Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAACAAAAAAAAAACACTACAGTACGTAGAATCTACCCAAATCCAATCGACTTTCTACTCTTCTATTTCACATTTTCACCCTTCTTTTTTTCAAAAAAAATCACCCTTTCTTCTTTATTCAGTTCGCCACCTCATACAAACATGTTAAACTCCAACGAAATTGCAGCAGGGCAGCAGCCATAACCATCGTCCAGCTCTTTTTTTCTCTCTCCTCTCTCATCTTCCATTAAACTCTCTTCCAAAAAACCTCAATAACTATTTCCACTTGCTCAAAACAAGCTAAAAATCAGTGATCTACAAGTCAAATTCAACGCAGTCGATCGTCAAAAAATTGAAGTCAAATCAAGCAAATTCAACTCTTGGATCTCTCAATTTCAGCTGCAAAATGCATTGAAATTTTCAGCTATTCGAATAAGAAGAGAATGATTGCGATGAAAGGTGCGAAATCGAAGTTAAGAATTGGTGGATTATTCGCGCTAACAACATTAATTAGTATAATTGGATTATACGGATTATTAAAGCCAATTCAAAATGGTTGTACTATGACATACATGTATCCGACCTACATTCCGATATCGGCGCCCAAGAATTTGTCGTCGAATAAGTATGGATTGTATTTGTATCATGAAGGATGGAAGAAGATTGATTTTGATCAGCATCTTAAGCAGCTTAATGGTGTTCCTATTTTGTTTGTTCCTGGCAATGGCGGTAGCTACAAGCAGGTATTCCAAGGTTTCTGATTAATTTGAAATTTATTCATATTTCTAAATTTGCTTAAGTTAGGTTTTACAGTTTTGATTGAATGCATTAGATAGTAACAAATTCGTTTAGTTATACTAGCGTTATACTACGTATGAGTATTGAGTAGTAGATTTTGTTGCTATTTTTGTATTTTCCGTAAGATTTTGTTACTATTTTTGGCTAGTAAATTATTTTAGATTAATTTGTTTGATTTTGATTCTCCAAAAATGGAATAGAAGTAGAAAGTTAGGGATTAGGATTTGAAATTGGCAAAAGATATCCGAATTACACTAATGTAAACTCAGATTTGAATCTAGAATTACAGCCTGGTTTATTTGGATTCGAAGGCATTTGATGATAAAGTTGGTGATAAAATATGGCCCTAGCTCTAGTCGGAAATTTGCCAAATGTCTTTAAACTAATTTTAAGCTTACATGATACATGATGATATGGTATACAGACAGATGTAGTCTGGCTCTGGTTTTGTAAGAGCTAGGTTAGGCATATGTGTTCATGAGAAAAATTGTACATCTTAGAAATATGTGCATCAAGAATAGGACATAAGCATCATGACTCGTAGAGACGTAGAGTCAATAGACCGGTTTAATGGTTTGGAGGATGGGTAACTCTTGGATTGAAGTATGATTGCAAATTTGCAATAATAGTCAATGGTCTTCTGCATACACATTTGCAAGTTTAGAGTTAGGAAGAAGAAGACAGTTATAAATTGGGGCGAACAAATTTCCACAGAGGTCCCCTATATGTTATGCAAGGTTATGAACTTCTAACTATTTATGGTTTCATGCCAATTATGCACTTAAGCTACCATATTGCTGTTCTTAGTACTTGTATTTTGCTGCTCTTGCTTCTGTTTTTGACCAAGTTGTTGCAAAAAAGAGAATGAGAAACTTTCTCATATTCCTTTTTCAGAAGATTTTTTTTGTCGCTTTGCTCCTCATAGGTGCGCCCGGTCGCAAAAGAGTCTCATTGGGCATATATATGGTTTCATACCAATTATGCACTTAAGCTACCATATTTCTGTTCTTAGTACTTGTAGTGTGTTGCTCTTGCTTCTGTTTTAGATTGAGTTGTTGCAGAAAAGAGAATGAGAAACTTTCTTATCATTCCTTTTTCAGAGGTTTTGTTTGTTGCTTTGCTCCTCATAGGTGCGTTCGATCGCAAAAGAGTCTCATTGGGCATATACCTCAGGGCCACCTGAACGTACCTATTATCAGGAAGCTTCCCTGAGTCCAGAGGAGGGAGGGCTGGACATTGACACAACTAAGTTTTCTCTGCCCAATAAATATGCTTCTACGCTGGATTGGTTTGCTGTGGATTTGGAAGGTGAACATTCTGCCATGGATGGTCAGATCCTTGAAGAGCACACAGAATTTGTTGTATATGCCATTCATCGGGTATGGTACCATCTGCCAACTTAAAGCTGTCTACCTGTTTTTTGCTTTTCTCAAATCGCCTATATTGTTTTATCCGCTTGTTTTTATCTTTTGTGTTTCTTAGCTGCTATTATTTATTTTACCAGAAAGAATATTTTGCTTGCTTTTTCTTGCTAATTTTGGATATGGTAGCAGATACTGGATCAGTATAAAGAGTCTTCTGATGCCAGAACAAAAGAAGGTGCTGCTGTCTCTGTTAATTTGCCAAAAAGTGTTGTATTAGTTGGTCACTCCATGGGAGGATTTGTTGCTAGAGCTGCAACTGTTAACCCTAACTTACGGAAATCATCCGTTGAAACGATTCTTACACTTTCAACTCCACACCAGTGAGTTCTTATTTTCTTTTTTCTTTTCTATTTGTCATGGGGGTGAAGTGGGGAGTTAGGGGGCTGCTTCACTGAACTGCATACACTATAGCCACTCAGTAATTTACCATATGAGCTTTACTTGATACAGGTCACCTCCTGTGGCATTGCAGCCGTCTTTGGGCTACTACTACACCTCCATAAATCAGAAATGGAAAGAAGGATACCAAATACAAGGCCCTCATGCTCAGAGTTATGCATCACAACCTATGCTCTCTCATGTTGTTGTGATCTCAATTTCTGGCGGAATTAATGATTATCAGGTTCCTTTATGTCTTACTTATTCAGTTTGATTTGTGCTACTGTTGTCGGATTATCTCAATTGCATTGCTCACTTGGTTATTTGTTCACTGTCATCCTTCTGTTCAAGTTATTTTCCAACTTGCTTTGTGGCAATTGCAGATGGTTTTTGTATTACCTACAATGATATATTTTTTCTTGCTATAATGATTTTCTATTTTTTTGATAAACAATTACACATTTACACCACTGCAATGGCTCTCAGTACTTGATTAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCAAAGAAAGGAGTACTACAGTATATAATATCCTTCGTTTAATAAGTTTATTGTACTTGATCTTTTCATAATAAAGTAAAGGTGATAAAGAACCAGTATGGATAGCTTTTAGAGGATCACTGCAATAAATGCTTGGAAAGATAATGGATAATCTAGGACAAATAATTTGAAATGTTATCAACATGGTAAAGAGGTAAATTGCTGTAAGAGGGAGGGGGTAATTATATTGAGTTCTGCATCTTGCAAACAAGTTATTACTCTTTAAGGTAGTATGTTTGTAATTTTGAAAGTAACTAGACTGAGATCTTGGCAGGTTAACATATTGTATTGGCTGAGTCTGTTGATTAAACAATAACTGATAGCCAACTTATCAAACATTTGATTAGCTGAATACTTTATTGCACCAAGCTGACTTGTGATATTATCATATTTGGTTAAGTTTTATTATGCTGTGTGGCAATTACTAGAATATTGCATGGTCCAGCATTTTGTACTTGTGTCACTAATCCCTTTTAAGCCTTTCACTTCGTATATTGTCACCTGCTAAATCTTTTGGATGAAACAAAAAATTGTCCTAGTTTTATGAATATTTGAACTGACTTATAGAAGCGCTAAGATAACTAAGATTTTCTAGTATCCGGAACAACAGTTTTCTTAAAGAAACTCCAATGGTCGTAGCTAGGGACTTGCTTGCAACTTTTAAAAGTCTCAAGCTACTAGCTTAACCATTGGAGTGGAAATGACAAATTAGCTTGGCCAAGCAAATTAGCTTGCCCAAGCTAATTTGCTTGACAAAAAGTAATTGATGGTCGATTGACAAGTGGGACACAATTAAATAACAAGCTAGTAGCTAACCATTGGGGTACAAATTAGTAGCAATAAGAATAGCTTGTAATCTTATGTGGCATGGCAAGCTAATTTAGAAATTAGCTTTCCATTGAAGATTACTCTCTTAGTAATCTAAGTACTTTGAAGGTGGGACTCTAACTAGATTGTTGCTGATTTGACTATGTCATTAAGGTGCTCCTTTCATAGGATCCTGAGTATGCATTCATCCTTTTTGTTTGCGGCATCTCTGGTTTCACTAAGTGTTTTAGCTATTTGTGTAATTGCATGCTGCCTAGGTGATGTGCATTCTAACTCCTTTTACCCTATCTAAAGGTGCGGTCGAAATTAGAAACTCTTGATGGCATTGTTCCTCCCACTCATGGCTTCATGATCAGTAGCACCGAAATGAGGAATGTGTGGTTGTCAATGGAACACCAGGCCATTTTATGGTGTAATCAGCTTGTTGTCCAAGTAAGGATCTATTGTCTCTTTCCATGAGAGTATATAGCATAATTCTTCTGTTCAGAGTAATGATTTTTTGTACGTTCAATGTAGGTGTCACACACACTTCTTAGTTTGGTGGATCCAGACACGAGAAATCCATTCACTGATAGACAAAAACGACTGGCAGTATTTACGAAGATGCTTTATAGTGGCCTTCGACAAAGAGTTTTAACAACTGGTGGCGATGAAAGCTATTCACATGGTATTATCATCACGCTCCTAACTGCAAATGCTGATTTTTAAACCAAAGTTTCTGCAAATAAATTGATTTGCATTGTTTTATGACACAAAGACAGTTGCATATTTGGGTAGAATCTTTTAATGACAGGCTTGTATTGAGCCATGACTCCGTGTAAAGATGTAGGGAAATAAGGAGCAGGATATGCTGTTGTATGCACAAAAGGCTAAATATTTTCCTAATTTTAGGATTATAATATGCATTGGGCTCATAGCCTCATATAG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MIAMKGAKSKLRIGGLFALTTLISIIGLYGLLKPIQNGCTMTYMYPTYIPISAPKNLSSNKYGLYLYHEGWKKIDFDQHLKQLNGVPILFVPGNGGSYKQVRSIAKESHWAYTSGPPERTYYQEASLSPEEGGLDIDTTKFSLPNKYASTLDWFAVDLEGEHSAMDGQILEEHTEFVVYAIHRILDQYKESSDARTKEGAAVSVNLPKSVVLVGHSMGGFVARAATVNPNLRKSSVETILTLSTPHQSPPVALQPSLGYYYTSINQKWKEGYQIQGPHAQSYASQPMLSHVVVISISGGINDYQVRSKLETLDGIVPPTHGFMISSTEMRNVWLSMEHQAILWCNQLVVQVSHTLLSLVDPDTRNPFTDRQKRLAVFTKMLYSGLRQRVLTTGGDESYSHGSCPKNIQWDMDSLEKDLYIQTSTVTVLAMDGKRRWLDIQKLGSNGKSHFVLVTNLSPCHGIRVHLWPEKGNSSTDLPLSQRVVEVTSTTAQIPSGPAPRQIEPGSQTEQPPPSAVFWLSPEAMQGFRFITISVAPRPTVSGRPPPAASMAVGQFFNLQEGVKDISPFSLLLSAISQNEMLFKEDHPIALNLSFSISLGLLPVTMSLKTSGCGIKNSGLSAQEDDDAENNRLCKMRCFPAVAFAWDRTSGLHIHPNLNSETVVVDSAPALWNSAQGSEKTTVLLLIDPHCAYNAKFSVSITAAASRFLLLYCSKIVGLAIAVVFFALMRQARAWEHDLPIPSMLTAVECNMKLSPFLLVTAVPLLIPLVLSVLQFHPVPSVSSFLVVSLACYMVANGLIIIVIVISQFVFHVCAVAHVFFRKRWQVWEGNFCLVCLQQFINLGSRIFSIKVVRVVRSNPVLMTALVAIILVCFVHPALGLSVLLISHALSCHNALCSYLTASYRRGTYKKESISSKDKDYDRPVQYAYQHSRRSKRYLPLEENHNITGGSPYSYDDIQLEIFHHRHGMLILHLLAMLMFAPSLVAWLQRLRLGQSFPWFLDSVLCIGVILHGVCDSNPELNFFVYPIPGVRGLEVKLSIAYLLAGYFSFLSGLALAPYRVFYAMATIGAFSFVFRMIRRRNREKGEAIFSSRKHSHRQ Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Homology
