAACTAATCAGCAATATATGAATCAGAGTTGTTTCCTTGTCTTGTATCACCTGATAGGCACATCCGTACAACTGTTGGGATCACAATTAGTGTTATTATGCAGCTTGTAGGAGTTATTGGTTGACCTGAGACGTTGCAGGCTCTCTTAACTCATTTAGACATACTGATCTTAGTCAGGTCAAAGTGGCTATGGTTGCTTTATCAAAGGTATGACTATCCACTGGTTGATATACAACAGTGAATCAAATACGAAATACTTTACTTTTCGCTCCTTTTTTCACCTATTACGATCAATAACGGATTTTGTTGGTGTTATATGTATTATCTGGTAGTTGATTTTTTTTGAAAATTAATTGATTATACTATATTTTTGGTAATGACTTCTGAATTTGGGTGTTTGGTTCTGATTTGTGAATCGATTTAGTAGTATTCAGTTGTCGATCATCTCCATCTTCTATTCTAGATATTCTCTCGAAGTGGTCGTTGCTAATTTTTCTTTTTGAATCTCTATCAATTAATTAATTCTATATATTTGGGTTTTTAGGGTATATTTCTAACTTTAATTGTGGGGTTTCAAATTTGGGAACTGTCGTTGTCAGTTTTAGTTTGGTTTTGGGGTGATCACTTTGAATTAATTTATGTGTGGGGTATTTTGGAGGAGTTGTGTTATTTTATTGGTTATTCATCCCAAGTTGGTAGAAGGGGTTGTGGTATAATGGTGGTTATGGGGATCCAAAGACTAAGGACTGTAGTGGAAGTTAGAAGGTGGCTGCGAATGAGCTGCCGAGTTTTGATCCTCCAATACCAATCTCTAATACATTGTAAATTTATCCCCCTTATATTGTTATCTTTTTTATTATTAGATTTAGAGTTTTTATAGTGTTGATTTGTTTACCTACCTTTTGATCTAATTACAAGTTATTTGAATTGAATATGTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTCTTTTGGAAAGGAAATCTCAACTCTAATTGGGAAACTTAATTAAGATTTACTTATTCTTAATACTTAATACTTAATGTTAGTTTGCTAGCTTGTGACATTTGGTGAGTATTTGATCTATTTTTGGATATAGTGATTGGAGGAAGTTCGAGTTGGACATGTCGGTTTTTAGTAGTGATTGGAGATTTGGAGGATATAGTGATTGAAAGATGTATGAAATCATGTCAGTTTTGAGTAATTCTTATGATTTTTGAAGATTGAGAAGGTATTATGGTGTTTTCATATATAAGTAAGAAGTACAATAACTGAGTATGGTTCCGCTTTTTCAACTAAGTGAAAGTAGTTCATATGGTCTTTGAAGATCGAGAAGGTATTATGGTGTTTTGGTGGGGAAGTAAGACGTACAATCACTGTTTATGCTGTTTATTTTTTGCATCGAAAAAAACTTATTATGGGTCTGCTTTTCAACGAAATGAATAAAATGGATACAACTTTACCAGTTATTATTCTGGAGGGTATTCATAATGTGAATTCATTTTCAGGTTTGAAGGATCTGTGATATTTTTCTTTTAAAAAAAATTCTTATTTATATATTTTTTTAAAATCTTAAATCTTATTTATATATGTATTTAAAATATTATTTATCAATTAGTCATTGGTGACAGATTTTACTCTGATTCTTTAAGGTATGGGGTAATTGGCACTCTGTCATGCATATGGAGACTTCACAGAACCATTATATTGGAGTGTAAATGACCTGGAATTTATTTGCATTGAAACAGGAAATCATTCACAATATTTAAAGAGGAAACGGGCTATCCCTGGTACAGCTTTGGCGGCGACACTTGCTTCCGCAACTATAGTTTCATATTCTATTCCCGATGTATGTTCACAAGGTGCCCGTTCTCACTGCATACAGAAGACCAAAGAGATGGGTACCTAGCAGGGAATGAAGAGAGTTGGTATATGTATGGTTTATTTAACTGGAGAGGTGTGTATTTAGTTATTTTATTATTCATAAATCAAATGTGCGCTATCTCTAGCTTCAGATTTCAACATTTGGATATACCCTTAGACCTTTGATGTGTAACCGATTTACTGAACATTATATTTGTGGAATGAGTTCACGTGCACATGTACATAATTACTGAACACGGTTGGTGATTAACACATTCTTAGCATTCTGGTGTTTGGTTTCGGCAGGTGAGCTGTAGGATTATTATATAGGTTATATTATAGAATCTTCCTAGAAGTTTTACTTGAGAAGTTGTCTACTATTGTATTATTCTGCTCTGCGCAGCTGCTAGCTTATTGTGGAAGGTACAATTGCATATTTGGTAACCTTTATCTCTCCAATTCTGTTACTGTATTATTCTGCTCTTCTGCTCAGCTGATATCTGTAGCTCGAGCCTTTGACATTAATTCAGCACTTCAGCATTGCATACGTCATTTCTCTCCTAAACAATGAAAGCATTAAGAGCCACACTGACAGGGCTTGGTTTCAACATGATGTTAGTTTCCTAGATCATGAATGGATGGCACCGGCAAGGGGGATGGGCCTTGAGACTTCCTATGAATTCATTCATAAAGGTATATTTCCTCTTTTGTAATTACAAATTTTTGTAAAGACGTAAAACGAAAGTGTAAAAACTTAATTGGGACGGAGGGAGTATTAAGTTTGAAATAACTAATTTTTTCATGTACACAAAGGAAAATGACCAGGTGTATGTTTATATGGTACATATAATCTTTGCCATTTTCATAATTGGAGGAAGGTACTGAAATGTTTAATAAATGTTGCAGAATCGTATTCATAATTGGAGGAAGACGACTCTAAGTTTGACTTGTATTCTATTTCTAGCTGCTGCATGCAATATGGTTTATACTTTATACGTAAGAGTCTTATCTGCATCTTTCCTTCCATCACCTTTTATTTCTGGGCCAAACCTTTCCTCTTGCAACATTATTCCCTTGGAAATAAAAAAAAGGTGGTGTTCATTATTAAGGCATTGTCCACTGCACATATGTCCACTTTAAAGATGATGTTCAGTCCTAGCTCTTAGGGACCAACTAATCTAACTAGAGTCTGCATTGATATAAGATATTACAAAATACCAGAAGTAACAAGTATGTGTTTTCCTTAAGAAGCGTACTGATTAATTCTTTAAACTTTATTATGCCAAGTGGGTTCATGGCTGAGTTCAGTTTCTTTTGTCACCAACTCTCTTGAGTCTCTTCTACTACAGCTCCCTGGTTCCAACAAAGAGAAGAAATAGCTTGCTTGGGGTCTACTTAACCAAGTCCGATATTATAGGTTTGCTTGAGAGAGATGATACTTGTGACAAGAAGTTGCATCTCAATAGAAAAGGAACGTTTTAGAAGCTTGTCTATTATATGAAAATACGATTTTATCATGACATTTCTCATTTATCATCTTCCTTGCACTATTCACAAAATTATAAGTGTCCGTCTTTTACCGAAATTTTTTACAAGATCATTTTTTATACCTTGGGGATCCAACAACTAGTTTTACAAAAAAAACATACAATGAGTTGAGAAATAAATAGTCATAAGTTCAAATATAAACTTTTAATTTGATCGACTTATGAATATATGACTTGAGTTACACATTATAATTAAACCGTATAAACTTTATAATTAGAAAGCTACACTTTTTAAACAGTTATACTTTATGATAAAATTGTTCTATTTTATATATAAGTAAAAAGTTATATCCTTTTTGTATGGGATCTTGTTTAAATCGACTCAATTTCATGAAAATACTACTTTTTCAACAAAAAAAAATATTTTTTATTTCACGAACATTATAAAAGTTGATAATCCTTCAATCTTAATATAATTAACTTTGAATTGAACACTTTCCTTTTTATTTTTAATTGACATATTTCTTTAGTTATGCTTTTAATGCATAACTTTAAATATTAATATCTTAAATTATCAATAACCAAAATTTATGAAACTAACTTCTTATTTAAAAACAAAATCGAGTTTTATTAGAATACCATGTTATTTGCAGCCTGCGTGATACTCGAAATAAAATTCCCAATACAATTAATAAATATTTGCATCCCCAAAAGAAAAAGGCACCAATTGCAAGGGGAACAACTCTAATTTTGTACATGGGTATTTTATATACAAATTTATGCACATTGCAACATCGATCAAGCTCATAATGAAAATGCGGCAATAAATATTCAAATAGAGGTATATATTGTACTGCCATTTTTGTCAACCAACTCTTAAGGTGAATGATTGATGAAGTGTATGTAGTTATTCATAAACTTATACCATCTCCGTTTTAAAATGATCTTTACACTTTCCGTTTTAGTCCGTTTCATAATGTTCTTTACACTTTGCTTTATTCTATTTTGCGCATGAAAATTTACTACCTTACCCTTCTTACCCCAAAATATTTACATTTTTCCACTCACTTTTTCTTACCTTATTAATTTTGTTTTCTTACATCCACCACCTTTTTACACATTTCTCTTACGTTATTTATATTTTATTATATTCAACCAACTTTTGTACTTTTGTCTTAATATTTGTGCAAACAGTAACCGTAACAATCTTTATGAAACAGAGGTAGTATATTTATTCAATATACCGTCCACGTAGATTTCAATTAATGAAGTTTGTTCTCTTGACATGTCAATACCATGTTAGTTTATAATGTTGCCAAGTATTAACTTAATACTCTTAACCAATTCAATAAAATACCAAGTGCTTTACCGTTAATTAAGCTTCCTACTTTCGAAAAAAATAACTTCAAAGTTAAAATCCTTTATGATTATGAACTTCGTAATTCACAAGAGCGTAAATACAAATATTTACAACTCTTTGTGTACGTGTTGAAAACTATAAATATCGTCTAGCTATAAAGTCTGAGTAATATGTCATGCTCATGGAACTTTATTTGACTTACGATCAAAATTCATTAATATTCACCTTAAAAATGTAAATAATATTTCCTTTGTTCTTTATTTAACACATAATTGAATTTTTACTTTTTTCAATGCACAAATTTGATCTTTAATATCTTTTAATTATAATTTTATTAATATATAAAACAATTACTATTTTAAAATTATACATTGTAAAGAATCTAATAAAATCATGTAGAAAATAATTTATGCAAAAATCATAATACATGGTCAAAAGATAATGTGAAAATAAGACAAACCCGAATTGTTGTAATAAATTAAGAACAATATTAGAAGTATCTTTAAATTGGGATAATAAGAGTAATAATTTAGCTCATAGAAATCTGTTATTACATATGTAACACTTGAATTTGCACGTAGTTATATGATTATTTATGGATAATACATAATAATGAATAAATTAATAAACAAATTGAGTAATAAAATATCAAGTTGACTGGCGCGTGCGTAGTACGCCACGGTTCAACTAGTTAATTAAAATTGAATTGAAAACCCCACCCATGTACTATATTCCACTTTTCCCATGTACTATATTCTCTTTCACATGTACTTCATTCCACTTTTCCATACAACTCAATCATCATTTGTACTTTATTCCACTTTTTCATGTACTATATTCCACTTTTCTTAAAATCTGTGTTTTTGGTCAAACAGGAAGATAATTATGGGACGGAGGGAGTAAGTTGCTAGTTTTGGATTTCTTTTACTCCTAGTGCATATGAATTTCCTACCATTTGTTCGGTACGCAGCATTCAATACAAAAACCAAGCAATGTCTTGGCGTAGTAGAAATGGTTTCACCTTCCAATCAAAAGGGTGAGGATTCAATTCCACTATGGGCACTTTGAGGGAGGGTTCCCCTTACCATTCCCCCACTCTCAAGGTATCTTATCTAGCCTGCAAATCCGGATAGGTTAACCCGTGCGGAGTTCCAACCTGGTAAATCATTTCATCTTACCTTCACAACAACAAAAAATAAAAGACATTCAATACCAAATTCGAAAGTTTTGTGCTAATGAGTATTGTCCATGACGTGAAACTAGATTTCCAATCATACGGAATACACCTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTACAAATTTACAATATCACTCAATAGCCGAGCACTTCTTAAGGCAATGGATCATAATGAAAATTTACCACCGTTGGCAATTTTGTATTGTTTTTTTTAATATAAGAAGAAAGATGCATGGTATTTGGGGTGGAAATGGGCATTTGTTCAAATTCACAAATAAATAAAACTGAGAAAAAGAGAAAACATGCTGAATTTTCGTCTAACACCCAACTACACTTTTTAGGCTTAGTTTGATCATAGGAAAAGCCGAAAAGTTTTGGTTCCATTATACCAACAATGAAAATAGTTAATGAAGCTTGAACGCAGTTTCGTCACCCCAAACTATGAGAAGATACAAAATTCATGGATATTCTATTTGAAACTCATTCTCTCATAAGGGGTTGCCGCCTTGCCGGTACCGTAACCAGATGGGCATAAAATCCAAGTGAAGAGAATACCCCTGGAGTTCCAATTACATCCACAAAATTTGAAAATTAAAAGAACAAAATGAGTTTGTGCTCCCAATTACCAACGCGCGGATGATGCAGCCATGCACGGGTGCGTACGTAGATCTACATGCACCTGCACCAAAACGCAAAACAAAAAAAAACAAAAAAATGTAACGCAAAAAATAAAAAAGAACGTATTAAACTAAACAGAAAGAACATAATAGAGTAAACGAAAAGAACATTAACCACAACCTGAAAAGAACACTAATGCTAAAAAACCAAAGAAAATGTACGAAAATGAAAAGAACATACTCACTCTCCTGATAAACTATAAAAATAACAACTATTTTTCAAAAAAAACATCATGTAAAAAATGCGACAGAAAAACAACAAAAAAGTCAAGTATCGATAATATTATAAAAAAAATAAAAAAGGTAAAATAGTTAAAAAGAACACAAAATAATTTAAAAAAGAACAATAACTTTTTTATAAAACACAAAAAACAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAACAACAAAAACTCAAAATTAAAATTAAAATTAAAAAAAAAAGACAACAAAGAAAGAAAAAAAAAACATGAAAAAGACAACATTTTCTTTTTCCTTATCAAACAAAAGAACAAAATGAAAGGGACGAAAAGAACAACGGATCTATATTCTTTTATTAGTTGTACTTGTTCTTTTCAAACTATATAGTGTTCTAACTAAAAAGACGAAAACGACGATATTTGGATGCACTTAAAACTAGAACAATATTTTCGTTAAAGGTATTTTTGTTCTTATCCTACGCATCAGATCTATGTTCTTTTATTAAGTGTTATTTTCCCTATTTAAACGATTTTATGTTCTAATTAAAAAGACGAACCGACGATTTCTTGATGCACTTAAAACTAAATCCATATATTTTTTAAATATTTTTGTTGTTTCGCCACGAATAAGACTATGTTCTTTTATAAGTGTTATTTGTTCTTTTCAAACCATTATATGTTCCCATTAAAATGAAACGACAAAATTTTGAAAAACTTTAGACCAGATCTATGGTATTTTTCATTTATTACTGTTCTTTTTCCTATGTTTTATTTTTTCTTATTAAGAAAAGAAGACGAGACTGCAATGAAGTTGTTGAACTTAAAATCAGATCTACAACTTTGCTATGTTCGTTTACAAGTGTAGTTTGTTCTTTTAATAAAGTGTGTTTTAATGGTTTTGGACTTAAAAACATAAATTAGTTCCTTTTAAAATCTTTTTTGTTCTTTTAATAAAAAAAAGTACAATAATTGTGTTACGAGTTAAAATAATATCTATGTTCTTTTAAAAGTTGTTTTCATACTAATAGTATAATTTATTTATTTATTTTAAATTCAAAATGTGTTTTAATTTTATAAAAATAATCATTAACAGTATCAAAAAAACTCTCTAAAAATTTAAAAGAACAATCTATGTTGATATAAAAGAACAAACTATGGTGATTTAAAATAACAAACTATGTTATGACATAGTAAAAGTAAAGTTATGAAAAGAACATTACAATTTGAAAAGAACATTAGAGGAAAGAACAAGGAAGCATACCTTAAACACTTGATTAACATTTACCAAGAGCATCAATATCCTTTAATAAATCTTCAAAACTGATCTCAATCCTCTGAAAATATCATGCTCTCATGTGATTCTCTTGCTTTGAAAACTAGCCAAATTGAACTAGTATTTTTCTTAATTCACTCATTTTCAACTAAGGAGAAACATTCATAAGGAATTTTAGAGAAAGGATAAAGAGAAAATGTAATTTTTATTCTTTCACTCACTATCTCACTCTTTCTCTCTCAAAAATCTCTCTTATGTTGAGAGAATATAAATCCTCTCCTCTTTCTCTCTCTAAAATGTATTTCTAAAATTCTAAAATGACTAAGGGTTATGATTCATAAATACAATATATATATATATATATATATATATATATATAGGGAAGAGATCATGTGAAAATACATCCTTATGTGAGTATACTAGTATATATGAGAATGAATCTAATCCGTAGGATTAGATTCAATCTAATGGCTAGGATTAATTTGAGCAAACCCATCCACCTTCCCCATTAAAAGCCACGTCTCTATCAATAAACCCCACCACTTTCTCTCTCTAAAACCTTTCCTCTTCTTTCTCTCTCCCGTTCAAGACTCCTGTTCTCCCTCCTCTCGCAAAAACCTCAGCGATTTTCTCTCTCCTCTCGCGAAAACCACCATCGCAGCTCCGATTTTCTCTCTCCGTTCAAGACTCTCTGTTCGCCGCCGGTGTATTGAAGATTTAAGGTAAATTCGAGTTCAATTGTTATACATTTCTTCTCTCCTTCTACAATTTTTTCAAATTTTAACCTAATTTTTTCAATTGAAGATGA

mRNA sequence

ATGGTGGGAGGAAAAATATGCGAAGTTACTCCCAAACTCCATCATCGCTTCTCAAATCCGAAAGAAGACTCACATCAAAGACCCCAAGATAAAACCTGTCAAAGTGGCTATGGTTGCTTTATCAAAGGAAATCATTCACAATATTTAAAGAGGAAACGGGCTATCCCTGGTACAGCTTTGGCGGCGACACTTGCTTCCGCAACTATAGTTTCATATTCTATTCCCGATCTCGAGCCTTTGACATTAATTCAGCACTTCAGCATTGCATACGTCATTTCTCTCCTAAACAATGAAAGCATTAAGAGCCACACTGACAGGGCTTGGTTTCAACATGATGTTAGTTTCCTAGATCATGAATGGATGGCACCGGCAAGGGGGATGGGCCTTGAGACTTCCTATGAATTCATTCATAAAGCTCCGATTTTCTCTCTCCGTTCAAGACTCTCTGTTCGCCGCCGGTGTATTGAAGATTTAAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGGGAGGAAAAATATGCGAAGTTACTCCCAAACTCCATCATCGCTTCTCAAATCCGAAAGAAGACTCACATCAAAGACCCCAAGATAAAACCTGTCAAAGTGGCTATGGTTGCTTTATCAAAGGAAATCATTCACAATATTTAAAGAGGAAACGGGCTATCCCTGGTACAGCTTTGGCGGCGACACTTGCTTCCGCAACTATAGTTTCATATTCTATTCCCGATCTCGAGCCTTTGACATTAATTCAGCACTTCAGCATTGCATACGTCATTTCTCTCCTAAACAATGAAAGCATTAAGAGCCACACTGACAGGGCTTGGTTTCAACATGATGTTAGTTTCCTAGATCATGAATGGATGGCACCGGCAAGGGGGATGGGCCTTGAGACTTCCTATGAATTCATTCATAAAGCTCCGATTTTCTCTCTCCGTTCAAGACTCTCTGTTCGCCGCCGGTGTATTGAAGATTTAAGATGA