BLAST of Spo00147.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902201516|gb|KNA13998.1| (hypothetical protein SOVF_111530 isoform A [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 2175.6 bits (5636), Expect = 0.000e+0 Identity = 1098/1098 (100.00%), Postives = 1098/1098 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731316851|ref|XP_010666038.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104883248 isoform X1 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1819.3 bits (4711), Expect = 0.000e+0 Identity = 901/1110 (81.17%), Postives = 997/1110 (89.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731316853|ref|XP_010666045.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104883248 isoform X2 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]) HSP 1 Score: 1796.9 bits (4653), Expect = 0.000e+0 Identity = 893/1110 (80.45%), Postives = 989/1110 (89.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. NCBI nr
Match: gi|902201517|gb|KNA13999.1| (hypothetical protein SOVF_111530 isoform B [Spinacia oleracea]) HSP 1 Score: 1780.8 bits (4611), Expect = 0.000e+0 Identity = 898/898 (100.00%), Postives = 898/898 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. NCBI nr
Match: gi|731413884|ref|XP_010658923.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC100262596 isoform X1 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1494.9 bits (3869), Expect = 0.000e+0 Identity = 749/1115 (67.17%), Postives = 883/1115 (79.19%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R3B0_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_111530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2175.6 bits (5636), Expect = 0.000e+0 Identity = 1098/1098 (100.00%), Postives = 1098/1098 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8D4G7_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g031330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1819.3 bits (4711), Expect = 0.000e+0 Identity = 901/1110 (81.17%), Postives = 997/1110 (89.82%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0J8D419_BETVU (Uncharacterized protein OS=Beta vulgaris subsp. vulgaris GN=BVRB_2g031330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1796.9 bits (4653), Expect = 0.000e+0 Identity = 893/1110 (80.45%), Postives = 989/1110 (89.10%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: A0A0K9R4X9_SPIOL (Uncharacterized protein OS=Spinacia oleracea GN=SOVF_111530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1780.8 