Protein sequence

MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTCQSGYGCFIKGNHSQYLKRKRAIPGTALAATLASATIVSYSIPDLEPLTLIQHFSIAYVISLLNNESIKSHTDRAWFQHDVSFLDHEWMAPARGMGLETSYEFIHKAPIFSLRSRLSVRRRCIEDLR
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spo01949.1Spo01949.1mRNA


Homology
[Close]
BLAST of Spo01949.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902188508|gb|KNA11175.1| (hypothetical protein SOVF_137720 isoform A [Spinacia oleracea])

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 2.500e-11
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 34
          MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC
Sbjct: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 33
[Close]
BLAST of Spo01949.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9QV95_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_137720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 1.700e-11
Identity = 33/33 (100.00%), Postives = 33/33 (100.00%), Query Frame = 1 

		  

Query: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 34
          MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC
Sbjct: 1  MVGGKICEVTPKLHHRFSNPKEDSHQRPQDKTC 33
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo01949.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
gi|902188508|gb|KNA11175.1|2.5e-11100.hypothetical protein SOVF_1377... [more]
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BLAST of Spo01949.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0K9QV95_SPIOL1.7e-11100.Uncharacterized protein OS=Spi... [more]
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BLAST of Spo01949.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of Spo01949.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0031048 chromatin silencing by small RNA
biological_process GO:0009560 embryo sac egg cell differentiation
biological_process GO:0009630 gravitropism
biological_process GO:0045132 meiotic chromosome segregation
biological_process GO:0006312 mitotic recombination
biological_process GO:0007062 sister chromatid cohesion
cellular_component GO:0009507 chloroplast
cellular_component GO:0005829 cytosol
molecular_function GO:0005488 binding
RNA-Seq Expression