bits (4611), Expect = 0.000e+0 Identity = 898/898 (100.00%), Postives = 898/898 (100.00%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Match: B9SLQ7_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_0530670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1409.8 bits (3648), Expect = 0.000e+0 Identity = 714/1115 (64.04%), Postives = 862/1115 (77.31%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BST1_ASPOR (GPI inositol-deacylase OS=Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) GN=bst1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 1.200e-51 Identity = 131/379 (34.56%), Postives = 196/379 (51.72%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BST1_CHAGB (GPI inositol-deacylase OS=Chaetomium globosum (strain ATCC 6205 / CBS 148.51 / DSM 1962 / NBRC 6347 / NRRL 1970) GN=BST1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 204.5 bits (519), Expect = 5.800e-51 Identity = 162/543 (29.83%), Postives = 248/543 (45.67%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BST1_NEUCR (GPI inositol-deacylase OS=Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) GN=bst-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 204.1 bits (518), Expect = 7.600e-51 Identity = 130/382 (34.03%), Postives = 192/382 (50.26%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BST1_ASPFU (GPI inositol-deacylase OS=Neosartorya fumigata (strain ATCC MYA-4609 / Af293 / CBS 101355 / FGSC A1100) GN=bst1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 1.700e-50 Identity = 126/382 (32.98%), Postives = 199/382 (52.09%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: BST1_EMENI (GPI inositol-deacylase OS=Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) GN=bst1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 200.3 bits (508), Expect = 1.100e-49 Identity = 129/389 (33.16%), Postives = 204/389 (52.44%), Query Frame = 1
BLAST of Spo00147.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Match: AT3G27325.2 (hydrolases, acting on ester bonds) HSP 1 Score: 1210.3 bits (3130), Expect = 0.000e+0 Identity = 626/1106 (56.60%), Postives = 793/1106 (71.70%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spo00147.1 vs. NCBI nr
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. NCBI nr) Total hits: 5
BLAST of Spo00147.1 vs. UniProtKB/TrEMBL
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. UniprotKB/TrEMBL) Total hits: 5
BLAST of Spo00147.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. ExPASy SwissProt) Total hits: 5
BLAST of Spo00147.1 vs. TAIR (Arabidopsis)
Analysis Date: 2018-06-29 (blastp Spinacia oleracea peptides vs. TAIR) Total hits: 1
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of S. oleracea
Date Performed: 2018-06-29
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
RNA-Seq Expression
Co-expression
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